MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 1833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010519	ATTTA	2	10	1972	1981	40 %	60 %	0 %	0 %	170718298
2	NC_010519	ATTTT	2	10	4574	4583	20 %	80 %	0 %	0 %	170718646
3	NC_010519	AATCC	2	10	5832	5841	40 %	20 %	0 %	40 %	170718862
4	NC_010519	CTTAA	2	10	8881	8890	40 %	40 %	0 %	20 %	170717422
5	NC_010519	GCAAA	2	10	10752	10761	60 %	0 %	20 %	20 %	170717531
6	NC_010519	GTTCG	2	10	10858	10867	0 %	40 %	40 %	20 %	170717531
7	NC_010519	AAATG	2	10	12239	12248	60 %	20 %	20 %	0 %	170717751
8	NC_010519	AATCC	2	10	12984	12993	40 %	20 %	0 %	40 %	170717973
9	NC_010519	GTATG	2	10	13993	14002	20 %	40 %	40 %	0 %	170717973
10	NC_010519	AAGAA	2	10	15181	15190	80 %	0 %	20 %	0 %	170717973
11	NC_010519	GGCGA	2	10	15840	15849	20 %	0 %	60 %	20 %	170718084
12	NC_010519	GATGT	2	10	16074	16083	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010519	TTGTG	2	10	16332	16341	0 %	60 %	40 %	0 %	170718188
14	NC_010519	GCAAT	2	10	17180	17189	40 %	20 %	20 %	20 %	170718299
15	NC_010519	TTGTA	2	10	17496	17505	20 %	60 %	20 %	0 %	170718332
16	NC_010519	TCTTT	2	10	18451	18460	0 %	80 %	0 %	20 %	170718332
17	NC_010519	TTAAA	2	10	18796	18805	60 %	40 %	0 %	0 %	170718343
18	NC_010519	TGATG	2	10	19795	19804	20 %	40 %	40 %	0 %	170718365
19	NC_010519	CAATA	2	10	21170	21179	60 %	20 %	0 %	20 %	170718376
20	NC_010519	ATTTA	2	10	22476	22485	40 %	60 %	0 %	0 %	170718398
21	NC_010519	TAAAA	2	10	22509	22518	80 %	20 %	0 %	0 %	170718398
22	NC_010519	TGTTT	2	10	22679	22688	0 %	80 %	20 %	0 %	170718398
23	NC_010519	CATTC	2	10	22987	22996	20 %	40 %	0 %	40 %	170718409
24	NC_010519	TTTAT	2	10	24818	24827	20 %	80 %	0 %	0 %	170718443
25	NC_010519	GTAAA	2	10	25367	25376	60 %	20 %	20 %	0 %	170718452
26	NC_010519	TTATT	2	10	25442	25451	20 %	80 %	0 %	0 %	170718452
27	NC_010519	ACTTT	2	10	30801	30810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010519	ATGCA	2	10	31259	31268	40 %	20 %	20 %	20 %	170718541
29	NC_010519	TGAAT	2	10	32186	32195	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010519	ATCGT	2	10	32390	32399	20 %	40 %	20 %	20 %	170718552
31	NC_010519	GCTTA	2	10	32681	32690	20 %	40 %	20 %	20 %	170718552
32	NC_010519	TGATG	2	10	33818	33827	20 %	40 %	40 %	0 %	170718563
33	NC_010519	TGCGT	2	10	35149	35158	0 %	40 %	40 %	20 %	170718585
34	NC_010519	TATTG	2	10	35195	35204	20 %	60 %	20 %	0 %	170718585
35	NC_010519	GGGAA	2	10	36385	36394	40 %	0 %	60 %	0 %	170718593
36	NC_010519	TTTAC	2	10	36706	36715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010519	GAATT	2	10	37049	37058	40 %	40 %	20 %	0 %	170718604
38	NC_010519	ATAAG	2	10	38337	38346	60 %	20 %	20 %	0 %	170718615
39	NC_010519	TAATT	2	10	38371	38380	40 %	60 %	0 %	0 %	170718615
40	NC_010519	GATAG	2	10	39655	39664	40 %	20 %	40 %	0 %	170718615
41	NC_010519	TACAT	2	10	41499	41508	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_010519	AAAAT	2	10	44392	44401	80 %	20 %	0 %	0 %	170718658
43	NC_010519	AATAA	2	10	44424	44433	80 %	20 %	0 %	0 %	170718658
44	NC_010519	TTAAA	2	10	44503	44512	60 %	40 %	0 %	0 %	170718658
45	NC_010519	AAATT	2	10	44853	44862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010519	AAACC	2	10	50595	50604	60 %	0 %	0 %	40 %	170718711
