MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid A

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010539	TGAT	2	8	703	710	25 %	50 %	25 %	0 %	172034821
2	NC_010539	TCAA	2	8	2012	2019	50 %	25 %	0 %	25 %	172034821
3	NC_010539	AAGT	2	8	2473	2480	50 %	25 %	25 %	0 %	172034821
4	NC_010539	AGGT	2	8	3301	3308	25 %	25 %	50 %	0 %	172034821
5	NC_010539	CGTC	2	8	4387	4394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010539	TGAA	2	8	4455	4462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010539	TACT	2	8	4930	4937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010539	TAAT	2	8	4974	4981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010539	TAAG	2	8	5050	5057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010539	CAAC	2	8	5383	5390	50 %	0 %	0 %	50 %	172034823
11	NC_010539	CAGT	2	8	5443	5450	25 %	25 %	25 %	25 %	172034823
12	NC_010539	GTCA	2	8	5606	5613	25 %	25 %	25 %	25 %	172034823
13	NC_010539	AATC	2	8	5799	5806	50 %	25 %	0 %	25 %	172034824
14	NC_010539	TTTA	2	8	6357	6364	25 %	75 %	0 %	0 %	172034825
15	NC_010539	CTGT	2	8	6565	6572	0 %	50 %	25 %	25 %	172034825
16	NC_010539	CTTT	2	8	6935	6942	0 %	75 %	0 %	25 %	172034826
17	NC_010539	GATT	2	8	7221	7228	25 %	50 %	25 %	0 %	172034827
18	NC_010539	TATT	2	8	7378	7385	25 %	75 %	0 %	0 %	172034827
19	NC_010539	TGAT	2	8	7452	7459	25 %	50 %	25 %	0 %	172034827
20	NC_010539	ATTT	2	8	8246	8253	25 %	75 %	0 %	0 %	172034828
21	NC_010539	TTTA	2	8	9324	9331	25 %	75 %	0 %	0 %	172034830
22	NC_010539	ATCA	2	8	9392	9399	50 %	25 %	0 %	25 %	172034830
23	NC_010539	TTTC	2	8	9506	9513	0 %	75 %	0 %	25 %	172034830
24	NC_010539	ATTT	2	8	10024	10031	25 %	75 %	0 %	0 %	172034830
25	NC_010539	GGAA	2	8	10047	10054	50 %	0 %	50 %	0 %	172034830
26	NC_010539	TAAC	2	8	11039	11046	50 %	25 %	0 %	25 %	172034831
27	NC_010539	GGAT	2	8	11395	11402	25 %	25 %	50 %	0 %	172034832
28	NC_010539	TTAA	2	8	12079	12086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010539	AATT	2	8	12091	12098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010539	AAGA	2	8	12337	12344	75 %	0 %	25 %	0 %	172034833
31	NC_010539	AAGT	2	8	12829	12836	50 %	25 %	25 %	0 %	172034833
32	NC_010539	AAAG	2	8	13276	13283	75 %	0 %	25 %	0 %	172034833
33	NC_010539	TATT	2	8	13525	13532	25 %	75 %	0 %	0 %	172034833
34	NC_010539	GTTA	2	8	13710	13717	25 %	50 %	25 %	0 %	172034833
35	NC_010539	CGCT	2	8	14611	14618	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010539	GTAA	2	8	15270	15277	50 %	25 %	25 %	0 %	172034837
37	NC_010539	AATT	2	8	17293	17300	50 %	50 %	0 %	0 %	172034838
38	NC_010539	ATCT	2	8	17587	17594	25 %	50 %	0 %	25 %	172034838
39	NC_010539	ACCA	2	8	18034	18041	50 %	0 %	0 %	50 %	172034838
40	NC_010539	TTGA	2	8	18341	18348	25 %	50 %	25 %	0 %	172034838
41	NC_010539	GGAA	2	8	18442	18449	50 %	0 %	50 %	0 %	172034838
42	NC_010539	TAAA	2	8	18566	18573	75 %	25 %	0 %	0 %	172034838
43	NC_010539	TTTG	2	8	19008	19015	0 %	75 %	25 %	0 %	172034838
44	NC_010539	CAGA	2	8	19153	19160	50 %	0 %	25 %	25 %	172034838
45	NC_010539	AAAC	2	8	19194	19201	75 %	0 %	0 %	25 %	172034838
46	NC_010539	GTGA	2	8	19217	19224	25 %	25 %	50 %	0 %	172034838
47	NC_010539	AATT	2	8	19424	19431	50 %	50 %	0 %	0 %	172034838
48	NC_010539	TAAC	2	8	19834	19841	50 %	25 %	0 %	25 %	172034838
49	NC_010539	AATT	2	8	19895	19902	50 %	50 %	0 %	0 %	172034838
50	NC_010539	GTTT	2	8	20697	20704	0 %	75 %	25 %	0 %	172034838
51	NC_010539	GCTG	2	8	20930	20937	0 %	25 %	50 %	25 %	172034838
