MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid A

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010539	TTTGTT	2	12	294	305	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	172034821
2	NC_010539	GTTCTT	2	12	1764	1775	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	172034821
3	NC_010539	GATTAT	2	12	5290	5301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	172034823
4	NC_010539	AAGGAA	2	12	7431	7442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034827
5	NC_010539	ATTGAT	2	12	9269	9280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	172034830
6	NC_010539	AGCATG	2	12	10464	10475	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	172034831
7	NC_010539	AAAGAA	2	12	12875	12886	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	172034833
8	NC_010539	GCTTAT	2	12	13562	13573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	172034833
9	NC_010539	TAATTC	2	12	14322	14333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	172034835
10	NC_010539	AATCTA	2	12	18487	18498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	172034838
11	NC_010539	AGATGA	2	12	18743	18754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	172034838
12	NC_010539	ATCTCT	2	12	25490	25501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	172034841
13	NC_010539	TCTTCA	2	12	25656	25667	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	172034841
14	NC_010539	ATTTCT	2	12	26363	26374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	172034841
15	NC_010539	AGGAGA	2	12	28767	28778	50 %	0 %	50 %	0 %	172034845
16	NC_010539	CTTTCT	2	12	29805	29816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034847
17	NC_010539	TAACTT	2	12	30522	30533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	172034848
18	NC_010539	ATCACC	2	12	31329	31340	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	172034849
19	NC_010539	TATCCT	2	12	36109	36120	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	172034854

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.