MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 chromosome 2

Total Repeats: 2514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010530	ACGAT	2	10	2603	2612	40 %	20 %	20 %	20 %	188591851
2	NC_010530	CCACG	2	10	3948	3957	20 %	0 %	20 %	60 %	188591852
3	NC_010530	GCGCG	2	10	4083	4092	0 %	0 %	60 %	40 %	188591852
4	NC_010530	AATGC	2	10	5337	5346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010530	GCCGG	2	10	6175	6184	0 %	0 %	60 %	40 %	188591853
6	NC_010530	AATGA	2	10	6915	6924	60 %	20 %	20 %	0 %	188591854
7	NC_010530	ACGCG	2	10	8015	8024	20 %	0 %	40 %	40 %	188591856
8	NC_010530	GCGCG	2	10	8271	8280	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010530	GGCGC	2	10	8412	8421	0 %	0 %	60 %	40 %	188591857
10	NC_010530	CGCTG	2	10	9361	9370	0 %	20 %	40 %	40 %	188591858
11	NC_010530	GCTGG	2	10	9469	9478	0 %	20 %	60 %	20 %	188591858
12	NC_010530	CCGCG	2	10	9631	9640	0 %	0 %	40 %	60 %	188591858
13	NC_010530	ACGCG	2	10	12952	12961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010530	GGCCT	2	10	13185	13194	0 %	20 %	40 %	40 %	188591862
15	NC_010530	TGCCG	2	10	16584	16593	0 %	20 %	40 %	40 %	188591865
16	NC_010530	GCCGC	2	10	17684	17693	0 %	0 %	40 %	60 %	188591866
17	NC_010530	GCCGT	2	10	17718	17727	0 %	20 %	40 %	40 %	188591866
18	NC_010530	CCGCG	2	10	19132	19141	0 %	0 %	40 %	60 %	188591866
19	NC_010530	GCCGG	2	10	20374	20383	0 %	0 %	60 %	40 %	188591867
20	NC_010530	CGCGC	2	10	20496	20505	0 %	0 %	40 %	60 %	188591867
21	NC_010530	CTGGC	2	10	20523	20532	0 %	20 %	40 %	40 %	188591867
22	NC_010530	CATGC	2	10	22345	22354	20 %	20 %	20 %	40 %	188591868
23	NC_010530	GCATG	2	10	24894	24903	20 %	20 %	40 %	20 %	188591869
24	NC_010530	CGCCC	2	10	25566	25575	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_010530	GGTCG	2	10	28477	28486	0 %	20 %	60 %	20 %	188591872
26	NC_010530	GCGCG	2	10	30241	30250	0 %	0 %	60 %	40 %	188591873
27	NC_010530	GCGCC	2	10	30443	30452	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_010530	GCCAG	2	10	31077	31086	20 %	0 %	40 %	40 %	188591874
29	NC_010530	CGGCG	2	10	31480	31489	0 %	0 %	60 %	40 %	188591874
30	NC_010530	TGCGC	2	10	33044	33053	0 %	20 %	40 %	40 %	188591876
31	NC_010530	AGCCG	2	10	33779	33788	20 %	0 %	40 %	40 %	188591876
32	NC_010530	CGCGG	2	10	33917	33926	0 %	0 %	60 %	40 %	188591876
33	NC_010530	GCGCA	2	10	34214	34223	20 %	0 %	40 %	40 %	188591877
34	NC_010530	GCCGA	2	10	34577	34586	20 %	0 %	40 %	40 %	188591877
35	NC_010530	CGGGC	2	10	35343	35352	0 %	0 %	60 %	40 %	188591878
36	NC_010530	GGCGC	2	10	36537	36546	0 %	0 %	60 %	40 %	188591879
37	NC_010530	CGGCG	2	10	36649	36658	0 %	0 %	60 %	40 %	188591879
38	NC_010530	TGGCT	2	10	38055	38064	0 %	40 %	40 %	20 %	188591880
39	NC_010530	CCGGC	2	10	38483	38492	0 %	0 %	40 %	60 %	188591880
40	NC_010530	GCGCG	2	10	40432	40441	0 %	0 %	60 %	40 %	188591882
41	NC_010530	CACCG	2	10	40562	40571	20 %	0 %	20 %	60 %	188591882
42	NC_010530	GCCGA	2	10	42191	42200	20 %	0 %	40 %	40 %	188591883
43	NC_010530	GCGTC	2	10	42333	42342	0 %	20 %	40 %	40 %	188591884
44	NC_010530	GCTGT	2	10	42647	42656	0 %	40 %	40 %	20 %	188591884
