MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Exiguobacterium sibiricum 255-15 chromosome

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010556	AAGTAG	2	12	55775	55786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010556	AGGAAG	2	12	79413	79424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010556	ATTTAA	2	12	87656	87667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010556	TATTTT	2	12	124536	124547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010556	CGAAAA	2	12	147014	147025	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010556	ATTTTT	2	12	152387	152398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010556	TAAAAT	2	12	161370	161381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010556	TAAAGT	2	12	263553	263564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010556	ACAGAC	2	12	273836	273847	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010556	TTTTAA	2	12	288442	288453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010556	CTGTTG	2	12	308423	308434	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010556	AAAACG	3	18	360674	360691	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010556	ATGACG	2	12	363261	363272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010556	TGTTTT	2	12	380611	380622	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010556	GAATAG	2	12	390424	390435	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010556	AACGGA	2	12	423066	423077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010556	GAAAAC	2	12	425751	425762	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010556	AAGGGA	2	12	467681	467692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010556	ATTTTT	2	12	548636	548647	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010556	TATGAA	2	12	570413	570424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010556	TTTTAG	2	12	734718	734729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010556	ATTAAA	2	12	735401	735412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010556	TCTGAT	2	12	869152	869163	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010556	GTATAT	2	12	882171	882182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010556	ATCAAT	2	12	907507	907518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010556	AAAGAG	2	12	920811	920822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010556	AATCAA	2	12	978491	978502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010556	ATTTCA	2	12	981533	981544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010556	ACATAA	2	12	982644	982655	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010556	CCTGCT	2	12	991112	991123	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010556	TGCCGC	2	12	1037537	1037548	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010556	GTGAAA	2	12	1115105	1115116	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010556	TGTAAA	2	12	1120094	1120105	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010556	TTTCGA	2	12	1224163	1224174	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010556	TAAAGT	2	12	1226665	1226676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010556	AAAAAC	2	12	1254442	1254453	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010556	GTTTTG	2	12	1278689	1278700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010556	AAAGTG	2	12	1330044	1330055	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010556	AATGAA	2	12	1331401	1331412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010556	TGTTAT	2	12	1335908	1335919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010556	CCTGTT	2	12	1342707	1342718	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010556	AAAAAG	2	12	1343293	1343304	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010556	ATCGCT	2	12	1344611	1344622	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010556	AAATGA	2	12	1424863	1424874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010556	ATCATG	2	12	1425830	1425841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010556	ATCAAG	2	12	1426019	1426030	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010556	AAACGG	2	12	1480437	1480448	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010556	TAAAGT	2	12	1483251	1483262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010556	CGGAAC	2	12	1503824	1503835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010556	GAACAG	2	12	1512301	1512312	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010556	GATAAT	2	12	1521594	1521605	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010556	GATAAT	2	12	1576061	1576072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010556	TTGTAT	2	12	1618942	1618953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010556	ACTTCA	2	12	1620388	1620399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010556	AAGCCA	2	12	1622112	1622123	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010556	TCTTTT	2	12	1627843	1627854	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010556	GATTTT	2	12	1636111	1636122	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010556	CCTATC	2	12	1644757	1644768	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010556	TCCGGA	2	12	1660529	1660540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010556	AGCTTC	2	12	1674166	1674177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010556	AGGACA	2	12	1679996	1680007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_010556	CTGTTC	2	12	1693655	1693666	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010556	TCCTTC	2	12	1730340	1730351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010556	CTGTCC	2	12	1742700	1742711	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010556	TTTCGA	2	12	1751254	1751265	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010556	GAAGGT	2	12	1768306	1768317	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010556	TATCAC	2	12	1788886	1788897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010556	ATCGTA	2	12	1894267	1894278	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010556	GATTTT	2	12	1937745	1937756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010556	AGATTA	2	12	1940157	1940168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010556	GTTTTT	2	12	1960825	1960836	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010556	AATAAC	2	12	2010617	2010628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_010556	ATTTTT	2	12	2015474	2015485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010556	CAAGAA	2	12	2141997	2142008	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010556	TTTCCA	2	12	2187029	2187040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010556	GTGTAA	2	12	2244871	2244882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010556	CCTTTT	2	12	2251763	2251774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010556	AAAGTG	2	12	2257885	2257896	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010556	TAAAGT	2	12	2293313	2293324	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010556	ATTGTC	2	12	2313084	2313095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010556	TCTATT	2	12	2378362	2378373	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010556	TTCCCC	2	12	2438540	2438551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_010556	CAAATC	2	12	2438573	2438584	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010556	TTTCAA	2	12	2438610	2438621	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010556	ATTTAC	2	12	2469467	2469478	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010556	CAGAAG	2	12	2504081	2504092	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010556	TTTTAT	2	12	2510170	2510181	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010556	TGGTTA	2	12	2552071	2552082	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010556	CGAATA	2	12	2561042	2561053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010556	ACAGTT	2	12	2575808	2575819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010556	CTTGTT	2	12	2581295	2581306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010556	ATATTT	2	12	2615002	2615013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010556	GAATCG	2	12	2655101	2655112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010556	TACTTT	2	12	2660764	2660775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010556	TTCTTT	2	12	2668108	2668119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010556	TCATTC	2	12	2760392	2760403	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010556	TTTGTT	2	12	2776869	2776880	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010556	CTATCT	2	12	2794620	2794631	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010556	ATGAAG	2	12	2796963	2796974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010556	TACACA	2	12	2807498	2807509	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010556	TAAGAA	2	12	2826591	2826602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010556	CGTTTT	2	12	2866055	2866066	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010556	ACAATA	2	12	2916188	2916199	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010556	ACTTTA	2	12	2922648	2922659	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010556	AGATTC	2	12	2987483	2987494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010556	GAAAAG	2	12	3021742	3021753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010556	AAAAGA	2	12	3032155	3032166	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.