MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 6347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010519	CCAA	2	8	676	683	50 %	0 %	0 %	50 %	170717207
2	NC_010519	ATGC	2	8	843	850	25 %	25 %	25 %	25 %	170717207
3	NC_010519	TGAT	2	8	940	947	25 %	50 %	25 %	0 %	170717207
4	NC_010519	AATT	2	8	2361	2368	50 %	50 %	0 %	0 %	170718298
5	NC_010519	TTGC	2	8	3704	3711	0 %	50 %	25 %	25 %	170718431
6	NC_010519	AATT	2	8	4207	4214	50 %	50 %	0 %	0 %	170718540
7	NC_010519	ATGA	2	8	4432	4439	50 %	25 %	25 %	0 %	170718540
8	NC_010519	TAAA	2	8	4647	4654	75 %	25 %	0 %	0 %	170718646
9	NC_010519	TAAA	2	8	5194	5201	75 %	25 %	0 %	0 %	170718753
10	NC_010519	CTGG	2	8	5793	5800	0 %	25 %	50 %	25 %	170718862
11	NC_010519	CAAC	2	8	5817	5824	50 %	0 %	0 %	50 %	170718862
12	NC_010519	ACCG	2	8	6840	6847	25 %	0 %	25 %	50 %	170718971
13	NC_010519	AATT	2	8	7068	7075	50 %	50 %	0 %	0 %	170718971
14	NC_010519	ATTA	2	8	7491	7498	50 %	50 %	0 %	0 %	170719078
15	NC_010519	GTAT	2	8	7643	7650	25 %	50 %	25 %	0 %	170719078
16	NC_010519	CAGA	2	8	7868	7875	50 %	0 %	25 %	25 %	170719078
17	NC_010519	CGCA	2	8	8265	8272	25 %	0 %	25 %	50 %	170717208
18	NC_010519	AAGT	2	8	8840	8847	50 %	25 %	25 %	0 %	170717422
19	NC_010519	CTTT	2	8	9552	9559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010519	AATG	2	8	9637	9644	50 %	25 %	25 %	0 %	170717531
21	NC_010519	CAAA	2	8	11346	11353	75 %	0 %	0 %	25 %	170717640
22	NC_010519	GAGC	2	8	11471	11478	25 %	0 %	50 %	25 %	170717640
23	NC_010519	GGAA	2	8	11730	11737	50 %	0 %	50 %	0 %	170717751
24	NC_010519	CTAT	2	8	11858	11865	25 %	50 %	0 %	25 %	170717751
25	NC_010519	ATGT	2	8	11903	11910	25 %	50 %	25 %	0 %	170717751
26	NC_010519	ACAA	2	8	12909	12916	75 %	0 %	0 %	25 %	170717973
27	NC_010519	AAAG	2	8	13153	13160	75 %	0 %	25 %	0 %	170717973
28	NC_010519	GAAG	2	8	13242	13249	50 %	0 %	50 %	0 %	170717973
29	NC_010519	GTTG	2	8	13553	13560	0 %	50 %	50 %	0 %	170717973
30	NC_010519	TACG	2	8	13851	13858	25 %	25 %	25 %	25 %	170717973
31	NC_010519	AATT	2	8	14536	14543	50 %	50 %	0 %	0 %	170717973
32	NC_010519	TTAT	2	8	14934	14941	25 %	75 %	0 %	0 %	170717973
33	NC_010519	CAGT	2	8	15073	15080	25 %	25 %	25 %	25 %	170717973
34	NC_010519	AGCG	2	8	15157	15164	25 %	0 %	50 %	25 %	170717973
35	NC_010519	TGAA	2	8	15550	15557	50 %	25 %	25 %	0 %	170718084
36	NC_010519	GGAT	2	8	16933	16940	25 %	25 %	50 %	0 %	170718299
37	NC_010519	ATAA	2	8	17009	17016	75 %	25 %	0 %	0 %	170718299
38	NC_010519	GAAA	2	8	17276	17283	75 %	0 %	25 %	0 %	170718299
39	NC_010519	TAAT	2	8	17709	17716	50 %	50 %	0 %	0 %	170718332
40	NC_010519	TTCT	2	8	17853	17860	0 %	75 %	0 %	25 %	170718332
41	NC_010519	AGGT	2	8	17940	17947	25 %	25 %	50 %	0 %	170718332
42	NC_010519	TCAT	2	8	18365	18372	25 %	50 %	0 %	25 %	170718332
43	NC_010519	AATT	2	8	18581	18588	50 %	50 %	0 %	0 %	170718343
44	NC_010519	TGCC	2	8	18676	18683	0 %	25 %	25 %	50 %	170718343
45	NC_010519	TTAT	2	8	18963	18970	25 %	75 %	0 %	0 %	170718354
46	NC_010519	AAAG	2	8	19494	19501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010519	AAAT	2	8	19508	19515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010519	GCAG	2	8	19843	19850	25 %	0 %	50 %	25 %	170718365
