MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Pyrobaculum neutrophilum V24Sta chromosome

Total Repeats: 1016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010525	AGGCG	2	10	281	290	20 %	0 %	60 %	20 %	171184486
2	NC_010525	CGAGG	2	10	2545	2554	20 %	0 %	60 %	20 %	171184490
3	NC_010525	CTGGA	2	10	2823	2832	20 %	20 %	40 %	20 %	171184490
4	NC_010525	ACACG	2	10	5025	5034	40 %	0 %	20 %	40 %	171184492
5	NC_010525	CTACG	2	10	12510	12519	20 %	20 %	20 %	40 %	171184505
6	NC_010525	CAGGC	2	10	12562	12571	20 %	0 %	40 %	40 %	171184505
7	NC_010525	GCGCC	2	10	14683	14692	0 %	0 %	40 %	60 %	171184507
8	NC_010525	CGACG	2	10	17020	17029	20 %	0 %	40 %	40 %	171184509
9	NC_010525	GAGGC	2	10	17536	17545	20 %	0 %	60 %	20 %	171184510
10	NC_010525	CAAAA	2	10	17758	17767	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010525	GCTCT	2	10	17975	17984	0 %	40 %	20 %	40 %	171184511
12	NC_010525	GACTC	2	10	19335	19344	20 %	20 %	20 %	40 %	171184512
13	NC_010525	CCTCG	2	10	21424	21433	0 %	20 %	20 %	60 %	171184514
14	NC_010525	TGGGG	2	10	21793	21802	0 %	20 %	80 %	0 %	171184515
15	NC_010525	GGGCA	2	10	22234	22243	20 %	0 %	60 %	20 %	171184515
16	NC_010525	ACCGC	2	10	22668	22677	20 %	0 %	20 %	60 %	171184515
17	NC_010525	TGCTC	2	10	23072	23081	0 %	40 %	20 %	40 %	171184516
18	NC_010525	CCTCC	2	10	26664	26673	0 %	20 %	0 %	80 %	171184521
19	NC_010525	GGCTG	2	10	27730	27739	0 %	20 %	60 %	20 %	171184525
20	NC_010525	CGCCA	2	10	33074	33083	20 %	0 %	20 %	60 %	171184531
21	NC_010525	CGGCC	2	10	33374	33383	0 %	0 %	40 %	60 %	171184531
22	NC_010525	CCTCC	2	10	34220	34229	0 %	20 %	0 %	80 %	171184533
23	NC_010525	CAACA	2	10	36939	36948	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_010525	GGAGA	2	10	39344	39353	40 %	0 %	60 %	0 %	171184539
25	NC_010525	ACGCT	2	10	43785	43794	20 %	20 %	20 %	40 %	171184544
26	NC_010525	AGACG	2	10	43834	43843	40 %	0 %	40 %	20 %	171184544
27	NC_010525	CCCGA	2	10	44094	44103	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_010525	TCGCC	2	10	44357	44366	0 %	20 %	20 %	60 %	171184545
29	NC_010525	TATCC	2	10	44580	44589	20 %	40 %	0 %	40 %	171184545
30	NC_010525	ATAGA	2	10	45995	46004	60 %	20 %	20 %	0 %	171184545
31	NC_010525	GGGCG	2	10	48684	48693	0 %	0 %	80 %	20 %	171184547
32	NC_010525	GCCGC	2	10	49697	49706	0 %	0 %	40 %	60 %	171184547
33	NC_010525	GATGT	2	10	50914	50923	20 %	40 %	40 %	0 %	171184547
34	NC_010525	GCGCC	2	10	51366	51375	0 %	0 %	40 %	60 %	171184548
35	NC_010525	AACAA	2	10	53118	53127	80 %	0 %	0 %	20 %	171184549
36	NC_010525	AGGGG	2	10	53193	53202	20 %	0 %	80 %	0 %	171184549
37	NC_010525	ACGTC	2	10	55108	55117	20 %	20 %	20 %	40 %	171184549
38	NC_010525	GACTG	2	10	60102	60111	20 %	20 %	40 %	20 %	171184549
39	NC_010525	GACTG	2	10	60579	60588	20 %	20 %	40 %	20 %	171184549
40	NC_010525	CGTCT	2	10	60803	60812	0 %	40 %	20 %	40 %	171184549
41	NC_010525	CCCCG	2	10	62206	62215	0 %	0 %	20 %	80 %	171184551
42	NC_010525	GGCTT	2	10	62908	62917	0 %	40 %	40 %	20 %	171184552
43	NC_010525	GCCTC	2	10	65069	65078	0 %	20 %	20 %	60 %	171184554
44	NC_010525	GAGGC	2	10	66004	66013	20 %	0 %	60 %	20 %	171184555
45	NC_010525	GGCGT	2	10	71104	71113	0 %	20 %	60 %	20 %	171184562
46	NC_010525	CTGGG	2	10	71405	71414	0 %	20 %	60 %	20 %	171184562
47	NC_010525	AGGTG	2	10	72548	72557	20 %	20 %	60 %	0 %	171184564
48	NC_010525	CCTCC	2	10	72934	72943	0 %	20 %	0 %	80 %	171184565
49	NC_010525	CGCCT	2	10	77531	77540	0 %	20 %	20 %	60 %	171184573
