MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 1214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010529	AGCG	2	8	549	556	25 %	0 %	50 %	25 %	188591328
2	NC_010529	TCGA	2	8	649	656	25 %	25 %	25 %	25 %	188591328
3	NC_010529	GTTT	2	8	790	797	0 %	75 %	25 %	0 %	188591328
4	NC_010529	TCGC	2	8	955	962	0 %	25 %	25 %	50 %	188591328
5	NC_010529	CGGA	2	8	3880	3887	25 %	0 %	50 %	25 %	188591329
6	NC_010529	GGAA	2	8	3941	3948	50 %	0 %	50 %	0 %	188591329
7	NC_010529	AGTC	2	8	4174	4181	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
8	NC_010529	CGTA	2	8	4493	4500	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
9	NC_010529	GAAA	2	8	4703	4710	75 %	0 %	25 %	0 %	188591329
10	NC_010529	TTTC	2	8	4765	4772	0 %	75 %	0 %	25 %	188591329
11	NC_010529	ACTG	2	8	5063	5070	25 %	25 %	25 %	25 %	188591329
12	NC_010529	TATC	2	8	6540	6547	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
13	NC_010529	ATCC	2	8	6617	6624	25 %	25 %	0 %	50 %	188591330
14	NC_010529	ATTT	2	8	7122	7129	25 %	75 %	0 %	0 %	188591330
15	NC_010529	GAAG	2	8	7397	7404	50 %	0 %	50 %	0 %	188591330
16	NC_010529	GGAA	2	8	7892	7899	50 %	0 %	50 %	0 %	188591330
17	NC_010529	TTCA	2	8	8345	8352	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
18	NC_010529	CATT	2	8	8674	8681	25 %	50 %	0 %	25 %	188591330
19	NC_010529	CGGC	2	8	9633	9640	0 %	0 %	50 %	50 %	188591331
20	NC_010529	CAGC	2	8	9747	9754	25 %	0 %	25 %	50 %	188591331
21	NC_010529	GGCA	2	8	10143	10150	25 %	0 %	50 %	25 %	188591331
22	NC_010529	GTGC	2	8	10243	10250	0 %	25 %	50 %	25 %	188591331
23	NC_010529	TGCT	2	8	12475	12482	0 %	50 %	25 %	25 %	188591332
24	NC_010529	CGAC	2	8	13307	13314	25 %	0 %	25 %	50 %	188591332
25	NC_010529	GGCA	2	8	13872	13879	25 %	0 %	50 %	25 %	188591333
26	NC_010529	CCAA	2	8	13970	13977	50 %	0 %	0 %	50 %	188591333
27	NC_010529	GCTG	2	8	13981	13988	0 %	25 %	50 %	25 %	188591333
28	NC_010529	CTGG	2	8	14056	14063	0 %	25 %	50 %	25 %	188591333
29	NC_010529	GCAG	2	8	14200	14207	25 %	0 %	50 %	25 %	188591333
30	NC_010529	GGCC	2	8	17123	17130	0 %	0 %	50 %	50 %	188591334
31	NC_010529	ATCG	2	8	17507	17514	25 %	25 %	25 %	25 %	188591334
32	NC_010529	GACT	2	8	18429	18436	25 %	25 %	25 %	25 %	188591335
33	NC_010529	CTTG	2	8	20760	20767	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
34	NC_010529	GTTC	2	8	21449	21456	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
35	NC_010529	AGGC	2	8	21537	21544	25 %	0 %	50 %	25 %	188591336
36	NC_010529	CCGC	2	8	21586	21593	0 %	0 %	25 %	75 %	188591336
37	NC_010529	CGAC	2	8	21732	21739	25 %	0 %	25 %	50 %	188591336
38	NC_010529	GAGC	2	8	21929	21936	25 %	0 %	50 %	25 %	188591336
39	NC_010529	TCGC	2	8	21997	22004	0 %	25 %	25 %	50 %	188591336
40	NC_010529	CGTT	2	8	22025	22032	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
41	NC_010529	GCCA	2	8	22034	22041	25 %	0 %	25 %	50 %	188591336
42	NC_010529	CAGG	2	8	22114	22121	25 %	0 %	50 %	25 %	188591336
43	NC_010529	TCGC	2	8	22597	22604	0 %	25 %	25 %	50 %	188591336
44	NC_010529	TCGT	2	8	22639	22646	0 %	50 %	25 %	25 %	188591336
