MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Phytoplasma australiense

Total Repeats: 613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010544	ATTGAA	2	12	223	234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	197294170
2	NC_010544	AAATTA	2	12	1742	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197294171
3	NC_010544	AATAAA	2	12	4000	4011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010544	TGCTGG	2	12	4607	4618	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010544	ATAAAA	2	12	5957	5968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	197294173
6	NC_010544	CGTAAA	2	12	8093	8104	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010544	AAATGA	2	12	9108	9119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197294174
8	NC_010544	TGATAT	2	12	10429	10440	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197294175
9	NC_010544	TTTTTC	2	12	13360	13371	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	197294179
10	NC_010544	AAAATA	2	12	15609	15620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	197294180
11	NC_010544	TATTTT	2	12	16098	16109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010544	CTTTAT	2	12	17898	17909	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010544	TTGCTT	2	12	18361	18372	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010544	AAATTT	2	12	18490	18501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010544	TTTTAT	2	12	18694	18705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010544	AAACAT	2	12	23293	23304	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	197294185
17	NC_010544	TATTTT	2	12	24018	24029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197294186
18	NC_010544	TAAATT	2	12	25986	25997	50 %	50 %	0 %	0 %	197294187
19	NC_010544	ATCTTT	2	12	27105	27116	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	197294188
20	NC_010544	TTTTCC	2	12	27155	27166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197294188
21	NC_010544	AGATTC	2	12	27471	27482	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197294188
22	NC_010544	TTTTCT	2	12	27778	27789	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	197294188
23	NC_010544	CTAAAC	2	12	28698	28709	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197294189
24	NC_010544	AAATAG	2	12	29798	29809	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197294190
25	NC_010544	TTATTT	2	12	30034	30045	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197294190
26	NC_010544	ATAATT	2	12	31308	31319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010544	AAACCA	2	12	32349	32360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197294192
28	NC_010544	TGCTTC	2	12	33005	33016	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	197294192
29	NC_010544	CTGTTA	2	12	33025	33036	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197294192
30	NC_010544	TGTTCT	2	12	33266	33277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197294192
31	NC_010544	TAATTT	2	12	35923	35934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010544	TTATTT	2	12	36552	36563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010544	GATTTG	2	12	38048	38059	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010544	TTTACC	2	12	38118	38129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010544	TTTTAT	2	12	38846	38857	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010544	ACTCAA	2	12	44621	44632	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197294200
37	NC_010544	AATTTT	2	12	45447	45458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197294201
38	NC_010544	CAAATC	2	12	46869	46880	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197294205
39	NC_010544	AATTAA	2	12	48984	48995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010544	AAAGAA	2	12	50935	50946	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010544	AAATAA	2	12	51357	51368	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010544	TAAAAA	2	12	52847	52858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010544	AAATTA	2	12	54074	54085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010544	AAAAGA	2	12	54527	54538	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010544	ACTGGT	2	12	55551	55562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010544	ATTTTT	2	12	56894	56905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010544	GTTGAA	2	12	62152	62163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197294209
48	NC_010544	GATTCT	2	12	62248	62259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197294209
49	NC_010544	TTGCTT	2	12	66994	67005	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197294211
50	NC_010544	CCTTAA	2	12	67798	67809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197294211
51	NC_010544	CCAAAA	2	12	67998	68009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010544	ACCAGT	2	12	68809	68820	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197294212
53	NC_010544	TAATTT	2	12	70285	70296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197294213
54	NC_010544	TTATTT	2	12	70852	70863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010544	TTTTTC	2	12	72235	72246	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010544	TTCTTT	2	12	73882	73893	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010544	TTGAGT	2	12	78484	78495	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197294218
58	NC_010544	ATTCTT	2	12	80414	80425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	197294220
59	NC_010544	AAATAA	2	12	83356	83367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010544	CCTTTA	2	12	84502	84513	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010544	ATTATA	2	12	85534	85545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010544	TTAAAA	2	12	86443	86454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010544	AAAAAC	2	12	89023	89034	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010544	ATCTAA	2	12	90828	90839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	197294225
65	NC_010544	ATTTGG	2	12	91075	91086	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197294225
66	NC_010544	TCTTAT	2	12	91416	91427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_010544	TCTAAA	2	12	91937	91948	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010544	TTTTAA	2	12	93529	93540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197294227
69	NC_010544	AAAATA	2	12	94771	94782	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010544	CCAAAA	3	18	96888	96905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197294231
71	NC_010544	TTCTTT	2	12	97317	97328	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	197294231