50	NC_010525	CCAAG	2	10	81281	81290	40 %	0 %	20 %	40 %	171184579
51	NC_010525	GTGGC	2	10	81695	81704	0 %	20 %	60 %	20 %	171184580
52	NC_010525	TCCTC	2	10	84873	84882	0 %	40 %	0 %	60 %	171184583
53	NC_010525	CCTCC	2	10	85982	85991	0 %	20 %	0 %	80 %	171184584
54	NC_010525	GTTGA	2	10	86282	86291	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010525	TCGCC	2	10	88167	88176	0 %	20 %	20 %	60 %	171184587
56	NC_010525	CGGGG	2	10	88432	88441	0 %	0 %	80 %	20 %	171184587
57	NC_010525	ACCTC	2	10	89381	89390	20 %	20 %	0 %	60 %	171184588
58	NC_010525	CGGGG	2	10	90642	90651	0 %	0 %	80 %	20 %	171184588
59	NC_010525	ACCGG	2	10	92958	92967	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_010525	CAGAG	2	10	94887	94896	40 %	0 %	40 %	20 %	171184594
61	NC_010525	CTCGG	2	10	96906	96915	0 %	20 %	40 %	40 %	171184597
62	NC_010525	TGACG	2	10	99433	99442	20 %	20 %	40 %	20 %	171184598
63	NC_010525	GCCTC	2	10	100096	100105	0 %	20 %	20 %	60 %	171184599
64	NC_010525	GGCGG	2	10	107716	107725	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010525	TCTGC	2	10	107795	107804	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_010525	CGGGG	2	10	111807	111816	0 %	0 %	80 %	20 %	171184609
67	NC_010525	AGGGG	2	10	112341	112350	20 %	0 %	80 %	0 %	171184609
68	NC_010525	CCTCC	2	10	113012	113021	0 %	20 %	0 %	80 %	171184610
69	NC_010525	AGGGG	2	10	113202	113211	20 %	0 %	80 %	0 %	171184610
70	NC_010525	CCTCC	2	10	116973	116982	0 %	20 %	0 %	80 %	171184615
71	NC_010525	CCCCA	2	10	117250	117259	20 %	0 %	0 %	80 %	171184615
72	NC_010525	CCCCT	2	10	118780	118789	0 %	20 %	0 %	80 %	171184615
73	NC_010525	CGGGC	2	10	121517	121526	0 %	0 %	60 %	40 %	171184618
74	NC_010525	ACGCC	2	10	126215	126224	20 %	0 %	20 %	60 %	171184621
75	NC_010525	GGAGG	2	10	127188	127197	20 %	0 %	80 %	0 %	171184622
76	NC_010525	CGCGA	2	10	128330	128339	20 %	0 %	40 %	40 %	171184623
77	NC_010525	TCCGC	2	10	129632	129641	0 %	20 %	20 %	60 %	171184625
78	NC_010525	GCCCA	2	10	130151	130160	20 %	0 %	20 %	60 %	171184626
79	NC_010525	CTATC	2	10	131367	131376	20 %	40 %	0 %	40 %	171184628
80	NC_010525	TATCC	2	10	131928	131937	20 %	40 %	0 %	40 %	171184629
81	NC_010525	CGAGG	2	10	135655	135664	20 %	0 %	60 %	20 %	171184632
82	NC_010525	GGCTA	2	10	145205	145214	20 %	20 %	40 %	20 %	171184644
83	NC_010525	CCCCA	2	10	146599	146608	20 %	0 %	0 %	80 %	171184647
84	NC_010525	ACGCC	2	10	148091	148100	20 %	0 %	20 %	60 %	171184649
85	NC_010525	CGGCG	2	10	150870	150879	0 %	0 %	60 %	40 %	171184653
86	NC_010525	GTCCA	2	10	152572	152581	20 %	20 %	20 %	40 %	171184655
87	NC_010525	GGAGG	2	10	155983	155992	20 %	0 %	80 %	0 %	171184659
88	NC_010525	GGCTG	2	10	160783	160792	0 %	20 %	60 %	20 %	171184663
89	NC_010525	AGAGG	2	10	160806	160815	40 %	0 %	60 %	0 %	171184663
90	NC_010525	GGCTC	2	10	163898	163907	0 %	20 %	40 %	40 %	171184667
91	NC_010525	CGAGG	2	10	164780	164789	20 %	0 %	60 %	20 %	171184668
92	NC_010525	AGGAC	2	10	165001	165010	40 %	0 %	40 %	20 %	171184668
93	NC_010525	CTTCG	2	10	170458	170467	0 %	40 %	20 %	40 %	171184674
94	NC_010525	GGTTA	2	10	171303	171312	20 %	40 %	40 %	0 %	171184676
95	NC_010525	GTAGC	2	10	172404	172413	20 %	20 %	40 %	20 %	171184677
96	NC_010525	GCCAA	2	10	174577	174586	40 %	0 %	20 %	40 %	171184680
97	NC_010525	GCTCT	2	10	174891	174900	0 %	40 %	20 %	40 %	171184680
98	NC_010525	GAAGA	2	10	175221	175230	60 %	0 %	40 %	0 %	171184680
99	NC_010525	GGCGC	2	10	178196	178205	0 %	0 %	60 %	40 %	171184684
