MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 chromosome 1

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010551	CCGGCC	2	12	50	61	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_010551	CGTTTT	2	12	82457	82468	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010551	GGCGCC	2	12	86335	86346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010551	ATGCGC	2	12	94282	94293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010551	GTTTTT	2	12	105468	105479	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010551	CGGGGG	2	12	105538	105549	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010551	TCGGCG	2	12	121997	122008	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010551	GGCACC	3	18	178231	178248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010551	GCCGGG	2	12	191169	191180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010551	TCGGTC	4	24	206354	206377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010551	GTCTCA	2	12	235465	235476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010551	GTGGCG	2	12	238583	238594	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010551	ATGGCG	2	12	238595	238606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010551	GCGGGC	2	12	280894	280905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010551	GATGCC	2	12	281081	281092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010551	TTTTTG	2	12	342151	342162	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010551	CTTTTG	2	12	381059	381070	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010551	GATTTT	2	12	413267	413278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010551	ACGCAA	2	12	427444	427455	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010551	GCCAGG	2	12	520964	520975	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010551	CTGCGC	2	12	588785	588796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010551	CGGCCC	2	12	593813	593824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_010551	GCAGGA	2	12	618374	618385	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010551	GGGGCG	2	12	674092	674103	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010551	CGGCGA	2	12	675589	675600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010551	GATTCG	2	12	676318	676329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010551	ACCGCG	2	12	686293	686304	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010551	CTGCCG	2	12	698621	698632	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010551	GCGGCC	2	12	701450	701461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010551	CGAAAT	2	12	721510	721521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010551	TGCCGG	2	12	727300	727311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010551	CCGCGG	2	12	738799	738810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010551	GATCGA	2	12	779305	779316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010551	AGTCAG	2	12	794904	794915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010551	CGACAC	2	12	798937	798948	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010551	GCGACA	2	12	803314	803325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010551	TCGCGG	2	12	807820	807831	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010551	AGCGAT	2	12	823017	823028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010551	CGGGCG	2	12	827600	827611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010551	CTTTTT	2	12	913080	913091	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010551	GTGATG	2	12	941046	941057	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010551	CGGATG	2	12	985690	985701	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010551	TTGCGC	2	12	986744	986755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010551	GAGCCT	2	12	1004436	1004447	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010551	TTGCGC	2	12	1085035	1085046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010551	TTTTGT	2	12	1095329	1095340	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010551	CGAAAA	2	12	1109793	1109804	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010551	TGCAGG	2	12	1116658	1116669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010551	CTTTTT	2	12	1116958	1116969	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010551	CTTTTC	2	12	1119636	1119647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010551	CGGGGC	2	12	1120280	1120291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010551	TTCCGT	2	12	1135746	1135757	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010551	GCGCCC	2	12	1144613	1144624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010551	ATGCGC	2	12	1145660	1145671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010551	CGGAAA	2	12	1186081	1186092	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010551	GCGGGA	2	12	1201205	1201216	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010551	CTCCGG	2	12	1325402	1325413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010551	TCACCC	2	12	1326285	1326296	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010551	GTTCAT	2	12	1377798	1377809	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010551	CGCACG	2	12	1391592	1391603	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010551	CGGCAG	2	12	1464123	1464134	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010551	TGAAGG	2	12	1470687	1470698	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010551	TCGATT	2	12	1502335	1502346	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010551	CCGCGC	2	12	1573202	1573213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010551	CGGAGT	2	12	1583450	1583461	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010551	GCCGAA	2	12	1632901	1632912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010551	TGCAGG	2	12	1650232	1650243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010551	TGCGGT	2	12	1662230	1662241	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010551	CACACG	3	18	1665463	1665480	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010551	CGGAGG	2	12	1665481	1665492	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010551	CGATAT	2	12	1698798	1698809	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010551	GCCGGC	2	12	1708991	1709002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010551	