MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 chromosome 2

Total Repeats: 2125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010530	ACGAT	2	10	2603	2612	40 %	20 %	20 %	20 %	188591851
2	NC_010530	CCACG	2	10	3948	3957	20 %	0 %	20 %	60 %	188591852
3	NC_010530	GCGCG	2	10	4083	4092	0 %	0 %	60 %	40 %	188591852
4	NC_010530	GCCGG	2	10	6175	6184	0 %	0 %	60 %	40 %	188591853
5	NC_010530	AATGA	2	10	6915	6924	60 %	20 %	20 %	0 %	188591854
6	NC_010530	ACGCG	2	10	8015	8024	20 %	0 %	40 %	40 %	188591856
7	NC_010530	GGCGC	2	10	8412	8421	0 %	0 %	60 %	40 %	188591857
8	NC_010530	CGCTG	2	10	9361	9370	0 %	20 %	40 %	40 %	188591858
9	NC_010530	GCTGG	2	10	9469	9478	0 %	20 %	60 %	20 %	188591858
10	NC_010530	CCGCG	2	10	9631	9640	0 %	0 %	40 %	60 %	188591858
11	NC_010530	GGCCT	2	10	13185	13194	0 %	20 %	40 %	40 %	188591862
12	NC_010530	TGCCG	2	10	16584	16593	0 %	20 %	40 %	40 %	188591865
13	NC_010530	GCCGC	2	10	17684	17693	0 %	0 %	40 %	60 %	188591866
14	NC_010530	GCCGT	2	10	17718	17727	0 %	20 %	40 %	40 %	188591866
15	NC_010530	CCGCG	2	10	19132	19141	0 %	0 %	40 %	60 %	188591866
16	NC_010530	GCCGG	2	10	20374	20383	0 %	0 %	60 %	40 %	188591867
17	NC_010530	CGCGC	2	10	20496	20505	0 %	0 %	40 %	60 %	188591867
18	NC_010530	CTGGC	2	10	20523	20532	0 %	20 %	40 %	40 %	188591867
19	NC_010530	CATGC	2	10	22345	22354	20 %	20 %	20 %	40 %	188591868
20	NC_010530	GCATG	2	10	24894	24903	20 %	20 %	40 %	20 %	188591869
21	NC_010530	GGTCG	2	10	28477	28486	0 %	20 %	60 %	20 %	188591872
22	NC_010530	GCGCG	2	10	30241	30250	0 %	0 %	60 %	40 %	188591873
23	NC_010530	GCCAG	2	10	31077	31086	20 %	0 %	40 %	40 %	188591874
24	NC_010530	CGGCG	2	10	31480	31489	0 %	0 %	60 %	40 %	188591874
25	NC_010530	TGCGC	2	10	33044	33053	0 %	20 %	40 %	40 %	188591876
26	NC_010530	AGCCG	2	10	33779	33788	20 %	0 %	40 %	40 %	188591876
27	NC_010530	CGCGG	2	10	33917	33926	0 %	0 %	60 %	40 %	188591876
28	NC_010530	GCGCA	2	10	34214	34223	20 %	0 %	40 %	40 %	188591877
29	NC_010530	GCCGA	2	10	34577	34586	20 %	0 %	40 %	40 %	188591877
30	NC_010530	CGGGC	2	10	35343	35352	0 %	0 %	60 %	40 %	188591878
31	NC_010530	GGCGC	2	10	36537	36546	0 %	0 %	60 %	40 %	188591879
32	NC_010530	CGGCG	2	10	36649	36658	0 %	0 %	60 %	40 %	188591879
33	NC_010530	TGGCT	2	10	38055	38064	0 %	40 %	40 %	20 %	188591880
34	NC_010530	CCGGC	2	10	38483	38492	0 %	0 %	40 %	60 %	188591880
35	NC_010530	GCGCG	2	10	40432	40441	0 %	0 %	60 %	40 %	188591882
36	NC_010530	CACCG	2	10	40562	40571	20 %	0 %	20 %	60 %	188591882
37	NC_010530	GCCGA	2	10	42191	42200	20 %	0 %	40 %	40 %	188591883
38	NC_010530	GCGTC	2	10	42333	42342	0 %	20 %	40 %	40 %	188591884
39	NC_010530	GCTGT	2	10	42647	42656	0 %	40 %	40 %	20 %	188591884