100	NC_010525	GCCTG	2	10	178233	178242	0 %	20 %	40 %	40 %	171184684
101	NC_010525	GATGA	2	10	180962	180971	40 %	20 %	40 %	0 %	171184685
102	NC_010525	TAGGC	2	10	181157	181166	20 %	20 %	40 %	20 %	171184685
103	NC_010525	TCCTC	2	10	181272	181281	0 %	40 %	0 %	60 %	171184686
104	NC_010525	AGATC	2	10	181692	181701	40 %	20 %	20 %	20 %	171184686
105	NC_010525	CCCTC	2	10	182973	182982	0 %	20 %	0 %	80 %	171184686
106	NC_010525	AGACG	2	10	183170	183179	40 %	0 %	40 %	20 %	171184686
107	NC_010525	TCGCC	2	10	183468	183477	0 %	20 %	20 %	60 %	171184686
108	NC_010525	TGTGG	2	10	189398	189407	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010525	GCCGT	2	10	189518	189527	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_010525	CGCCT	2	10	190334	190343	0 %	20 %	20 %	60 %	171184694
111	NC_010525	TCCCC	2	10	190378	190387	0 %	20 %	0 %	80 %	171184694
112	NC_010525	CCCTC	2	10	190491	190500	0 %	20 %	0 %	80 %	171184694
113	NC_010525	CCTCA	2	10	192086	192095	20 %	20 %	0 %	60 %	171184697
114	NC_010525	CACCT	2	10	193978	193987	20 %	20 %	0 %	60 %	171184700
115	NC_010525	GGGCT	2	10	198376	198385	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010525	AGCGG	2	10	199517	199526	20 %	0 %	60 %	20 %	171184705
117	NC_010525	CCCCG	2	10	200106	200115	0 %	0 %	20 %	80 %	171184706
118	NC_010525	GGCCG	2	10	201330	201339	0 %	0 %	60 %	40 %	171184708
119	NC_010525	GAGCG	2	10	203084	203093	20 %	0 %	60 %	20 %	171184709
120	NC_010525	GCCCG	2	10	205408	205417	0 %	0 %	40 %	60 %	171184712
121	NC_010525	GCCGC	2	10	207677	207686	0 %	0 %	40 %	60 %	171184715
122	NC_010525	CCAGC	2	10	208728	208737	20 %	0 %	20 %	60 %	171184715
123	NC_010525	TCGCC	2	10	209243	209252	0 %	20 %	20 %	60 %	171184716
124	NC_010525	GGGTG	2	10	209567	209576	0 %	20 %	80 %	0 %	171184717
125	NC_010525	CGGTG	2	10	212022	212031	0 %	20 %	60 %	20 %	171184719
126	NC_010525	CGGGT	2	10	213104	213113	0 %	20 %	60 %	20 %	171184720
127	NC_010525	TGCTA	2	10	217000	217009	20 %	40 %	20 %	20 %	171184724
128	NC_010525	AGCCT	2	10	218048	218057	20 %	20 %	20 %	40 %	171184726
129	NC_010525	CTCGA	2	10	218318	218327	20 %	20 %	20 %	40 %	171184727
130	NC_010525	GGAGA	2	10	223952	223961	40 %	0 %	60 %	0 %	171184734
131	NC_010525	CCGGG	2	10	225030	225039	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010525	TGACG	2	10	225380	225389	20 %	20 %	40 %	20 %	171184737
133	NC_010525	ACCTA	2	10	226154	226163	40 %	20 %	0 %	40 %	171184739
134	NC_010525	TCTCC	2	10	229573	229582	0 %	40 %	0 %	60 %	171184744
135	NC_010525	CAGTC	2	10	229732	229741	20 %	20 %	20 %	40 %	171184744
136	NC_010525	CCAAG	2	10	230090	230099	40 %	0 %	20 %	40 %	171184744
137	NC_010525	CGAGG	2	10	230216	230225	20 %	0 %	60 %	20 %	171184744
138	NC_010525	GCGGG	2	10	232787	232796	0 %	0 %	80 %	20 %	171184746
139	NC_010525	AGGGG	2	10	235709	235718	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010525	CCGCC	2	10	236135	236144	0 %	0 %	20 %	80 %	171184750
141	NC_010525	GGTCT	2	10	236516	236525	0 %	40 %	40 %	20 %	171184750
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143	NC_010525	TGGAC	2	10	238753	238762	20 %	20 %	40 %	20 %	171184752
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149	NC_010525	CCGCC	2	10	250693	250702	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
150	NC_010525	GCCGC	2	10	253704	253713	0 %	0 %	40 %	60 %	171184769
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253	NC_010525	AGAGC	2	10	419131	419140	40 %	0 %	40 %	20 %	171184937
