MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid A

Total Repeats: 573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010539	CTG	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
2	NC_010539	TTA	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034821
3	NC_010539	GTT	2	6	351	356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
4	NC_010539	GGT	2	6	425	430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
5	NC_010539	ACA	2	6	537	542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034821
6	NC_010539	TTC	2	6	553	558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
7	NC_010539	TGG	2	6	634	639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
8	NC_010539	ACG	2	6	678	683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034821
9	NC_010539	CAT	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
10	NC_010539	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034821
11	NC_010539	TGT	2	6	754	759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
12	NC_010539	AGT	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034821
13	NC_010539	TAT	2	6	789	794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034821
14	NC_010539	CTA	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
15	NC_010539	TCA	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
16	NC_010539	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
17	NC_010539	ATT	2	6	937	942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034821
18	NC_010539	GTT	2	6	969	974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
19	NC_010539	AGG	2	6	1110	1115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034821
20	NC_010539	GCT	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
21	NC_010539	TGT	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
22	NC_010539	CGA	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034821
23	NC_010539	TGG	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
24	NC_010539	TCA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
25	NC_010539	TGG	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
26	NC_010539	GCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
27	NC_010539	TTG	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
28	NC_010539	GGT	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
29	NC_010539	CCT	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034821
30	NC_010539	CCA	2	6	2124	2129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034821
31	NC_010539	TCC	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034821
32	NC_010539	GTT	2	6	2271	2276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
33	NC_010539	ATG	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034821
34	NC_010539	CTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
35	NC_010539	TTC	2	6	2323	2328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
36	NC_010539	TTC	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
37	NC_010539	GGC	2	6	2398	2403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034821
38	NC_010539	TGT	2	6	2525	2530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
39	NC_010539	CAC	2	6	2572	2577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034821
40	NC_010539	TGG	2	6	2620	2625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
41	NC_010539	TCT	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
42	NC_010539	GTC	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
43	NC_010539	CCT	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034821
44	NC_010539	GCA	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034821
45	NC_010539	GGT	2	6	2979	2984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
46	NC_010539	GCT	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
47	NC_010539	CTA	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
48	NC_010539	CTT	2	6	3009	3014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
49	NC_010539	TCA	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
50	NC_010539	GAG	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034821
51	NC_010539	TCA	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
52	NC_010539	TCA	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
53	NC_010539	CTT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
54	NC_010539	TTC	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
55	NC_010539	TGT	2	6	3558	3563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
56	NC_010539	CTG	2	6	3656	3661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010539	TTA	2	6	3709	3714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010539	CTA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010539	TGT	3	9	3821	3829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010539	CTT	2	6	3910	3915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010539	TTC	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010539	CTG	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010539	CTA	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010539	GAC	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010539	ATG	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010539	CCT	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010539	CGT	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034822
68	NC_010539	TGA	2	6	4687	4692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034822
69	NC_010539	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034822
70	NC_010539	ATG	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034822
71	NC_010539	TAC	2	6	4986	4991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010539	TCA	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010539	GTT	2	6	5133	5138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034823
74	NC_010539	CAG	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034823
75	NC_010539	TTA	2	6	5161	5166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034823
76	NC_010539	GGA	2	6	5214	5219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034823
77	NC_010539	TGA	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034823
78	NC_010539	GCT	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034823
79	NC_010539	GGT	2	6	5455	5460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034823
80	NC_010539	TTA	2	6	5557	5562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034823
81	NC_010539	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034823
82	NC_010539	ATT	2	6	5673	5678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034823
83	NC_010539	AGG	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034823
84	NC_010539	GAT	2	6	5721	5726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034824
85	NC_010539	CAA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034824
86	NC_010539	AGA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034824
87	NC_010539	AAG	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034824
88	NC_010539	CGA	2	6	5893	5898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034824
89	NC_010539	TGT	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034824
90	NC_010539	GAT	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034824
91	NC_010539	ATA	2	6	6070	6075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010539	GCG	2	6	6133	6138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034825
93	NC_010539	TTC	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034825
94	NC_010539	TTC	2	6	6219	6224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034825
95	NC_010539	TAA	2	6	6228	6233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034825
96	NC_010539	CTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034825
97	NC_010539	TCT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034825
98	NC_010539	TTG	2	6	6315	6320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034825
99	NC_010539	CAA	2	6	6371	6376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034825
100	NC_010539	AAT	2	6	6573	6578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034825
101	NC_010539	TGA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034825
102	NC_010539	TCA	4	12	6716	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034825
103	NC_010539	AAG	2	6	6811	6816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010539	GAG	2	6	6943	6948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034826
105	NC_010539	TTA	2	6	6964	6969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034826
106	NC_010539	TAA	2	6	6989	6994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034826
107	NC_010539	GAA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034826
108	NC_010539	CAG	2	6	7053	7058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010539	TTA	2	6	7128	7133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034827
110	NC_010539	AGA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034827
111	NC_010539	TAT	3	9	7306	7314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034827
112	NC_010539	ATT	2	6	7496	7501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034827
113	NC_010539	TAT	2	6	7545	7550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010539	CGG	2	6	7647	7652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034828
115	NC_010539	AAG	2	6	7671	7676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034828
116	NC_010539	TAG	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034828
117	NC_010539	TCA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034828
118	NC_010539	TCC	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034828
119	NC_010539	CAA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034828
120	NC_010539	GAA	2	6	7937	7942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034828
121	NC_010539	TTA	2	6	7982	7987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034828
122	NC_010539	GAT	2	6	8042	8047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034828
123	NC_010539	TGA	2	6	8167	8172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034828
124	NC_010539	TCC	2	6	8194	8199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034828
125	NC_010539	TGA	2	6	8212	8217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034828
126	NC_010539	TGT	2	6	8360	8365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034829
127	NC_010539	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034829
128	NC_010539	CGA	2	6	8553	8558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034829
129	NC_010539	TAA	2	6	8613	8618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034829
130	NC_010539	ATC	2	6	8710	8715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034829
131	NC_010539	TCT	2	6	8756	8761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034829
132	NC_010539	CAA	2	6	8895	8900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034829
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258	NC_010539	TGA	2	6	17529	17534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034838
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383	NC_010539	TCA	2	6	26043	26048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034841
384	NC_010539	ATC	2	6	26075	26080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034841
385	NC_010539	CAA	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034841
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387	NC_010539	AGC	2	6	26219	26224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034841
388	NC_010539	TTC	2	6	26255	26260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034841
389	NC_010539	TTC	2	6	26417	26422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034841
390	NC_010539	GCT	2	6	26512	26517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034841
391	NC_010539	ATT	2	6	26636	26641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034841
392	NC_010539	AAT	2	6	26745	26750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_010539	ATC	3	9	26786	26794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034842
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396	NC_010539	GCT	2	6	26844	26849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034842
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400	NC_010539	ATA	2	6	27123	27128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034842
401	NC_010539	TAG	2	6	27184	27189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034842
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449	NC_010539	ACA	2	6	30889	30894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_010539	TAT	2	6	31126	31131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034849
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499	NC_010539	CGT	2	6	34551	34556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034849
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