45	NC_010529	TCCA	2	8	23456	23463	25 %	25 %	0 %	50 %	188591336
46	NC_010529	GGGC	2	8	24998	25005	0 %	0 %	75 %	25 %	188591337
47	NC_010529	CAGG	2	8	25044	25051	25 %	0 %	50 %	25 %	188591338
48	NC_010529	CGGC	2	8	25074	25081	0 %	0 %	50 %	50 %	188591338
49	NC_010529	GTCT	2	8	25559	25566	0 %	50 %	25 %	25 %	188591338
50	NC_010529	GCCA	2	8	26060	26067	25 %	0 %	25 %	50 %	188591338
51	NC_010529	CCGG	2	8	26430	26437	0 %	0 %	50 %	50 %	188591338
52	NC_010529	GCAG	2	8	27137	27144	25 %	0 %	50 %	25 %	188591339
53	NC_010529	GCCG	2	8	27163	27170	0 %	0 %	50 %	50 %	188591339
54	NC_010529	CAGG	2	8	27263	27270	25 %	0 %	50 %	25 %	188591339
55	NC_010529	TGCC	2	8	27352	27359	0 %	25 %	25 %	50 %	188591339
56	NC_010529	CCAT	2	8	27376	27383	25 %	25 %	0 %	50 %	188591339
57	NC_010529	CAAG	2	8	27687	27694	50 %	0 %	25 %	25 %	188591340
58	NC_010529	CACT	2	8	28240	28247	25 %	25 %	0 %	50 %	188591341
59	NC_010529	CTCA	2	8	29607	29614	25 %	25 %	0 %	50 %	188591343
60	NC_010529	ATGA	2	8	29671	29678	50 %	25 %	25 %	0 %	188591343
61	NC_010529	GAAC	2	8	30509	30516	50 %	0 %	25 %	25 %	188591343
62	NC_010529	TGCT	2	8	30813	30820	0 %	50 %	25 %	25 %	188591343
63	NC_010529	GAAC	2	8	30910	30917	50 %	0 %	25 %	25 %	188591343
64	NC_010529	GATA	2	8	31813	31820	50 %	25 %	25 %	0 %	188591344
65	NC_010529	GGCT	2	8	32339	32346	0 %	25 %	50 %	25 %	188591345
66	NC_010529	AGCG	2	8	32412	32419	25 %	0 %	50 %	25 %	188591345
67	NC_010529	ACGA	2	8	32694	32701	50 %	0 %	25 %	25 %	188591345
68	NC_010529	GGTG	2	8	33037	33044	0 %	25 %	75 %	0 %	188591346
69	NC_010529	AGGG	2	8	33616	33623	25 %	0 %	75 %	0 %	188591346
70	NC_010529	TTTG	2	8	34710	34717	0 %	75 %	25 %	0 %	188591348
71	NC_010529	CCAA	2	8	35538	35545	50 %	0 %	0 %	50 %	188591349
72	NC_010529	TTGT	2	8	36209	36216	0 %	75 %	25 %	0 %	188591350
73	NC_010529	GATA	2	8	36702	36709	50 %	25 %	25 %	0 %	188591350
74	NC_010529	CATA	2	8	36898	36905	50 %	25 %	0 %	25 %	188591350
75	NC_010529	TTGC	2	8	37117	37124	0 %	50 %	25 %	25 %	188591350
76	NC_010529	ACCC	2	8	37387	37394	25 %	0 %	0 %	75 %	188591350
77	NC_010529	CTTG	2	8	37480	37487	0 %	50 %	25 %	25 %	188591350
78	NC_010529	CAAA	2	8	37592	37599	75 %	0 %	0 %	25 %	188591350
79	NC_010529	AATG	2	8	37600	37607	50 %	25 %	25 %	0 %	188591350
80	NC_010529	TCAT	2	8	37808	37815	25 %	50 %	0 %	25 %	188591351
81	NC_010529	CAAA	2	8	37833	37840	75 %	0 %	0 %	25 %	188591351
82	NC_010529	CCAG	2	8	38223	38230	25 %	0 %	25 %	50 %	188591352
83	NC_010529	TGCT	2	8	38243	38250	0 %	50 %	25 %	25 %	188591352
84	NC_010529	GCAA	2	8	38515	38522	50 %	0 %	25 %	25 %	188591352
85	NC_010529	TGCT	2	8	38541	38548	0 %	50 %	25 %	25 %	188591352
86	NC_010529	AATT	2	8	39689	39696	50 %	50 %	0 %	0 %	188591353
87	NC_010529	CGCC	2	8	40743	40750	0 %	0 %	25 %	75 %	188591354
88	NC_010529	GCTT	2	8	41087	41094	0 %	50 %	25 %	25 %	188591354
89	NC_010529	AGGC	2	8	41231	41238	25 %	0 %	50 %	25 %	188591355
90	NC_010529	GGAT	2	8	42266	42273	25 %	25 %	50 %	0 %	188591355
91	NC_010529	TCGG	2	8	42325	42332	0 %	25 %	50 %	25 %	188591355
92	NC_010529	GGGC	2	8	42893	42900	0 %	0 %	75 %	25 %	188591356
