MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 14999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010524	GGCG	2	8	179	186	0 %	0 %	75 %	25 %	171056693
2	NC_010524	CTGG	2	8	282	289	0 %	25 %	50 %	25 %	171056693
3	NC_010524	GTCG	2	8	461	468	0 %	25 %	50 %	25 %	171056693
4	NC_010524	CTCG	2	8	881	888	0 %	25 %	25 %	50 %	171056693
5	NC_010524	CGCA	2	8	933	940	25 %	0 %	25 %	50 %	171056693
6	NC_010524	GCCG	2	8	2053	2060	0 %	0 %	50 %	50 %	171056694
7	NC_010524	CGAG	2	8	2583	2590	25 %	0 %	50 %	25 %	171056694
8	NC_010524	ACCT	2	8	2726	2733	25 %	25 %	0 %	50 %	171056694
9	NC_010524	GACC	2	8	2967	2974	25 %	0 %	25 %	50 %	171056695
10	NC_010524	TCGA	2	8	3217	3224	25 %	25 %	25 %	25 %	171056695
11	NC_010524	GGCC	2	8	3234	3241	0 %	0 %	50 %	50 %	171056695
12	NC_010524	CACC	2	8	3975	3982	25 %	0 %	0 %	75 %	171056695
13	NC_010524	TGCG	2	8	3992	3999	0 %	25 %	50 %	25 %	171056695
14	NC_010524	CGAC	2	8	4232	4239	25 %	0 %	25 %	50 %	171056695
15	NC_010524	CGCC	2	8	4899	4906	0 %	0 %	25 %	75 %	171056695
16	NC_010524	TGGA	2	8	4948	4955	25 %	25 %	50 %	0 %	171056695
17	NC_010524	GCCA	2	8	5709	5716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010524	GAAT	2	8	5749	5756	50 %	25 %	25 %	0 %	171056696
19	NC_010524	GGGC	2	8	5896	5903	0 %	0 %	75 %	25 %	171056696
20	NC_010524	GAAG	2	8	6004	6011	50 %	0 %	50 %	0 %	171056696
21	NC_010524	GCCA	2	8	6549	6556	25 %	0 %	25 %	50 %	171056697
22	NC_010524	GGCC	2	8	6584	6591	0 %	0 %	50 %	50 %	171056697
23	NC_010524	CGGG	2	8	7611	7618	0 %	0 %	75 %	25 %	171056699
24	NC_010524	GGCC	2	8	7650	7657	0 %	0 %	50 %	50 %	171056699
25	NC_010524	ACGC	2	8	7994	8001	25 %	0 %	25 %	50 %	171056699
26	NC_010524	CGGC	2	8	8014	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	171056699
27	NC_010524	GCCA	2	8	8102	8109	25 %	0 %	25 %	50 %	171056699
28	NC_010524	GCCG	2	8	8332	8339	0 %	0 %	50 %	50 %	171056699
29	NC_010524	AGCC	2	8	8648	8655	25 %	0 %	25 %	50 %	171056699
30	NC_010524	CGGC	2	8	10012	10019	0 %	0 %	50 %	50 %	171056700
31	NC_010524	CCGG	2	8	10322	10329	0 %	0 %	50 %	50 %	171056700
32	NC_010524	CAGG	2	8	10364	10371	25 %	0 %	50 %	25 %	171056700
33	NC_010524	GGCG	2	8	10461	10468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010524	GCGG	2	8	11047	11054	0 %	0 %	75 %	25 %	171056701
35	NC_010524	GGCC	2	8	11353	11360	0 %	0 %	50 %	50 %	171056702
36	NC_010524	CCGG	2	8	11562	11569	0 %	0 %	50 %	50 %	171056702
37	NC_010524	GGCG	2	8	11776	11783	0 %	0 %	75 %	25 %	171056702
38	NC_010524	GGTC	2	8	12507	12514	0 %	25 %	50 %	25 %	171056703
39	NC_010524	GCCC	2	8	13823	13830	0 %	0 %	25 %	75 %	171056705
40	NC_010524	GCCC	2	8	13922	13929	0 %	0 %	25 %	75 %	171056705
41	NC_010524	CGCC	2	8	14069	14076	0 %	0 %	25 %	75 %	171056705
42	NC_010524	CGGC	2	8	14326	14333	0 %	0 %	50 %	50 %	171056705
43	NC_010524	GGCC	2	8	14726	14733	0 %	0 %	50 %	50 %	171056705
44	NC_010524	CAGC	2	8	14748	14755	25 %	0 %	25 %	50 %	171056705
45	NC_010524	GGCC	2	8	15151	15158	0 %	0 %	50 %	50 %	171056706
46	NC_010524	GGTG	2	8	15327	15334	0 %	25 %	75 %	0 %	171056707
47	NC_010524	GCTG	2	8	15472	15479	0 %	25 %	50 %	25 %	171056707
48	NC_010524	GCCG	2	8	15532	15539	0 %	0 %	50 %	50 %	171056707
