MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 4492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010520	TAAAT	2	10	3608	3617	60 %	40 %	0 %	0 %	170759251
2	NC_010520	TGGAT	2	10	4872	4881	20 %	40 %	40 %	0 %	170760652
3	NC_010520	ACTTT	2	10	5932	5941	20 %	60 %	0 %	20 %	170760652
4	NC_010520	ATAAG	2	10	6318	6327	60 %	20 %	20 %	0 %	170760652
5	NC_010520	CTATG	2	10	6412	6421	20 %	40 %	20 %	20 %	170758200
6	NC_010520	GAATA	2	10	7105	7114	60 %	20 %	20 %	0 %	170758200
7	NC_010520	AGGTA	2	10	8023	8032	40 %	20 %	40 %	0 %	170758200
8	NC_010520	GGTAA	2	10	9501	9510	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010520	TCGTG	2	10	10292	10301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010520	TAAGT	2	10	12030	12039	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010520	AAAAT	2	10	13881	13890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010520	AATAA	2	10	15354	15363	80 %	20 %	0 %	0 %	170759030
13	NC_010520	TTTTA	2	10	16294	16303	20 %	80 %	0 %	0 %	170761427
14	NC_010520	AATAA	2	10	16643	16652	80 %	20 %	0 %	0 %	170758506
15	NC_010520	TTATT	2	10	17086	17095	20 %	80 %	0 %	0 %	170758506
16	NC_010520	TATAA	2	10	17732	17741	60 %	40 %	0 %	0 %	170758506
17	NC_010520	CAAAG	2	10	18521	18530	60 %	0 %	20 %	20 %	170758506
18	NC_010520	TAATG	2	10	18706	18715	40 %	40 %	20 %	0 %	170758506
19	NC_010520	TAAAA	2	10	19254	19263	80 %	20 %	0 %	0 %	170758506
20	NC_010520	GAAAT	2	10	19543	19552	60 %	20 %	20 %	0 %	170761569
21	NC_010520	ATATT	2	10	19982	19991	40 %	60 %	0 %	0 %	170761569
22	NC_010520	TAATA	2	10	20042	20051	60 %	40 %	0 %	0 %	170761569
23	NC_010520	ATAGT	2	10	21100	21109	40 %	40 %	20 %	0 %	170760698
24	NC_010520	AATTT	2	10	21590	21599	40 %	60 %	0 %	0 %	170760698
25	NC_010520	CTAAA	2	10	22520	22529	60 %	20 %	0 %	20 %	170760371
26	NC_010520	TGAAA	2	10	22563	22572	60 %	20 %	20 %	0 %	170760371
27	NC_010520	TCAAT	2	10	23178	23187	40 %	40 %	0 %	20 %	170760371
28	NC_010520	TTTAA	2	10	23651	23660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010520	ATTAA	2	10	23671	23680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010520	TATTT	2	10	23743	23752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010520	ATAAG	2	10	25709	25718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010520	TAATT	2	10	26677	26686	40 %	60 %	0 %	0 %	170758213
33	NC_010520	ATTTT	2	10	27506	27515	20 %	80 %	0 %	0 %	170761324
34	NC_010520	TAAAT	2	10	27844	27853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010520	ATATA	2	10	28132	28141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010520	AATAA	2	10	29701	29710	80 %	20 %	0 %	0 %	170759786
37	NC_010520	AAAAT	2	10	31310	31319	80 %	20 %	0 %	0 %	170759519
38	NC_010520	ATATT	2	10	31741	31750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010520	AATAA	2	10	31799	31808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010520	GATTT	2	10	32818	32827	20 %	60 %	20 %	0 %	170760406
41	NC_010520	TAATA	2	10	35351	35360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010520	GAATA	2	10	35438	35447	60 %	20 %	20 %	0 %	170760907
43	NC_010520	TTATT	2	10	35454	35463	20 %	80 %	0 %	0 %	170760907
44	NC_010520	ATAAA	2	10	35833	35842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010520	GATTT	2	10	36188	36197	20 %	60 %	20 %	0 %	170759625
46	NC_010520	AAAAG	2	10	36447	36456	80 %	0 %	20 %	0 %	170759625
47	NC_010520	TTGTA	2	10	36712	36721	20 %	60 %	20 %	0 %	170761388
48	NC_010520	ATAGA	2	10	38110	38119	60 %	20 %	20 %	0 %	170761377
49	NC_010520	TATAT	2	10	38306	38315	40 %	60 %	0 %	0 %	170761377
50	NC_010520	AGTAT	2	10	39790	39799	40 %	40 %	20 %	0 %	170759586
51	NC_010520	TTAAT	2	10	40827	40836	40 %	60 %	0 %	0 %	170760863
52	NC_010520	TCATA	2	10	40871	40880	40 %	40 %	0 %	20 %	170760863
53	NC_010520	TATAG	2	10	40994	41003	40 %	40 %	20 %	0 %	170760863