45	NC_010530	CGGCG	2	10	44090	44099	0 %	0 %	60 %	40 %	188591885
46	NC_010530	GCGTG	2	10	44271	44280	0 %	20 %	60 %	20 %	188591885
47	NC_010530	CCGCG	2	10	44348	44357	0 %	0 %	40 %	60 %	188591885
48	NC_010530	CGCGC	2	10	44744	44753	0 %	0 %	40 %	60 %	188591886
49	NC_010530	GGCCG	2	10	45025	45034	0 %	0 %	60 %	40 %	188591886
50	NC_010530	TGGGG	2	10	45852	45861	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010530	CTTGC	2	10	47203	47212	0 %	40 %	20 %	40 %	188591889
52	NC_010530	GGCCG	2	10	47387	47396	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_010530	GGCCG	2	10	48450	48459	0 %	0 %	60 %	40 %	188591890
54	NC_010530	CGAAC	2	10	50249	50258	40 %	0 %	20 %	40 %	188591893
55	NC_010530	CGGGC	2	10	50368	50377	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_010530	GGTCG	2	10	51168	51177	0 %	20 %	60 %	20 %	188591894
57	NC_010530	CGAGC	2	10	52000	52009	20 %	0 %	40 %	40 %	188591896
58	NC_010530	CGCGG	2	10	53085	53094	0 %	0 %	60 %	40 %	188591896
59	NC_010530	CTCGA	2	10	53443	53452	20 %	20 %	20 %	40 %	188591897
60	NC_010530	GCGCC	2	10	53477	53486	0 %	0 %	40 %	60 %	188591897
61	NC_010530	GCCGC	3	15	55287	55301	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_010530	GGCAG	2	10	55356	55365	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010530	GCAGG	2	10	55733	55742	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010530	GGGCA	2	10	56544	56553	20 %	0 %	60 %	20 %	188591899
65	NC_010530	TGGCC	2	10	56787	56796	0 %	20 %	40 %	40 %	188591899
66	NC_010530	CGCGG	2	10	56842	56851	0 %	0 %	60 %	40 %	188591899
67	NC_010530	ACGGC	2	10	57062	57071	20 %	0 %	40 %	40 %	188591899
68	NC_010530	CGGCG	2	10	57123	57132	0 %	0 %	60 %	40 %	188591899
69	NC_010530	GCACG	2	10	57933	57942	20 %	0 %	40 %	40 %	188591900
70	NC_010530	CGGCA	2	10	58899	58908	20 %	0 %	40 %	40 %	188591902
71	NC_010530	ATCGA	2	10	60514	60523	40 %	20 %	20 %	20 %	188591903
72	NC_010530	GCGCC	2	10	63251	63260	0 %	0 %	40 %	60 %	188591905
73	NC_010530	GCGCG	2	10	63346	63355	0 %	0 %	60 %	40 %	188591905
74	NC_010530	GGCGC	2	10	65510	65519	0 %	0 %	60 %	40 %	188591908
75	NC_010530	GCCGC	2	10	65682	65691	0 %	0 %	40 %	60 %	188591908
76	NC_010530	CGGCC	2	10	66605	66614	0 %	0 %	40 %	60 %	188591908
77	NC_010530	CTTGC	2	10	67084	67093	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_010530	GGCCA	2	10	67272	67281	20 %	0 %	40 %	40 %	188591910
79	NC_010530	CGGCG	2	10	68660	68669	0 %	0 %	60 %	40 %	188591911
80	NC_010530	ATGCC	2	10	69559	69568	20 %	20 %	20 %	40 %	188591912
81	NC_010530	ACGGC	2	10	69874	69883	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_010530	ACCCC	2	10	71566	71575	20 %	0 %	0 %	80 %	188591914
83	NC_010530	GGGGC	2	10	72495	72504	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010530	GGCAT	2	10	73753	73762	20 %	20 %	40 %	20 %	188591915
85	NC_010530	GCCGC	2	10	73888	73897	0 %	0 %	40 %	60 %	188591915
86	NC_010530	GCGCG	2	10	74154	74163	0 %	0 %	60 %	40 %	188591915
87	NC_010530	GGTCC	2	10	75821	75830	0 %	20 %	40 %	40 %	188591917
88	NC_010530	TTTGC	2	10	76255	76264	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010530	TTTGC	2	10	76268	76277	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010530	CAGCG	2	10	78153	78162	20 %	0 %	40 %	40 %	188591919
