MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid A

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010539	TCGTT	2	10	2810	2819	0 %	60 %	20 %	20 %	172034821
2	NC_010539	CTTTC	2	10	4787	4796	0 %	60 %	0 %	40 %	172034822
3	NC_010539	TTAGT	2	10	5069	5078	20 %	60 %	20 %	0 %	172034823
4	NC_010539	ACAAG	2	10	6481	6490	60 %	0 %	20 %	20 %	172034825
5	NC_010539	ATAAA	2	10	6789	6798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010539	CGGAG	2	10	8334	8343	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010539	ACCAC	2	10	8371	8380	40 %	0 %	0 %	60 %	172034829
8	NC_010539	TTTGG	2	10	9632	9641	0 %	60 %	40 %	0 %	172034830
9	NC_010539	TGTTA	2	10	10183	10192	20 %	60 %	20 %	0 %	172034830
10	NC_010539	CAATA	2	10	10260	10269	60 %	20 %	0 %	20 %	172034830
11	NC_010539	ACGAT	2	10	10534	10543	40 %	20 %	20 %	20 %	172034831
12	NC_010539	AATTC	2	10	12108	12117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010539	TAACT	2	10	12925	12934	40 %	40 %	0 %	20 %	172034833
14	NC_010539	ACAAA	2	10	13653	13662	80 %	0 %	0 %	20 %	172034833
15	NC_010539	AAAGG	2	10	15332	15341	60 %	0 %	40 %	0 %	172034837
16	NC_010539	TAATT	2	10	17106	17115	40 %	60 %	0 %	0 %	172034838
17	NC_010539	TAATA	2	10	18137	18146	60 %	40 %	0 %	0 %	172034838
18	NC_010539	TTCCA	2	10	19862	19871	20 %	40 %	0 %	40 %	172034838
19	NC_010539	CTTTT	2	10	20389	20398	0 %	80 %	0 %	20 %	172034838
20	NC_010539	CATTC	2	10	20572	20581	20 %	40 %	0 %	40 %	172034838
21	NC_010539	GTTTT	2	10	24215	24224	0 %	80 %	20 %	0 %	172034840
22	NC_010539	TGAAA	2	10	27640	27649	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010539	AAACG	2	10	29741	29750	60 %	0 %	20 %	20 %	172034847
24	NC_010539	GACAG	2	10	30773	30782	40 %	0 %	40 %	20 %	172034848
25	NC_010539	TGAGA	2	10	30832	30841	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010539	CTTCT	2	10	32686	32695	0 %	60 %	0 %	40 %	172034849
27	NC_010539	GGACG	2	10	33429	33438	20 %	0 %	60 %	20 %	172034849
28	NC_010539	CGTTG	2	10	33916	33925	0 %	40 %	40 %	20 %	172034849
29	NC_010539	TATAG	2	10	35496	35505	40 %	40 %	20 %	0 %	172034852
30	NC_010539	AGGTC	2	10	38454	38463	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.