MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid C

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010542	AATT	2	8	16	23	50 %	50 %	0 %	0 %	172034886
2	NC_010542	TTAC	2	8	948	955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010542	TAAT	2	8	1457	1464	50 %	50 %	0 %	0 %	172034887
4	NC_010542	TGGT	2	8	1739	1746	0 %	50 %	50 %	0 %	172034887
5	NC_010542	GATT	2	8	1747	1754	25 %	50 %	25 %	0 %	172034887
6	NC_010542	GAAT	2	8	1937	1944	50 %	25 %	25 %	0 %	172034887
7	NC_010542	GCTT	2	8	1963	1970	0 %	50 %	25 %	25 %	172034887
8	NC_010542	TTTC	2	8	2581	2588	0 %	75 %	0 %	25 %	172034887
9	NC_010542	TTGA	2	8	3215	3222	25 %	50 %	25 %	0 %	172034887
10	NC_010542	GAAG	3	12	3638	3649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010542	TAAT	2	8	4623	4630	50 %	50 %	0 %	0 %	172034888
12	NC_010542	TCAA	2	8	4800	4807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010542	TGAT	2	8	4815	4822	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010542	GTTT	2	8	5107	5114	0 %	75 %	25 %	0 %	172034889
15	NC_010542	AGGT	2	8	5526	5533	25 %	25 %	50 %	0 %	172034889
16	NC_010542	ATCT	2	8	6185	6192	25 %	50 %	0 %	25 %	172034889
17	NC_010542	TATT	2	8	6260	6267	25 %	75 %	0 %	0 %	172034889
18	NC_010542	GGGT	2	8	6349	6356	0 %	25 %	75 %	0 %	172034889
19	NC_010542	AGGA	2	8	6974	6981	50 %	0 %	50 %	0 %	172034891
20	NC_010542	AAAG	2	8	7903	7910	75 %	0 %	25 %	0 %	172034893
21	NC_010542	AGAA	2	8	8774	8781	75 %	0 %	25 %	0 %	172034896
22	NC_010542	ATTA	2	8	9069	9076	50 %	50 %	0 %	0 %	172034896
23	NC_010542	GTTT	2	8	9207	9214	0 %	75 %	25 %	0 %	172034896
24	NC_010542	TAGT	2	8	9419	9426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010542	ACAA	2	8	9954	9961	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_010542	ATTT	2	8	10106	10113	25 %	75 %	0 %	0 %	172034898
27	NC_010542	ATTA	2	8	10654	10661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010542	TTAA	2	8	10676	10683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010542	TTAA	2	8	10725	10732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010542	TAAT	2	8	10738	10745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010542	TAAA	2	8	10779	10786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010542	GTAA	2	8	10829	10836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010542	TATT	2	8	12008	12015	25 %	75 %	0 %	0 %	172034899
34	NC_010542	TTTG	2	8	13565	13572	0 %	75 %	25 %	0 %	172034902
35	NC_010542	CTTG	2	8	14066	14073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.