GCACCG	2	12	1781993	1782004	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010551	TGCGCG	2	12	1790836	1790847	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010551	ACAGGA	2	12	1816715	1816726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010551	ATTATG	2	12	1837537	1837548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010551	TGGTGT	2	12	1842066	1842077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010551	TTCGAT	2	12	1843238	1843249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010551	CCGCGC	2	12	1851430	1851441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010551	ATCGCG	2	12	1865506	1865517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010551	CCGGGC	2	12	1898093	1898104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010551	GTGAAG	2	12	1962015	1962026	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010551	TGCGGC	2	12	2036674	2036685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010551	CCCGGC	2	12	2041652	2041663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010551	ACCGAC	2	12	2083791	2083802	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010551	AACGGC	2	12	2090530	2090541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010551	GTCGCG	2	12	2178438	2178449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010551	CCGCGC	2	12	2220231	2220242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010551	CTGACG	2	12	2225459	2225470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010551	GCGGGC	2	12	2244874	2244885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010551	CAGAGG	2	12	2278042	2278053	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010551	TCCGTT	2	12	2282895	2282906	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010551	GCGGCC	2	12	2305300	2305311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010551	AAACGG	2	12	2326072	2326083	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010551	CGACGC	2	12	2344344	2344355	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010551	ATCGCA	2	12	2353375	2353386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010551	CATTCT	2	12	2361693	2361704	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010551	CGGCAG	2	12	2390561	2390572	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010551	CGGGCG	2	12	2449598	2449609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010551	CGGCCG	2	12	2488356	2488367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010551	GCGACT	2	12	2504995	2505006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010551	ACTTGA	2	12	2522257	2522268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010551	CGTAGA	2	12	2630939	2630950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_010551	GCCCGC	2	12	2642891	2642902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_010551	GCATCG	2	12	2645772	2645783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010551	ACGTGT	2	12	2663121	2663132	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_010551	GCCGGC	2	12	2672944	2672955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010551	CGCATC	2	12	2707625	2707636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_010551	TGCCGT	2	12	2713653	2713664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010551	CGAAGC	2	12	2718779	2718790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010551	CTTTTT	2	12	2718900	2718911	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_010551	CTCACG	2	12	2769799	2769810	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010551	GGCGCG	2	12	2788883	2788894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010551	CGCCGA	2	12	2799460	2799471	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010551	CGGAAC	2	12	2819444	2819455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010551	AAACGC	2	12	2823581	2823592	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010551	CCGGCC	2	12	2827587	2827598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010551	ACGGCA	2	12	2879416	2879427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010551	TTCGAA	2	12	2888805	2888816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010551	TGCAGT	2	12	2890390	2890401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010551	AGCGCC	2	12	2907485	2907496	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010551	TTTCAT	2	12	2913784	2913795	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010551	CCCGGC	2	12	2958848	2958859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010551	AGCGAA	2	12	2966332	2966343	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010551	CGCATG	2	12	2966354	2966365	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010551	GTAGTT	2	12	2971994	2972005	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010551	GTGCCG	2	12	2989187	2989198	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010551	GGCAAG	2	12	3008972	3008983	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010551	GCTGCC	2	12	3012969	3012980	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010551	TTTTTC	2	12	3020451	3020462	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_010551	CGGCCG	2	12	3025379	3025390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010551	TCGCTA	2	12	3027375	3027386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010551	CGTTTT	2	12	3038455	3038466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_010551	GGGGCC	2	12	3073718	3073729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010551	CGTGAC	2	12	3076281	3076292	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010551	TTGTCT	2	12	3083404	3083415	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_010551	TCCTTG	2	12	3114796	3114807	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010551	GTCGAC	2	12	3121401	3121412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010551	CTGAAA	2	12	3173682	3173693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_010551	CCGGCC	2	12	3195744	3195755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_010551	CCTCGT	2	12	3280233	3280244	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010551	CGTTTG	2	12	3290114	3290125	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_010551	GCGCCG	2	12	3295498	3295509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010551	CGGCCG	2	12	3321105	3321116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.