MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid D

Total Repeats: 13

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010543	TGAGT	2	10	504	513	20 %	40 %	40 %	0 %	172034906
2	NC_010543	TGCCG	2	10	636	645	0 %	20 %	40 %	40 %	172034906
3	NC_010543	CATTA	2	10	1417	1426	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010543	TTAAA	2	10	3551	3560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010543	GACAA	2	10	4457	4466	60 %	0 %	20 %	20 %	172034910
6	NC_010543	TTGTT	2	10	4948	4957	0 %	80 %	20 %	0 %	172034910
7	NC_010543	CCTTG	2	10	5298	5307	0 %	40 %	20 %	40 %	172034910
8	NC_010543	TAAAT	2	10	7008	7017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010543	AGTTT	2	10	7056	7065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010543	ATTTT	2	10	7489	7498	20 %	80 %	0 %	0 %	172034913
11	NC_010543	AGTAA	2	10	7959	7968	60 %	20 %	20 %	0 %	172034914
12	NC_010543	TTGTA	2	10	8305	8314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010543	GTGTT	2	10	8531	8540	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.