49	NC_010519	AAGT	2	8	20004	20011	50 %	25 %	25 %	0 %	170718365
50	NC_010519	CTTG	2	8	20195	20202	0 %	50 %	25 %	25 %	170718365
51	NC_010519	GTAA	2	8	20294	20301	50 %	25 %	25 %	0 %	170718365
52	NC_010519	TGCG	2	8	20541	20548	0 %	25 %	50 %	25 %	170718365
53	NC_010519	TTGG	2	8	20572	20579	0 %	50 %	50 %	0 %	170718365
54	NC_010519	AAAG	2	8	20615	20622	75 %	0 %	25 %	0 %	170718365
55	NC_010519	ATAA	2	8	21202	21209	75 %	25 %	0 %	0 %	170718376
56	NC_010519	AATA	2	8	21377	21384	75 %	25 %	0 %	0 %	170718376
57	NC_010519	ATAA	2	8	21503	21510	75 %	25 %	0 %	0 %	170718376
58	NC_010519	ATAA	2	8	21597	21604	75 %	25 %	0 %	0 %	170718376
59	NC_010519	TAAA	2	8	22354	22361	75 %	25 %	0 %	0 %	170718387
60	NC_010519	CATC	2	8	22542	22549	25 %	25 %	0 %	50 %	170718398
61	NC_010519	TCGG	2	8	22854	22861	0 %	25 %	50 %	25 %	170718409
62	NC_010519	TTTA	2	8	23067	23074	25 %	75 %	0 %	0 %	170718409
63	NC_010519	TATT	2	8	23408	23415	25 %	75 %	0 %	0 %	170718409
64	NC_010519	ATTT	2	8	23724	23731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010519	AATA	2	8	24522	24529	75 %	25 %	0 %	0 %	170718432
66	NC_010519	AAAG	2	8	24917	24924	75 %	0 %	25 %	0 %	170718443
67	NC_010519	TTTC	2	8	25292	25299	0 %	75 %	0 %	25 %	170718452
68	NC_010519	TTGG	2	8	25695	25702	0 %	50 %	50 %	0 %	170718452
69	NC_010519	GCTG	2	8	26029	26036	0 %	25 %	50 %	25 %	170718463
70	NC_010519	GGAA	2	8	26356	26363	50 %	0 %	50 %	0 %	170718463
71	NC_010519	TCTA	2	8	27298	27305	25 %	50 %	0 %	25 %	170718474
72	NC_010519	ACTA	2	8	27403	27410	50 %	25 %	0 %	25 %	170718474
73	NC_010519	TACA	2	8	27898	27905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010519	AAGT	2	8	29391	29398	50 %	25 %	25 %	0 %	170718507
75	NC_010519	TAAT	2	8	29447	29454	50 %	50 %	0 %	0 %	170718507
76	NC_010519	TGGT	2	8	29528	29535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010519	ACAA	2	8	29752	29759	75 %	0 %	0 %	25 %	170718518
78	NC_010519	GGCA	2	8	30164	30171	25 %	0 %	50 %	25 %	170718518
79	NC_010519	TTAA	2	8	30221	30228	50 %	50 %	0 %	0 %	170718518
80	NC_010519	ATTT	2	8	30249	30256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010519	ATTG	2	8	30266	30273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010519	TAAC	2	8	30283	30290	50 %	25 %	0 %	25 %	170718529
83	NC_010519	AATT	2	8	30340	30347	50 %	50 %	0 %	0 %	170718529
84	NC_010519	AAGA	2	8	30600	30607	75 %	0 %	25 %	0 %	170718529
85	NC_010519	GTTT	2	8	30833	30840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010519	AATT	2	8	31529	31536	50 %	50 %	0 %	0 %	170718541
87	NC_010519	TAAG	2	8	31925	31932	50 %	25 %	25 %	0 %	170718541
88	NC_010519	TTAT	2	8	32874	32881	25 %	75 %	0 %	0 %	170718552
89	NC_010519	ATGA	2	8	32971	32978	50 %	25 %	25 %	0 %	170718552
90	NC_010519	CTGC	2	8	33436	33443	0 %	25 %	25 %	50 %	170718552
91	NC_010519	GTCA	2	8	33475	33482	25 %	25 %	25 %	25 %	170718552
92	NC_010519	ATCG	2	8	34008	34015	25 %	25 %	25 %	25 %	170718563
93	NC_010519	AATT	2	8	34410	34417	50 %	50 %	0 %	0 %	170718574
94	NC_010519	GAAA	2	8	34696	34703	75 %	0 %	25 %	0 %	170718574