40	NC_010530	CGGCG	2	10	44090	44099	0 %	0 %	60 %	40 %	188591885
41	NC_010530	GCGTG	2	10	44271	44280	0 %	20 %	60 %	20 %	188591885
42	NC_010530	CCGCG	2	10	44348	44357	0 %	0 %	40 %	60 %	188591885
43	NC_010530	CGCGC	2	10	44744	44753	0 %	0 %	40 %	60 %	188591886
44	NC_010530	GGCCG	2	10	45025	45034	0 %	0 %	60 %	40 %	188591886
45	NC_010530	CTTGC	2	10	47203	47212	0 %	40 %	20 %	40 %	188591889
46	NC_010530	GGCCG	2	10	48450	48459	0 %	0 %	60 %	40 %	188591890
47	NC_010530	CGAAC	2	10	50249	50258	40 %	0 %	20 %	40 %	188591893
48	NC_010530	GGTCG	2	10	51168	51177	0 %	20 %	60 %	20 %	188591894
49	NC_010530	CGAGC	2	10	52000	52009	20 %	0 %	40 %	40 %	188591896
50	NC_010530	CGCGG	2	10	53085	53094	0 %	0 %	60 %	40 %	188591896
51	NC_010530	CTCGA	2	10	53443	53452	20 %	20 %	20 %	40 %	188591897
52	NC_010530	GCGCC	2	10	53477	53486	0 %	0 %	40 %	60 %	188591897
53	NC_010530	GGGCA	2	10	56544	56553	20 %	0 %	60 %	20 %	188591899
54	NC_010530	TGGCC	2	10	56787	56796	0 %	20 %	40 %	40 %	188591899
55	NC_010530	CGCGG	2	10	56842	56851	0 %	0 %	60 %	40 %	188591899
56	NC_010530	ACGGC	2	10	57062	57071	20 %	0 %	40 %	40 %	188591899
57	NC_010530	CGGCG	2	10	57123	57132	0 %	0 %	60 %	40 %	188591899
58	NC_010530	GCACG	2	10	57933	57942	20 %	0 %	40 %	40 %	188591900
59	NC_010530	CGGCA	2	10	58899	58908	20 %	0 %	40 %	40 %	188591902
60	NC_010530	ATCGA	2	10	60514	60523	40 %	20 %	20 %	20 %	188591903
61	NC_010530	GCGCC	2	10	63251	63260	0 %	0 %	40 %	60 %	188591905
62	NC_010530	GCGCG	2	10	63346	63355	0 %	0 %	60 %	40 %	188591905
63	NC_010530	GGCGC	2	10	65510	65519	0 %	0 %	60 %	40 %	188591908
64	NC_010530	GCCGC	2	10	65682	65691	0 %	0 %	40 %	60 %	188591908
65	NC_010530	CGGCC	2	10	66605	66614	0 %	0 %	40 %	60 %	188591908
66	NC_010530	GGCCA	2	10	67272	67281	20 %	0 %	40 %	40 %	188591910
67	NC_010530	CGGCG	2	10	68660	68669	0 %	0 %	60 %	40 %	188591911
68	NC_010530	ATGCC	2	10	69559	69568	20 %	20 %	20 %	40 %	188591912
69	NC_010530	ACCCC	2	10	71566	71575	20 %	0 %	0 %	80 %	188591914
70	NC_010530	GGCAT	2	10	73753	73762	20 %	20 %	40 %	20 %	188591915
71	NC_010530	GCCGC	2	10	73888	73897	0 %	0 %	40 %	60 %	188591915
72	NC_010530	GCGCG	2	10	74154	74163	0 %	0 %	60 %	40 %	188591915
73	NC_010530	GGTCC	2	10	75821	75830	0 %	20 %	40 %	40 %	188591917
74	NC_010530	CAGCG	2	10	78153	78162	20 %	0 %	40 %	40 %	188591919
75	NC_010530	GCCGC	2	10	78378	78387	0 %	0 %	40 %	60 %	188591919
76	NC_010530	AGTTC	2	10	80031	80040	20 %	40 %	20 %	20 %	188591921
77	NC_010530	GCCAT	2	10	80534	80543	20 %	20 %	20 %	40 %	188591922
78	NC_010530	GCGCC	2	10	81697	81706	0 %	0 %	40 %	60 %	188591922
79	NC_010530	ATCGG	2	10	82166	82175	20 %	20 %	40 %	20 %	188591922
80	NC_010530	GGCGT	2	10	83632	83641	0 %	20 %	60 %	20 %	188591924
