MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree chromosome

Total Repeats: 13108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010520	AATA	2	8	49	56	75 %	25 %	0 %	0 %	170760502
2	NC_010520	AAGT	2	8	78	85	50 %	25 %	25 %	0 %	170760502
3	NC_010520	TTAC	2	8	218	225	25 %	50 %	0 %	25 %	170760502
4	NC_010520	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	170760502
5	NC_010520	ATGC	2	8	485	492	25 %	25 %	25 %	25 %	170760502
6	NC_010520	AATT	3	12	567	578	50 %	50 %	0 %	0 %	170760502
7	NC_010520	AAAT	2	8	610	617	75 %	25 %	0 %	0 %	170760502
8	NC_010520	AGAA	2	8	670	677	75 %	0 %	25 %	0 %	170760502
9	NC_010520	AACA	2	8	722	729	75 %	0 %	0 %	25 %	170760502
10	NC_010520	TACC	2	8	765	772	25 %	25 %	0 %	50 %	170760502
11	NC_010520	AAAC	2	8	1049	1056	75 %	0 %	0 %	25 %	170760502
12	NC_010520	TAAA	2	8	1326	1333	75 %	25 %	0 %	0 %	170760502
13	NC_010520	TTAT	2	8	1382	1389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010520	AAAT	2	8	1873	1880	75 %	25 %	0 %	0 %	170761565
15	NC_010520	TTTA	2	8	2276	2283	25 %	75 %	0 %	0 %	170761565
16	NC_010520	AATT	2	8	2751	2758	50 %	50 %	0 %	0 %	170758477
17	NC_010520	TAAT	2	8	2991	2998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010520	TAAA	2	8	3301	3308	75 %	25 %	0 %	0 %	170759251
19	NC_010520	GAAA	2	8	3489	3496	75 %	0 %	25 %	0 %	170759251
20	NC_010520	GGAT	2	8	4246	4253	25 %	25 %	50 %	0 %	170760277
21	NC_010520	ACTA	2	8	4351	4358	50 %	25 %	0 %	25 %	170760277
22	NC_010520	TTTA	2	8	5093	5100	25 %	75 %	0 %	0 %	170760652
23	NC_010520	GATG	2	8	5155	5162	25 %	25 %	50 %	0 %	170760652
24	NC_010520	GACA	2	8	5414	5421	50 %	0 %	25 %	25 %	170760652
25	NC_010520	ATTT	2	8	5671	5678	25 %	75 %	0 %	0 %	170760652
26	NC_010520	AATG	2	8	5763	5770	50 %	25 %	25 %	0 %	170760652
27	NC_010520	GTAA	2	8	6380	6387	50 %	25 %	25 %	0 %	170758200
28	NC_010520	ATAA	2	8	6755	6762	75 %	25 %	0 %	0 %	170758200
29	NC_010520	GATT	2	8	7005	7012	25 %	50 %	25 %	0 %	170758200
30	NC_010520	ATAA	2	8	8935	8942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010520	GAAA	2	8	9054	9061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010520	CTTC	2	8	9325	9332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010520	GGTA	2	8	10461	10468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010520	TTCT	2	8	10787	10794	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010520	AGAA	2	8	11199	11206	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010520	AGGT	2	8	12629	12636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010520	TGCT	2	8	13016	13023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010520	TTAA	2	8	14796	14803	50 %	50 %	0 %	0 %	170759809
39	NC_010520	TAAA	2	8	14827	14834	75 %	25 %	0 %	0 %	170759809
40	NC_010520	AGAA	2	8	14900	14907	75 %	0 %	25 %	0 %	170759030
41	NC_010520	TATG	2	8	15236	15243	25 %	50 %	25 %	0 %	170759030
42	NC_010520	TACT	2	8	15298	15305	25 %	50 %	0 %	25 %	170759030
43	NC_010520	AAAC	2	8	15513	15520	75 %	0 %	0 %	25 %	170761427
44	NC_010520	AAAT	2	8	15726	15733	75 %	25 %	0 %	0 %	170761427
45	NC_010520	GGAA	2	8	16044	16051	50 %	0 %	50 %	0 %	170761427
46	NC_010520	TTTA	2	8	16624	16631	25 %	75 %	0 %	0 %	170758506
47	NC_010520	ATAA	2	8	16799	16806	75 %	25 %	0 %	0 %	170758506
48	NC_010520	TAAA	2	8	16833	16840	75 %	25 %	0 %	0 %	170758506
