MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010547	TTTGAA	2	12	36912	36923	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010547	CCTGTA	2	12	70981	70992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010547	TGATAA	2	12	90509	90520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010547	ATTATC	3	18	94806	94823	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010547	TTAATT	2	12	100274	100285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010547	TATGAT	2	12	126824	126835	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010547	TATGAT	2	12	129412	129423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010547	GATAAC	2	12	137233	137244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010547	AACAAA	2	12	140979	140990	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010547	ATAAAA	2	12	171466	171477	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010547	TTAGCA	2	12	194528	194539	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010547	TCTTTT	2	12	199572	199583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010547	CTTTTT	2	12	287326	287337	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010547	AAAAAT	2	12	288135	288146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010547	CTATTA	2	12	288389	288400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010547	ATCTAA	2	12	327213	327224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010547	ATTAAT	2	12	331380	331391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010547	TATAAT	2	12	332742	332753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010547	AAGATA	2	12	358858	358869	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010547	CTAAAA	2	12	358880	358891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010547	AAGAAA	2	12	369648	369659	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010547	TTAATT	2	12	370305	370316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010547	AAATTA	2	12	374758	374769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010547	AAACAA	2	12	390181	390192	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010547	TTTGGA	2	12	404632	404643	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010547	TAACTT	2	12	410227	410238	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010547	ATTAAT	2	12	424303	424314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010547	TTAGTT	2	12	424569	424580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.