81	NC_010530	GGGCT	2	10	83785	83794	0 %	20 %	60 %	20 %	188591924
82	NC_010530	CGCGC	2	10	84316	84325	0 %	0 %	40 %	60 %	188591924
83	NC_010530	CGTGC	2	10	84399	84408	0 %	20 %	40 %	40 %	188591924
84	NC_010530	TGCGC	2	10	85672	85681	0 %	20 %	40 %	40 %	188591925
85	NC_010530	CCATC	2	10	86823	86832	20 %	20 %	0 %	60 %	188591926
86	NC_010530	CGGCG	2	10	87335	87344	0 %	0 %	60 %	40 %	188591926
87	NC_010530	CTTGC	2	10	88068	88077	0 %	40 %	20 %	40 %	188591926
88	NC_010530	GCGCC	2	10	88591	88600	0 %	0 %	40 %	60 %	188591927
89	NC_010530	CGGCG	2	10	89994	90003	0 %	0 %	60 %	40 %	188591929
90	NC_010530	GCCGG	2	10	92457	92466	0 %	0 %	60 %	40 %	188591931
91	NC_010530	GCGCC	2	10	93641	93650	0 %	0 %	40 %	60 %	188591932
92	NC_010530	CCTGG	2	10	95864	95873	0 %	20 %	40 %	40 %	188591935
93	NC_010530	AGGCC	2	10	96016	96025	20 %	0 %	40 %	40 %	188591935
94	NC_010530	GCGCC	2	10	97774	97783	0 %	0 %	40 %	60 %	188591936
95	NC_010530	CGCGG	2	10	99089	99098	0 %	0 %	60 %	40 %	188591938
96	NC_010530	GCACC	2	10	101005	101014	20 %	0 %	20 %	60 %	188591939
97	NC_010530	GGCCG	2	10	103789	103798	0 %	0 %	60 %	40 %	188591942
98	NC_010530	GCTGC	2	10	103959	103968	0 %	20 %	40 %	40 %	188591942
99	NC_010530	GCCGC	2	10	105754	105763	0 %	0 %	40 %	60 %	188591943
100	NC_010530	GCGCG	2	10	106066	106075	0 %	0 %	60 %	40 %	188591943
101	NC_010530	TGACC	2	10	106556	106565	20 %	20 %	20 %	40 %	188591943
102	NC_010530	GGGCG	2	10	108091	108100	0 %	0 %	80 %	20 %	188591944
103	NC_010530	GGCCA	2	10	108815	108824	20 %	0 %	40 %	40 %	188591944
104	NC_010530	CGCTG	2	10	109194	109203	0 %	20 %	40 %	40 %	188591945
105	NC_010530	GCCTG	2	10	110409	110418	0 %	20 %	40 %	40 %	188591945
106	NC_010530	GCCGC	2	10	111199	111208	0 %	0 %	40 %	60 %	188591946
107	NC_010530	CTGGG	2	10	111721	111730	0 %	20 %	60 %	20 %	188591946
108	NC_010530	GAAGG	2	10	111979	111988	40 %	0 %	60 %	0 %	188591946
109	NC_010530	CGGCG	2	10	113499	113508	0 %	0 %	60 %	40 %	188591948
110	NC_010530	CACGC	2	10	114490	114499	20 %	0 %	20 %	60 %	188591950
111	NC_010530	GTTCA	2	10	114528	114537	20 %	40 %	20 %	20 %	188591950
112	NC_010530	GAAAA	2	10	116915	116924	80 %	0 %	20 %	0 %	188591953
113	NC_010530	GTTCG	2	10	120367	120376	0 %	40 %	40 %	20 %	188591955
114	NC_010530	CGGTG	2	10	121964	121973	0 %	20 %	60 %	20 %	188591957
115	NC_010530	TTCCA	2	10	122442	122451	20 %	40 %	0 %	40 %	188591958
116	NC_010530	GCGCC	2	10	124560	124569	0 %	0 %	40 %	60 %	188591960
117	NC_010530	GCCGA	2	10	124608	124617	20 %	0 %	40 %	40 %	188591960
118	NC_010530	TGGCG	2	10	124712	124721	0 %	20 %	60 %	20 %	188591960
119	NC_010530	ACTGC	2	10	125707	125716	20 %	20 %	20 %	40 %	188591961
