MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium urealyticum DSM 7109 chromosome

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010545	GTCGAC	2	12	8105	8116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010545	GGGGGT	2	12	23629	23640	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010545	GGCAGC	2	12	25008	25019	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010545	GTGGCC	2	12	51849	51860	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010545	AACCCG	2	12	92132	92143	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010545	GTTGTG	2	12	130584	130595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010545	AGCGAA	2	12	133721	133732	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010545	CCCGTA	2	12	134498	134509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010545	GCCGGG	2	12	143335	143346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010545	AGGGTA	2	12	312427	312438	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010545	CACAAT	2	12	328616	328627	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010545	TTCGGT	2	12	329663	329674	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010545	CCTTCC	2	12	330073	330084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010545	TTGCTG	2	12	418108	418119	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010545	CTTACC	2	12	428027	428038	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010545	GGGAAC	2	12	433718	433729	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010545	AAAGGT	2	12	433739	433750	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010545	TTGCTA	2	12	443514	443525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010545	GTGGCC	2	12	443556	443567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010545	GAACGG	2	12	477868	477879	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010545	GTGGGG	2	12	489680	489691	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010545	GGGGCA	2	12	489729	489740	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010545	GGTTCG	2	12	515327	515338	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010545	GTTAAA	2	12	659379	659390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010545	GCCGTG	2	12	681728	681739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010545	AGGGGC	2	12	694495	694506	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010545	TGCCCA	2	12	705104	705115	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010545	CAGGGC	2	12	715398	715409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010545	GCACTT	2	12	747376	747387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010545	CAAGGA	2	12	766100	766111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010545	AAGCAG	2	12	809948	809959	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010545	GCCGGA	2	12	877945	877956	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010545	TGGCTG	2	12	884246	884257	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010545	CGGCCT	2	12	884390	884401	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010545	CTCGGA	2	12	884545	884556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010545	GGGTTT	2	12	960199	960210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010545	CGTGGG	2	12	1157408	1157419	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010545	CAACCT	2	12	1198830	1198841	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010545	AAGTTC	2	12	1265871	1265882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010545	TTAACA	2	12	1265887	1265898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010545	TACGGG	2	12	1302926	1302937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010545	TTCGCT	2	12	1303702	1303713	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010545	CCACAA	2	12	1306824	1306835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010545	CTACCC	2	12	1308703	1308714	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010545	CCCCAC	2	12	1436033	1436044	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
46	NC_010545	ACCCGA	2	12	1459991	1460002	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010545	CCCGAC	2	12	1510711	1510722	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010545	CCCGAC	2	12	1510776	1510787	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010545	CCCGAC	2	12	1510860	1510871	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010545	CCCGAC	2	12	1510879	1510890	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010545	CCCGAC	2	12	1510898	1510909	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010545	CCCAGC	2	12	1516196	1516207	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010545	CGGCGT	2	12	1519457	1519468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010545	TCACCC	2	12	1533792	1533803	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010545	AGCCTC	2	12	1622065	1622076	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010545	CCGGGC	2	12	1635562	1635573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010545	TTGGTG	2	12	1658774	1658785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010545	TCACCC	2	12	1669275	1669286	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010545	CCCCGC	2	12	1684873	1684884	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_010545	CCGCCC	2	12	1755895	1755906	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
61	NC_010545	TCGCAA	2	12	1780865	1780876	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010545	CGCCCA	2	12	1802800	1802811	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010545	CTGCCG	2	12	1812444	1812455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010545	TACGGG	2	12	1851446	1851457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010545	TTCGCT	2	12	1852223	1852234	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010545	AGAAAA	2	12	1918918	1918929	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010545	GGCCTA	2	12	1945567	1945578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010545	GTTTTT	2	12	1946212	1946223	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010545	CCCCTC	2	12	1988343	1988354	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_010545	GCTTCG	2	12	2026528	2026539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010545	GCCCAG	2	12	2043378	2043389	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010545	CACCAA	2	12	2049934	2049945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010545	TGAGAG	2	12	2070532	2070543	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010545	GCTGGG	2	12	2084187	2084198	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010545	GGCGCT	2	12	2100354	2100365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010545	AGCGCC	2	12	2111610	2111621	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010545	GACGTC	2	12	2167757	2167768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010545	AGGCGC	2	12	2198124	2198135	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010545	CCCCGC	2	12	2214704	2214715	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_010545	TTTTTA	2	12	2226093	2226104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010545	ATCGCC	2	12	2268672	2268683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010545	GGGGCT	2	12	2269836	2269847	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010545	CACAGC	2	12	2284747	2284758	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010545	ACCGCG	2	12	2284866	2284877	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010545	CCGAAC	2	12	2288463	2288474	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010545	CGCCCC	2	12	2291573	2291584	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
87	NC_010545	CCCTTC	2	12	2308363	2308374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_010545	GCCCCC	2	12	2322838	2322849	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
89	NC_010545	CCCGCG	2	12	2333272	2333283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.