MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 4815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010524	GCCGC	3	15	496	510	0 %	0 %	40 %	60 %	171056693
2	NC_010524	GCGCC	2	10	2864	2873	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_010524	GGCCG	2	10	7433	7442	0 %	0 %	60 %	40 %	171056698
4	NC_010524	AGGCG	2	10	8742	8751	20 %	0 %	60 %	20 %	171056699
5	NC_010524	GTGCC	2	10	10610	10619	0 %	20 %	40 %	40 %	171056701
6	NC_010524	CGGCG	2	10	10860	10869	0 %	0 %	60 %	40 %	171056701
7	NC_010524	GCCAG	2	10	11275	11284	20 %	0 %	40 %	40 %	171056702
8	NC_010524	TGCGC	2	10	11438	11447	0 %	20 %	40 %	40 %	171056702
9	NC_010524	ACCGC	2	10	12314	12323	20 %	0 %	20 %	60 %	171056703
10	NC_010524	GCAGC	2	10	13353	13362	20 %	0 %	40 %	40 %	171056704
11	NC_010524	AGCCC	2	10	14084	14093	20 %	0 %	20 %	60 %	171056705
12	NC_010524	CGGTG	2	10	14738	14747	0 %	20 %	60 %	20 %	171056705
13	NC_010524	CTGGC	2	10	14847	14856	0 %	20 %	40 %	40 %	171056706
14	NC_010524	AGCGC	2	10	15522	15531	20 %	0 %	40 %	40 %	171056707
15	NC_010524	CGATC	2	10	17810	17819	20 %	20 %	20 %	40 %	171056708
16	NC_010524	GCGCG	2	10	18755	18764	0 %	0 %	60 %	40 %	171056708
17	NC_010524	CCGGC	2	10	19471	19480	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
18	NC_010524	GCGCC	2	10	19482	19491	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
19	NC_010524	CCACG	2	10	20412	20421	20 %	0 %	20 %	60 %	171056709
20	NC_010524	TGCGC	2	10	20676	20685	0 %	20 %	40 %	40 %	171056709
21	NC_010524	GAGCT	2	10	20797	20806	20 %	20 %	40 %	20 %	171056709
22	NC_010524	GCCGC	2	10	21336	21345	0 %	0 %	40 %	60 %	171056709
23	NC_010524	GTGCT	2	10	24379	24388	0 %	40 %	40 %	20 %	171056711
24	NC_010524	GCGCC	2	10	24585	24594	0 %	0 %	40 %	60 %	171056711
25	NC_010524	TCGGC	2	10	24868	24877	0 %	20 %	40 %	40 %	171056712
26	NC_010524	CGGCG	2	10	24893	24902	0 %	0 %	60 %	40 %	171056712
27	NC_010524	CGACC	2	10	26653	26662	20 %	0 %	20 %	60 %	171056713
28	NC_010524	GGCCG	2	10	28567	28576	0 %	0 %	60 %	40 %	171056714
29	NC_010524	TCGCG	2	10	28976	28985	0 %	20 %	40 %	40 %	171056715
30	NC_010524	CTGGC	2	10	33704	33713	0 %	20 %	40 %	40 %	171056721
31	NC_010524	CCAGC	2	10	34419	34428	20 %	0 %	20 %	60 %	171056722
32	NC_010524	CTTAC	2	10	35276	35285	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_010524	GCGCC	2	10	39200	39209	0 %	0 %	40 %	60 %	171056727
34	NC_010524	GCCCG	2	10	40997	41006	0 %	0 %	40 %	60 %	171056729
35	NC_010524	CGGCG	2	10	43212	43221	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010524	CGGCG	2	10	43287	43296	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010524	CGGGC	2	10	43912	43921	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010524	CCGGG	2	10	43983	43992	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_010524	TGCGC	2	10	45090	45099	0 %	20 %	40 %	40 %	171056731
40	NC_010524	CGCGC	2	10	46446	46455	0 %	0 %	40 %	60 %	171056732
41	NC_010524	GCAGC	2	10	46520	46529	20 %	0 %	40 %	40 %	171056732
42	NC_010524	CGAGC	2	10	46679	46688	20 %	0 %	40 %	40 %	171056732
43	NC_010524	TGGTG	2	10	46909	46918	0 %	40 %	60 %	0 %	171056732
44	NC_010524	GCGTG	2	10	46941	46950	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010524	GCGCC	2	10	48354	48363	0 %	0 %	40 %	60 %	171056734
