MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 6144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010529	GGC	2	6	58	63	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591328
2	NC_010529	ACG	2	6	143	148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591328
3	NC_010529	AAG	2	6	253	258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591328
4	NC_010529	GGA	2	6	312	317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591328
5	NC_010529	CAG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591328
6	NC_010529	TAC	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591328
7	NC_010529	ACA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591328
8	NC_010529	ACT	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591328
9	NC_010529	GAA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591328
10	NC_010529	ATG	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591328
11	NC_010529	CTT	2	6	619	624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591328
12	NC_010529	CCA	2	6	722	727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591328
13	NC_010529	ACA	2	6	749	754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591328
14	NC_010529	CCG	2	6	821	826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
15	NC_010529	ATG	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591328
16	NC_010529	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591328
17	NC_010529	CCG	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
18	NC_010529	TCA	2	6	935	940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591328
19	NC_010529	GAG	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591328
20	NC_010529	CAG	2	6	1141	1146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591328
21	NC_010529	AAG	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591328
22	NC_010529	GAC	2	6	1165	1170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591328
23	NC_010529	GAG	2	6	1213	1218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591328
24	NC_010529	CTG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591328
25	NC_010529	TTC	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591328
26	NC_010529	TCA	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591328
27	NC_010529	AGG	2	6	1499	1504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591328
28	NC_010529	GCG	2	6	1569	1574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591328
29	NC_010529	CTT	2	6	1622	1627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591328
30	NC_010529	CCG	2	6	1677	1682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
31	NC_010529	AAC	2	6	1727	1732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591328
32	NC_010529	CTG	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591328
33	NC_010529	GCG	2	6	1874	1879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591328
34	NC_010529	CGC	2	6	1932	1937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
35	NC_010529	CTT	2	6	1953	1958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591328
36	NC_010529	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591328
37	NC_010529	CGC	2	6	2019	2024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591328
38	NC_010529	ACG	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
39	NC_010529	CGG	2	6	2219	2224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591329
40	NC_010529	CAA	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591329
41	NC_010529	GAA	2	6	2340	2345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591329
42	NC_010529	GGC	2	6	2346	2351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591329
43	NC_010529	TCG	4	12	2461	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591329
44	NC_010529	AAC	2	6	2616	2621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591329
45	NC_010529	ACC	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591329
46	NC_010529	CTC	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591329
47	NC_010529	CGA	2	6	3233	3238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
48	NC_010529	GAA	2	6	3245	3250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591329
49	NC_010529	AGA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591329
50	NC_010529	TTC	2	6	3330	3335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591329
51	NC_010529	GAC	2	6	3366	3371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
52	NC_010529	ACG	2	6	3484	3489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
53	NC_010529	GTC	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591329
54	NC_010529	GCA	2	6	3547	3552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
55	NC_010529	GCT	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591329
56	NC_010529	GGA	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591329
57	NC_010529	AAG	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591329
58	NC_010529	CGC	2	6	3723	3728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591329
59	NC_010529	CAA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591329
60	NC_010529	CTC	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591329
61	NC_010529	GAG	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591329
62	NC_010529	CCG	2	6	4090	4095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591329
63	NC_010529	ACA	2	6	4186	4191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591329
64	NC_010529	CGA	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
65	NC_010529	CGG	2	6	4385	4390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591329
66	NC_010529	AGC	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591329
67	NC_010529	TTG	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591329
68	NC_010529	GGC	2	6	5039	5044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591329
69	NC_010529	CGT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591330
70	NC_010529	AAG	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591330
71	NC_010529	CGC	2	6	5948	5953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591330
72	NC_010529	GTT	2	6	5988	5993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591330
73	NC_010529	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591330
74	NC_010529	ATT	2	6	6238	6243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188591330
