MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 chromosome 2

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010552	CCGGTG	2	12	116	127	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010552	AAATAT	2	12	1586	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010552	GCCAAC	2	12	19348	19359	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010552	GCATCT	2	12	35512	35523	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010552	CGTTTT	2	12	46399	46410	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010552	CGTGTT	2	12	46443	46454	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010552	CTGCCG	2	12	52560	52571	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010552	CGGGGC	2	12	63197	63208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010552	CTATAC	2	12	83751	83762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010552	TGCTGT	2	12	86481	86492	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010552	CCGGAA	2	12	159885	159896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010552	GAGGGG	2	12	159912	159923	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010552	CGGAAA	2	12	171350	171361	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010552	GATCGA	2	12	171617	171628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010552	CGCATC	2	12	179865	179876	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010552	ACGTCG	2	12	195044	195055	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010552	TCGAAT	2	12	209945	209956	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010552	GCTTCG	2	12	217759	217770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010552	TCGCGC	2	12	244439	244450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010552	CGGTAG	2	12	248906	248917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010552	TATTTT	2	12	289040	289051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010552	CGCACC	2	12	290924	290935	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010552	ATGCGT	2	12	329324	329335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010552	CAGCAC	2	12	334624	334635	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010552	CGTTGC	2	12	343365	343376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010552	GGAAAT	2	12	384874	384885	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010552	CGATAC	2	12	445520	445531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010552	AGGTGA	2	12	452822	452833	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010552	CTCGAT	2	12	521062	521073	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010552	ACACGC	2	12	554486	554497	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010552	TATGCA	2	12	580422	580433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010552	AGGAGA	2	12	604398	604409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010552	TCGGCG	2	12	651468	651479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010552	CTGCGC	2	12	669349	669360	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010552	GCGGCC	2	12	705899	705910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010552	CGCGTG	2	12	713850	713861	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010552	CGTAAT	2	12	729266	729277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010552	TGCTGA	2	12	769788	769799	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010552	TGTTCG	2	12	819673	819684	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010552	CGATCC	2	12	832147	832158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010552	GGTGAA	2	12	833594	833605	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010552	AATCGA	2	12	857504	857515	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010552	TATCGA	2	12	898466	898477	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010552	ATGCGA	2	12	903747	903758	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010552	TGCCGC	2	12	912329	912340	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010552	GCAGCG	2	12	923840	923851	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010552	CCGATC	2	12	946013	946024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010552	CCGGCG	2	12	946700	946711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010552	GTGCGG	2	12	948326	948337	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010552	GCACCT	2	12	956110	956121	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010552	GTGCGG	2	12	961165	961176	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010552	TGAAAA	2	12	1008136	1008147	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010552	CAGGGC	2	12	1009800	1009811	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010552	TTCGAA	2	12	1071531	1071542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010552	CGAAAA	2	12	1082543	1082554	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010552	ATGGCG	2	12	1156331	1156342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010552	AAGGGG	2	12	1180209	1180220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010552	CGCGCC	2	12	1185358	1185369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010552	AGCCGC	2	12	1185532	1185543	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010552	CGGCCG	2	12	1215712	1215723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010552	GAGGAA	2	12	1248054	1248065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010552	TCGGCG	2	12	1255031	1255042	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010552	TTGCGC	2	12	1259961	1259972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010552	AAGCGC	2	12	1321242	1321253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010552	AGGCCG	2	12	1366433	1366444	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010552	ACACGC	2	12	1379345	1379356	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010552	CCGGCA	2	12	1383542	1383553	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010552	ACCGTC	2	12	1392803	1392814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010552	GCGATT	2	12	1404941	1404952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010552	GTTGCA	2	12	1465276	1465287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010552	CCATGC	2	12	1490106	1490117	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010552	TCGCGA	2	12	1495903	1495914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010552	GCGCCC	2	12	1504768	1504779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010552	GAAGTG	2	12	1508629	1508640	