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257	NC_010525	AGTAT	2	10	426407	426416	40 %	40 %	20 %	0 %	171184944
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262	NC_010525	GCCGC	2	10	429664	429673	0 %	0 %	40 %	60 %	171184947
263	NC_010525	GCCCT	2	10	429861	429870	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
264	NC_010525	CCTCC	2	10	432102	432111	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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266	NC_010525	TCGGG	2	10	435181	435190	0 %	20 %	60 %	20 %	171184953
267	NC_010525	GCTTT	2	10	436417	436426	0 %	60 %	20 %	20 %	171184954
268	NC_010525	GCTCT	2	10	437312	437321	0 %	40 %	20 %	40 %	171184955
269	NC_010525	ATATA	2	10	438438	438447	60 %	40 %	0 %	0 %	171184956
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280	NC_010525	TTGTG	2	10	449991	450000	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_010525	ATGTG	2	10	451283	451292	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010525	TAGGC	2	10	452612	452621	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_010525	TTGGG	2	10	457862	457871	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_010525	CGAGG	2	10	492519	492528	20 %	0 %	60 %	20 %	171185010
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319	NC_010525	AGCTC	2	10	525859	525868	20 %	20 %	20 %	40 %	171185042
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364	NC_010525	TCCCC	2	10	595062	595071	0 %	20 %	0 %	80 %	171185129
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367	NC_010525	ACCTC	2	10	605209	605218	20 %	20 %	0 %	60 %	171185137
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369	NC_010525	CGTTG	2	10	606211	606220	0 %	40 %	40 %	20 %	171185139
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371	NC_010525	AGACC	2	10	608584	608593	40 %	0 %	20 %	40 %	171185143
372	NC_010525	ACGTC	2	10	610424	610433	20 %	20 %	20 %	40 %	171185144
373	NC_010525	GGACT	2	10	611558	611567	20 %	20 %	40 %	20 %	171185145
374	NC_010525	GCGCC	2	10	611845	611854	0 %	0 %	40 %	60 %	171185145
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379	NC_010525	CAAGA	2	10	623039	623048	60 %	0 %	20 %	20 %	171185161
380	NC_010525	CCTCC	2	10	625354	625363	0 %	20 %	0 %	80 %	171185164
381	NC_010525	GATTT	2	10	629022	629031	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
382	NC_010525	GATGA	2	10	633058	633067	40 %	20 %	40 %	0 %	171185175
383	NC_010525	AAGGC	2	10	633484	633493	40 %	0 %	40 %	20 %	171185175
384	NC_010525	GCTTG	2	10	641798	641807	0 %	40 %	40 %	20 %	171185184
385	NC_010525	GCCTT	2	10	643208	643217	0 %	40 %	20 %	40 %	171185187
386	NC_010525	AGGCG	2	10	650130	650139	20 %	0 %	60 %	20 %	171185196
387	NC_010525	AGGCG	2	10	651986	651995	20 %	0 %	60 %	20 %	171185198
388	NC_010525	TACGA	2	10	658889	658898	40 %	20 %	20 %	20 %	171185205
389	NC_010525	GCCCC	2	10	664308	664317	0 %	0 %	20 %	80 %	171185209
390	NC_010525	TCAAG	2	10	669600	669609	40 %	20 %	20 %	20 %	171185218
391	NC_010525	GATAT	2	10	670313	670322	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
392	NC_010525	GTCCC	2	10	671452	671461	0 %	20 %	20 %	60 %	171185219
393	NC_010525	GCGCC	2	10	671575	671584	0 %	0 %	40 %	60 %	171185219
394	NC_010525	AACCT	2	10	676781	676790	40 %	20 %	0 %	40 %	171185226
395	NC_010525	CTCCG	2	10	680229	680238	0 %	20 %	20 %	60 %	171185230
396	NC_010525	CCTCC	2	10	682717	682726	0 %	20 %	0 %	80 %	171185234
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