120	NC_010530	CGAGC	2	10	126366	126375	20 %	0 %	40 %	40 %	188591961
121	NC_010530	CGGCG	2	10	130716	130725	0 %	0 %	60 %	40 %	188591968
122	NC_010530	ATGGC	2	10	130851	130860	20 %	20 %	40 %	20 %	188591969
123	NC_010530	GCCGC	2	10	131177	131186	0 %	0 %	40 %	60 %	188591969
124	NC_010530	CGCGC	2	10	132742	132751	0 %	0 %	40 %	60 %	188591970
125	NC_010530	CGGGC	2	10	133541	133550	0 %	0 %	60 %	40 %	188591971
126	NC_010530	CGGCC	2	10	133994	134003	0 %	0 %	40 %	60 %	188591971
127	NC_010530	ACGGC	2	10	135337	135346	20 %	0 %	40 %	40 %	188591971
128	NC_010530	GATGC	2	10	136336	136345	20 %	20 %	40 %	20 %	188591971
129	NC_010530	GGCGC	2	10	138466	138475	0 %	0 %	60 %	40 %	188591973
130	NC_010530	GCGCC	2	10	140776	140785	0 %	0 %	40 %	60 %	188591974
131	NC_010530	CGCGC	2	10	140976	140985	0 %	0 %	40 %	60 %	188591974
132	NC_010530	GCTCG	2	10	143720	143729	0 %	20 %	40 %	40 %	188591977
133	NC_010530	GCCGC	2	10	144474	144483	0 %	0 %	40 %	60 %	188591977
134	NC_010530	CAGGG	2	10	146518	146527	20 %	0 %	60 %	20 %	188591979
135	NC_010530	CCGCG	2	10	146613	146622	0 %	0 %	40 %	60 %	188591979
136	NC_010530	TGGCG	2	10	149472	149481	0 %	20 %	60 %	20 %	188591981
137	NC_010530	CGGCC	2	10	151474	151483	0 %	0 %	40 %	60 %	188591983
138	NC_010530	GCGCC	2	10	151647	151656	0 %	0 %	40 %	60 %	188591983
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151	NC_010530	GCCTT	2	10	174823	174832	0 %	40 %	20 %	40 %	188592002
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249	NC_010530	GCCAT	2	10	295130	295139	20 %	20 %	20 %	40 %	188592107
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251	NC_010530	CGGCC	2	10	297155	297164	0 %	0 %	40 %	60 %	188592110
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253	NC_010530	AGACC	2	10	303543	303552	40 %	0 %	20 %	40 %	188592119
254	NC_010530	GACCA	2	10	305074	305083	40 %	0 %	20 %	40 %	188592121
255	NC_010530	TGCGC	2	10	305991	306000	0 %	20 %	40 %	40 %	188592121
256	NC_010530	ACGCC	2	10	306217	306226	20 %	0 %	20 %	60 %	188592122
257	NC_010530	GAGCA	2	10	306249	306258	40 %	0 %	40 %	20 %	188592122
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259	NC_010530	GTCCG	2	10	311950	311959	0 %	20 %	40 %	40 %	188592126
260	NC_010530	CACGC	2	10	312864	312873	20 %	0 %	20 %	60 %	188592127
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262	NC_010530	CCTTG	2	10	316796	316805	0 %	40 %	20 %	40 %	188592129
263	NC_010530	CCTGG	2	10	317916	317925	0 %	20 %	40 %	40 %	188592130
264	NC_010530	GCCAT	2	10	319045	319054	20 %	20 %	20 %	40 %	188592131
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266	NC_010530	GGGCT	2	10	324461	324470	0 %	20 %	60 %	20 %	188592133
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