49	NC_010520	TTTA	2	8	17209	17216	25 %	75 %	0 %	0 %	170758506
50	NC_010520	GCTA	2	8	17282	17289	25 %	25 %	25 %	25 %	170758506
51	NC_010520	AGTA	2	8	17395	17402	50 %	25 %	25 %	0 %	170758506
52	NC_010520	TAAA	2	8	18108	18115	75 %	25 %	0 %	0 %	170758506
53	NC_010520	ATTT	2	8	18507	18514	25 %	75 %	0 %	0 %	170758506
54	NC_010520	ATGG	2	8	18752	18759	25 %	25 %	50 %	0 %	170758506
55	NC_010520	ATTT	2	8	18822	18829	25 %	75 %	0 %	0 %	170758506
56	NC_010520	TAAT	2	8	19277	19284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010520	AATT	2	8	19376	19383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010520	TACA	2	8	19465	19472	50 %	25 %	0 %	25 %	170761569
59	NC_010520	AAGA	2	8	19473	19480	75 %	0 %	25 %	0 %	170761569
60	NC_010520	AAAT	2	8	19519	19526	75 %	25 %	0 %	0 %	170761569
61	NC_010520	GGAT	2	8	19740	19747	25 %	25 %	50 %	0 %	170761569
62	NC_010520	ATTC	2	8	20013	20020	25 %	50 %	0 %	25 %	170761569
63	NC_010520	AAAT	2	8	21049	21056	75 %	25 %	0 %	0 %	170760698
64	NC_010520	ATAA	2	8	21066	21073	75 %	25 %	0 %	0 %	170760698
65	NC_010520	TAGT	2	8	21214	21221	25 %	50 %	25 %	0 %	170760698
66	NC_010520	AAAG	2	8	21239	21246	75 %	0 %	25 %	0 %	170760698
67	NC_010520	TAAA	2	8	21478	21485	75 %	25 %	0 %	0 %	170760698
68	NC_010520	AAAT	2	8	21512	21519	75 %	25 %	0 %	0 %	170760698
69	NC_010520	ATTT	2	8	21624	21631	25 %	75 %	0 %	0 %	170759414
70	NC_010520	GTTA	2	8	21765	21772	25 %	50 %	25 %	0 %	170759414
71	NC_010520	TATT	2	8	22304	22311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010520	AATA	2	8	22321	22328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010520	CAAG	2	8	23419	23426	50 %	0 %	25 %	25 %	170760371
74	NC_010520	TAAA	2	8	23720	23727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010520	ATTT	2	8	24275	24282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010520	ATAA	2	8	24762	24769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010520	ATTT	3	12	25493	25504	25 %	75 %	0 %	0 %	170759780
78	NC_010520	ATCT	2	8	26003	26010	25 %	50 %	0 %	25 %	170758213
79	NC_010520	AAAT	2	8	26376	26383	75 %	25 %	0 %	0 %	170758213
80	NC_010520	AAAT	2	8	26397	26404	75 %	25 %	0 %	0 %	170758213
81	NC_010520	AGGT	2	8	27251	27258	25 %	25 %	50 %	0 %	170758213
82	NC_010520	TAAA	2	8	27434	27441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010520	ATAA	2	8	28309	28316	75 %	25 %	0 %	0 %	170759786
84	NC_010520	GATA	2	8	28389	28396	50 %	25 %	25 %	0 %	170759786
85	NC_010520	ATGT	2	8	28660	28667	25 %	50 %	25 %	0 %	170759786
86	NC_010520	AGAA	2	8	29319	29326	75 %	0 %	25 %	0 %	170759786
87	NC_010520	TAAA	2	8	29369	29376	75 %	25 %	0 %	0 %	170759786
88	NC_010520	TAAA	2	8	29381	29388	75 %	25 %	0 %	0 %	170759786
89	NC_010520	TAAA	2	8	29417	29424	75 %	25 %	0 %	0 %	170759786
90	NC_010520	AATG	2	8	29634	29641	50 %	25 %	25 %	0 %	170759786
91	NC_010520	TGTA	2	8	29724	29731	25 %	50 %	25 %	0 %	170759786
92	NC_010520	AATA	2	8	29732	29739	75 %	25 %	0 %	0 %	170759786
93	NC_010520	AGCT	2	8	30110	30117	25 %	25 %	25 %	25 %	170759255
94	NC_010520	CATA	2	8	30473	30480	50 %	25 %	0 %	25 %	170759255
95	NC_010520	AAGA	2	8	30983	30990	75 %	0 %	25 %	0 %	170759255
96	NC_010520	TAAA	2	8	31158	31165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010520	AATA	2	8	31190	31197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010520	ATGA	2	8	31222	31229	50 %	25 %	25 %	0 %	170759519