91	NC_010530	GCCGC	2	10	78378	78387	0 %	0 %	40 %	60 %	188591919
92	NC_010530	AGTTC	2	10	80031	80040	20 %	40 %	20 %	20 %	188591921
93	NC_010530	GCCAT	2	10	80534	80543	20 %	20 %	20 %	40 %	188591922
94	NC_010530	GCGCC	2	10	81697	81706	0 %	0 %	40 %	60 %	188591922
95	NC_010530	ATCGG	2	10	82166	82175	20 %	20 %	40 %	20 %	188591922
96	NC_010530	CCCCG	2	10	82396	82405	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
97	NC_010530	GGCGT	2	10	83632	83641	0 %	20 %	60 %	20 %	188591924
98	NC_010530	GGGCT	2	10	83785	83794	0 %	20 %	60 %	20 %	188591924
99	NC_010530	CGCGC	2	10	84316	84325	0 %	0 %	40 %	60 %	188591924
100	NC_010530	CGTGC	2	10	84399	84408	0 %	20 %	40 %	40 %	188591924
101	NC_010530	TGCGC	2	10	85672	85681	0 %	20 %	40 %	40 %	188591925
102	NC_010530	GCGCC	2	10	86726	86735	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_010530	CCATC	2	10	86823	86832	20 %	20 %	0 %	60 %	188591926
104	NC_010530	CGGCG	2	10	87335	87344	0 %	0 %	60 %	40 %	188591926
105	NC_010530	CTTGC	2	10	88068	88077	0 %	40 %	20 %	40 %	188591926
106	NC_010530	GCGCC	2	10	88591	88600	0 %	0 %	40 %	60 %	188591927
107	NC_010530	CGGCG	2	10	89994	90003	0 %	0 %	60 %	40 %	188591929
108	NC_010530	AACGC	2	10	91989	91998	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_010530	GCCGG	2	10	92457	92466	0 %	0 %	60 %	40 %	188591931
110	NC_010530	GCGCC	2	10	93641	93650	0 %	0 %	40 %	60 %	188591932
111	NC_010530	CCTGG	2	10	95864	95873	0 %	20 %	40 %	40 %	188591935
112	NC_010530	AGGCC	2	10	96016	96025	20 %	0 %	40 %	40 %	188591935
113	NC_010530	CGGGG	2	10	97217	97226	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010530	GCGCC	2	10	97774	97783	0 %	0 %	40 %	60 %	188591936
115	NC_010530	TGATG	2	10	97983	97992	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010530	CGCGG	2	10	99089	99098	0 %	0 %	60 %	40 %	188591938
117	NC_010530	GCACC	2	10	101005	101014	20 %	0 %	20 %	60 %	188591939
118	NC_010530	GGCCG	2	10	103789	103798	0 %	0 %	60 %	40 %	188591942
119	NC_010530	GCTGC	2	10	103959	103968	0 %	20 %	40 %	40 %	188591942
120	NC_010530	GCCGC	2	10	105754	105763	0 %	0 %	40 %	60 %	188591943
121	NC_010530	GCGCG	2	10	106066	106075	0 %	0 %	60 %	40 %	188591943
122	NC_010530	TGACC	2	10	106556	106565	20 %	20 %	20 %	40 %	188591943
123	NC_010530	GGGCG	2	10	108091	108100	0 %	0 %	80 %	20 %	188591944
124	NC_010530	GGCCA	2	10	108815	108824	20 %	0 %	40 %	40 %	188591944
125	NC_010530	CGCTG	2	10	109194	109203	0 %	20 %	40 %	40 %	188591945
126	NC_010530	GCCTG	2	10	110409	110418	0 %	20 %	40 %	40 %	188591945
127	NC_010530	GCCGC	2	10	111199	111208	0 %	0 %	40 %	60 %	188591946
128	NC_010530	CTGGG	2	10	111721	111730	0 %	20 %	60 %	20 %	188591946
129	NC_010530	GAAGG	2	10	111979	111988	40 %	0 %	60 %	0 %	188591946
130	NC_010530	GCGCC	2	10	112451	112460	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_010530	TAATC	2	10	112652	112661	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010530	GAGGG	2	10	112698	112707	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010530	CGGCG	2	10	113499	113508	0 %	0 %	60 %	40 %	188591948
