MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haemophilus somnus 2336 chromosome

Total Repeats: 2415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010519	AT	3	6	997	1002	50 %	50 %	0 %	0 %	170717207
2	NC_010519	AT	3	6	2582	2587	50 %	50 %	0 %	0 %	170718298
3	NC_010519	TG	3	6	3594	3599	0 %	50 %	50 %	0 %	170718431
4	NC_010519	TC	3	6	4968	4973	0 %	50 %	0 %	50 %	170718753
5	NC_010519	TC	3	6	5139	5144	0 %	50 %	0 %	50 %	170718753
6	NC_010519	CT	3	6	6013	6018	0 %	50 %	0 %	50 %	170718971
7	NC_010519	GA	3	6	7350	7355	50 %	0 %	50 %	0 %	170719078
8	NC_010519	AC	3	6	8308	8313	50 %	0 %	0 %	50 %	170717208
9	NC_010519	CA	3	6	10736	10741	50 %	0 %	0 %	50 %	170717531
10	NC_010519	TC	3	6	12410	12415	0 %	50 %	0 %	50 %	170717862
11	NC_010519	AT	3	6	14849	14854	50 %	50 %	0 %	0 %	170717973
12	NC_010519	AT	3	6	16087	16092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010519	AG	3	6	16478	16483	50 %	0 %	50 %	0 %	170718188
14	NC_010519	CT	3	6	18130	18135	0 %	50 %	0 %	50 %	170718332
15	NC_010519	GT	3	6	19682	19687	0 %	50 %	50 %	0 %	170718365
16	NC_010519	AT	3	6	19909	19914	50 %	50 %	0 %	0 %	170718365
17	NC_010519	CT	4	8	21108	21115	0 %	50 %	0 %	50 %	170718376
18	NC_010519	AG	3	6	22601	22606	50 %	0 %	50 %	0 %	170718398
19	NC_010519	TA	3	6	22710	22715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010519	AG	3	6	22762	22767	50 %	0 %	50 %	0 %	170718409
21	NC_010519	TC	3	6	23211	23216	0 %	50 %	0 %	50 %	170718409
22	NC_010519	TA	3	6	25012	25017	50 %	50 %	0 %	0 %	170718452
23	NC_010519	AG	3	6	26774	26779	50 %	0 %	50 %	0 %	170718463
24	NC_010519	AT	3	6	27642	27647	50 %	50 %	0 %	0 %	170718474
25	NC_010519	TG	3	6	28255	28260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010519	TA	4	8	29485	29492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010519	AT	3	6	31904	31909	50 %	50 %	0 %	0 %	170718541
28	NC_010519	AG	3	6	33028	33033	50 %	0 %	50 %	0 %	170718552
29	NC_010519	AG	3	6	33702	33707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010519	AG	3	6	34380	34385	50 %	0 %	50 %	0 %	170718563
31	NC_010519	TC	3	6	40375	40380	0 %	50 %	0 %	50 %	170718615
32	NC_010519	TA	3	6	40583	40588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010519	AT	3	6	40927	40932	50 %	50 %	0 %	0 %	170718626
34	NC_010519	AC	3	6	41155	41160	50 %	0 %	0 %	50 %	170718626
35	NC_010519	GT	3	6	41543	41548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010519	GT	3	6	42422	42427	0 %	50 %	50 %	0 %	170718637
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38	NC_010519	TA	3	6	42915	42920	50 %	50 %	0 %	0 %	170718637
39	NC_010519	CT	3	6	44157	44162	0 %	50 %	0 %	50 %	170718658
40	NC_010519	TA	3	6	44383	44388	50 %	50 %	0 %	0 %	170718658
41	NC_010519	TC	3	6	44768	44773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010519	TC	3	6	45052	45057	0 %	50 %	0 %	50 %	170718669
43	NC_010519	CT	3	6	45674	45679	0 %	50 %	0 %	50 %	170718680
44	NC_010519	TA	3	6	45872	45877	50 %	50 %	0 %	0 %	170718680
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49	NC_010519	TC	3	6	54034	54039	0 %	50 %	0 %	50 %	170718754
50	NC_010519	AT	3	6	54238	54243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010519	AT	3	6	54762	54767	50 %	50 %	0 %	0 %	170718763
52	NC_010519	TG	3	6	55714	55719	0 %	50 %	50 %	0 %	170718785
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54	NC_010519	AT	3	6	57216	57221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_010519	TA	3	6	59573	59578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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62	NC_010519	CA	3	6	62596	62601	50 %	0 %	0 %	50 %	170718818
63	NC_010519	CA	3	6	63105	63110	50 %	0 %	0 %	50 %	170718818
64	NC_010519	AT	3	6	64969	64974	50 %	50 %	0 %	0 %	170718829
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69	NC_010519	AT	3	6	70130	70135	50 %	50 %	0 %	0 %	170718874
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72	NC_010519	TA	3	6	74176	74181	50 %	50 %	0 %	0 %	170718907
73	NC_010519	TA	3	6	74879	74884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_010519	AT	3	6	145975	145980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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