99	NC_010520	ATGT	2	8	31438	31445	25 %	50 %	25 %	0 %	170759519
100	NC_010520	TATT	2	8	31705	31712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010520	GGAA	2	8	32083	32090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010520	AATA	2	8	32546	32553	75 %	25 %	0 %	0 %	170760406
103	NC_010520	AAGG	2	8	33702	33709	50 %	0 %	50 %	0 %	170760406
104	NC_010520	AGAA	2	8	34103	34110	75 %	0 %	25 %	0 %	170759151
105	NC_010520	TGCA	2	8	34242	34249	25 %	25 %	25 %	25 %	170759151
106	NC_010520	AAAG	2	8	34260	34267	75 %	0 %	25 %	0 %	170759151
107	NC_010520	GAAG	2	8	34944	34951	50 %	0 %	50 %	0 %	170758489
108	NC_010520	AATT	2	8	35154	35161	50 %	50 %	0 %	0 %	170761583
109	NC_010520	TTAT	2	8	35563	35570	25 %	75 %	0 %	0 %	170760907
110	NC_010520	AATG	2	8	35717	35724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010520	AAAT	2	8	35915	35922	75 %	25 %	0 %	0 %	170759625
112	NC_010520	AATT	2	8	36627	36634	50 %	50 %	0 %	0 %	170761388
113	NC_010520	GATT	2	8	36988	36995	25 %	50 %	25 %	0 %	170761388
114	NC_010520	ATAA	2	8	37550	37557	75 %	25 %	0 %	0 %	170760354
115	NC_010520	AATT	2	8	37654	37661	50 %	50 %	0 %	0 %	170760354
116	NC_010520	ATTA	2	8	38183	38190	50 %	50 %	0 %	0 %	170761377
117	NC_010520	ATAA	2	8	38415	38422	75 %	25 %	0 %	0 %	170761377
118	NC_010520	ATAA	2	8	38865	38872	75 %	25 %	0 %	0 %	170760243
119	NC_010520	TTAG	2	8	39523	39530	25 %	50 %	25 %	0 %	170759586
120	NC_010520	CTAT	2	8	39658	39665	25 %	50 %	0 %	25 %	170759586
121	NC_010520	TAAA	2	8	39704	39711	75 %	25 %	0 %	0 %	170759586
122	NC_010520	AAAT	2	8	39846	39853	75 %	25 %	0 %	0 %	170759586
123	NC_010520	TAAA	2	8	40101	40108	75 %	25 %	0 %	0 %	170759586
124	NC_010520	ATAA	2	8	40259	40266	75 %	25 %	0 %	0 %	170760863
125	NC_010520	TCTT	2	8	40397	40404	0 %	75 %	0 %	25 %	170760863
126	NC_010520	TTTA	2	8	40638	40645	25 %	75 %	0 %	0 %	170760863
127	NC_010520	GAAA	2	8	40735	40742	75 %	0 %	25 %	0 %	170760863
128	NC_010520	TTTA	2	8	41239	41246	25 %	75 %	0 %	0 %	170760863
129	NC_010520	ATTT	2	8	41502	41509	25 %	75 %	0 %	0 %	170761642
130	NC_010520	ATTT	2	8	41539	41546	25 %	75 %	0 %	0 %	170761642
131	NC_010520	AAAT	2	8	41566	41573	75 %	25 %	0 %	0 %	170761642
132	NC_010520	TTTA	2	8	41623	41630	25 %	75 %	0 %	0 %	170761642
133	NC_010520	ATGG	2	8	41658	41665	25 %	25 %	50 %	0 %	170761642
134	NC_010520	TTAC	2	8	42241	42248	25 %	50 %	0 %	25 %	170761642
135	NC_010520	CTTC	2	8	42726	42733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_010520	GGTA	2	8	43862	43869	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010520	AGAA	2	8	44175	44182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010520	TTCT	2	8	44188	44195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010520	AGAA	2	8	44600	44607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010520	AGGT	2	8	46030	46037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010520	TGCT	2	8	46417	46424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010520	GATG	2	8	47826	47833	25 %	25 %	50 %	0 %	170760651
143	NC_010520	AAAT	2	8	47871	47878	75 %	25 %	0 %	0 %	170760651
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145	NC_010520	TATT	2	8	48538	48545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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