46	NC_010524	CGCTG	2	10	49037	49046	0 %	20 %	40 %	40 %	171056734
47	NC_010524	CGCGG	2	10	49200	49209	0 %	0 %	60 %	40 %	171056734
48	NC_010524	GCCGG	2	10	49344	49353	0 %	0 %	60 %	40 %	171056734
49	NC_010524	CGGCT	2	10	51878	51887	0 %	20 %	40 %	40 %	171056738
50	NC_010524	CCGGC	2	10	53116	53125	0 %	0 %	40 %	60 %	171056739
51	NC_010524	TCGAG	2	10	54734	54743	20 %	20 %	40 %	20 %	171056741
52	NC_010524	GGCCC	2	10	56629	56638	0 %	0 %	40 %	60 %	171056742
53	NC_010524	CCCGA	2	10	58226	58235	20 %	0 %	20 %	60 %	171056744
54	NC_010524	CGGCG	2	10	59417	59426	0 %	0 %	60 %	40 %	171056746
55	NC_010524	CATCG	2	10	59865	59874	20 %	20 %	20 %	40 %	171056746
56	NC_010524	CCAGC	2	10	60599	60608	20 %	0 %	20 %	60 %	171056746
57	NC_010524	CGGCC	2	10	60936	60945	0 %	0 %	40 %	60 %	171056746
58	NC_010524	CGGCG	2	10	60946	60955	0 %	0 %	60 %	40 %	171056746
59	NC_010524	GCCAC	2	10	61126	61135	20 %	0 %	20 %	60 %	171056746
60	NC_010524	GCGCC	2	10	61624	61633	0 %	0 %	40 %	60 %	171056747
61	NC_010524	GCGCG	2	10	63347	63356	0 %	0 %	60 %	40 %	171056750
62	NC_010524	GCCGC	2	10	64069	64078	0 %	0 %	40 %	60 %	171056751
63	NC_010524	CGAGC	2	10	64511	64520	20 %	0 %	40 %	40 %	171056751
64	NC_010524	CAGGC	2	10	64869	64878	20 %	0 %	40 %	40 %	171056751
65	NC_010524	GGCCG	2	10	65559	65568	0 %	0 %	60 %	40 %	171056752
66	NC_010524	CAGCT	2	10	65787	65796	20 %	20 %	20 %	40 %	171056752
67	NC_010524	TGCGC	2	10	66926	66935	0 %	20 %	40 %	40 %	171056754
68	NC_010524	CGCGG	2	10	68037	68046	0 %	0 %	60 %	40 %	171056756
69	NC_010524	TGCTC	2	10	68751	68760	0 %	40 %	20 %	40 %	171056758
70	NC_010524	CCGGG	2	10	69252	69261	0 %	0 %	60 %	40 %	171056758
71	NC_010524	GCGCC	2	10	69527	69536	0 %	0 %	40 %	60 %	171056758
72	NC_010524	GCGCG	2	10	69834	69843	0 %	0 %	60 %	40 %	171056758
73	NC_010524	GCGCC	2	10	71114	71123	0 %	0 %	40 %	60 %	171056759
74	NC_010524	GCACG	2	10	71561	71570	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_010524	CGAGG	2	10	72430	72439	20 %	0 %	60 %	20 %	171056760
76	NC_010524	CGGTG	2	10	72492	72501	0 %	20 %	60 %	20 %	171056760
77	NC_010524	CCCAG	2	10	74667	74676	20 %	0 %	20 %	60 %	171056762
78	NC_010524	CACGG	2	10	76187	76196	20 %	0 %	40 %	40 %	171056764
79	NC_010524	GCCGC	2	10	76299	76308	0 %	0 %	40 %	60 %	171056764
80	NC_010524	GCCGC	2	10	76526	76535	0 %	0 %	40 %	60 %	171056764
81	NC_010524	GCCGC	2	10	77110	77119	0 %	0 %	40 %	60 %	171056765
82	NC_010524	CCGCG	2	10	77524	77533	0 %	0 %	40 %	60 %	171056765
83	NC_010524	GGCCG	2	10	78482	78491	0 %	0 %	60 %	40 %	171056766
84	NC_010524	GCGCC	2	10	79021	79030	0 %	0 %	40 %	60 %	171056767
85	NC_010524	GCCGT	2	10	79256	79265	0 %	20 %	40 %	40 %	171056767
86	NC_010524	CGCGG	2	10	79572	79581	0 %	0 %	60 %	40 %	171056768
87	NC_010524	GGCTG	2	10	81072	81081	0 %	20 %	60 %	20 %	171056770
88	NC_010524	TCGAC	2	10	81341	81350	20 %	20 %	20 %	40 %	171056770
89	NC_010524	GGCCG	2	10	82371	82380	0 %	0 %	60 %	40 %	171056771
90	NC_010524	GCCGG	2	10	82699	82708	0 %	0 %	60 %	40 %	171056771
91	NC_010524	GCCGC	2	10	83653	83662	0 %	0 %	40 %	60 %	171056772
92	NC_010524	GCGCC	2	10	84512	84521	0 %	0 %	40 %	60 %	171056773
93	NC_010524	CCCGA	2	10	84657	84666	20 %	0 %	20 %	60 %	171056773