72	NC_010544	TTTTTA	2	12	99114	99125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010544	ATAAAT	2	12	100777	100788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197294233
74	NC_010544	TAAAAA	2	12	100866	100877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010544	AAAGTT	2	12	103413	103424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010544	TGAAAT	2	12	105131	105142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	197294236
77	NC_010544	TTAAAA	2	12	106862	106873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197294237
78	NC_010544	AGAAAG	2	12	107613	107624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197294239
79	NC_010544	TTAGAA	2	12	108195	108206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	197294240
80	NC_010544	TTTTGG	2	12	108622	108633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197294240
81	NC_010544	GATTTG	2	12	110259	110270	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010544	TTTACC	2	12	110329	110340	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010544	TTTTAT	2	12	111065	111076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010544	AAAATT	2	12	114559	114570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197294242
85	NC_010544	AATTAG	2	12	116256	116267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	197294245
86	NC_010544	ATCATT	2	12	117033	117044	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010544	AAATTT	2	12	120368	120379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010544	ATATTT	2	12	120396	120407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010544	ATTTTT	2	12	123251	123262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197294249
90	NC_010544	GCAGTT	2	12	123451	123462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197294250
91	NC_010544	TAATCT	2	12	124756	124767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	197294251
92	NC_010544	TTGGTG	2	12	125023	125034	0 %	50 %	50 %	0 %	197294251
93	NC_010544	AGCTCA	2	12	125603	125614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197294251
94	NC_010544	ATATTT	2	12	125734	125745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197294251
95	NC_010544	CTATTG	2	12	127128	127139	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197294252
96	NC_010544	ATTTTA	2	12	127514	127525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197294252
97	NC_010544	TTTCTT	2	12	128366	128377	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_010544	GAAAAA	2	12	130709	130720	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010544	GCACAA	2	12	131048	131059	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010544	TTTGTT	2	12	135998	136009	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010544	GAAAAA	2	12	138226	138237	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	197294260
102	NC_010544	TTTTTA	2	12	139607	139618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010544	TTGTTT	2	12	140766	140777	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010544	TTCATG	2	12	141988	141999	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197294262
105	NC_010544	TACATA	2	12	144951	144962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010544	ACTTCA	2	12	149300	149311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197294266
107	NC_010544	TTTTTC	2	12	150218	150229	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010544	TAATTT	2	12	150620	150631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197294267
109	NC_010544	AATCAA	2	12	152581	152592	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	197294269
110	NC_010544	TTTCTT	3	18	156041	156058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	197294272
111	NC_010544	CAGGAA	2	12	158016	158027	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	197294273
112	NC_010544	TGTTAA	2	12	159750	159761	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010544	AAATCC	2	12	160384	160395	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010544	TTATTT	2	12	161023	161034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197294275
115	NC_010544	AGAATT	2	12	161145	161156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	197294275
116	NC_010544	TATTAA	2	12	162558	162569	50 %	50 %	0 %	0 %	197294275
117	NC_010544	GCAAAA	2	12	163056	163067	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	197294275
118	NC_010544	ATGTAT	2	12	163332	163343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197294275
119	NC_010544	GTTTTT	2	12	164143	164154	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010544	CTTTTT	2	12	164561	164572	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_010544	TATTTT	2	12	166845	166856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197294277
122	NC_010544	AACAAA	2	12	169288	169299	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010544	TTGTTT	2	12	169523	169534	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	197294279
124	NC_010544	AAAATA	2	12	169889	169900	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	197294279
125	NC_010544	ATCACA	2	12	170630	170641	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197294279
126	NC_010544	AATAGG	2	12	170699	170710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	197294279
127	NC_010544	ATAACC	2	12	172360	172371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197294280
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246	NC_010544	TTTTCT	2	12	326367	326378	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
247	NC_010544	TTTCGG	2	12	327018	327029	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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250	NC_010544	TTTGAT	2	12	336154	336165	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	197294396
251	NC_010544	TAATTT	2	12	336393	336404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197294396
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253	NC_010544	TTTCTT	2	12	337610	337621	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_010544	TTTGTT	2	12	338087	338098	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	197294398
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288	NC_010544	TACATA	2	12	396940	396951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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487	NC_010544	TTTGTT	2	12	674303	674314	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	197294707
488	NC_010544	TTGGTT	2	12	674580	674591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197294707
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499	NC_010544	TAAAAA	2	12	689147	689158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	197294713
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