MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome linear

Total Repeats: 5105

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010547	GAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054854
2	NC_010547	TAA	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054854
3	NC_010547	GAC	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054854
4	NC_010547	ATA	2	6	643	648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054854
5	NC_010547	ACC	2	6	708	713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054854
6	NC_010547	ACC	2	6	752	757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054854
7	NC_010547	AAG	2	6	943	948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054854
8	NC_010547	CAA	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054855
9	NC_010547	CAA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054855
10	NC_010547	GCT	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054855
11	NC_010547	AGA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054855
12	NC_010547	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054855
13	NC_010547	AGA	2	6	1400	1405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054855
14	NC_010547	CAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054855
15	NC_010547	AGA	2	6	1466	1471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054855
16	NC_010547	ACA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054856
17	NC_010547	AAC	2	6	1593	1598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054856
18	NC_010547	TAA	2	6	1622	1627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054856
19	NC_010547	GAA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172054856
20	NC_010547	TGC	2	6	1757	1762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054856
21	NC_010547	TGG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054856
22	NC_010547	CAC	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054857
23	NC_010547	TAT	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054857
24	NC_010547	TAA	2	6	2416	2421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054857
25	NC_010547	TAT	2	6	2560	2565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054858
26	NC_010547	ATA	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054858
27	NC_010547	ACT	2	6	2795	2800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054858
28	NC_010547	CTA	2	6	2854	2859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054859
29	NC_010547	CAA	2	6	2907	2912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054859
30	NC_010547	ATT	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054859
31	NC_010547	TGA	2	6	2993	2998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054859
32	NC_010547	TTA	2	6	3009	3014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054859
33	NC_010547	TTC	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054859
34	NC_010547	ATT	2	6	3059	3064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054859
35	NC_010547	CAT	2	6	3236	3241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054859
36	NC_010547	ATT	2	6	3299	3304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054860
37	NC_010547	GGT	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054860
38	NC_010547	TAA	2	6	3429	3434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054860
39	NC_010547	ATA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054860
40	NC_010547	ATC	2	6	3494	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054860
41	NC_010547	ACA	3	9	3504	3512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054860
42	NC_010547	TTG	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054860
43	NC_010547	TTA	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054861
44	NC_010547	ATG	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054861
45	NC_010547	TAA	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054861
46	NC_010547	CCA	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054862
47	NC_010547	ATA	2	6	4266	4271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054862
48	NC_010547	TAT	2	6	4292	4297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054862
49	NC_010547	TAG	2	6	4339	4344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054862
50	NC_010547	CCT	2	6	4365	4370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054862
51	NC_010547	GTT	2	6	4371	4376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054862
52	NC_010547	CAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054862
53	NC_010547	CTG	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054862
54	NC_010547	TCC	3	9	4430	4438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054862
55	NC_010547	AAT	2	6	4442	4447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054862
56	NC_010547	ATA	2	6	4568	4573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054862
57	NC_010547	ATA	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054862
58	NC_010547	ATT	2	6	4686	4691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054862
59	NC_010547	TAA	2	6	4882	4887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054863
60	NC_010547	TTC	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
61	NC_010547	CAT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054863
62	NC_010547	TCT	3	9	4913	4921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
63	NC_010547	TCT	2	6	5113	5118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
64	NC_010547	ATC	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054863
65	NC_010547	TTG	2	6	5239	5244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054863
66	NC_010547	ATG	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054863
67	NC_010547	TAG	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054863
68	NC_010547	CTT	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
69	NC_010547	TTA	2	6	5327	5332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054863
70	NC_010547	GTT	2	6	5482	5487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054863
71	NC_010547	TCA	3	9	5558	5566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054863
72	NC_010547	TCT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054863
73	NC_010547	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054863
74	NC_010547	CAT	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054863
75	NC_010547	TTG	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054863
76	NC_010547	TGT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054863
77	NC_010547	ACG	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054863
78	NC_010547	GAT	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054863
79	NC_010547	CTT	2	6	6123	6128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054864
80	NC_010547	CAA	2	6	6148	6153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054864
81	NC_010547	TAG	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054864
82	NC_010547	TAA	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054864
83	NC_010547	TGA	2	6	6298	6303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054864
84	NC_010547	GAC	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054864
85	NC_010547	ATT	2	6	6457	6462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054864
86	NC_010547	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054864
87	NC_010547	TCT	2	6	6503	6508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054864
88	NC_010547	TTA	2	6	6539	6544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054864
89	NC_010547	GTT	2	6	6590	6595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054864
90	NC_010547	ATT	2	6	6628	6633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054864
91	NC_010547	CTC	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054864
92	NC_010547	GAT	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054864
93	NC_010547	GTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054864
94	NC_010547	TGC	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054865
95	NC_010547	GTG	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054865
96	NC_010547	GGT	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054865
97	NC_010547	CTA	2	6	7526	7531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054865
98	NC_010547	TCC	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172054865
99	NC_010547	ACC	2	6	7621	7626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172054865
100	NC_010547	CAT	2	6	7674	7679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054865
101	NC_010547	TGG	2	6	7757	7762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054865
102	NC_010547	ATG	2	6	7948	7953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054865
103	NC_010547	CTT	2	6	8108	8113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054865
104	NC_010547	CAT	2	6	8318	8323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054865
105	NC_010547	ACA	2	6	8367	8372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054865
106	NC_010547	GCT	2	6	8407	8412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054865
107	NC_010547	GCT	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172054865
108	NC_010547	AAT	2	6	8584	8589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054865
109	NC_010547	AAT	2	6	8659	8664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054865
110	NC_010547	TAA	2	6	8748	8753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054865
111	NC_010547	CTT	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054865
112	NC_010547	TCT	2	6	8905	8910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054865
113	NC_010547	TCT	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054865
114	NC_010547	TGT	2	6	8981	8986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172054865
115	NC_010547	CTA	2	6	9077	9082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054865
116	NC_010547	TGG	2	6	9471	9476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172054866
117	NC_010547	TAA	3	9	9499	9507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054866
118	NC_010547	TTC	2	6	10032	10037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172054867
119	NC_010547	TAA	2	6	10056	10061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054867
120	NC_010547	GAC	2	6	10118	10123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054867
121	NC_010547	AAC	2	6	10252	10257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054867
122	NC_010547	CAT	2	6	10281	10286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054867
123	NC_010547	CAA	2	6	10485	10490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172054868
124	NC_010547	ATT	2	6	10540	10545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172054868
125	NC_010547	TCA	2	6	10552	10557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172054868
126	NC_010547	TAA	2	6	10571	10576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054868
127	NC_010547	CAG	2	6	10719	10724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054868
128	NC_010547	GAT	2	6	10803	10808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172054868
129	NC_010547	CGA	3	9	11095	11103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172054869
130	NC_010547	AAT	2	6	11507	11512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172054869
131	NC_010547	GAG	2	6	11576	11581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172054869
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