MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 2744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010546	CAAAA	2	10	1508	1517	80 %	0 %	0 %	20 %	172034919
2	NC_010546	CCATA	2	10	3213	3222	40 %	20 %	0 %	40 %	172034921
3	NC_010546	AACGA	2	10	4066	4075	60 %	0 %	20 %	20 %	172034921
4	NC_010546	TAAAT	2	10	7147	7156	60 %	40 %	0 %	0 %	172034923
5	NC_010546	TTGGG	2	10	7202	7211	0 %	40 %	60 %	0 %	172034923
6	NC_010546	TTTTG	2	10	10097	10106	0 %	80 %	20 %	0 %	172034931
7	NC_010546	GCCAA	2	10	10275	10284	40 %	0 %	20 %	40 %	172034931
8	NC_010546	TCATT	2	10	10366	10375	20 %	60 %	0 %	20 %	172034931
9	NC_010546	AATGA	2	10	11180	11189	60 %	20 %	20 %	0 %	172034932
10	NC_010546	AGAAA	2	10	14090	14099	80 %	0 %	20 %	0 %	172034934
11	NC_010546	AGAAA	2	10	16263	16272	80 %	0 %	20 %	0 %	172034936
12	NC_010546	GATAG	2	10	17149	17158	40 %	20 %	40 %	0 %	172034937
13	NC_010546	AACTT	2	10	22321	22330	40 %	40 %	0 %	20 %	172034944
14	NC_010546	TAAAG	2	10	22514	22523	60 %	20 %	20 %	0 %	172034945
15	NC_010546	GCATC	2	10	23725	23734	20 %	20 %	20 %	40 %	172034946
16	NC_010546	CTTGA	2	10	27662	27671	20 %	40 %	20 %	20 %	172034949
17	NC_010546	CTAAT	2	10	27676	27685	40 %	40 %	0 %	20 %	172034949
18	NC_010546	AATCA	2	10	29817	29826	60 %	20 %	0 %	20 %	172034952
19	NC_010546	TGAGA	2	10	31052	31061	40 %	20 %	40 %	0 %	172034953
20	NC_010546	AACCC	2	10	31328	31337	40 %	0 %	0 %	60 %	172034953
21	NC_010546	AAACC	2	10	32566	32575	60 %	0 %	0 %	40 %	172034956
22	NC_010546	AATAT	2	10	33009	33018	60 %	40 %	0 %	0 %	172034956
23	NC_010546	CTGCT	2	10	33461	33470	0 %	40 %	20 %	40 %	172034957
24	NC_010546	TTTAT	2	10	34654	34663	20 %	80 %	0 %	0 %	172034958
25	NC_010546	TACTC	2	10	38670	38679	20 %	40 %	0 %	40 %	172034962
26	NC_010546	ATGGC	2	10	40768	40777	20 %	20 %	40 %	20 %	172034968
27	NC_010546	CCGTC	2	10	43823	43832	0 %	20 %	20 %	60 %	172034971
28	NC_010546	TTGGG	3	15	45427	45441	0 %	40 %	60 %	0 %	172034972
29	NC_010546	CTTTA	2	10	45824	45833	20 %	60 %	0 %	20 %	172034972
30	NC_010546	ATTAG	2	10	47448	47457	40 %	40 %	20 %	0 %	172034973
31	NC_010546	TAAAT	2	10	50848	50857	60 %	40 %	0 %	0 %	172034977
32	NC_010546	CAGAA	2	10	50937	50946	60 %	0 %	20 %	20 %	172034977
33	NC_010546	GGAAT	2	10	51774	51783	40 %	20 %	40 %	0 %	172034978
34	NC_010546	CAGCG	2	10	53396	53405	20 %	0 %	40 %	40 %	172034979
35	NC_010546	TCCCA	2	10	54344	54353	20 %	20 %	0 %	60 %	172034981
36	NC_010546	TCCAA	2	10	56069	56078	40 %	20 %	0 %	40 %	172034982
37	NC_010546	TCTAT	2	10	62804	62813	20 %	60 %	0 %	20 %	172034987
38	NC_010546	GTCCT	2	10	67716	67725	0 %	40 %	20 %	40 %	172034994
39	NC_010546	ATTTA	2	10	69462	69471	40 %	60 %	0 %	0 %	172034994
40	NC_010546	CAGGA	2	10	72952	72961	40 %	0 %	40 %	20 %	172034995
41	NC_010546	AAAAC	2	10	73496	73505	80 %	0 %	0 %	20 %	172034995
42	NC_010546	CATCG	2	10	75704	75713	20 %	20 %	20 %	40 %	172034997
43	NC_010546	GTTTA	2	10	82975	82984	20 %	60 %	20 %	0 %	172035006
44	NC_010546	TTTGT	2	10	84751	84760	0 %	80 %	20 %	0 %	172035008
45	NC_010546	TTAAT	2	10	85616	85625	40 %	60 %	0 %	0 %	172035009
46	NC_010546	TCCTT	2	10	89579	89588	0 %	60 %	0 %	40 %	172035012
47	NC_010546	AGGAA	2	10	89885	89894	60 %	0 %	40 %	0 %	172035013