47	NC_010519	AATCC	2	10	54902	54911	40 %	20 %	0 %	40 %	170718774
48	NC_010519	TTATT	2	10	55326	55335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010519	ATCAA	2	10	57968	57977	60 %	20 %	0 %	20 %	170718796
50	NC_010519	AATAG	2	10	58574	58583	60 %	20 %	20 %	0 %	170718807
51	NC_010519	TACCG	2	10	58769	58778	20 %	20 %	20 %	40 %	170718807
52	NC_010519	AAACC	2	10	59035	59044	60 %	0 %	0 %	40 %	170718807
53	NC_010519	TAGGA	2	10	59595	59604	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010519	CAAAT	2	10	62046	62055	60 %	20 %	0 %	20 %	170718818
55	NC_010519	TAATT	2	10	71694	71703	40 %	60 %	0 %	0 %	170718896
56	NC_010519	AAACT	2	10	72689	72698	60 %	20 %	0 %	20 %	170718896
57	NC_010519	CAAAT	2	10	73025	73034	60 %	20 %	0 %	20 %	170718896
58	NC_010519	TGAGA	2	10	74442	74451	40 %	20 %	40 %	0 %	170718907
59	NC_010519	TAAAT	2	10	76236	76245	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010519	GTTTT	2	10	76592	76601	0 %	80 %	20 %	0 %	170718929
61	NC_010519	GGTGC	2	10	77954	77963	0 %	20 %	60 %	20 %	170718940
62	NC_010519	CTTTG	2	10	78477	78486	0 %	60 %	20 %	20 %	170718940
63	NC_010519	TTCAA	2	10	81461	81470	40 %	40 %	0 %	20 %	170718940
64	NC_010519	AATTT	2	10	81710	81719	40 %	60 %	0 %	0 %	170718940
65	NC_010519	ATTTA	2	10	82240	82249	40 %	60 %	0 %	0 %	170718940
66	NC_010519	TTTTG	2	10	82981	82990	0 %	80 %	20 %	0 %	170718940
67	NC_010519	ATCTT	2	10	86301	86310	20 %	60 %	0 %	20 %	170718940
68	NC_010519	TGTAT	2	10	86346	86355	20 %	60 %	20 %	0 %	170718940
69	NC_010519	ATTGT	2	10	87200	87209	20 %	60 %	20 %	0 %	170718940
70	NC_010519	TTTTG	2	10	88843	88852	0 %	80 %	20 %	0 %	170718940
71	NC_010519	ATGTA	2	10	89372	89381	40 %	40 %	20 %	0 %	170718951
72	NC_010519	TTGCG	2	10	91714	91723	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_010519	GTAAT	2	10	93352	93361	40 %	40 %	20 %	0 %	170719005
74	NC_010519	ACCGC	2	10	94602	94611	20 %	0 %	20 %	60 %	170719012
75	NC_010519	AAAGT	2	10	95624	95633	60 %	20 %	20 %	0 %	170719023
76	NC_010519	AACTG	2	10	95642	95651	40 %	20 %	20 %	20 %	170719023
77	NC_010519	GAAAG	2	10	96471	96480	60 %	0 %	40 %	0 %	170719034
78	NC_010519	AACCG	2	10	96913	96922	40 %	0 %	20 %	40 %	170719045
79	NC_010519	TATGG	2	10	98197	98206	20 %	40 %	40 %	0 %	170719056
80	NC_010519	ATGTG	2	10	99701	99710	20 %	40 %	40 %	0 %	170719079
81	NC_010519	AGGTA	2	10	101733	101742	40 %	20 %	40 %	0 %	170719101
82	NC_010519	AATGA	2	10	102627	102636	60 %	20 %	20 %	0 %	170719112
83	NC_010519	TTCCA	2	10	103250	103259	20 %	40 %	0 %	40 %	170719112
84	NC_010519	ATGAT	2	10	106019	106028	40 %	40 %	20 %	0 %	170719156
85	NC_010519	TTCAC	2	10	114028	114037	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_010519	AGTAC	2	10	114331	114340	40 %	20 %	20 %	20 %	170717242
87	NC_010519	CCAAT	2	10	114827	114836	40 %	20 %	0 %	40 %	170717242
88	NC_010519	TTTGT	2	10	115167	115176	0 %	80 %	20 %	0 %	170717242
89	NC_010519	GTGCG	2	10	115731	115740	0 %	20 %	60 %	20 %	170717253
90	NC_010519	AATTA	2	10	117335	117344	60 %	40 %	0 %	0 %	170717264
91	NC_010519	AATTT	2	10	118783	118792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010519	TAAAA	2	10	119000	119009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010519	ATAGC	2	10	119095	119104	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010519	CTGAA	2	10	120297	120306	40 %	20 %	20 %	20 %	170717306
