MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus taiwanensis LMG 19424 plasmid pRALTA

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010529	G	6	6	3221	3226	0 %	0 %	100 %	0 %	188591329
2	NC_010529	T	6	6	6300	6305	0 %	100 %	0 %	0 %	188591330
3	NC_010529	C	7	7	7585	7591	0 %	0 %	0 %	100 %	188591330
4	NC_010529	C	8	8	8290	8297	0 %	0 %	0 %	100 %	188591330
5	NC_010529	A	8	8	9014	9021	100 %	0 %	0 %	0 %	188591330
6	NC_010529	T	6	6	10122	10127	0 %	100 %	0 %	0 %	188591331
7	NC_010529	G	6	6	19491	19496	0 %	0 %	100 %	0 %	188591335
8	NC_010529	T	6	6	20190	20195	0 %	100 %	0 %	0 %	188591336
9	NC_010529	A	6	6	24722	24727	100 %	0 %	0 %	0 %	188591337
10	NC_010529	T	6	6	28662	28667	0 %	100 %	0 %	0 %	188591341
11	NC_010529	C	6	6	29404	29409	0 %	0 %	0 %	100 %	188591343
12	NC_010529	G	6	6	30546	30551	0 %	0 %	100 %	0 %	188591343
13	NC_010529	T	6	6	31014	31019	0 %	100 %	0 %	0 %	188591344
14	NC_010529	G	7	7	33245	33251	0 %	0 %	100 %	0 %	188591346
15	NC_010529	A	7	7	34941	34947	100 %	0 %	0 %	0 %	188591348
16	NC_010529	T	6	6	36993	36998	0 %	100 %	0 %	0 %	188591350
17	NC_010529	T	6	6	38353	38358	0 %	100 %	0 %	0 %	188591352
18	NC_010529	T	7	7	38377	38383	0 %	100 %	0 %	0 %	188591352
19	NC_010529	T	7	7	41133	41139	0 %	100 %	0 %	0 %	188591354
20	NC_010529	C	6	6	44077	44082	0 %	0 %	0 %	100 %	188591357
21	NC_010529	G	6	6	50719	50724	0 %	0 %	100 %	0 %	188591364
22	NC_010529	G	6	6	53328	53333	0 %	0 %	100 %	0 %	188591365
23	NC_010529	C	6	6	61637	61642	0 %	0 %	0 %	100 %	188591372
24	NC_010529	G	7	7	69423	69429	0 %	0 %	100 %	0 %	188591383
25	NC_010529	A	6	6	69486	69491	100 %	0 %	0 %	0 %	188591383
26	NC_010529	A	6	6	71395	71400	100 %	0 %	0 %	0 %	188591387
27	NC_010529	G	6	6	72516	72521	0 %	0 %	100 %	0 %	188591388
28	NC_010529	A	6	6	79759	79764	100 %	0 %	0 %	0 %	188591394
29	NC_010529	C	6	6	105175	105180	0 %	0 %	0 %	100 %	188591410
30	NC_010529	A	6	6	111667	111672	100 %	0 %	0 %	0 %	188591416
31	NC_010529	G	7	7	114447	114453	0 %	0 %	100 %	0 %	188591422
32	NC_010529	C	6	6	117775	117780	0 %	0 %	0 %	100 %	188591427
33	NC_010529	C	6	6	124843	124848	0 %	0 %	0 %	100 %	188591435
34	NC_010529	A	6	6	124893	124898	100 %	0 %	0 %	0 %	188591435
35	NC_010529	A	6	6	131611	131616	100 %	0 %	0 %	0 %	188591441
36	NC_010529	C	6	6	137450	137455	0 %	0 %	0 %	100 %	188591448
37	NC_010529	T	6	6	141813	141818	0 %	100 %	0 %	0 %	188591451
38	NC_010529	G	6	6	150914	150919	0 %	0 %	100 %	0 %	188591463
39	NC_010529	C	6	6	162349	162354	0 %	0 %	0 %	100 %	188591478
