MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid B

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010541	TGGT	2	8	1103	1110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010541	GAGC	2	8	1221	1228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010541	TCAA	2	8	1950	1957	50 %	25 %	0 %	25 %	172034861
4	NC_010541	ATCT	2	8	2164	2171	25 %	50 %	0 %	25 %	172034862
5	NC_010541	TGAG	2	8	2228	2235	25 %	25 %	50 %	0 %	172034862
6	NC_010541	GATT	2	8	2398	2405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010541	CTTA	2	8	2828	2835	25 %	50 %	0 %	25 %	172034865
8	NC_010541	ACCT	2	8	4207	4214	25 %	25 %	0 %	50 %	172034866
9	NC_010541	TTAA	2	8	4278	4285	50 %	50 %	0 %	0 %	172034866
10	NC_010541	AAAC	2	8	4742	4749	75 %	0 %	0 %	25 %	172034866
11	NC_010541	TTAT	2	8	4899	4906	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
12	NC_010541	AAGG	3	12	4912	4923	50 %	0 %	50 %	0 %	172034866
13	NC_010541	TATT	2	8	5016	5023	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
14	NC_010541	TGAT	2	8	5104	5111	25 %	50 %	25 %	0 %	172034866
15	NC_010541	TTAT	2	8	5165	5172	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
16	NC_010541	AAAC	2	8	5534	5541	75 %	0 %	0 %	25 %	172034866
17	NC_010541	TTAC	2	8	5762	5769	25 %	50 %	0 %	25 %	172034866
18	NC_010541	AGTT	2	8	5821	5828	25 %	50 %	25 %	0 %	172034866
19	NC_010541	ATGG	2	8	6354	6361	25 %	25 %	50 %	0 %	172034866
20	NC_010541	AATC	2	8	6903	6910	50 %	25 %	0 %	25 %	172034867
21	NC_010541	CCAA	2	8	6994	7001	50 %	0 %	0 %	50 %	172034867
22	NC_010541	CAAA	2	8	7113	7120	75 %	0 %	0 %	25 %	172034867
23	NC_010541	TCAG	2	8	7294	7301	25 %	25 %	25 %	25 %	172034868
24	NC_010541	CTTT	2	8	8088	8095	0 %	75 %	0 %	25 %	172034869
25	NC_010541	TAAT	2	8	8250	8257	50 %	50 %	0 %	0 %	172034869
26	NC_010541	CTTT	2	8	8699	8706	0 %	75 %	0 %	25 %	172034869
27	NC_010541	ACTA	2	8	8941	8948	50 %	25 %	0 %	25 %	172034869
28	NC_010541	ATCT	2	8	9102	9109	25 %	50 %	0 %	25 %	172034869
29	NC_010541	GACT	2	8	9279	9286	25 %	25 %	25 %	25 %	172034869
30	NC_010541	TCCT	2	8	9382	9389	0 %	50 %	0 %	50 %	172034869
31	NC_010541	GATT	2	8	9638	9645	25 %	50 %	25 %	0 %	172034869
32	NC_010541	TTAA	2	8	10238	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	172034869
33	NC_010541	CTTT	2	8	11046	11053	0 %	75 %	0 %	25 %	172034869
34	NC_010541	TCGT	2	8	11131	11138	0 %	50 %	25 %	25 %	172034869
35	NC_010541	CAGT	2	8	11631	11638	25 %	25 %	25 %	25 %	172034870
36	NC_010541	AATC	2	8	11766	11773	50 %	25 %	0 %	25 %	172034870
37	NC_010541	TAGA	2	8	12848	12855	50 %	25 %	25 %	0 %	172034871
38	NC_010541	TATT	2	8	13347	13354	25 %	75 %	0 %	0 %	172034871
39	NC_010541	AAAG	2	8	13471	13478	75 %	0 %	25 %	0 %	172034871
40	NC_010541	TTTC	2	8	13541	13548	0 %	75 %	0 %	25 %	172034871
41	NC_010541	ATTG	2	8	13646	13653	25 %	50 %	25 %	0 %	172034872
42	NC_010541	ATCT	2	8	14541	14548	25 %	50 %	0 %	25 %	172034873
43	NC_010541	CAAA	2	8	14821	14828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010541	TAAA	2	8	14829	14836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010541	GAAA	2	8	15126	15133	75 %	0 %	25 %	0 %	172034874
46	NC_010541	CTAT	2	8	15420	15427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010541	TAAT	2	8	15469	15476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010541	AATA	2	8	15559	15566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010541	GATT	2	8	15983	15990	25 %	50 %	25 %	0 %	172034875
50	NC_010541	GATT	2	8	16124	16131	25 %	50 %	25 %	0 %	172034875
51	NC_010541	CTAA	2	8	16704	16711	50 %	25 %	0 %	25 %	172034876
52	NC_010541	TTTG	2	8	16753	16760	0 %	75 %	25 %	0 %	172034876
53	NC_010541	GCTT	2	8	17069	17076	0 %	50 %	25 %	25 %	172034876
54	NC_010541	CAAT	2	8	18064	18071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010541	ACGA	2	8	18557	18564	50 %	0 %	25 %	25 %	172034878
56	NC_010541	TTCG	2	8	18953	18960	0 %	50 %	25 %	25 %	172034878
57	NC_010541	TAAT	2	8	18973	18980	50 %	50 %	0 %	0 %	172034878
58	NC_010541	TGTA	2	8	19220	19227	25 %	50 %	25 %	0 %	172034879
59	NC_010541	ATTT	2	8	19507	19514	25 %	75 %	0 %	0 %	172034879
60	NC_010541	CTAA	2	8	19975	19982	50 %	25 %	0 %	25 %	172034880
61	NC_010541	ATTC	2	8	20233	20240	25 %	50 %	0 %	25 %	172034881
62	NC_010541	GATA	2	8	20674	20681	50 %	25 %	25 %	0 %	172034882
63	NC_010541	TTCG	2	8	20906	20913	0 %	50 %	25 %	25 %	172034883
64	NC_010541	TGGT	2	8	21056	21063	0 %	50 %	50 %	0 %	172034883
65	NC_010541	ATTA	2	8	21215	21222	50 %	50 %	0 %	0 %	172034883
66	NC_010541	TTTA	2	8	21979	21986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010541	AATT	2	8	22161	22168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010541	TCAA	2	8	22236	22243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010541	CTAC	2	8	23161	23168	25 %	25 %	0 %	50 %	172034884
70	NC_010541	CTAC	2	8	23818	23825	25 %	25 %	0 %	50 %	172034884
71	NC_010541	CTAC	2	8	24475	24482	25 %	25 %	0 %	50 %	172034884
72	NC_010541	ACGG	2	8	27556	27563	25 %	0 %	50 %	25 %	172034884
73	NC_010541	TGAA	2	8	27865	27872	50 %	25 %	25 %	0 %	172034884

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.