95	NC_010519	AATAT	2	10	120906	120915	60 %	40 %	0 %	0 %	170717306
96	NC_010519	ATTTT	2	10	124700	124709	20 %	80 %	0 %	0 %	170717340
97	NC_010519	TTCTT	2	10	125102	125111	0 %	80 %	0 %	20 %	170717351
98	NC_010519	ATCAG	2	10	125508	125517	40 %	20 %	20 %	20 %	170717351
99	NC_010519	ATGTT	2	10	127095	127104	20 %	60 %	20 %	0 %	170717373
100	NC_010519	GCGAA	2	10	128556	128565	40 %	0 %	40 %	20 %	170717384
101	NC_010519	GATTG	2	10	129919	129928	20 %	40 %	40 %	0 %	170717395
102	NC_010519	GTAAA	2	10	130707	130716	60 %	20 %	20 %	0 %	170717413
103	NC_010519	CTTAT	2	10	131318	131327	20 %	60 %	0 %	20 %	170717423
104	NC_010519	TCTAT	2	10	131367	131376	20 %	60 %	0 %	20 %	170717423
105	NC_010519	TATTT	2	10	131677	131686	20 %	80 %	0 %	0 %	170717423
106	NC_010519	ACATT	2	10	132090	132099	40 %	40 %	0 %	20 %	170717434
107	NC_010519	GTAAA	2	10	134214	134223	60 %	20 %	20 %	0 %	170717456
108	NC_010519	GGTAT	2	10	134808	134817	20 %	40 %	40 %	0 %	170717467
109	NC_010519	GAAGC	2	10	135731	135740	40 %	0 %	40 %	20 %	170717478
110	NC_010519	TGTTT	2	10	138844	138853	0 %	80 %	20 %	0 %	170717520
111	NC_010519	GAAAA	2	10	143162	143171	80 %	0 %	20 %	0 %	170717576
112	NC_010519	AGCAA	2	10	143335	143344	60 %	0 %	20 %	20 %	170717576
113	NC_010519	AATGG	2	10	144186	144195	40 %	20 %	40 %	0 %	170717585
114	NC_010519	CTTTT	2	10	146379	146388	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010519	TTTTC	2	10	146560	146569	0 %	80 %	0 %	20 %	170717607
116	NC_010519	TGATT	2	10	147827	147836	20 %	60 %	20 %	0 %	170717629
117	NC_010519	ATTCG	2	10	150323	150332	20 %	40 %	20 %	20 %	170717652
118	NC_010519	AAAAC	2	10	152216	152225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_010519	GTTTT	2	10	152240	152249	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010519	GATTT	2	10	153691	153700	20 %	60 %	20 %	0 %	170717674
121	NC_010519	TTTGG	2	10	153894	153903	0 %	60 %	40 %	0 %	170717674
122	NC_010519	AATAA	2	10	154136	154145	80 %	20 %	0 %	0 %	170717685
123	NC_010519	TTATG	2	10	159834	159843	20 %	60 %	20 %	0 %	170717729
124	NC_010519	AATGT	2	10	161263	161272	40 %	40 %	20 %	0 %	170717740
125	NC_010519	GCTTG	2	10	164948	164957	0 %	40 %	40 %	20 %	170717774
126	NC_010519	GCTTA	2	10	167703	167712	20 %	40 %	20 %	20 %	170717818
127	NC_010519	ATTTG	2	10	167950	167959	20 %	60 %	20 %	0 %	170717829
128	NC_010519	ATGGC	2	10	168218	168227	20 %	20 %	40 %	20 %	170717829
129	NC_010519	GCACC	2	10	168529	168538	20 %	0 %	20 %	60 %	170717840
130	NC_010519	TTTAC	2	10	169846	169855	20 %	60 %	0 %	20 %	170717840
131	NC_010519	AACAG	2	10	170073	170082	60 %	0 %	20 %	20 %	170717840
132	NC_010519	AAGTA	2	10	173091	173100	60 %	20 %	20 %	0 %	170717863
133	NC_010519	ATTTG	2	10	173169	173178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010519	TCATT	2	10	173314	173323	20 %	60 %	0 %	20 %	170717874
135	NC_010519	TGCCA	2	10	173585	173594	20 %	20 %	20 %	40 %	170717874
136	NC_010519	AAAAC	2	10	175092	175101	80 %	0 %	0 %	20 %	170717885
137	NC_010519	AATTT	2	10	175505	175514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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