54	NC_010520	ATTGT	2	10	42010	42019	20 %	60 %	20 %	0 %	170761642
55	NC_010520	ATAGA	2	10	42115	42124	60 %	20 %	20 %	0 %	170761642
56	NC_010520	GGTAA	2	10	42902	42911	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010520	TCGTG	2	10	43693	43702	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_010520	TAAGT	2	10	45431	45440	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010520	AAAAT	2	10	47282	47291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010520	GAATA	2	10	48218	48227	60 %	20 %	20 %	0 %	170760651
61	NC_010520	TAATT	2	10	48517	48526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010520	GGTAA	2	10	49441	49450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010520	TCGTG	2	10	50232	50241	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010520	TAAGT	2	10	51970	51979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010520	AAAAT	2	10	53821	53830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010520	TTATA	2	10	54332	54341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010520	AAATC	2	10	55693	55702	60 %	20 %	0 %	20 %	170761185
68	NC_010520	GGTAA	2	10	57318	57327	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010520	TCGTG	2	10	58109	58118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_010520	TAAGT	2	10	59847	59856	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010520	AAAAT	2	10	61698	61707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010520	TGATT	2	10	62034	62043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010520	GTATA	2	10	63355	63364	40 %	40 %	20 %	0 %	170759492
74	NC_010520	TTATA	2	10	63427	63436	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010520	GGTAA	2	10	64322	64331	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010520	TCGTG	2	10	65113	65122	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_010520	TAAGT	2	10	66851	66860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010520	AAAAT	2	10	68702	68711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010520	GAAGA	2	10	69209	69218	60 %	0 %	40 %	0 %	170759119
80	NC_010520	AAATA	2	10	69827	69836	80 %	20 %	0 %	0 %	170759119
81	NC_010520	ATTAT	2	10	69950	69959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010520	GGTAA	2	10	70602	70611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010520	TCGTG	2	10	71393	71402	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010520	TAAGT	2	10	73131	73140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010520	AAAAT	2	10	74982	74991	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010520	TTGAA	2	10	76334	76343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010520	CAATC	2	10	76485	76494	40 %	20 %	0 %	40 %	170758302
88	NC_010520	ATTTT	2	10	78779	78788	20 %	80 %	0 %	0 %	170760829
89	NC_010520	ATTTT	2	10	79132	79141	20 %	80 %	0 %	0 %	170760829
90	NC_010520	AAAAT	2	10	79166	79175	80 %	20 %	0 %	0 %	170760829
91	NC_010520	TTTCC	2	10	79847	79856	0 %	60 %	0 %	40 %	170758407
92	NC_010520	ATTTT	2	10	79862	79871	20 %	80 %	0 %	0 %	170758407
93	NC_010520	GAATA	2	10	80421	80430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010520	TAAAT	2	10	83849	83858	60 %	40 %	0 %	0 %	170758221
95	NC_010520	TAAAT	2	10	84642	84651	60 %	40 %	0 %	0 %	170760438
96	NC_010520	TAGAA	2	10	84771	84780	60 %	20 %	20 %	0 %	170760438
97	NC_010520	GATAG	2	10	86379	86388	40 %	20 %	40 %	0 %	170759978
98	NC_010520	ATGGA	2	10	86584	86593	40 %	20 %	40 %	0 %	170759978
99	NC_010520	AGGAT	2	10	87080	87089	40 %	20 %	40 %	0 %	170760429
100	NC_010520	AATGG	2	10	87327	87336	40 %	20 %	40 %	0 %	170760429
101	NC_010520	AAATT	2	10	87512	87521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010520	AAAGA	2	10	88068	88077	80 %	0 %	20 %	0 %	170761397