48	NC_010546	TTACG	2	10	91222	91231	20 %	40 %	20 %	20 %	172035015
49	NC_010546	TACCA	2	10	96622	96631	40 %	20 %	0 %	40 %	172035024
50	NC_010546	AATTA	2	10	97238	97247	60 %	40 %	0 %	0 %	172035025
51	NC_010546	CCCGT	2	10	99433	99442	0 %	20 %	20 %	60 %	172035026
52	NC_010546	TAAGC	2	10	103866	103875	40 %	20 %	20 %	20 %	172035030
53	NC_010546	CCTAC	2	10	104217	104226	20 %	20 %	0 %	60 %	172035030
54	NC_010546	TGGGA	2	10	107712	107721	20 %	20 %	60 %	0 %	172035031
55	NC_010546	CTTAA	2	10	109035	109044	40 %	40 %	0 %	20 %	172035032
56	NC_010546	TCGTT	2	10	109746	109755	0 %	60 %	20 %	20 %	172035033
57	NC_010546	ATTTT	2	10	110718	110727	20 %	80 %	0 %	0 %	172035034
58	NC_010546	ATATT	2	10	114209	114218	40 %	60 %	0 %	0 %	172035039
59	NC_010546	TGGGG	2	10	117751	117760	0 %	20 %	80 %	0 %	172035043
60	NC_010546	GATGG	2	10	118633	118642	20 %	20 %	60 %	0 %	172035043
61	NC_010546	GCCAA	2	10	118648	118657	40 %	0 %	20 %	40 %	172035043
62	NC_010546	AATTT	2	10	121616	121625	40 %	60 %	0 %	0 %	172035048
63	NC_010546	ATCTT	2	10	123418	123427	20 %	60 %	0 %	20 %	172035050
64	NC_010546	ATTTT	2	10	124103	124112	20 %	80 %	0 %	0 %	172035051
65	NC_010546	AACGT	2	10	124908	124917	40 %	20 %	20 %	20 %	172035052
66	NC_010546	AGAAA	2	10	125683	125692	80 %	0 %	20 %	0 %	172035053
67	NC_010546	CTTCT	2	10	129742	129751	0 %	60 %	0 %	40 %	172035058
68	NC_010546	AAGAT	2	10	129789	129798	60 %	20 %	20 %	0 %	172035058
69	NC_010546	AAAGG	2	10	130718	130727	60 %	0 %	40 %	0 %	172035059
70	NC_010546	AGGTA	2	10	131098	131107	40 %	20 %	40 %	0 %	172035059
71	NC_010546	TTAGA	2	10	133486	133495	40 %	40 %	20 %	0 %	172035061
72	NC_010546	AAAAG	2	10	134112	134121	80 %	0 %	20 %	0 %	172035061
73	NC_010546	TTTTG	2	10	138295	138304	0 %	80 %	20 %	0 %	172035065
74	NC_010546	TTGAT	2	10	145270	145279	20 %	60 %	20 %	0 %	172035071
75	NC_010546	TGTTA	2	10	148792	148801	20 %	60 %	20 %	0 %	172035075
76	NC_010546	GAAAA	2	10	150039	150048	80 %	0 %	20 %	0 %	172035076
77	NC_010546	TTTCT	2	10	150211	150220	0 %	80 %	0 %	20 %	172035077
78	NC_010546	TTGTT	2	10	152581	152590	0 %	80 %	20 %	0 %	172035081
79	NC_010546	AGAAT	2	10	152592	152601	60 %	20 %	20 %	0 %	172035081
80	NC_010546	AATTG	2	10	152794	152803	40 %	40 %	20 %	0 %	172035081
81	NC_010546	AAGAG	2	10	153098	153107	60 %	0 %	40 %	0 %	172035081
82	NC_010546	TATCA	2	10	154524	154533	40 %	40 %	0 %	20 %	172035082
83	NC_010546	AAAAT	2	10	155321	155330	80 %	20 %	0 %	0 %	172035083
84	NC_010546	TAAAT	2	10	156108	156117	60 %	40 %	0 %	0 %	172035083
85	NC_010546	GCTAA	2	10	156150	156159	40 %	20 %	20 %	20 %	172035083
86	NC_010546	AGATT	2	10	156828	156837	40 %	40 %	20 %	0 %	172035084
87	NC_010546	CAATT	2	10	157398	157407	40 %	40 %	0 %	20 %	172035085
88	NC_010546	TGGTA	2	10	158060	158069	20 %	40 %	40 %	0 %	172035086
89	NC_010546	TGATG	2	10	159587	159596	20 %	40 %	40 %	0 %	172035088
90	NC_010546	CCTTT	2	10	162717	162726	0 %	60 %	0 %	40 %	172035091
91	NC_010546	GTGAC	2	10	163937	163946	20 %	20 %	40 %	20 %	172035092
92	NC_010546	TCAAC	2	10	167986	167995	40 %	20 %	0 %	40 %	172035097
93	NC_010546	GGATT	2	10	168228	168237	20 %	40 %	40 %	0 %	172035097
94	NC_010546	CTCGC	2	10	172787	172796	0 %	20 %	20 %	60 %	172035103
