MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptothrix cholodnii SP-6 chromosome

Total Repeats: 427

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010524	C	6	6	38	43	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_010524	G	6	6	16393	16398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010524	C	6	6	27475	27480	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_010524	A	6	6	39075	39080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010524	G	6	6	43540	43545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010524	G	6	6	61480	61485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010524	T	6	6	72029	72034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010524	T	6	6	100878	100883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010524	G	7	7	107176	107182	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010524	C	6	6	133114	133119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_010524	A	6	6	172720	172725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010524	A	6	6	195185	195190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010524	T	6	6	198674	198679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010524	T	6	6	204872	204877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010524	T	6	6	231419	231424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010524	T	6	6	234643	234648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010524	C	11	11	256633	256643	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_010524	C	7	7	285996	286002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_010524	C	6	6	286110	286115	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_010524	G	6	6	326980	326985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010524	C	6	6	330047	330052	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_010524	C	6	6	337779	337784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_010524	T	6	6	347373	347378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010524	A	6	6	354356	354361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010524	G	6	6	359186	359191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010524	C	6	6	369974	369979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_010524	T	7	7	390078	390084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010524	T	7	7	409837	409843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010524	A	6	6	410880	410885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010524	T	7	7	418045	418051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010524	T	6	6	423158	423163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010524	G	6	6	442765	442770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010524	G	6	6	442820	442825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010524	A	7	7	466845	466851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010524	C	6	6	469866	469871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_010524	T	6	6	496979	496984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010524	G	6	6	498541	498546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010524	C	6	6	505396	505401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_010524	C	6	6	510479	510484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_010524	G	6	6	513053	513058	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010524	C	6	6	513128	513133	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_010524	A	6	6	513148	513153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010524	T	6	6	522292	522297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010524	A	6	6	524477	524482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010524	T	6	6	525028	525033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010524	G	6	6	528701	528706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010524	C	6	6	545376	545381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_010524	A	6	6	554416	554421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010524	A	6	6	581099	581104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010524	G	6	6	582423	582428	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010524	G	7	7	584678	584684	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010524	G	6	6	602387	602392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010524	A	6	6	602462	602467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010524	G	6	6	621602	621607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010524	G	6	6	632526	632531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010524	A	6	6	635288	635293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010524	A	8	8	651369	651376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010524	G	6	6	657603	657608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010524	A	6	6	657901	657906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010524	G	6	6	684464	684469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010524	C	6	6	700671	700676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_010524	T	6	6	701070	701075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010524	A	6	6	708533	708538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010524	C	6	6	712019	712024	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_010524	G	6	6	739854	739859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010524	C	6	6	739875	739880	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_010524	A	6	6	742380	742385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010524	C	7	7	758032	758038	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_010524	G	6	6	762751	762756	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010524	G	6	6	764714	764719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010524	G	6	6	781404	781409	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010524	G	6	6	781491	781496	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010524	A	6	6	810851	810856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010524	A	6	6	820131	820136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010524	C	6	6	825091	825096	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_010524	C	6	6	843021	843026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_010524	G	6	6	843061	843066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010524	C	6	6	843126	843131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_010524	T	6	6	896548	896553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010524	T	6	6	902314	902319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010524	C	7	7	951386	951392	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_010524	T	6	6	961731	961736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010524	T	6	6	970034	970039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010524	C	6	6	972264	972269	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_010524	A	7	7	985624	985630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010524	C	6	6	988903	988908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_010524	T	6	6	997011	997016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010524	C	6	6	1002376	1002381	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_010524	T	8	8	1002417	1002424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010524	T	9	9	1004122	1004130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010524	T	6	6	1012282	1012287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010524	T	8	8	1012318	1012325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010524	A	6	6	1012628	1012633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010524	T	6	6	1014119	1014124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010524	G	6	6	1020193	1020198	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010524	A	8	8	1021951	1021958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010524	A	6	6	1065963	1065968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010524	T	6	6	1065987	1065992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010524	G	6	6	1066063	1066068	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010524	G	6	6	1080059	1080064	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010524	T	6	6	1081181	1081186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010524	G	6	6	1084896	1084901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010524	G	6	6	1103651	1103656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010524	C	6	6	1106718	1106723	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_010524	A	6	6	1111242	1111247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010524	A	6	6	1115115	1115120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010524	G	6	6	1164997	1165002	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010524	G	6	6	1166217	1166222	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010524	A	8	8	1166489	1166496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010524	A	6	6	1166929	1166934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010524	T	6	6	1175410	1175415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010524	A	6	6	1189826	1189831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010524	A	6	6	1221485	1221490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010524	G	6	6	1230190	1230195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010524	C	6	6	1231372	1231377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
116	NC_010524	A	6	6	1256186	1256191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010524	C	6	6	1279519	1279524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_010524	T	7	7	1294089	1294095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010524	C	6	6	1295352	1295357	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_010524	G	6	6	1305102	1305107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010524	C	9	9	1309822	1309830	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_010524	T	7	7	1311019	1311025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010524	A	6	6	1356572	1356577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010524	C	6	6	1363228	1363233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_010524	T	7	7	1374552	1374558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010524	G	7	7	1384457	1384463	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010524	G	6	6	1388859	1388864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010524	A	6	6	1406749	1406754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010524	G	7	7	1437004	1437010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010524	A	6	6	1461480	1461485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010524	G	7	7	1461607	1461613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010524	G	7	7	1482268	1482274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010524	C	6	6	1483502	1483507	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_010524	G	7	7	1508121	1508127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_010524	C	6	6	1513854	1513859	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
137	NC_010524	T	7	7	1522495	1522501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_010524	T	7	7	1553265	1553271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010524	G	6	6	1567043	1567048	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010524	C	6	6	1567055	1567060	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_010524	G	6	6	1569070	1569075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010524	A	6	6	1585122	1585127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010524	T	6	6	1586768	1586773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010524	T	6	6	1610417	1610422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010524	C	6	6	1642603	1642608	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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148	NC_010524	G	6	6	1660226	1660231	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010524	C	6	6	1688347	1688352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
150	NC_010524	A	6	6	1690725	1690730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.