103	NC_010520	ATTTA	2	10	89162	89171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010520	TACAA	2	10	89420	89429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010520	TTTAA	2	10	89827	89836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010520	AAGTT	2	10	90721	90730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010520	TAAAT	2	10	92182	92191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010520	TATAA	2	10	93277	93286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010520	ATTTA	2	10	94549	94558	40 %	60 %	0 %	0 %	170759849
110	NC_010520	TAATA	2	10	94819	94828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010520	TAATA	2	10	96004	96013	60 %	40 %	0 %	0 %	170761497
112	NC_010520	ATATT	2	10	98188	98197	40 %	60 %	0 %	0 %	170760011
113	NC_010520	ATACA	2	10	99877	99886	60 %	20 %	0 %	20 %	170758335
114	NC_010520	GAAAA	2	10	100688	100697	80 %	0 %	20 %	0 %	170758335
115	NC_010520	TAAGA	2	10	101091	101100	60 %	20 %	20 %	0 %	170758335
116	NC_010520	GAAAA	2	10	104547	104556	80 %	0 %	20 %	0 %	170760729
117	NC_010520	ACATT	2	10	107540	107549	40 %	40 %	0 %	20 %	170758725
118	NC_010520	AAAAT	2	10	110027	110036	80 %	20 %	0 %	0 %	170759848
119	NC_010520	ATAAA	2	10	110117	110126	80 %	20 %	0 %	0 %	170759848
120	NC_010520	ATTTA	2	10	111004	111013	40 %	60 %	0 %	0 %	170758653
121	NC_010520	GTTAT	2	10	113615	113624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010520	ATTTT	2	10	115355	115364	20 %	80 %	0 %	0 %	170760334
123	NC_010520	ATACA	2	10	115872	115881	60 %	20 %	0 %	20 %	170759288
124	NC_010520	AATAT	2	10	116176	116185	60 %	40 %	0 %	0 %	170759288
125	NC_010520	TAAAA	2	10	116468	116477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010520	AAGAA	2	10	117441	117450	80 %	0 %	20 %	0 %	170760773
127	NC_010520	TAATA	2	10	117729	117738	60 %	40 %	0 %	0 %	170760773
128	NC_010520	AGAGA	2	10	117763	117772	60 %	0 %	40 %	0 %	170760773
129	NC_010520	TAAAT	2	10	118353	118362	60 %	40 %	0 %	0 %	170760773
130	NC_010520	TTCTA	2	10	119642	119651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010520	TAATT	2	10	120694	120703	40 %	60 %	0 %	0 %	170760476
132	NC_010520	GTAAC	2	10	122851	122860	40 %	20 %	20 %	20 %	170759745
133	NC_010520	AAAAG	2	10	123581	123590	80 %	0 %	20 %	0 %	170759745
134	NC_010520	TTAAA	2	10	123643	123652	60 %	40 %	0 %	0 %	170759745
135	NC_010520	GCTTA	2	10	124558	124567	20 %	40 %	20 %	20 %	170759745
136	NC_010520	AGAAA	2	10	124809	124818	80 %	0 %	20 %	0 %	170759745
137	NC_010520	TATAA	2	10	125694	125703	60 %	40 %	0 %	0 %	170760647
138	NC_010520	ATAAA	2	10	128133	128142	80 %	20 %	0 %	0 %	170759897
139	NC_010520	ATTAT	2	10	128263	128272	40 %	60 %	0 %	0 %	170759897
140	NC_010520	TAATT	2	10	128665	128674	40 %	60 %	0 %	0 %	170759897
141	NC_010520	TTATG	2	10	130327	130336	20 %	60 %	20 %	0 %	170759897
142	NC_010520	ACAAA	2	10	132923	132932	80 %	0 %	0 %	20 %	170761042
143	NC_010520	TAGAA	2	10	134133	134142	60 %	20 %	20 %	0 %	170758457
144	NC_010520	ATTTT	2	10	135256	135265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010520	ATGGA	2	10	135989	135998	40 %	20 %	40 %	0 %	170759628
146	NC_010520	TCTAT	2	10	136721	136730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_010520	ATAAA	2	10	178318	178327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_010520	ATATT	2	10	253576	253585	40 %	60 %	0 %	0 %	170758834
276	NC_010520	TAAAA	2	10	253650	253659	80 %	20 %	0 %	0 %	170758834
277	NC_010520	CCTAT	2	10	254063	254072	20 %	40 %	0 %	40 %	170758834
278	NC_010520	ATATA	2	10	254148	254157	60 %	40 %	0 %	0 %	170758834
279	NC_010520	AATTT	2	10	254384	254393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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396	NC_010520	ATATA	2	10	366202	366211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_010520	ACTTT	2	10	375633	375642	20 %	60 %	0 %	20 %	170761666
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