49	NC_010524	CGGG	2	8	15642	15649	0 %	0 %	75 %	25 %	171056707
50	NC_010524	GCCA	2	8	15887	15894	25 %	0 %	25 %	50 %	171056707
51	NC_010524	CCGG	2	8	16319	16326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010524	TGCG	2	8	16353	16360	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010524	CAGC	2	8	16438	16445	25 %	0 %	25 %	50 %	171056708
54	NC_010524	GGCG	2	8	16556	16563	0 %	0 %	75 %	25 %	171056708
55	NC_010524	CGCA	2	8	16575	16582	25 %	0 %	25 %	50 %	171056708
56	NC_010524	GTCG	2	8	16598	16605	0 %	25 %	50 %	25 %	171056708
57	NC_010524	GGCC	2	8	16714	16721	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
58	NC_010524	GGCC	2	8	16841	16848	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
59	NC_010524	GCGG	2	8	16871	16878	0 %	0 %	75 %	25 %	171056708
60	NC_010524	CGCC	2	8	17423	17430	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
61	NC_010524	CCCG	2	8	17545	17552	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
62	NC_010524	CCGC	2	8	17645	17652	0 %	0 %	25 %	75 %	171056708
63	NC_010524	GCCG	2	8	18269	18276	0 %	0 %	50 %	50 %	171056708
64	NC_010524	ACCA	2	8	18489	18496	50 %	0 %	0 %	50 %	171056708
65	NC_010524	CTCG	2	8	18617	18624	0 %	25 %	25 %	50 %	171056708
66	NC_010524	CGCC	2	8	19638	19645	0 %	0 %	25 %	75 %	171056709
67	NC_010524	CCGG	2	8	19977	19984	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
68	NC_010524	GCCG	2	8	20100	20107	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
69	NC_010524	ACCT	2	8	20158	20165	25 %	25 %	0 %	50 %	171056709
70	NC_010524	GCTG	2	8	20327	20334	0 %	25 %	50 %	25 %	171056709
71	NC_010524	CGCC	2	8	20445	20452	0 %	0 %	25 %	75 %	171056709
72	NC_010524	CGGC	2	8	21490	21497	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
73	NC_010524	GCCG	2	8	21519	21526	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
74	NC_010524	GCTG	2	8	21686	21693	0 %	25 %	50 %	25 %	171056709
75	NC_010524	CCGA	2	8	22324	22331	25 %	0 %	25 %	50 %	171056709
76	NC_010524	GGCC	2	8	22872	22879	0 %	0 %	50 %	50 %	171056709
77	NC_010524	GGCC	2	8	23098	23105	0 %	0 %	50 %	50 %	171056710
78	NC_010524	GCCG	2	8	23317	23324	0 %	0 %	50 %	50 %	171056710
79	NC_010524	CCGG	2	8	23912	23919	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
80	NC_010524	CTCG	2	8	23991	23998	0 %	25 %	25 %	50 %	171056711
81	NC_010524	GGCC	2	8	24123	24130	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
82	NC_010524	CGGC	2	8	24480	24487	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
83	NC_010524	CAGC	2	8	24519	24526	25 %	0 %	25 %	50 %	171056711
84	NC_010524	GGCC	2	8	24630	24637	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
85	NC_010524	GGCC	2	8	24756	24763	0 %	0 %	50 %	50 %	171056711
86	NC_010524	GCTG	2	8	25120	25127	0 %	25 %	50 %	25 %	171056712
87	NC_010524	GGCC	2	8	25658	25665	0 %	0 %	50 %	50 %	171056712
88	NC_010524	TGCC	2	8	25857	25864	0 %	25 %	25 %	50 %	171056712
89	NC_010524	CTGC	2	8	26111	26118	0 %	25 %	25 %	50 %	171056713
90	NC_010524	CTGC	2	8	26218	26225	0 %	25 %	25 %	50 %	171056713
91	NC_010524	TCGT	2	8	26396	26403	0 %	50 %	25 %	25 %	171056713
92	NC_010524	CGGG	2	8	26710	26717	0 %	0 %	75 %	25 %	171056713
93	NC_010524	AACC	2	8	26758	26765	50 %	0 %	0 %	50 %	171056713
