MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid D

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010543	GGCT	2	8	420	427	0 %	25 %	50 %	25 %	172034906
2	NC_010543	TCTT	2	8	724	731	0 %	75 %	0 %	25 %	172034907
3	NC_010543	ATTT	2	8	1496	1503	25 %	75 %	0 %	0 %	172034908
4	NC_010543	ATGG	2	8	1769	1776	25 %	25 %	50 %	0 %	172034908
5	NC_010543	GAAG	2	8	1973	1980	50 %	0 %	50 %	0 %	172034908
6	NC_010543	AAAG	2	8	2095	2102	75 %	0 %	25 %	0 %	172034908
7	NC_010543	AAAC	3	12	2464	2475	75 %	0 %	0 %	25 %	172034909
8	NC_010543	AATT	2	8	2920	2927	50 %	50 %	0 %	0 %	172034909
9	NC_010543	TACA	2	8	3254	3261	50 %	25 %	0 %	25 %	172034909
10	NC_010543	TGAG	2	8	4197	4204	25 %	25 %	50 %	0 %	172034910
11	NC_010543	TTTG	2	8	4531	4538	0 %	75 %	25 %	0 %	172034910
12	NC_010543	TGAG	2	8	4653	4660	25 %	25 %	50 %	0 %	172034910
13	NC_010543	GTTC	2	8	4689	4696	0 %	50 %	25 %	25 %	172034910
14	NC_010543	TTGA	2	8	4909	4916	25 %	50 %	25 %	0 %	172034910
15	NC_010543	TTGA	2	8	5149	5156	25 %	50 %	25 %	0 %	172034910
16	NC_010543	CTGT	2	8	5173	5180	0 %	50 %	25 %	25 %	172034910
17	NC_010543	TTTA	2	8	5258	5265	25 %	75 %	0 %	0 %	172034910
18	NC_010543	ATTA	2	8	5468	5475	50 %	50 %	0 %	0 %	172034910
19	NC_010543	TTTG	2	8	6095	6102	0 %	75 %	25 %	0 %	172034911
20	NC_010543	GCGA	2	8	6147	6154	25 %	0 %	50 %	25 %	172034911
21	NC_010543	TGAT	2	8	6885	6892	25 %	50 %	25 %	0 %	172034912
22	NC_010543	TTGA	2	8	7258	7265	25 %	50 %	25 %	0 %	172034913
23	NC_010543	AATG	2	8	9032	9039	50 %	25 %	25 %	0 %	172034915
24	NC_010543	TGGT	2	8	9046	9053	0 %	50 %	50 %	0 %	172034915

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.