93	NC_010529	CCCG	2	8	43087	43094	0 %	0 %	25 %	75 %	188591356
94	NC_010529	CGTT	2	8	44442	44449	0 %	50 %	25 %	25 %	188591357
95	NC_010529	GGAA	2	8	44463	44470	50 %	0 %	50 %	0 %	188591357
96	NC_010529	TCGG	2	8	45278	45285	0 %	25 %	50 %	25 %	188591358
97	NC_010529	TCCT	2	8	45539	45546	0 %	50 %	0 %	50 %	188591358
98	NC_010529	GGGC	2	8	45603	45610	0 %	0 %	75 %	25 %	188591358
99	NC_010529	TCCA	2	8	46370	46377	25 %	25 %	0 %	50 %	188591360
100	NC_010529	ATGG	2	8	46504	46511	25 %	25 %	50 %	0 %	188591360
101	NC_010529	ATGG	2	8	47445	47452	25 %	25 %	50 %	0 %	188591362
102	NC_010529	CCGG	2	8	48035	48042	0 %	0 %	50 %	50 %	188591362
103	NC_010529	GATT	2	8	48712	48719	25 %	50 %	25 %	0 %	188591362
104	NC_010529	CTGC	2	8	49313	49320	0 %	25 %	25 %	50 %	188591363
105	NC_010529	GCCG	2	8	49431	49438	0 %	0 %	50 %	50 %	188591363
106	NC_010529	GGCT	2	8	49537	49544	0 %	25 %	50 %	25 %	188591363
107	NC_010529	GATG	2	8	50051	50058	25 %	25 %	50 %	0 %	188591363
108	NC_010529	CCGG	2	8	50728	50735	0 %	0 %	50 %	50 %	188591364
109	NC_010529	CTGC	2	8	52557	52564	0 %	25 %	25 %	50 %	188591365
110	NC_010529	CGAT	2	8	52621	52628	25 %	25 %	25 %	25 %	188591365
111	NC_010529	CCGA	2	8	54904	54911	25 %	0 %	25 %	50 %	188591365
112	NC_010529	GCCG	2	8	55041	55048	0 %	0 %	50 %	50 %	188591366
113	NC_010529	TCGA	2	8	55166	55173	25 %	25 %	25 %	25 %	188591366
114	NC_010529	CCCG	2	8	55443	55450	0 %	0 %	25 %	75 %	188591366
115	NC_010529	GCGA	2	8	55514	55521	25 %	0 %	50 %	25 %	188591366
116	NC_010529	GGAT	2	8	55950	55957	25 %	25 %	50 %	0 %	188591366
117	NC_010529	CGGC	2	8	56894	56901	0 %	0 %	50 %	50 %	188591368
118	NC_010529	CGGT	2	8	56965	56972	0 %	25 %	50 %	25 %	188591368
119	NC_010529	CACC	2	8	58083	58090	25 %	0 %	0 %	75 %	188591369
120	NC_010529	GGCG	2	8	58301	58308	0 %	0 %	75 %	25 %	188591369
121	NC_010529	GGGT	2	8	59938	59945	0 %	25 %	75 %	0 %	188591370
122	NC_010529	GCCA	2	8	60037	60044	25 %	0 %	25 %	50 %	188591370
123	NC_010529	CCCG	2	8	60298	60305	0 %	0 %	25 %	75 %	188591370
124	NC_010529	GGGC	2	8	60869	60876	0 %	0 %	75 %	25 %	188591371
125	NC_010529	TCGC	2	8	61086	61093	0 %	25 %	25 %	50 %	188591371
126	NC_010529	CAGC	2	8	61160	61167	25 %	0 %	25 %	50 %	188591371
127	NC_010529	CGGC	2	8	61248	61255	0 %	0 %	50 %	50 %	188591371
128	NC_010529	GCAG	2	8	61425	61432	25 %	0 %	50 %	25 %	188591372
129	NC_010529	GTCC	2	8	61488	61495	0 %	25 %	25 %	50 %	188591372
130	NC_010529	AAGC	2	8	61561	61568	50 %	0 %	25 %	25 %	188591372
131	NC_010529	TGCC	2	8	63874	63881	0 %	25 %	25 %	50 %	188591374
132	NC_010529	TCAA	2	8	63909	63916	50 %	25 %	0 %	25 %	188591374
133	NC_010529	GTCG	2	8	64864	64871	0 %	25 %	50 %	25 %	188591375
134	NC_010529	GCCG	2	8	65197	65204	0 %	0 %	50 %	50 %	188591375
135	NC_010529	GCGG	2	8	65906	65913	0 %	0 %	75 %	25 %	188591377
136	NC_010529	CTTC	2	8	65994	66001	0 %	50 %	0 %	50 %	188591378
137	NC_010529	CTCG	2	8	67700	67707	0 %	25 %	25 %	50 %	188591380
138	NC_010529	GAAG	2	8	68092	68099	50 %	0 %	50 %	0 %	188591381
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