94	NC_010524	CCGA	2	8	26993	27000	25 %	0 %	25 %	50 %	171056713
95	NC_010524	GGCA	2	8	27526	27533	25 %	0 %	50 %	25 %	171056714
96	NC_010524	GCCG	2	8	27685	27692	0 %	0 %	50 %	50 %	171056714
97	NC_010524	CTGG	2	8	27724	27731	0 %	25 %	50 %	25 %	171056714
98	NC_010524	GTGC	2	8	28117	28124	0 %	25 %	50 %	25 %	171056714
99	NC_010524	GCTC	2	8	28458	28465	0 %	25 %	25 %	50 %	171056714
100	NC_010524	GCCG	2	8	29363	29370	0 %	0 %	50 %	50 %	171056715
101	NC_010524	TGCG	2	8	29545	29552	0 %	25 %	50 %	25 %	171056715
102	NC_010524	GCCG	2	8	29745	29752	0 %	0 %	50 %	50 %	171056715
103	NC_010524	CCGG	2	8	29884	29891	0 %	0 %	50 %	50 %	171056716
104	NC_010524	GCCA	2	8	30132	30139	25 %	0 %	25 %	50 %	171056716
105	NC_010524	CGGC	2	8	30220	30227	0 %	0 %	50 %	50 %	171056716
106	NC_010524	CAGC	2	8	30538	30545	25 %	0 %	25 %	50 %	171056717
107	NC_010524	GCGG	2	8	30610	30617	0 %	0 %	75 %	25 %	171056717
108	NC_010524	CGCA	2	8	30754	30761	25 %	0 %	25 %	50 %	171056717
109	NC_010524	CGGT	2	8	30839	30846	0 %	25 %	50 %	25 %	171056717
110	NC_010524	CCCG	2	8	30954	30961	0 %	0 %	25 %	75 %	171056717
111	NC_010524	GGCC	2	8	31419	31426	0 %	0 %	50 %	50 %	171056717
112	NC_010524	CGCC	2	8	31671	31678	0 %	0 %	25 %	75 %	171056717
113	NC_010524	CGCA	2	8	31837	31844	25 %	0 %	25 %	50 %	171056717
114	NC_010524	GGCT	2	8	32210	32217	0 %	25 %	50 %	25 %	171056718
115	NC_010524	GCCC	2	8	32468	32475	0 %	0 %	25 %	75 %	171056719
116	NC_010524	CAGC	2	8	32543	32550	25 %	0 %	25 %	50 %	171056719
117	NC_010524	AGCA	2	8	32724	32731	50 %	0 %	25 %	25 %	171056719
118	NC_010524	GCCG	2	8	32856	32863	0 %	0 %	50 %	50 %	171056719
119	NC_010524	GCCG	2	8	32891	32898	0 %	0 %	50 %	50 %	171056719
120	NC_010524	TGCG	2	8	33227	33234	0 %	25 %	50 %	25 %	171056720
121	NC_010524	CGGC	2	8	33270	33277	0 %	0 %	50 %	50 %	171056720
122	NC_010524	CCCG	2	8	33609	33616	0 %	0 %	25 %	75 %	171056721
123	NC_010524	GCCG	2	8	34142	34149	0 %	0 %	50 %	50 %	171056722
124	NC_010524	CAGG	2	8	34692	34699	25 %	0 %	50 %	25 %	171056722
125	NC_010524	CGGC	2	8	35177	35184	0 %	0 %	50 %	50 %	171056722
126	NC_010524	GGGA	2	8	35223	35230	25 %	0 %	75 %	0 %	171056722
127	NC_010524	GCTG	2	8	35948	35955	0 %	25 %	50 %	25 %	171056723
128	NC_010524	GCCG	2	8	36456	36463	0 %	0 %	50 %	50 %	171056723
129	NC_010524	CTGG	2	8	36507	36514	0 %	25 %	50 %	25 %	171056723
130	NC_010524	CGGG	2	8	36642	36649	0 %	0 %	75 %	25 %	171056723
131	NC_010524	GATC	2	8	37160	37167	25 %	25 %	25 %	25 %	171056724
132	NC_010524	TCGA	2	8	37188	37195	25 %	25 %	25 %	25 %	171056724
133	NC_010524	ACGC	2	8	37323	37330	25 %	0 %	25 %	50 %	171056724
134	NC_010524	CGCC	2	8	37415	37422	0 %	0 %	25 %	75 %	171056724
135	NC_010524	GCGG	2	8	37591	37598	0 %	0 %	75 %	25 %	171056724
136	NC_010524	GGCC	2	8	37922	37929	0 %	0 %	50 %	50 %	171056725
137	NC_010524	GCGA	2	8	37990	37997	25 %	0 %	50 %	25 %	171056725
138	NC_010524	GCCG	2	8	38198	38205	0 %	0 %	50 %	50 %	171056725
139	NC_010524	GGGC	2	8	38402	38409	0 %	0 %	75 %	25 %	171056725
140	NC_010524	TCGA	2	8	38418	38425	25 %	25 %	25 %	25 %	171056725
141	NC_010524	TCGA	2	8	38827	38834	25 %	25 %	25 %	25 %	171056726
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