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010552	GCGTGC	2	12	1521449	1521460	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010552	CGTTCG	2	12	1539617	1539628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010552	GCACGC	2	12	1562308	1562319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010552	ACCATC	2	12	1592089	1592100	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_010552	TCGCGC	2	12	1609646	1609657	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010552	GCCGTC	2	12	1623602	1623613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010552	CTGGAA	2	12	1654381	1654392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_010552	CGAAAA	2	12	1663099	1663110	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010552	CCATCG	2	12	1694582	1694593	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010552	CTTCCG	2	12	1699210	1699221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010552	GGCAAA	2	12	1741008	1741019	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010552	CGGGGC	2	12	1761428	1761439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010552	TGCCGA	2	12	1769968	1769979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010552	CGTCAC	2	12	1802799	1802810	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010552	AGGCGG	2	12	1809308	1809319	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010552	AAGCGG	3	18	1809320	1809337	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010552	CGTGCC	2	12	1812390	1812401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010552	CGCCCG	2	12	1812425	1812436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010552	GACGCG	2	12	1822736	1822747	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010552	TCCCGC	2	12	1857635	1857646	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010552	GCTCCG	2	12	1878187	1878198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010552	ACTGTC	2	12	1894633	1894644	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010552	CGGGCG	2	12	1901217	1901228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010552	GGTGTG	2	12	1969185	1969196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010552	TCGGCC	2	12	1987533	1987544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010552	GACGGC	2	12	1987650	1987661	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010552	TCGTGC	2	12	1992464	1992475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010552	AGAACG	2	12	2008873	2008884	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010552	CGATCG	2	12	2013572	2013583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010552	GATCAA	2	12	2026827	2026838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010552	CTGGCG	2	12	2026857	2026868	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010552	CATCGC	2	12	2063298	2063309	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010552	GCAATC	2	12	2064341	2064352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010552	TTCGCA	2	12	2082161	2082172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010552	ACGAAT	3	18	2095983	2096000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010552	GCTTGC	2	12	2105191	2105202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010552	CCGGGG	2	12	2105275	2105286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010552	CGCGGC	2	12	2105927	2105938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010552	GCATGC	2	12	2107984	2107995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010552	CCGCCC	2	12	2124801	2124812	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
115	NC_010552	CGTTGA	2	12	2149595	2149606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_010552	TCGCCG	2	12	2154527	2154538	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010552	TTCCGG	2	12	2157846	2157857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010552	TCCGCA	2	12	2200601	2200612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010552	CGGCGC	2	12	2211261	2211272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010552	GGCCGC	2	12	2214304	2214315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010552	GCAAGC	2	12	2223671	2223682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010552	ATCGCA	2	12	2223701	2223712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010552	ACGTCG	2	12	2275667	2275678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010552	TCGATA	2	12	2305385	2305396	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010552	CGAGAT	2	12	2312558	2312569	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010552	GTCGGG	2	12	2316397	2316408	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010552	CCGGCG	2	12	2327906	2327917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010552	GGTCGG	2	12	2328143	2328154	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010552	CGGCGA	2	12	2329148	2329159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010552	CGTATC	2	12	2459903	2459914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010552	CCTCGC	2	12	2470926	2470937	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010552	GCCGGC	2	12	2471236	2471247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010552	CCGCAA	2	12	2471402	2471413	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010552	CGGACG	2	12	2475648	2475659	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010552	CAGGCC	2	12	2487150	2487161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010552	AGCAGG	2	12	2511913	2511924	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_010552	TTTGAA	2	12	2518986	2518997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010552	TTCATC	2	12	2560576	2560587	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010552	CCGCGC	2	12	2568643	2568654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_010552	CGCTCC	7	42	2642051	2642092	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_010552	AAACGC	2	12	2645424	2645435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010552	ACCGGC	2	12	2663870	2663881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010552	AAAAGC	2	12	2672908	2672919	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_010552	CAGCGC	2	12	2689875	2689886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010552	CGATAT	2	12	2726712	2726723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_010552	CCCCCG	2	12	2728420	2728431	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
147	NC_010552	GCCCGC	2	12	2748406	2748417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.