MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid A

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010539	GA	3	6	743	748	50 %	0 %	50 %	0 %	172034821
2	NC_010539	AT	3	6	983	988	50 %	50 %	0 %	0 %	172034821
3	NC_010539	TG	3	6	2543	2548	0 %	50 %	50 %	0 %	172034821
4	NC_010539	GC	3	6	4203	4208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010539	AG	3	6	4354	4359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010539	GT	3	6	7370	7375	0 %	50 %	50 %	0 %	172034827
7	NC_010539	AG	3	6	7763	7768	50 %	0 %	50 %	0 %	172034828
8	NC_010539	GA	3	6	8796	8801	50 %	0 %	50 %	0 %	172034829
9	NC_010539	AG	3	6	9130	9135	50 %	0 %	50 %	0 %	172034830
10	NC_010539	TC	3	6	9771	9776	0 %	50 %	0 %	50 %	172034830
11	NC_010539	GA	3	6	10067	10072	50 %	0 %	50 %	0 %	172034830
12	NC_010539	TA	3	6	10333	10338	50 %	50 %	0 %	0 %	172034831
13	NC_010539	AT	3	6	11812	11817	50 %	50 %	0 %	0 %	172034832
14	NC_010539	TA	3	6	12193	12198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010539	GA	3	6	13789	13794	50 %	0 %	50 %	0 %	172034834
16	NC_010539	AT	3	6	13866	13871	50 %	50 %	0 %	0 %	172034834
17	NC_010539	TC	4	8	13899	13906	0 %	50 %	0 %	50 %	172034834
18	NC_010539	AT	3	6	13977	13982	50 %	50 %	0 %	0 %	172034835
19	NC_010539	TA	3	6	15946	15951	50 %	50 %	0 %	0 %	172034838
20	NC_010539	TA	3	6	17369	17374	50 %	50 %	0 %	0 %	172034838
21	NC_010539	AT	3	6	17904	17909	50 %	50 %	0 %	0 %	172034838
22	NC_010539	CA	3	6	19397	19402	50 %	0 %	0 %	50 %	172034838
23	NC_010539	TA	3	6	20479	20484	50 %	50 %	0 %	0 %	172034838
24	NC_010539	GT	3	6	21586	21591	0 %	50 %	50 %	0 %	172034839
25	NC_010539	GA	3	6	21768	21773	50 %	0 %	50 %	0 %	172034839
26	NC_010539	TA	3	6	21923	21928	50 %	50 %	0 %	0 %	172034839
27	NC_010539	CT	3	6	22910	22915	0 %	50 %	0 %	50 %	172034839
28	NC_010539	AT	3	6	23435	23440	50 %	50 %	0 %	0 %	172034840
29	NC_010539	TG	4	8	23711	23718	0 %	50 %	50 %	0 %	172034840
30	NC_010539	TA	3	6	24636	24641	50 %	50 %	0 %	0 %	172034840
31	NC_010539	AT	4	8	24964	24971	50 %	50 %	0 %	0 %	172034840
32	NC_010539	TC	3	6	25163	25168	0 %	50 %	0 %	50 %	172034841
33	NC_010539	AT	3	6	25432	25437	50 %	50 %	0 %	0 %	172034841
34	NC_010539	AT	3	6	25796	25801	50 %	50 %	0 %	0 %	172034841
35	NC_010539	AC	3	6	26768	26773	50 %	0 %	0 %	50 %	172034842
36	NC_010539	AG	3	6	28954	28959	50 %	0 %	50 %	0 %	172034846
37	NC_010539	AT	4	8	29014	29021	50 %	50 %	0 %	0 %	172034846
38	NC_010539	TA	3	6	29053	29058	50 %	50 %	0 %	0 %	172034846
39	NC_010539	AT	3	6	29208	29213	50 %	50 %	0 %	0 %	172034846
40	NC_010539	CT	3	6	29301	29306	0 %	50 %	0 %	50 %	172034846
41	NC_010539	TA	3	6	30327	30332	50 %	50 %	0 %	0 %	172034848
42	NC_010539	TC	3	6	30823	30828	0 %	50 %	0 %	50 %	172034848
43	NC_010539	AC	3	6	31416	31421	50 %	0 %	0 %	50 %	172034849
44	NC_010539	AG	3	6	31774	31779	50 %	0 %	50 %	0 %	172034849
45	NC_010539	AT	3	6	32212	32217	50 %	50 %	0 %	0 %	172034849
46	NC_010539	CA	3	6	33268	33273	50 %	0 %	0 %	50 %	172034849
47	NC_010539	AC	3	6	33475	33480	50 %	0 %	0 %	50 %	172034849
48	NC_010539	TA	3	6	34750	34755	50 %	50 %	0 %	0 %	172034850
49	NC_010539	AT	3	6	35338	35343	50 %	50 %	0 %	0 %	172034852
50	NC_010539	AG	3	6	36150	36155	50 %	0 %	50 %	0 %	172034854
51	NC_010539	TC	3	6	36253	36258	0 %	50 %	0 %	50 %	172034854
52	NC_010539	GA	4	8	36586	36593	50 %	0 %	50 %	0 %	172034855
53	NC_010539	GA	3	6	37617	37622	50 %	0 %	50 %	0 %	172034857
54	NC_010539	GC	3	6	39106	39111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010539	CA	3	6	39207	39212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.