40	NC_010529	C	6	6	169601	169606	0 %	0 %	0 %	100 %	188591484
41	NC_010529	A	6	6	173169	173174	100 %	0 %	0 %	0 %	188591488
42	NC_010529	C	6	6	183497	183502	0 %	0 %	0 %	100 %	188591498
43	NC_010529	C	6	6	186239	186244	0 %	0 %	0 %	100 %	188591501
44	NC_010529	G	6	6	187321	187326	0 %	0 %	100 %	0 %	188591503
45	NC_010529	G	6	6	191110	191115	0 %	0 %	100 %	0 %	188591505
46	NC_010529	A	6	6	200639	200644	100 %	0 %	0 %	0 %	188591514
47	NC_010529	C	6	6	203019	203024	0 %	0 %	0 %	100 %	188591517
48	NC_010529	T	7	7	204367	204373	0 %	100 %	0 %	0 %	188591518
49	NC_010529	A	6	6	208631	208636	100 %	0 %	0 %	0 %	188591521
50	NC_010529	A	6	6	212080	212085	100 %	0 %	0 %	0 %	188591523
51	NC_010529	A	8	8	212307	212314	100 %	0 %	0 %	0 %	188591524
52	NC_010529	G	6	6	212758	212763	0 %	0 %	100 %	0 %	188591524
53	NC_010529	C	6	6	215114	215119	0 %	0 %	0 %	100 %	188591526
54	NC_010529	A	7	7	216625	216631	100 %	0 %	0 %	0 %	188591527
55	NC_010529	A	6	6	220867	220872	100 %	0 %	0 %	0 %	188591531
56	NC_010529	A	6	6	222949	222954	100 %	0 %	0 %	0 %	188591534
57	NC_010529	C	6	6	223767	223772	0 %	0 %	0 %	100 %	188591536
58	NC_010529	T	6	6	225528	225533	0 %	100 %	0 %	0 %	188591537
59	NC_010529	A	6	6	225785	225790	100 %	0 %	0 %	0 %	188591538
60	NC_010529	G	6	6	232877	232882	0 %	0 %	100 %	0 %	188591544
61	NC_010529	G	6	6	236411	236416	0 %	0 %	100 %	0 %	188591548
62	NC_010529	A	6	6	241994	241999	100 %	0 %	0 %	0 %	188591557
63	NC_010529	G	6	6	242500	242505	0 %	0 %	100 %	0 %	188591557
64	NC_010529	A	6	6	243394	243399	100 %	0 %	0 %	0 %	188591558
65	NC_010529	C	6	6	261992	261997	0 %	0 %	0 %	100 %	188591569
66	NC_010529	G	6	6	269940	269945	0 %	0 %	100 %	0 %	188591576
67	NC_010529	T	7	7	270222	270228	0 %	100 %	0 %	0 %	188591576
68	NC_010529	A	6	6	276894	276899	100 %	0 %	0 %	0 %	188591580
69	NC_010529	T	6	6	278356	278361	0 %	100 %	0 %	0 %	188591581
70	NC_010529	T	6	6	279842	279847	0 %	100 %	0 %	0 %	188591583
71	NC_010529	T	6	6	281153	281158	0 %	100 %	0 %	0 %	188591585
72	NC_010529	T	7	7	281849	281855	0 %	100 %	0 %	0 %	188591585
73	NC_010529	C	6	6	287997	288002	0 %	0 %	0 %	100 %	188591590
74	NC_010529	A	7	7	290284	290290	100 %	0 %	0 %	0 %	188591590
75	NC_010529	C	7	7	294241	294247	0 %	0 %	0 %	100 %	188591593
76	NC_010529	A	6	6	295738	295743	100 %	0 %	0 %	0 %	188591595
77	NC_010529	A	7	7	299706	299712	100 %	0 %	0 %	0 %	188591599
78	NC_010529	T	6	6	299852	299857	0 %	100 %	0 %	0 %	188591600
79	NC_010529	A	7	7	299884	299890	100 %	0 %	0 %	0 %	188591600
