MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 2570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010520	TAGCAG	2	12	405	416	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170760502
2	NC_010520	AAAAAT	2	12	1344	1355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170760502
3	NC_010520	TCTATT	2	12	1565	1576	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010520	GATAAT	2	12	2163	2174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170761565
5	NC_010520	AAGTTA	2	12	2846	2857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170758477
6	NC_010520	CAAATA	2	12	3079	3090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170759251
7	NC_010520	ATAAAG	2	12	3175	3186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170759251
8	NC_010520	ATAAAA	2	12	3309	3320	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170759251
9	NC_010520	GAAGTA	2	12	4807	4818	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170760652
10	NC_010520	TTGATA	2	12	5858	5869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170760652
11	NC_010520	AGGATT	2	12	6502	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170758200
12	NC_010520	TTTAAA	2	12	7369	7380	50 %	50 %	0 %	0 %	170758200
13	NC_010520	CAAGCT	2	12	7595	7606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170758200
14	NC_010520	GATATA	2	12	7814	7825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170758200
15	NC_010520	ATAGAT	2	12	17717	17728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170758506
16	NC_010520	ACAAAT	2	12	18626	18637	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170758506
17	NC_010520	AATAAA	2	12	19599	19610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170761569
18	NC_010520	GCAAAA	2	12	23455	23466	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	170760371
19	NC_010520	AGATTT	2	12	24290	24301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010520	ATATAG	2	12	26636	26647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170758213
21	NC_010520	AGAAGC	2	12	27054	27065	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170758213
22	NC_010520	AGATGA	2	12	34200	34211	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170759151
23	NC_010520	CTATAG	2	12	34381	34392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170758489
24	NC_010520	AATATA	2	12	35395	35406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010520	AGAAAA	2	12	36204	36215	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170759625
26	NC_010520	GATATA	2	12	40845	40856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760863
27	NC_010520	TATTTT	2	12	40881	40892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	170760863
28	NC_010520	ATGTTT	2	12	41255	41266	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170760863
29	NC_010520	AATATG	2	12	63115	63126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010520	TAAAAA	2	12	78470	78481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010520	ATTATA	2	12	82009	82020	50 %	50 %	0 %	0 %	170760067
32	NC_010520	AATATG	2	12	82029	82040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760067
33	NC_010520	AATTAT	2	12	84051	84062	50 %	50 %	0 %	0 %	170758221
34	NC_010520	GAAAAA	2	12	84592	84603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170760438
35	NC_010520	TGTAGA	2	12	85427	85438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761387
36	NC_010520	AAAATA	2	12	87044	87055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170760429
37	NC_010520	GTTTTA	2	12	87277	87288	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170760429
38	NC_010520	AGAAAA	2	12	87312	87323	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170760429
39	NC_010520	ATCACA	2	12	88256	88267	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170761397
40	NC_010520	GAGTAA	2	12	88714	88725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170761397
41	NC_010520	CTAATT	2	12	94257	94268	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	170761134
42	NC_010520	TAAATT	2	12	98419	98430	50 %	50 %	0 %	0 %	170758880
43	NC_010520	ATAAAT	2	12	102364	102375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758865
44	NC_010520	AGTTAA	2	12	104227	104238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760729
45	NC_010520	AATATA	2	12	109454	109465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760316
46	NC_010520	TAAAAA	2	12	109827	109838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170759848
47	NC_010520	AGGACA	2	12	110202	110213	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170759848
48	NC_010520	GTAGAT	2	12	110470	110481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759848
49	NC_010520	TACTGA	2	12	113127	113138	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170760788
50	NC_010520	TATTAA	2	12	114246	114257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010520	AATAAA	2	12	116306	116317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170759288
52	NC_010520	TTAAAT	2	12	121414	121425	50 %	50 %	0 %	0 %	170759339
53	NC_010520	TCAAAA	2	12	123930	123941	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170759745
54	NC_010520	TTTGCT	2	12	124956	124967	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	170759745
55	NC_010520	AGAAAA	2	12	126125	126136	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170760647
56	NC_010520	GAAAAA	2	12	127091	127102	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170759897
57	NC_010520	AGGAAA	2	12	127353	127364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170759897
58	NC_010520	AATGTA	2	12	128163	128174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170759897
59	NC_010520	GATATG	2	12	128396	128407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759897
60	NC_010520	TGGATA	2	12	131214	131225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760246
61	NC_010520	GAACAC	2	12	132426	132437	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	170761042
62	NC_010520	CATAAC	2	12	132453	132464	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170761042
63	NC_010520	ATAAAT	2	12	132525	132536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761042
64	NC_010520	CTACAG	2	12	136034	136045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170759628
65	NC_010520	TATAGT	2	12	136795	136806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010520	GTAATA	2	12	136888	136899	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760905
67	NC_010520	CACAAC	2	12	138454	138465	50 %	0 %	0 %	50 %	170761644
68	NC_010520	ATATAA	2	12	140804	140815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759570
69	NC_010520	ATTTTT	2	12	143545	143556	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	170761720
70	NC_010520	GTAAGT	2	12	143779	143790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170761720
71	NC_010520	TTGAAA	2	12	143977	143988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760949
72	NC_010520	AAAGAA	2	12	148389	148400	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170759597
73	NC_010520	TATAAA	2	12	149470	149481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760804
74	NC_010520	ATTAGT	2	12	152333	152344	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170758380
75	NC_010520	TAAACT	2	12	156808	156819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	170758789