134	NC_010530	CACGC	2	10	114490	114499	20 %	0 %	20 %	60 %	188591950
135	NC_010530	GTTCA	2	10	114528	114537	20 %	40 %	20 %	20 %	188591950
136	NC_010530	GAAAA	2	10	116915	116924	80 %	0 %	20 %	0 %	188591953
137	NC_010530	GTTCG	2	10	120367	120376	0 %	40 %	40 %	20 %	188591955
138	NC_010530	CGGTG	2	10	121964	121973	0 %	20 %	60 %	20 %	188591957
139	NC_010530	TTCCA	2	10	122442	122451	20 %	40 %	0 %	40 %	188591958
140	NC_010530	GCGCC	2	10	124560	124569	0 %	0 %	40 %	60 %	188591960
141	NC_010530	GCCGA	2	10	124608	124617	20 %	0 %	40 %	40 %	188591960
142	NC_010530	TGGCG	2	10	124712	124721	0 %	20 %	60 %	20 %	188591960
143	NC_010530	TGGCT	2	10	125337	125346	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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146	NC_010530	GCCGC	2	10	130476	130485	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_010530	CGGCG	2	10	130716	130725	0 %	0 %	60 %	40 %	188591968
148	NC_010530	ATGGC	2	10	130851	130860	20 %	20 %	40 %	20 %	188591969
149	NC_010530	GCCGC	2	10	131177	131186	0 %	0 %	40 %	60 %	188591969
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151	NC_010530	CGGGC	2	10	133541	133550	0 %	0 %	60 %	40 %	188591971
152	NC_010530	CGGCC	2	10	133994	134003	0 %	0 %	40 %	60 %	188591971
153	NC_010530	ACGGC	2	10	135337	135346	20 %	0 %	40 %	40 %	188591971
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156	NC_010530	TGGGG	3	15	138097	138111	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_010530	GCCGC	2	10	144474	144483	0 %	0 %	40 %	60 %	188591977
162	NC_010530	CAAAG	2	10	144708	144717	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_010530	CCGCG	2	10	146613	146622	0 %	0 %	40 %	60 %	188591979
165	NC_010530	TGGCG	2	10	149472	149481	0 %	20 %	60 %	20 %	188591981
166	NC_010530	CGGCC	2	10	151474	151483	0 %	0 %	40 %	60 %	188591983
167	NC_010530	GCGCC	2	10	151647	151656	0 %	0 %	40 %	60 %	188591983
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174	NC_010530	GCTGG	2	10	163003	163012	0 %	20 %	60 %	20 %	188591990
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182	NC_010530	GCCTT	2	10	174823	174832	0 %	40 %	20 %	40 %	188592002
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184	NC_010530	GCGTC	2	10	176204	176213	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_010530	ACGAA	2	10	177113	177122	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_010530	TCGTG	2	10	178464	178473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_010530	GGGAG	2	10	179925	179934	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
188	NC_010530	CTCAT	2	10	181923	181932	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
189	NC_010530	GTTTT	2	10	182589	182598	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_010530	TGGCC	2	10	193669	193678	0 %	20 %	40 %	40 %	188592016
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207	NC_010530	TGGGG	2	10	196057	196066	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_010530	CAAGA	2	10	246720	246729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_010530	TGTGG	2	10	247847	247856	0 %	40 %	60 %	0 %	188592066
