MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 26143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010519	TTG	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170717207
2	NC_010519	AAT	2	6	498	503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170717207
3	NC_010519	ACA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717207
4	NC_010519	CAA	2	6	612	617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717207
5	NC_010519	TTG	2	6	661	666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170717207
6	NC_010519	TGG	2	6	755	760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170717207
7	NC_010519	AAT	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170717207
8	NC_010519	GTT	2	6	834	839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170717207
9	NC_010519	AAG	2	6	982	987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
10	NC_010519	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170717207
11	NC_010519	GAA	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
12	NC_010519	GAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
13	NC_010519	ATT	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170717207
14	NC_010519	GAA	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
15	NC_010519	AAG	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717207
16	NC_010519	ACA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718298
17	NC_010519	AGT	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718298
18	NC_010519	TAT	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718298
19	NC_010519	GAA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718298
20	NC_010519	TAC	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718298
21	NC_010519	GCT	2	6	2294	2299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718298
22	NC_010519	AAT	2	6	2318	2323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718298
23	NC_010519	TAT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718298
24	NC_010519	CTG	2	6	2441	2446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718298
25	NC_010519	CAA	2	6	2538	2543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718298
26	NC_010519	AAG	2	6	2553	2558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718298
27	NC_010519	TCA	2	6	2687	2692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718298
28	NC_010519	GTT	2	6	2694	2699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718298
29	NC_010519	TGA	3	9	2713	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170718298
30	NC_010519	ATC	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718431
31	NC_010519	TAT	2	6	2842	2847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718431
32	NC_010519	CAA	2	6	2851	2856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
33	NC_010519	AAT	2	6	2938	2943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718431
34	NC_010519	CAA	2	6	2990	2995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
35	NC_010519	AAC	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
36	NC_010519	TTA	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718431
37	NC_010519	TCA	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718431
38	NC_010519	CAT	2	6	3195	3200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718431
39	NC_010519	AAC	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
40	NC_010519	ACA	2	6	3256	3261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
41	NC_010519	TCA	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718431
42	NC_010519	ACA	2	6	3463	3468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
43	NC_010519	CAA	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
44	NC_010519	ACA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718431
45	NC_010519	GAA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170718431
46	NC_010519	ACA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718540
47	NC_010519	TCT	2	6	3950	3955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718540
48	NC_010519	TCA	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718540
49	NC_010519	ATA	2	6	4402	4407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718540
50	NC_010519	TTG	2	6	4525	4530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718540
51	NC_010519	TAC	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718646
52	NC_010519	TAA	2	6	4735	4740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718646
53	NC_010519	TAT	2	6	4809	4814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718753
54	NC_010519	CAG	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718753
55	NC_010519	TTG	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718753
56	NC_010519	AAT	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718753
57	NC_010519	TAT	2	6	5212	5217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718753
58	NC_010519	AAT	2	6	5220	5225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718753
59	NC_010519	GTC	2	6	5307	5312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718753
60	NC_010519	GAC	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718753
61	NC_010519	CAA	2	6	5425	5430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718753
62	NC_010519	TGT	2	6	5460	5465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718753
63	NC_010519	ATT	2	6	5469	5474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170718753
64	NC_010519	ACC	2	6	5494	5499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718862
65	NC_010519	TTC	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718862
66	NC_010519	TAC	2	6	5551	5556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718862
67	NC_010519	CTG	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170718862
68	NC_010519	TTC	2	6	5931	5936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170718971
69	NC_010519	AAT	2	6	5958	5963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718971
70	NC_010519	CAT	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718971
71	NC_010519	ACA	2	6	6172	6177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170718971
72	NC_010519	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718971
73	NC_010519	TTG	2	6	6548	6553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718971
74	NC_010519	CAC	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718971
75	NC_010519	CAC	2	6	6680	6685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718971
76	NC_010519	CAC	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170718971
77	NC_010519	TTG	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718971
78	NC_010519	TTG	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170718971
79	NC_010519	ATA	2	6	6821	6826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170718971
80	NC_010519	ACT	2	6	7030	7035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170718971
81	NC_010519	GCA	2	6	7090	7095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170718971
82	NC_010519	CCG	2	6	7099	7104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170718971
83	NC_010519	ACA	2	6	7326	7331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719078
84	NC_010519	ACT	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719078
85	NC_010519	TCA	2	6	7378	7383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719078
86	NC_010519	TGA	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170719078
87	NC_010519	ATT	2	6	7398	7403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170719078
88	NC_010519	TCT	2	6	7477	7482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170719078
89	NC_010519	TAA	2	6	7721	7726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170719078
90	NC_010519	ATT	2	6	7783	7788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170719078
91	NC_010519	ATC	2	6	7835	7840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170719078
92	NC_010519	AAC	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170719078
93	NC_010519	CAG	2	6	8244	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170717208
94	NC_010519	AAC	2	6	8255	8260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717208
95	NC_010519	TCG	3	9	8284	8292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170717208
96	NC_010519	TTC	2	6	8295	8300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170717208
97	NC_010519	TAT	2	6	8380	8385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170717208
98	NC_010519	AAG	2	6	8609	8614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717317
99	NC_010519	AAT	2	6	8624	8629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170717317
100	NC_010519	AAC	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717422
101	NC_010519	TAG	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170717422
102	NC_010519	TCG	2	6	8892	8897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170717422
103	NC_010519	AAC	2	6	9025	9030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717422
104	NC_010519	TAC	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170717422
105	NC_010519	TCG	2	6	9057	9062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170717422
106	NC_010519	GTT	2	6	9220	9225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170717422
107	NC_010519	AAC	2	6	9320	9325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717422
108	NC_010519	AGG	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170717422
109	NC_010519	AAC	2	6	9375	9380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717422
110	NC_010519	TAT	3	9	9492	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170717422
111	NC_010519	ATG	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170717531
112	NC_010519	ATC	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170717531
113	NC_010519	GCA	2	6	9785	9790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170717531
114	NC_010519	GGC	2	6	9793	9798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170717531
115	NC_010519	CAA	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717531
116	NC_010519	CAA	2	6	9861	9866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170717531
117	NC_010519	ATT	2	6	9911	9916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170717531
118	NC_010519	TGA	2	6	10030	10035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170717531
119	NC_010519	GTC	2	6	10080	10085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170717531
120	NC_010519	TGA	2	6	10474	10479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170717531
121	NC_010519	CAC	2	6	10509	10514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170717531
122	NC_010519	TGG	2	6	10596	10601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170717531
123	NC_010519	AGA	2	6	10702	10707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717531
124	NC_010519	TGA	3	9	10953	10961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170717531
125	NC_010519	GAT	2	6	11096	11101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170717531
126	NC_010519	ATT	2	6	11191	11196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170717531
127	NC_010519	AAG	2	6	11205	11210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717531
128	NC_010519	TAC	2	6	11217	11222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170717531
129	NC_010519	GAA	2	6	11240	11245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717531
130	NC_010519	GAA	2	6	11294	11299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170717531
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