75	NC_010529	TCA	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591330
76	NC_010529	CAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188591330
77	NC_010529	GGA	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591330
78	NC_010529	GAC	2	6	6672	6677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
79	NC_010529	TAA	2	6	6740	6745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591330
80	NC_010529	TTG	2	6	6811	6816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591330
81	NC_010529	TCG	2	6	6877	6882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591330
82	NC_010529	ACG	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
83	NC_010529	ATC	3	9	7065	7073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591330
84	NC_010529	CGA	2	6	7271	7276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
85	NC_010529	TTC	2	6	7441	7446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591330
86	NC_010529	CGC	2	6	7622	7627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591330
87	NC_010529	TTG	2	6	7633	7638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591330
88	NC_010529	AGC	2	6	7746	7751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
89	NC_010529	ACG	2	6	7780	7785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591330
90	NC_010529	TTC	2	6	7821	7826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591330
91	NC_010529	CGG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591330
92	NC_010529	AGA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591330
93	NC_010529	GAA	2	6	8054	8059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591330
94	NC_010529	GTT	2	6	8079	8084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188591330
95	NC_010529	ATG	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591330
96	NC_010529	GGC	2	6	8130	8135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591330
97	NC_010529	AAT	2	6	8361	8366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188591330
98	NC_010529	CGC	2	6	8396	8401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591330
99	NC_010529	GGT	2	6	8576	8581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188591330
100	NC_010529	ATG	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188591330
101	NC_010529	GCC	2	6	9025	9030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591330
102	NC_010529	GGC	2	6	9652	9657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591331
103	NC_010529	AAG	2	6	9712	9717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591331
104	NC_010529	GAA	3	9	10011	10019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591331
105	NC_010529	AAG	2	6	10033	10038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188591331
106	NC_010529	TCG	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591331
107	NC_010529	CAT	2	6	10206	10211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591331
108	NC_010529	GAG	2	6	10260	10265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591331
109	NC_010529	GGC	2	6	10314	10319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591331
110	NC_010529	CCG	2	6	12410	12415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591332
111	NC_010529	TCG	2	6	12442	12447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591332
112	NC_010529	GAC	2	6	12528	12533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591332
113	NC_010529	TCT	2	6	12622	12627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188591332
114	NC_010529	CGG	2	6	12836	12841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591332
115	NC_010529	CGG	2	6	12874	12879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591332
116	NC_010529	AGG	2	6	12901	12906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591332
117	NC_010529	CTG	2	6	12930	12935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591332
118	NC_010529	AAC	2	6	12963	12968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591332
119	NC_010529	ATC	2	6	13001	13006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591332
120	NC_010529	AGG	2	6	13021	13026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591332
121	NC_010529	TGC	2	6	13045	13050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591332
122	NC_010529	GCC	2	6	13077	13082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591332
123	NC_010529	CGT	2	6	13113	13118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591332
124	NC_010529	GCG	2	6	13134	13139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591332
125	NC_010529	ACG	2	6	13185	13190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591332
126	NC_010529	GCA	2	6	13225	13230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591332
127	NC_010529	CTC	2	6	13351	13356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591332
128	NC_010529	CGC	2	6	13367	13372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591332
129	NC_010529	CGC	2	6	13383	13388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591332
130	NC_010529	AGC	2	6	13501	13506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591332
131	NC_010529	GGC	2	6	13565	13570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591332
132	NC_010529	GAG	2	6	13656	13661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188591332
133	NC_010529	CGC	2	6	13666	13671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188591332
134	NC_010529	ACG	2	6	13723	13728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591332
135	NC_010529	CTG	2	6	13731	13736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188591332
136	NC_010529	GCA	2	6	13749	13754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591332
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151	NC_010529	ATC	2	6	14530	14535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188591333
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249	NC_010529	CCT	2	6	23948	23953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188591337
250	NC_010529	AGC	2	6	24024	24029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188591337
251	NC_010529	CAA	2	6	24083	24088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188591337
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253	NC_010529	CGG	2	6	24185	24190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188591337
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