80	NC_010529	C	6	6	302285	302290	0 %	0 %	0 %	100 %	188591602
81	NC_010529	A	6	6	303861	303866	100 %	0 %	0 %	0 %	188591603
82	NC_010529	A	6	6	304561	304566	100 %	0 %	0 %	0 %	188591603
83	NC_010529	C	6	6	306091	306096	0 %	0 %	0 %	100 %	188591606
84	NC_010529	A	7	7	307236	307242	100 %	0 %	0 %	0 %	188591607
85	NC_010529	A	6	6	308927	308932	100 %	0 %	0 %	0 %	188591609
86	NC_010529	T	6	6	309561	309566	0 %	100 %	0 %	0 %	188591609
87	NC_010529	T	6	6	311944	311949	0 %	100 %	0 %	0 %	188591611
88	NC_010529	T	6	6	312487	312492	0 %	100 %	0 %	0 %	188591612
89	NC_010529	A	7	7	314685	314691	100 %	0 %	0 %	0 %	188591614
90	NC_010529	T	7	7	315451	315457	0 %	100 %	0 %	0 %	188591615
91	NC_010529	G	6	6	320721	320726	0 %	0 %	100 %	0 %	188591618
92	NC_010529	A	7	7	322189	322195	100 %	0 %	0 %	0 %	188591620
93	NC_010529	A	6	6	323336	323341	100 %	0 %	0 %	0 %	188591622
94	NC_010529	T	6	6	323996	324001	0 %	100 %	0 %	0 %	188591624
95	NC_010529	A	6	6	327489	327494	100 %	0 %	0 %	0 %	188591627
96	NC_010529	T	7	7	327905	327911	0 %	100 %	0 %	0 %	188591628
97	NC_010529	T	6	6	329738	329743	0 %	100 %	0 %	0 %	188591629
98	NC_010529	G	6	6	330418	330423	0 %	0 %	100 %	0 %	188591629
99	NC_010529	T	6	6	331288	331293	0 %	100 %	0 %	0 %	188591631
100	NC_010529	G	6	6	331551	331556	0 %	0 %	100 %	0 %	188591631
101	NC_010529	A	7	7	332601	332607	100 %	0 %	0 %	0 %	188591634
102	NC_010529	G	7	7	333342	333348	0 %	0 %	100 %	0 %	188591635
103	NC_010529	T	7	7	334934	334940	0 %	100 %	0 %	0 %	188591636
104	NC_010529	A	7	7	343566	343572	100 %	0 %	0 %	0 %	188591641
105	NC_010529	T	6	6	343636	343641	0 %	100 %	0 %	0 %	188591641
106	NC_010529	A	7	7	345740	345746	100 %	0 %	0 %	0 %	188591643
107	NC_010529	T	8	8	346219	346226	0 %	100 %	0 %	0 %	188591643
108	NC_010529	T	6	6	349530	349535	0 %	100 %	0 %	0 %	188591645
109	NC_010529	A	6	6	353811	353816	100 %	0 %	0 %	0 %	188591646
110	NC_010529	G	6	6	359418	359423	0 %	0 %	100 %	0 %	188591652
111	NC_010529	C	10	10	367024	367033	0 %	0 %	0 %	100 %	188591661
112	NC_010529	G	6	6	369934	369939	0 %	0 %	100 %	0 %	188591662
113	NC_010529	A	6	6	376015	376020	100 %	0 %	0 %	0 %	188591669
114	NC_010529	A	6	6	379693	379698	100 %	0 %	0 %	0 %	188591673
115	NC_010529	C	7	7	382167	382173	0 %	0 %	0 %	100 %	188591676
116	NC_010529	A	6	6	385738	385743	100 %	0 %	0 %	0 %	188591679
117	NC_010529	A	7	7	389622	389628	100 %	0 %	0 %	0 %	188591683
118	NC_010529	T	6	6	389875	389880	0 %	100 %	0 %	0 %	188591684
119	NC_010529	C	6	6	390900	390905	0 %	0 %	0 %	100 %	188591686
