MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 chromosome 2

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010530	GAAGGC	2	12	47091	47102	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010530	TGTGAA	2	12	55818	55829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010530	CAGGAT	2	12	68262	68273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010530	CGCGCA	2	12	97496	97507	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010530	GCACGG	2	12	114850	114861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010530	CGAAAG	2	12	128412	128423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010530	AGAGGG	2	12	152327	152338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010530	CGGGCG	2	12	157510	157521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010530	ACGCTG	2	12	158067	158078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010530	CCCGAT	2	12	158580	158591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010530	CCGGCG	2	12	158603	158614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010530	GCACGC	2	12	161945	161956	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010530	ACGACA	2	12	168692	168703	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010530	TATCTC	2	12	182680	182691	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010530	GGATGC	2	12	192619	192630	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010530	GTGGAT	2	12	220235	220246	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010530	GTGCGC	2	12	231410	231421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010530	ACGCGG	2	12	315079	315090	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010530	GCCGCT	2	12	379331	379342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010530	CTCGAG	2	12	453734	453745	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010530	CCGCGC	2	12	476954	476965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010530	CCGGCT	2	12	502863	502874	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010530	CACCCC	2	12	512447	512458	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
24	NC_010530	CATTCG	2	12	526070	526081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010530	GATCAG	2	12	580310	580321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010530	GCGGGG	2	12	648456	648467	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010530	GCGCCG	2	12	652302	652313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010530	GGGCAG	2	12	670444	670455	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010530	CAGCAT	2	12	698025	698036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010530	ACCCAG	2	12	699321	699332	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010530	TGAGGT	2	12	709137	709148	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010530	TGCCGG	2	12	712927	712938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010530	CGCTGC	2	12	756708	756719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010530	AGCGCT	2	12	766039	766050	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010530	CGGCGC	2	12	815367	815378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010530	GCCGGG	2	12	856752	856763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010530	CCGCGC	2	12	857802	857813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010530	TTGCTC	2	12	883839	883850	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010530	GGCGAT	2	12	933002	933013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010530	ATCATT	2	12	958761	958772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010530	CCCTCT	2	12	1008467	1008478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010530	GCCAGG	2	12	1056203	1056214	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010530	GCCGCG	2	12	1130701	1130712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010530	CTGCGC	2	12	1247521	1247532	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010530	CTGGCG	2	12	1311832	1311843	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010530	CATTCG	2	12	1319551	1319562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010530	TCATTA	2	12	1323839	1323850	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010530	CGCCGG	2	12	1337898	1337909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010530	CGGAGG	2	12	1426705	1426716	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010530	CGGCGC	2	12	1445815	1445826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010530	ATGCGC	2	12	1490079	1490090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010530	TCACCG	2	12	1498419	1498430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010530	CAAGCG	2	12	1520095	1520106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010530	CGCCTT	2	12	1556149	1556160	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010530	GGACCG	2	12	1594145	1594156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010530	CGGCGC	2	12	1595620	1595631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010530	CCGCGC	2	12	1597192	1597203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010530	GCCGGC	2	12	1637714	1637725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010530	CGAGCG	2	12	1637765	1637776	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010530	ACGATT	2	12	1679730	1679741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010530	CCCCCG	2	12	1777751	1777762	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
62	NC_010530	TCCCAA	2	12	1844572	1844583	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010530	GGCGCT	2	12	1853190	1853201	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010530	GCCCGC	2	12	1869043	1869054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010530	AAGGGA	2	12	1877647	1877658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010530	CTTGCC	2	12	1953109	1953120	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010530	CGGCCG	2	12	1963225	1963236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010530	CGCCAG	2	12	1978699	1978710	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010530	GCAGCG	2	12	1978971	1978982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010530	AAGACA	2	12	2000264	2000275	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010530	CATGAC	2	12	2011449	2011460	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010530	CATATC	2	12	2061735	2061746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010530	ACGCAA	2	12	2112817	2112828	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010530	GGCGTG	2	12	2138518	2138529	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010530	GCCGGG	2	12	2156591	2156602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010530	CTCAAG	2	12	2185821	2185832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010530	CCGGCG	2	12	2250807	2250818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010530	AATGGC	2	12	2277822	2277833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010530	GGCGCC	2	12	2448270	2448281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010530	CTTCCC	2	12	2501055	2501066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010530	GTATCG	2	12	2502293	2502304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.