MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010547	TCTTA	2	10	126	135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010547	AGATA	2	10	1126	1135	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010547	TAAAA	2	10	9223	9232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010547	TTAGA	2	10	12052	12061	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010547	ACTTA	2	10	12078	12087	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010547	ACTTT	2	10	15248	15257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010547	AAATC	2	10	37130	37139	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010547	GATAA	2	10	38429	38438	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010547	CATTT	2	10	39664	39673	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010547	ATTAT	2	10	49518	49527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010547	AACAG	2	10	66329	66338	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_010547	ACATA	2	10	83580	83589	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010547	ATTAA	2	10	92681	92690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010547	TTAAA	2	10	93150	93159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010547	CAAAG	2	10	93187	93196	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010547	CCAAA	2	10	96979	96988	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_010547	TCCAC	2	10	101538	101547	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_010547	TAGCT	2	10	111322	111331	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010547	CAACT	2	10	114946	114955	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010547	AAGAG	2	10	118328	118337	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010547	CTTAC	2	10	118690	118699	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010547	GTCAT	2	10	119235	119244	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010547	CAATC	2	10	125237	125246	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_010547	ATAAC	2	10	152004	152013	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010547	GATAT	2	10	153801	153810	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010547	TAAAT	2	10	158965	158974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010547	CTTCT	2	10	191677	191686	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010547	ATCAA	2	10	191993	192002	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010547	TTTAA	2	10	252173	252182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010547	CAGAT	2	10	287169	287178	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010547	TGATT	2	10	287212	287221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010547	TAAAA	2	10	288013	288022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010547	AAGAA	2	10	288586	288595	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010547	GATTT	2	10	290405	290414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010547	ATTTA	2	10	291385	291394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010547	AGAGC	2	10	293036	293045	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010547	AATTA	2	10	303139	303148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010547	TATAT	2	10	308728	308737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010547	GTTTT	2	10	309659	309668	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010547	TGAGT	2	10	313262	313271	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010547	ACTTA	2	10	322903	322912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010547	CTTAA	2	10	322915	322924	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010547	TTATT	2	10	327926	327935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010547	AGAAA	2	10	347884	347893	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010547	AAAGT	2	10	349552	349561	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010547	TAAAA	2	10	349584	349593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010547	AGTTA	2	10	361633	361642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010547	TGATT	2	10	374797	374806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010547	TAATC	2	10	375860	375869	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010547	AATTA	2	10	401947	401956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010547	AAGTC	2	10	404608	404617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010547	AAATT	2	10	406980	406989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010547	GTTGA	2	10	423477	423486	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.