76	NC_010520	TTAAAG	2	12	157361	157372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170759825
77	NC_010520	GGTCAA	2	12	157615	157626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170759825
78	NC_010520	TACCTA	2	12	158448	158459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170761052
79	NC_010520	ACATTA	2	12	159169	159180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010520	TAAAAA	2	12	159352	159363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010520	AAGGAA	2	12	161927	161938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010520	AAAAGA	2	12	161994	162005	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170758932
83	NC_010520	ATAAAT	2	12	162235	162246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758932
84	NC_010520	AAACTT	2	12	162985	162996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010520	AGATTT	2	12	163246	163257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170758890
86	NC_010520	AAAGAA	2	12	163433	163444	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170758890
87	NC_010520	ATGAAT	2	12	165002	165013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760235
88	NC_010520	TTTATT	2	12	165274	165285	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010520	AGTAAT	2	12	168720	168731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760721
90	NC_010520	GTGGTA	2	12	169232	169243	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170759851
91	NC_010520	ATATAA	2	12	170438	170449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170761198
92	NC_010520	AGGTAT	2	12	174091	174102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759805
93	NC_010520	GTAGGA	2	12	174221	174232	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170759805
94	NC_010520	TTGAAA	2	12	174515	174526	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760163
95	NC_010520	AGTTAT	2	12	176345	176356	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170761792
96	NC_010520	TACAAC	2	12	177438	177449	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170759127
97	NC_010520	AAAAAT	2	12	178980	178991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170759526
98	NC_010520	ATGGTA	2	12	182988	182999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170760573
99	NC_010520	AACATA	2	12	183056	183067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170760573
100	NC_010520	AATTAA	2	12	185438	185449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758312
101	NC_010520	TAATTT	2	12	186156	186167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170761182
102	NC_010520	AATAAA	2	12	187134	187145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170758894
103	NC_010520	ATAAAA	2	12	187207	187218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170758894
104	NC_010520	TTTAAT	2	12	189074	189085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010520	GAAAAA	2	12	189626	189637	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170759265
106	NC_010520	TAAAGT	2	12	189931	189942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170759265
107	NC_010520	TAATAT	2	12	193724	193735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010520	AATGGT	2	12	194135	194146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170759936
109	NC_010520	TTAAAA	2	12	195496	195507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759254
110	NC_010520	TAAATA	2	12	196256	196267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170759254
111	NC_010520	AAAGAT	2	12	196873	196884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170759254
112	NC_010520	ATGTAA	2	12	198309	198320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760081
113	NC_010520	AGAGAT	2	12	200875	200886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170758963
114	NC_010520	TGTAAT	2	12	201633	201644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170758963
115	NC_010520	GAAATA	2	12	203908	203919	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170759975
116	NC_010520	TATAAA	2	12	204353	204364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010520	TATTTA	2	12	204555	204566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010520	AATTAA	2	12	204920	204931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170760070
119	NC_010520	GAAAAA	2	12	206756	206767	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170761041
120	NC_010520	TAATAC	2	12	209509	209520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	170759510
121	NC_010520	GGTAAG	2	12	210824	210835	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170759510
122	NC_010520	ATATAG	2	12	211313	211324	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170761762
123	NC_010520	TAAGAT	2	12	211845	211856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170760761
124	NC_010520	CAGATA	2	12	212921	212932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170761018
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126	NC_010520	TAAAAG	2	12	214319	214330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170761018
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130	NC_010520	AATTAT	2	12	215904	215915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010520	TATAAA	2	12	216481	216492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170758885
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230	NC_010520	TAATAT	2	12	393245	393256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_010520	TAAATT	2	12	393727	393738	50 %	50 %	0 %	0 %	170758687
232	NC_010520	GAGATC	2	12	395318	395329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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240	NC_010520	TTATTT	2	12	402503	402514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	170761578
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476	NC_010520	AGCATC	2	12	763682	763693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170761155
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479	NC_010520	AATATA	2	12	767480	767491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_010520	AGTTTC	2	12	770414	770425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170758895
481	NC_010520	TAAACT	2	12	770678	770689	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
482	NC_010520	CTAAAT	2	12	772264	772275	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	170760497
483	NC_010520	GCTTAA	2	12	773979	773990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170761559
484	NC_010520	ATTTTT	2	12	776552	776563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	170760400
485	NC_010520	GAATAA	2	12	780719	780730	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
486	NC_010520	CTCCAT	2	12	781223	781234	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	170758595
487	NC_010520	GAGTCA	2	12	787311	787322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170759925
488	NC_010520	AAAATA	2	12	787609	787620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_010520	GATGAA	2	12	789008	789019	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170761069
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499	NC_010520	GTAATA	2	12	803468	803479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170761757
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