MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010529	GGCGAT	2	12	14936	14947	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010529	CCGCGA	2	12	44953	44964	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010529	CTGGTC	2	12	58565	58576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010529	TCGCGA	2	12	62414	62425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010529	GCTGGG	2	12	69304	69315	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_010529	TCCGGT	2	12	73013	73024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010529	ATGACG	2	12	100064	100075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010529	GATCGA	2	12	108271	108282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010529	GGCGCC	2	12	127769	127780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010529	TCGCCC	2	12	132305	132316	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010529	AGCGCT	2	12	132366	132377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010529	GTCAAG	2	12	145054	145065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010529	CGCCGG	2	12	145071	145082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_010529	AGGAAG	2	12	145461	145472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010529	TATCTC	2	12	200466	200477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010529	GTTTCT	2	12	225983	225994	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010529	TCCGAG	2	12	257300	257311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010529	CGGCCG	2	12	258581	258592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010529	CGGCCG	2	12	275185	275196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010529	TCGCGA	2	12	317999	318010	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010529	AGCGGC	2	12	328798	328809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010529	GGTGCC	2	12	353961	353972	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010529	ACTGAA	2	12	417221	417232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010529	AGTTGC	2	12	446482	446493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010529	ATGCGC	2	12	452572	452583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010529	CGCTGC	2	12	497180	497191	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010529	GCGCTC	2	12	501168	501179	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010529	ACCATC	2	12	523233	523244	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.