52	NC_010539	GGTG	2	8	21659	21666	0 %	25 %	75 %	0 %	172034839
53	NC_010539	AATT	2	8	22025	22032	50 %	50 %	0 %	0 %	172034839
54	NC_010539	TCAT	2	8	22749	22756	25 %	50 %	0 %	25 %	172034839
55	NC_010539	TAAA	2	8	22847	22854	75 %	25 %	0 %	0 %	172034839
56	NC_010539	GATT	2	8	23538	23545	25 %	50 %	25 %	0 %	172034840
57	NC_010539	AATT	2	8	24418	24425	50 %	50 %	0 %	0 %	172034840
58	NC_010539	AAAT	2	8	25085	25092	75 %	25 %	0 %	0 %	172034841
59	NC_010539	TGTC	2	8	25261	25268	0 %	50 %	25 %	25 %	172034841
60	NC_010539	TTTC	2	8	25285	25292	0 %	75 %	0 %	25 %	172034841
61	NC_010539	AAAT	2	8	26120	26127	75 %	25 %	0 %	0 %	172034841
62	NC_010539	CAAA	2	8	26989	26996	75 %	0 %	0 %	25 %	172034842
63	NC_010539	AGAA	2	8	27685	27692	75 %	0 %	25 %	0 %	172034844
64	NC_010539	ATTT	2	8	27808	27815	25 %	75 %	0 %	0 %	172034844
65	NC_010539	TTGA	2	8	27915	27922	25 %	50 %	25 %	0 %	172034844
66	NC_010539	GTAA	2	8	28126	28133	50 %	25 %	25 %	0 %	172034844
67	NC_010539	ATTG	2	8	28230	28237	25 %	50 %	25 %	0 %	172034844
68	NC_010539	ACAT	2	8	28977	28984	50 %	25 %	0 %	25 %	172034846
69	NC_010539	TGTT	2	8	29194	29201	0 %	75 %	25 %	0 %	172034846
70	NC_010539	GTTG	2	8	29338	29345	0 %	50 %	50 %	0 %	172034846
71	NC_010539	ATTA	2	8	29580	29587	50 %	50 %	0 %	0 %	172034847
72	NC_010539	CCAT	2	8	30223	30230	25 %	25 %	0 %	50 %	172034848
73	NC_010539	TTGC	2	8	30275	30282	0 %	50 %	25 %	25 %	172034848
74	NC_010539	ATTC	2	8	30355	30362	25 %	50 %	0 %	25 %	172034848
75	NC_010539	CTAT	2	8	30563	30570	25 %	50 %	0 %	25 %	172034848
76	NC_010539	GTTT	2	8	31734	31741	0 %	75 %	25 %	0 %	172034849
77	NC_010539	CAAA	2	8	32120	32127	75 %	0 %	0 %	25 %	172034849
78	NC_010539	ATTA	2	8	32225	32232	50 %	50 %	0 %	0 %	172034849
79	NC_010539	TGTC	2	8	32290	32297	0 %	50 %	25 %	25 %	172034849
80	NC_010539	TTAA	2	8	32484	32491	50 %	50 %	0 %	0 %	172034849
81	NC_010539	TAAA	2	8	33631	33638	75 %	25 %	0 %	0 %	172034849
82	NC_010539	TTCC	2	8	34379	34386	0 %	50 %	0 %	50 %	172034849
83	NC_010539	GTTG	2	8	35072	35079	0 %	50 %	50 %	0 %	172034851
84	NC_010539	ATCT	2	8	35213	35220	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010539	TGAA	2	8	35237	35244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010539	TATT	2	8	35311	35318	25 %	75 %	0 %	0 %	172034852
87	NC_010539	TTTA	2	8	35506	35513	25 %	75 %	0 %	0 %	172034852
88	NC_010539	AATA	2	8	35889	35896	75 %	25 %	0 %	0 %	172034853
89	NC_010539	TAAA	2	8	36546	36553	75 %	25 %	0 %	0 %	172034855
90	NC_010539	AATA	2	8	36649	36656	75 %	25 %	0 %	0 %	172034855
91	NC_010539	ATTA	2	8	36890	36897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010539	ATCA	2	8	37365	37372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_010539	AAGC	2	8	37667	37674	50 %	0 %	25 %	25 %	172034857
94	NC_010539	AATC	2	8	37753	37760	50 %	25 %	0 %	25 %	172034857
95	NC_010539	TCTT	2	8	37850	37857	0 %	75 %	0 %	25 %	172034857
96	NC_010539	ATTA	2	8	38349	38356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010539	TGAT	2	8	38413	38420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010539	TTGT	2	8	38901	38908	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010539	TAAG	2	8	38959	38966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010539	TGCG	2	8	39160	39167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010539	TGCT	2	8	39219	39226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010539	AGGT	2	8	39487	39494	25 %	25 %	50 %	0 %	172034858

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.