MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 62712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010546	TCT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
2	NC_010546	AAT	2	6	136	141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
3	NC_010546	TCC	2	6	253	258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
4	NC_010546	GTT	2	6	285	290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034918
5	NC_010546	TCC	2	6	308	313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
6	NC_010546	TCT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
7	NC_010546	CCA	2	6	458	463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034918
8	NC_010546	TCA	3	9	642	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034918
9	NC_010546	AAT	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
10	NC_010546	TTC	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
11	NC_010546	AAT	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
12	NC_010546	TCC	2	6	809	814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
13	NC_010546	CGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034918
14	NC_010546	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
15	NC_010546	AGA	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034919
16	NC_010546	TCT	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034919
17	NC_010546	AAT	2	6	1221	1226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034919
18	NC_010546	GTC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
19	NC_010546	TGA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034919
20	NC_010546	GCA	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034919
21	NC_010546	CTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
22	NC_010546	AAC	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034919
23	NC_010546	TCC	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034919
24	NC_010546	GTT	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034919
25	NC_010546	GTC	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
26	NC_010546	GCT	2	6	1876	1881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
27	NC_010546	ATC	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034919
28	NC_010546	CTG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034920
29	NC_010546	CAA	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034920
30	NC_010546	TCC	2	6	2222	2227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034920
31	NC_010546	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
32	NC_010546	TAA	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
33	NC_010546	TAA	2	6	2844	2849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
34	NC_010546	CCA	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
35	NC_010546	ATG	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034921
36	NC_010546	CTA	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
37	NC_010546	TAG	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034921
38	NC_010546	GAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034921
39	NC_010546	ATA	2	6	2990	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
40	NC_010546	ATT	2	6	3025	3030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
41	NC_010546	CCA	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
42	NC_010546	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
43	NC_010546	CCA	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
44	NC_010546	GCT	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
45	NC_010546	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
46	NC_010546	AAT	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
47	NC_010546	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
48	NC_010546	CTA	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
49	NC_010546	GCA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
50	NC_010546	AAT	3	9	4255	4263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
51	NC_010546	GTT	2	6	4351	4356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034921
52	NC_010546	ATC	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
53	NC_010546	CAC	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
54	NC_010546	ATC	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
55	NC_010546	TCA	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
56	NC_010546	AAC	2	6	4550	4555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034921
57	NC_010546	AGC	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
58	NC_010546	CTG	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
59	NC_010546	ATC	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
60	NC_010546	ACC	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
61	NC_010546	TAA	2	6	4918	4923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
62	NC_010546	GCC	2	6	4930	4935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034921
63	NC_010546	GCT	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
64	NC_010546	TGT	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034921
65	NC_010546	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
66	NC_010546	GAG	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034921
67	NC_010546	TCT	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034921
68	NC_010546	AAG	2	6	5602	5607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034921
69	NC_010546	CCA	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
70	NC_010546	CAC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
71	NC_010546	AGC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034922
72	NC_010546	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
73	NC_010546	CTG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034922
74	NC_010546	TCA	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
75	NC_010546	CCG	2	6	6026	6031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034922
76	NC_010546	GTT	2	6	6191	6196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034922
77	NC_010546	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034922
78	NC_010546	ACC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
79	NC_010546	TCA	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
80	NC_010546	TCA	3	9	6428	6436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
81	NC_010546	GAG	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034923
82	NC_010546	CTT	2	6	6666	6671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034923
83	NC_010546	TAA	2	6	6697	6702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
84	NC_010546	TGA	3	9	6716	6724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
85	NC_010546	GAT	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
86	NC_010546	TGT	2	6	6926	6931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034923
87	NC_010546	ACC	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034923
88	NC_010546	ATA	2	6	6967	6972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
89	NC_010546	ATG	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
90	NC_010546	CAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034923
91	NC_010546	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
92	NC_010546	AAT	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
93	NC_010546	CAA	2	6	7422	7427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034924
94	NC_010546	CCT	2	6	7452	7457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034924
95	NC_010546	ATC	2	6	7501	7506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034924
96	NC_010546	ATT	2	6	7528	7533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034924
97	NC_010546	ATC	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034924
98	NC_010546	ATT	2	6	7616	7621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034924
99	NC_010546	TGC	2	6	7877	7882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034925
100	NC_010546	TAA	2	6	7907	7912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034925
101	NC_010546	ATT	2	6	7931	7936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034925
102	NC_010546	AGA	2	6	8004	8009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034925
103	NC_010546	TGT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034925
104	NC_010546	CAA	2	6	8104	8109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034925
105	NC_010546	GTT	3	9	8130	8138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034926
106	NC_010546	AAT	2	6	8174	8179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034926
107	NC_010546	GTT	2	6	8193	8198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034926
108	NC_010546	TCG	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
109	NC_010546	GCT	2	6	8225	8230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
110	NC_010546	ACT	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034926
111	NC_010546	CTT	2	6	8274	8279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034926
112	NC_010546	GTC	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034926
113	NC_010546	CAT	2	6	8540	8545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034927
114	NC_010546	TAA	2	6	8715	8720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034927
115	NC_010546	GTT	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034928
116	NC_010546	CGG	2	6	9019	9024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034928
117	NC_010546	ATG	2	6	9137	9142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034928
118	NC_010546	TAG	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034929
119	NC_010546	GAA	2	6	9346	9351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034929
120	NC_010546	TTG	2	6	9398	9403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034929
121	NC_010546	ATT	2	6	9472	9477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034929
122	NC_010546	GTT	2	6	9483	9488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034929
123	NC_010546	GAT	2	6	9613	9618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034929
124	NC_010546	GGA	2	6	9642	9647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034929
125	NC_010546	TGA	2	6	9821	9826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034929
126	NC_010546	ATT	2	6	9841	9846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034929
127	NC_010546	CAA	2	6	10131	10136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034931
128	NC_010546	ATA	2	6	10294	10299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034931
129	NC_010546	TTA	2	6	10412	10417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034931
130	NC_010546	GGT	2	6	10462	10467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034931
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