MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010519	CTTT	2	8	9552	9559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010519	AAAG	2	8	19494	19501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010519	AAAT	2	8	19508	19515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010519	ATTT	2	8	23724	23731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010519	TACA	2	8	27898	27905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010519	TGGT	2	8	29528	29535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010519	ATTT	2	8	30249	30256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010519	ATTG	2	8	30266	30273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010519	GTTT	2	8	30833	30840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010519	AGCA	2	8	36278	36285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010519	TATT	2	8	37586	37593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010519	TTAT	2	8	40541	40548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010519	ATTT	2	8	44941	44948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010519	ATTA	2	8	49381	49388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010519	ATTT	2	8	49982	49989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010519	TTAA	2	8	56696	56703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010519	CTAC	2	8	57091	57098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010519	TCAA	2	8	63268	63275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010519	AATT	2	8	65949	65956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010519	TAAG	2	8	66016	66023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010519	AAAT	2	8	66055	66062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010519	ATTA	2	8	66075	66082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010519	AATA	2	8	66105	66112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010519	TTTA	2	8	71188	71195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010519	TTAT	2	8	71292	71299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010519	TTTA	2	8	71318	71325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010519	CAAA	2	8	71346	71353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010519	AATC	2	8	74914	74921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010519	GATG	2	8	76655	76662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010519	ATTT	2	8	88909	88916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010519	AAAT	2	8	96594	96601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010519	GAAA	2	8	96651	96658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010519	AAAT	2	8	98298	98305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010519	ATAA	2	8	108111	108118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010519	AATC	2	8	109051	109058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010519	TTTA	2	8	113911	113918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010519	GCAA	2	8	113978	113985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010519	TCCT	2	8	115199	115206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010519	TGAA	2	8	118555	118562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010519	TTTC	2	8	118599	118606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010519	AAAG	2	8	118694	118701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010519	AAAT	2	8	118968	118975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010519	AACA	2	8	126665	126672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010519	TTCA	2	8	128920	128927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010519	AAAG	2	8	130067	130074	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010519	ATTA	2	8	134411	134418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010519	TTAT	2	8	137863	137870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010519	AATG	2	8	138138	138145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010519	TATT	2	8	141250	141257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010519	ACAA	2	8	145990	145997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010519	TTTA	2	8	146179	146186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010519	ATTC	2	8	146292	146299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010519	TTAT	2	8	146319	146326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010519	TGTT	2	8	146338	146345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010519	AGTC	2	8	153949	153956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010519	TAAT	2	8	161785	161792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010519	TCAA	2	8	161827	161834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010519	TAAG	2	8	164454	164461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010519	ATTT	2	8	168456	168463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010519	TAAA	2	8	176264	176271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010519	TTAG	2	8	178007	178014	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010519	TGAA	2	8	178291	178298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010519	GTAA	2	8	178872	178879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010519	TTTA	2	8	180047	180054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010519	AGCC	2	8	183186	183193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010519	GTAG	2	8	197509	197516	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010519	TTAT	2	8	197835	197842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010519	TAAA	2	8	199941	199948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010519	CCAG	2	8	199965	199972	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010519	ATAA	2	8	200059	200066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010519	TTTG	2	8	200200	200207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010519	TGAT	2	8	200442	200449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010519	CTTG	2	8	200873	200880	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010519	ATTT	2	8	201180	201187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010519	ATTG	2	8	201787	201794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010519	TTTA	2	8	205849	205856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010519	TACT	2	8	212565	212572	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010519	AAAC	2	8	216888	216895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010519	CCTT	2	8	217611	217618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010519	ATGA	2	8	220317	220324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010519	TTGC	2	8	229701	229708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010519	TCAT	2	8	236191	236198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010519	ATAA	2	8	247631	247638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010519	ATTT	2	8	256277	256284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010519	ATTT	2	8	258024	258031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010519	TGAA	2	8	258039	258046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010519	CCCT	2	8	260470	260477	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_010519	CTTG	2	8	261324	261331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010519	TTAT	2	8	261826	261833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010519	TAAT	2	8	262098	262105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010519	ATTA	2	8	262114	262121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010519	TGAT	2	8	263218	263225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010519	TGAT	2	8	264098	264105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010519	TAAA	2	8	264180	264187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010519	TTTA	2	8	264601	264608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010519	GTTT	2	8	268870	268877	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010519	TTTG	2	8	272708	272715	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010519	ATTT	2	8	274121	274128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010519	TTGC	2	8	274322	274329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010519	TCTT	2	8	274405	274412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010519	TAAA	2	8	279423	279430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010519	GATA	2	8	279589	279596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010519	TGAT	2	8	279629	279636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010519	ACCA	2	8	297805	297812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010519	TGTT	2	8	298266	298273	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010519	ATTA	2	8	298421	298428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010519	GTAA	2	8	299596	299603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010519	ATTT	2	8	303032	303039	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010519	ATTT	2	8	303873	303880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010519	TTAT	2	8	305451	305458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010519	TTTA	2	8	305560	305567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010519	ATTT	2	8	305589	305596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010519	TCAG	2	8	306537	306544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010519	TAAA	2	8	306618	306625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010519	ATTT	2	8	307039	307046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010519	GAAA	2	8	307097	307104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010519	ATTC	2	8	310537	310544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010519	ATAA	2	8	311878	311885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010519	AATC	2	8	318928	318935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010519	ATAA	2	8	325360	325367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010519	AATG	2	8	325433	325440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010519	TCAT	2	8	325771	325778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010519	AAGC	2	8	328846	328853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010519	GTAT	2	8	328965	328972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010519	TTGT	2	8	335407	335414	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010519	TTTA	2	8	335536	335543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010519	GACA	2	8	335836	335843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010519	TGAA	2	8	338089	338096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010519	ACGG	2	8	338672	338679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010519	AAAT	2	8	339817	339824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010519	TATC	2	8	339825	339832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010519	GATC	2	8	341969	341976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010519	TTGT	2	8	343709	343716	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010519	AGAA	2	8	343848	343855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010519	TTAA	2	8	343882	343889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010519	ACGA	2	8	345295	345302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010519	TTCA	2	8	349900	349907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010519	GTTA	2	8	360272	360279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010519	CAAC	2	8	361198	361205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010519	TTTC	2	8	368627	368634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010519	TTGA	2	8	368636	368643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010519	ATTT	2	8	368794	368801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010519	TTTG	2	8	368882	368889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010519	TAGA	2	8	370025	370032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010519	TAAA	2	8	370785	370792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010519	TATT	2	8	372339	372346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010519	TATC	2	8	377881	377888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010519	GAAA	2	8	378008	378015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010519	ATTT	2	8	383073	383080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010519	TTTG	2	8	390613	390620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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