94	NC_010524	CGGTG	2	10	84686	84695	0 %	20 %	60 %	20 %	171056773
95	NC_010524	GCCCG	2	10	86697	86706	0 %	0 %	40 %	60 %	171056775
96	NC_010524	GCCGC	2	10	91034	91043	0 %	0 %	40 %	60 %	171056778
97	NC_010524	CCGGG	2	10	91076	91085	0 %	0 %	60 %	40 %	171056778
98	NC_010524	GCGCC	2	10	92429	92438	0 %	0 %	40 %	60 %	171056779
99	NC_010524	CTGAT	2	10	94076	94085	20 %	40 %	20 %	20 %	171056780
100	NC_010524	ACGGC	2	10	95019	95028	20 %	0 %	40 %	40 %	171056781
101	NC_010524	GCCCG	2	10	95809	95818	0 %	0 %	40 %	60 %	171056782
102	NC_010524	GCGCG	2	10	96467	96476	0 %	0 %	60 %	40 %	171056783
103	NC_010524	GGGCC	2	10	97638	97647	0 %	0 %	60 %	40 %	171056784
104	NC_010524	GGCGT	2	10	97833	97842	0 %	20 %	60 %	20 %	171056784
105	NC_010524	TCGGG	2	10	99671	99680	0 %	20 %	60 %	20 %	171056786
106	NC_010524	GCCGC	2	10	99952	99961	0 %	0 %	40 %	60 %	171056786
107	NC_010524	TCGTC	2	10	100824	100833	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010524	GCCGG	2	10	101534	101543	0 %	0 %	60 %	40 %	171056788
109	NC_010524	GGCCA	2	10	101617	101626	20 %	0 %	40 %	40 %	171056788
110	NC_010524	CGGTG	2	10	102059	102068	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
111	NC_010524	CGCAG	2	10	102452	102461	20 %	0 %	40 %	40 %	171056789
112	NC_010524	GGCGT	2	10	102778	102787	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
113	NC_010524	GGTCG	2	10	102855	102864	0 %	20 %	60 %	20 %	171056789
114	NC_010524	GCGCG	2	10	103070	103079	0 %	0 %	60 %	40 %	171056789
115	NC_010524	CGCTG	2	10	103409	103418	0 %	20 %	40 %	40 %	171056790
116	NC_010524	CGGCG	2	10	106754	106763	0 %	0 %	60 %	40 %	171056794
117	NC_010524	CGATC	2	10	108495	108504	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010524	GTCGC	2	10	109650	109659	0 %	20 %	40 %	40 %	171056797
119	NC_010524	GCATC	2	10	109917	109926	20 %	20 %	20 %	40 %	171056797
120	NC_010524	CCGTG	2	10	111382	111391	0 %	20 %	40 %	40 %	171056799
121	NC_010524	AGGGC	2	10	111484	111493	20 %	0 %	60 %	20 %	171056799
122	NC_010524	CGGCC	2	10	112015	112024	0 %	0 %	40 %	60 %	171056799
123	NC_010524	GCGCG	2	10	114200	114209	0 %	0 %	60 %	40 %	171056801
124	NC_010524	GGTCG	2	10	115664	115673	0 %	20 %	60 %	20 %	171056802
125	NC_010524	AGCGC	2	10	117407	117416	20 %	0 %	40 %	40 %	171056803
126	NC_010524	CGACC	2	10	118214	118223	20 %	0 %	20 %	60 %	171056804
127	NC_010524	TGCCC	2	10	118955	118964	0 %	20 %	20 %	60 %	171056806
128	NC_010524	AGGCC	2	10	119599	119608	20 %	0 %	40 %	40 %	171056807
129	NC_010524	CGGCG	2	10	124043	124052	0 %	0 %	60 %	40 %	171056811
130	NC_010524	CCGGC	2	10	124492	124501	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_010524	CCGCC	2	10	125391	125400	0 %	0 %	20 %	80 %	171056812
132	NC_010524	CGGCG	2	10	125439	125448	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010524	CGGCC	2	10	126023	126032	0 %	0 %	40 %	60 %	171056813
134	NC_010524	GCTGG	2	10	127158	127167	0 %	20 %	60 %	20 %	171056815
135	NC_010524	GCCGC	2	10	127594	127603	0 %	0 %	40 %	60 %	171056815
136	NC_010524	CCGTG	2	10	128484	128493	0 %	20 %	40 %	40 %	171056816
137	NC_010524	CGCGG	2	10	128628	128637	0 %	0 %	60 %	40 %	171056816
138	NC_010524	GCTGG	2	10	130362	130371	0 %	20 %	60 %	20 %	171056818
139	NC_010524	CTGGC	2	10	130435	130444	0 %	20 %	40 %	40 %	171056818