262	NC_010530	AGCGC	2	10	248252	248261	20 %	0 %	40 %	40 %	188592067
263	NC_010530	CGTCT	2	10	248540	248549	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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266	NC_010530	GCTGT	2	10	250927	250936	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_010530	GGCGC	2	10	251034	251043	0 %	0 %	60 %	40 %	188592071
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269	NC_010530	TGGGC	2	10	251316	251325	0 %	20 %	60 %	20 %	188592071
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271	NC_010530	GCCGA	2	10	251909	251918	20 %	0 %	40 %	40 %	188592072
272	NC_010530	CGGCC	2	10	253673	253682	0 %	0 %	40 %	60 %	188592074
273	NC_010530	CCGGC	2	10	255431	255440	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
274	NC_010530	CAAAA	2	10	255453	255462	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_010530	GCAGC	2	10	262341	262350	20 %	0 %	40 %	40 %	188592081
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381	NC_010530	CCGGG	2	10	378866	378875	0 %	0 %	60 %	40 %	188592177
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398	NC_010530	GCCGC	2	10	402191	402200	0 %	0 %	40 %	60 %	188592197
399	NC_010530	CCGCG	2	10	403506	403515	0 %	0 %	40 %	60 %	188592199
400	NC_010530	AAGGC	2	10	405717	405726	40 %	0 %	40 %	20 %	188592201
401	NC_010530	CCCAC	2	10	408521	408530	20 %	0 %	0 %	80 %	188592203
402	NC_010530	GCGCC	2	10	408981	408990	0 %	0 %	40 %	60 %	188592203
403	NC_010530	ATGGC	2	10	409209	409218	20 %	20 %	40 %	20 %	188592203
404	NC_010530	CGCGG	2	10	409745	409754	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
405	NC_010530	CGGAC	2	10	412487	412496	20 %	0 %	40 %	40 %	188592207
406	NC_010530	GGTCT	2	10	412764	412773	0 %	40 %	40 %	20 %	188592208
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408	NC_010530	GCCGT	2	10	415670	415679	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
409	NC_010530	GCCGC	2	10	416029	416038	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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421	NC_010530	CGGGT	2	10	426339	426348	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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425	NC_010530	GCCAC	2	10	428231	428240	20 %	0 %	20 %	60 %	188592222
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434	NC_010530	CCGCG	2	10	437392	437401	0 %	0 %	40 %	60 %	188592230
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437	NC_010530	AGCGC	2	10	439896	439905	20 %	0 %	40 %	40 %	188592230
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441	NC_010530	GCGGT	2	10	443076	443085	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
442	NC_010530	GCCCG	2	10	446656	446665	0 %	0 %	40 %	60 %	188592236
443	NC_010530	GCGCC	2	10	447288	447297	0 %	0 %	40 %	60 %	188592236
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451	NC_010530	GGGAA	2	10	452195	452204	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
452	NC_010530	CGGGA	2	10	454271	454280	20 %	0 %	60 %	20 %	188592245
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