95	NC_010546	GCACG	2	10	173207	173216	20 %	0 %	40 %	40 %	172035103
96	NC_010546	TCAAC	2	10	174017	174026	40 %	20 %	0 %	40 %	172035104
97	NC_010546	CTTCC	2	10	177471	177480	0 %	40 %	0 %	60 %	172035110
98	NC_010546	CTTAA	2	10	178046	178055	40 %	40 %	0 %	20 %	172035110
99	NC_010546	ATTTT	2	10	179333	179342	20 %	80 %	0 %	0 %	172035111
100	NC_010546	TTGTC	2	10	182011	182020	0 %	60 %	20 %	20 %	172035112
101	NC_010546	ATTAA	2	10	183203	183212	60 %	40 %	0 %	0 %	172035113
102	NC_010546	AGGGA	2	10	185042	185051	40 %	0 %	60 %	0 %	172035115
103	NC_010546	TAAAA	2	10	186061	186070	80 %	20 %	0 %	0 %	172035116
104	NC_010546	TAAAT	2	10	186331	186340	60 %	40 %	0 %	0 %	172035116
105	NC_010546	GAATT	2	10	186397	186406	40 %	40 %	20 %	0 %	172035116
106	NC_010546	AATAG	2	10	189051	189060	60 %	20 %	20 %	0 %	172035118
107	NC_010546	GAGTT	2	10	191274	191283	20 %	40 %	40 %	0 %	172035120
108	NC_010546	TAAAT	2	10	195867	195876	60 %	40 %	0 %	0 %	172035124
109	NC_010546	CAACA	2	10	197212	197221	60 %	0 %	0 %	40 %	172035125
110	NC_010546	TAATA	2	10	197751	197760	60 %	40 %	0 %	0 %	172035125
111	NC_010546	AGGCA	2	10	198513	198522	40 %	0 %	40 %	20 %	172035126
112	NC_010546	AAATT	2	10	202259	202268	60 %	40 %	0 %	0 %	172035128
113	NC_010546	ACTTA	2	10	202423	202432	40 %	40 %	0 %	20 %	172035129
114	NC_010546	AGAAT	2	10	202696	202705	60 %	20 %	20 %	0 %	172035129
115	NC_010546	TAGAA	2	10	203217	203226	60 %	20 %	20 %	0 %	172035129
116	NC_010546	AAAAT	2	10	205149	205158	80 %	20 %	0 %	0 %	172035130
117	NC_010546	TCTCA	2	10	208437	208446	20 %	40 %	0 %	40 %	172035136
118	NC_010546	CTTCC	2	10	208909	208918	0 %	40 %	0 %	60 %	172035136
119	NC_010546	TTTAG	2	10	209451	209460	20 %	60 %	20 %	0 %	172035136
120	NC_010546	AGGCA	2	10	209983	209992	40 %	0 %	40 %	20 %	172035136
121	NC_010546	GGATG	2	10	210042	210051	20 %	20 %	60 %	0 %	172035136
122	NC_010546	GCTAT	2	10	211945	211954	20 %	40 %	20 %	20 %	172035138
123	NC_010546	AACAT	2	10	213787	213796	60 %	20 %	0 %	20 %	172035141
124	NC_010546	TTGGG	2	10	214521	214530	0 %	40 %	60 %	0 %	172035142
125	NC_010546	CTATA	2	10	216970	216979	40 %	40 %	0 %	20 %	172035146
126	NC_010546	GTATA	2	10	219301	219310	40 %	40 %	20 %	0 %	172035150
127	NC_010546	AATAA	2	10	219494	219503	80 %	20 %	0 %	0 %	172035150
128	NC_010546	ATTTT	2	10	220372	220381	20 %	80 %	0 %	0 %	172035150
129	NC_010546	CCATT	2	10	221859	221868	20 %	40 %	0 %	40 %	172035151
130	NC_010546	TTTAT	2	10	223385	223394	20 %	80 %	0 %	0 %	172035152
131	NC_010546	TGGGT	2	10	224562	224571	0 %	40 %	60 %	0 %	172035154
132	NC_010546	ATTAA	2	10	232841	232850	60 %	40 %	0 %	0 %	172035158
133	NC_010546	TCATA	2	10	232978	232987	40 %	40 %	0 %	20 %	172035159
134	NC_010546	TAAAA	2	10	233240	233249	80 %	20 %	0 %	0 %	172035159
135	NC_010546	ATAAA	2	10	233843	233852	80 %	20 %	0 %	0 %	172035159
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257	NC_010546	GGTTA	2	10	493436	493445	20 %	40 %	40 %	0 %	172035410
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261	NC_010546	ACTAA	2	10	496274	496283	60 %	20 %	0 %	20 %	172035413
262	NC_010546	TAAAT	2	10	497402	497411	60 %	40 %	0 %	0 %	172035414
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