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152	NC_010524	AGGCG	2	10	151521	151530	20 %	0 %	60 %	20 %	171056836
153	NC_010524	GACGT	2	10	152757	152766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_010524	TGGCA	2	10	181498	181507	20 %	20 %	40 %	20 %	171056865
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176	NC_010524	GGCGG	2	10	185774	185783	0 %	0 %	80 %	20 %	171056869
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259	NC_010524	CTTGC	2	10	265761	265770	0 %	40 %	20 %	40 %	171056939
260	NC_010524	CGCAG	2	10	266672	266681	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
261	NC_010524	GCGCC	2	10	267329	267338	0 %	0 %	40 %	60 %	171056942
262	NC_010524	CGCGC	2	10	268606	268615	0 %	0 %	40 %	60 %	171056944
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264	NC_010524	CCAGG	2	10	268798	268807	20 %	0 %	40 %	40 %	171056944
265	NC_010524	GCGCC	2	10	268827	268836	0 %	0 %	40 %	60 %	171056944
266	NC_010524	TTGTG	2	10	270343	270352	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010524	CGGCC	2	10	271204	271213	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
268	NC_010524	GCGAT	2	10	271803	271812	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
269	NC_010524	GCCGC	2	10	272495	272504	0 %	0 %	40 %	60 %	171056948
270	NC_010524	CGGTG	2	10	272971	272980	0 %	20 %	60 %	20 %	171056948
271	NC_010524	TGCTG	2	10	273102	273111	0 %	40 %	40 %	20 %	171056948
272	NC_010524	TGGAT	2	10	273295	273304	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010524	CGGCT	2	10	274678	274687	0 %	20 %	40 %	40 %	171056950
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379	NC_010524	CGCGG	2	10	371225	371234	0 %	0 %	60 %	40 %	171057031
380	NC_010524	GTCGA	2	10	371729	371738	20 %	20 %	40 %	20 %	171057031
381	NC_010524	GGCAC	2	10	373060	373069	20 %	0 %	40 %	40 %	171057032
382	NC_010524	CGGTG	2	10	373340	373349	0 %	20 %	60 %	20 %	171057032
383	NC_010524	GCGCC	2	10	374253	374262	0 %	0 %	40 %	60 %	171057033
384	NC_010524	CGGCG	2	10	374323	374332	0 %	0 %	60 %	40 %	171057033
385	NC_010524	GGCGC	2	10	375133	375142	0 %	0 %	60 %	40 %	171057033
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387	NC_010524	TCGGC	2	10	376203	376212	0 %	20 %	40 %	40 %	171057033
388	NC_010524	GCGGT	2	10	376256	376265	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
389	NC_010524	GGTCG	2	10	376878	376887	0 %	20 %	60 %	20 %	171057035
390	NC_010524	CTCGA	2	10	378469	378478	20 %	20 %	20 %	40 %	171057035
391	NC_010524	CCGGG	2	10	380578	380587	0 %	0 %	60 %	40 %	171057037
392	NC_010524	GATCT	2	10	381759	381768	20 %	40 %	20 %	20 %	171057037
393	NC_010524	GGCAT	2	10	385359	385368	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
394	NC_010524	GCCCA	2	10	386162	386171	20 %	0 %	20 %	60 %	171057042
395	NC_010524	GCTGC	2	10	386222	386231	0 %	20 %	40 %	40 %	171057042
396	NC_010524	GGCGC	3	15	386349	386363	0 %	0 %	60 %	40 %	171057042
397	NC_010524	CGGCC	2	10	386473	386482	0 %	0 %	40 %	60 %	171057042
398	NC_010524	GCGCC	2	10	387609	387618	0 %	0 %	40 %	60 %	171057044
399	NC_010524	CGCGG	2	10	389587	389596	0 %	0 %	60 %	40 %	171057046
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