120	NC_010529	G	8	8	397921	397928	0 %	0 %	100 %	0 %	188591692
121	NC_010529	T	6	6	398304	398309	0 %	100 %	0 %	0 %	188591693
122	NC_010529	A	6	6	404124	404129	100 %	0 %	0 %	0 %	188591699
123	NC_010529	T	6	6	417738	417743	0 %	100 %	0 %	0 %	188591714
124	NC_010529	T	6	6	418110	418115	0 %	100 %	0 %	0 %	188591714
125	NC_010529	T	6	6	418612	418617	0 %	100 %	0 %	0 %	188591714
126	NC_010529	C	7	7	431168	431174	0 %	0 %	0 %	100 %	188591723
127	NC_010529	G	6	6	433847	433852	0 %	0 %	100 %	0 %	188591725
128	NC_010529	C	6	6	437499	437504	0 %	0 %	0 %	100 %	188591730
129	NC_010529	A	6	6	439039	439044	100 %	0 %	0 %	0 %	188591731
130	NC_010529	G	10	10	440405	440414	0 %	0 %	100 %	0 %	188591731
131	NC_010529	C	6	6	447281	447286	0 %	0 %	0 %	100 %	188591737
132	NC_010529	G	7	7	450997	451003	0 %	0 %	100 %	0 %	188591740
133	NC_010529	T	6	6	472644	472649	0 %	100 %	0 %	0 %	188591763
134	NC_010529	G	6	6	473319	473324	0 %	0 %	100 %	0 %	188591764
135	NC_010529	G	6	6	477979	477984	0 %	0 %	100 %	0 %	188591766
136	NC_010529	G	6	6	480203	480208	0 %	0 %	100 %	0 %	188591768
137	NC_010529	A	6	6	483415	483420	100 %	0 %	0 %	0 %	188591772
138	NC_010529	T	8	8	484901	484908	0 %	100 %	0 %	0 %	188591774
139	NC_010529	C	6	6	487466	487471	0 %	0 %	0 %	100 %	188591778
140	NC_010529	G	6	6	489606	489611	0 %	0 %	100 %	0 %	188591781
141	NC_010529	T	6	6	489791	489796	0 %	100 %	0 %	0 %	188591782
142	NC_010529	T	6	6	494013	494018	0 %	100 %	0 %	0 %	188591788
143	NC_010529	T	6	6	503228	503233	0 %	100 %	0 %	0 %	188591799
144	NC_010529	C	6	6	507766	507771	0 %	0 %	0 %	100 %	188591802
145	NC_010529	T	6	6	508086	508091	0 %	100 %	0 %	0 %	188591802
146	NC_010529	G	6	6	509913	509918	0 %	0 %	100 %	0 %	188591805
147	NC_010529	T	6	6	513344	513349	0 %	100 %	0 %	0 %	188591808
148	NC_010529	T	7	7	526531	526537	0 %	100 %	0 %	0 %	188591817
149	NC_010529	T	6	6	536428	536433	0 %	100 %	0 %	0 %	188591827
150	NC_010529	T	6	6	540555	540560	0 %	100 %	0 %	0 %	188591831
151	NC_010529	G	6	6	540605	540610	0 %	0 %	100 %	0 %	188591831
152	NC_010529	C	6	6	544521	544526	0 %	0 %	0 %	100 %	188591834
153	NC_010529	C	7	7	544964	544970	0 %	0 %	0 %	100 %	188591835
154	NC_010529	A	6	6	545618	545623	100 %	0 %	0 %	0 %	188591835
155	NC_010529	T	6	6	549118	549123	0 %	100 %	0 %	0 %	188591838
156	NC_010529	T	6	6	549205	549210	0 %	100 %	0 %	0 %	188591838
157	NC_010529	G	7	7	554130	554136	0 %	0 %	100 %	0 %	188591845
158	NC_010529	C	6	6	554485	554490	0 %	0 %	0 %	100 %	188591846

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.