95	NC_010519	GATC	2	8	34795	34802	25 %	25 %	25 %	25 %	170718574
96	NC_010519	TTTA	2	8	35277	35284	25 %	75 %	0 %	0 %	170718585
97	NC_010519	ACTT	2	8	35375	35382	25 %	50 %	0 %	25 %	170718585
98	NC_010519	TTTA	2	8	35452	35459	25 %	75 %	0 %	0 %	170718585
99	NC_010519	AGCA	2	8	36278	36285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010519	AATA	2	8	36341	36348	75 %	25 %	0 %	0 %	170718593
101	NC_010519	ATGA	2	8	36528	36535	50 %	25 %	25 %	0 %	170718593
102	NC_010519	ATGG	2	8	36844	36851	25 %	25 %	50 %	0 %	170718604
103	NC_010519	TGGA	2	8	36923	36930	25 %	25 %	50 %	0 %	170718604
104	NC_010519	CAAG	2	8	37388	37395	50 %	0 %	25 %	25 %	170718604
105	NC_010519	TATT	2	8	37586	37593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010519	GTTG	2	8	37966	37973	0 %	50 %	50 %	0 %	170718615
107	NC_010519	TAAG	2	8	38041	38048	50 %	25 %	25 %	0 %	170718615
108	NC_010519	AACC	2	8	38356	38363	50 %	0 %	0 %	50 %	170718615
109	NC_010519	TTTG	2	8	38556	38563	0 %	75 %	25 %	0 %	170718615
110	NC_010519	ATCT	2	8	39086	39093	25 %	50 %	0 %	25 %	170718615
111	NC_010519	TATT	2	8	39361	39368	25 %	75 %	0 %	0 %	170718615
112	NC_010519	CATA	2	8	39902	39909	50 %	25 %	0 %	25 %	170718615
113	NC_010519	TTAT	2	8	40541	40548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010519	GCCA	2	8	40844	40851	25 %	0 %	25 %	50 %	170718626
115	NC_010519	TTTG	2	8	40957	40964	0 %	75 %	25 %	0 %	170718626
116	NC_010519	AAGT	2	8	41098	41105	50 %	25 %	25 %	0 %	170718626
117	NC_010519	TAAT	2	8	41172	41179	50 %	50 %	0 %	0 %	170718626
118	NC_010519	AAAT	2	8	41284	41291	75 %	25 %	0 %	0 %	170718626
119	NC_010519	ATTG	2	8	41929	41936	25 %	50 %	25 %	0 %	170718637
120	NC_010519	TTAA	2	8	42209	42216	50 %	50 %	0 %	0 %	170718637
121	NC_010519	CCAA	2	8	43376	43383	50 %	0 %	0 %	50 %	170718647
122	NC_010519	AATT	2	8	43410	43417	50 %	50 %	0 %	0 %	170718647
123	NC_010519	TAAA	2	8	43716	43723	75 %	25 %	0 %	0 %	170718647
124	NC_010519	ATTT	2	8	44941	44948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010519	CAAC	2	8	45191	45198	50 %	0 %	0 %	50 %	170718669
126	NC_010519	GTTT	2	8	45212	45219	0 %	75 %	25 %	0 %	170718669
127	NC_010519	ACCG	2	8	46202	46209	25 %	0 %	25 %	50 %	170718680
128	NC_010519	GTAG	2	8	46343	46350	25 %	25 %	50 %	0 %	170718680
129	NC_010519	ATCA	2	8	46365	46372	50 %	25 %	0 %	25 %	170718680
130	NC_010519	ATCA	2	8	46562	46569	50 %	25 %	0 %	25 %	170718689
131	NC_010519	AATT	2	8	46879	46886	50 %	50 %	0 %	0 %	170718689
132	NC_010519	AGTA	2	8	46950	46957	50 %	25 %	25 %	0 %	170718689
133	NC_010519	CAAA	2	8	46986	46993	75 %	0 %	0 %	25 %	170718689
134	NC_010519	TTTC	2	8	48213	48220	0 %	75 %	0 %	25 %	170718689
135	NC_010519	TACC	2	8	49047	49054	25 %	25 %	0 %	50 %	170718689
136	NC_010519	ATTA	2	8	49381	49388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010519	TAAA	2	8	49749	49756	75 %	25 %	0 %	0 %	170718700
138	NC_010519	ATTT	2	8	49982	49989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010519	TAAA	2	8	50345	50352	75 %	25 %	0 %	0 %	170718711
140	NC_010519	AAAT	2	8	50662	50669	75 %	25 %	0 %	0 %	170718711
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