MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD05

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010518	GGCC	2	8	607	614	0 %	0 %	50 %	50 %	170752180
2	NC_010518	GGCC	2	8	649	656	0 %	0 %	50 %	50 %	170752180
3	NC_010518	TCCG	2	8	1523	1530	0 %	25 %	25 %	50 %	170752180
4	NC_010518	CTCG	2	8	1531	1538	0 %	25 %	25 %	50 %	170752180
5	NC_010518	CCGC	2	8	2248	2255	0 %	0 %	25 %	75 %	170752180
6	NC_010518	GTCG	2	8	2296	2303	0 %	25 %	50 %	25 %	170752180
7	NC_010518	GACC	2	8	2309	2316	25 %	0 %	25 %	50 %	170752180
8	NC_010518	CGGC	2	8	2320	2327	0 %	0 %	50 %	50 %	170752180
9	NC_010518	GAGG	2	8	2468	2475	25 %	0 %	75 %	0 %	170752180
10	NC_010518	GACC	2	8	3988	3995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010518	TGAG	2	8	4588	4595	25 %	25 %	50 %	0 %	170752182
12	NC_010518	CCGG	2	8	4901	4908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_010518	GCAA	2	8	5313	5320	50 %	0 %	25 %	25 %	170752183
14	NC_010518	TGAG	2	8	5463	5470	25 %	25 %	50 %	0 %	170752183
15	NC_010518	CATC	2	8	5702	5709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010518	GGGA	2	8	5754	5761	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010518	TGGA	2	8	5961	5968	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010518	ATCG	2	8	7045	7052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010518	CTGC	2	8	7637	7644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010518	TTCA	2	8	8678	8685	25 %	50 %	0 %	25 %	170752185
21	NC_010518	CGGA	2	8	8700	8707	25 %	0 %	50 %	25 %	170752185
22	NC_010518	CAAT	2	8	8749	8756	50 %	25 %	0 %	25 %	170752185
23	NC_010518	TAGA	2	8	9071	9078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010518	GCTT	2	8	9301	9308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010518	GACC	2	8	9541	9548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010518	GCAC	2	8	9641	9648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010518	CGCC	2	8	10187	10194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_010518	TGCA	2	8	10372	10379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010518	CCCG	2	8	10434	10441	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_010518	CCAC	2	8	10475	10482	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_010518	GCCA	2	8	10782	10789	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010518	CGGA	2	8	10973	10980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010518	GATA	2	8	11060	11067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010518	GACG	2	8	11132	11139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010518	ATTT	2	8	11166	11173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010518	GACG	2	8	11368	11375	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010518	GCTG	2	8	11982	11989	0 %	25 %	50 %	25 %	170752186
38	NC_010518	TTAT	2	8	12124	12131	25 %	75 %	0 %	0 %	170752186
39	NC_010518	AGTC	2	8	12824	12831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010518	GACG	2	8	13177	13184	25 %	0 %	50 %	25 %	170752187
41	NC_010518	GGAC	2	8	13299	13306	25 %	0 %	50 %	25 %	170752187
42	NC_010518	TCGC	2	8	13509	13516	0 %	25 %	25 %	50 %	170752187
43	NC_010518	GGGC	2	8	13518	13525	0 %	0 %	75 %	25 %	170752187
44	NC_010518	ACCG	2	8	13549	13556	25 %	0 %	25 %	50 %	170752187
45	NC_010518	CGCT	2	8	14635	14642	0 %	25 %	25 %	50 %	170752188
46	NC_010518	CGGT	2	8	15121	15128	0 %	25 %	50 %	25 %	170752189
47	NC_010518	CGTG	2	8	15631	15638	0 %	25 %	50 %	25 %	170752190
48	NC_010518	ACGG	2	8	16920	16927	25 %	0 %	50 %	25 %	170752191
49	NC_010518	TGGC	2	8	17374	17381	0 %	25 %	50 %	25 %	170752192
50	NC_010518	ACGA	2	8	17457	17464	50 %	0 %	25 %	25 %	170752192
51	NC_010518	ACGG	2	8	17553	17560	25 %	0 %	50 %	25 %	170752192
52	NC_010518	GGGC	2	8	17706	17713	0 %	0 %	75 %	25 %	170752192
53	NC_010518	AACG	2	8	17881	17888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010518	GTTT	2	8	17942	17949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010518	CCAC	2	8	18019	18026	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_010518	CTCC	2	8	18786	18793	0 %	25 %	0 %	75 %	170752194
57	NC_010518	GTGC	2	8	19192	19199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_010518	GCCT	2	8	19245	19252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010518	GCTG	2	8	20283	20290	0 %	25 %	50 %	25 %	170752195
60	NC_010518	GAGC	2	8	20705	20712	25 %	0 %	50 %	25 %	170752197
61	NC_010518	CCCA	2	8	22392	22399	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_010518	GAGC	2	8	22706	22713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010518	CGGC	2	8	22730	22737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010518	CCGA	2	8	22915	22922	25 %	0 %	25 %	50 %	170752199
65	NC_010518	CGGC	2	8	22985	22992	0 %	0 %	50 %	50 %	170752199
66	NC_010518	CGAG	2	8	24352	24359	25 %	0 %	50 %	25 %	170752200
67	NC_010518	TCGA	2	8	24925	24932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010518	CGGG	2	8	25377	25384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010518	CTTC	2	8	25808	25815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010518	GATC	2	8	25990	25997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010518	AGCC	2	8	26410	26417	25 %	0 %	25 %	50 %	170752202
72	NC_010518	CCTC	2	8	26650	26657	0 %	25 %	0 %	75 %	170752202
73	NC_010518	CGAC	2	8	26709	26716	25 %	0 %	25 %	50 %	170752202
74	NC_010518	TCGA	2	8	27165	27172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010518	CTTC	2	8	27425	27432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010518	TCGA	2	8	27759	27766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010518	GGCC	2	8	27844	27851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010518	GCTG	2	8	27965	27972	0 %	25 %	50 %	25 %	170752203
79	NC_010518	AGCC	2	8	28299	28306	25 %	0 %	25 %	50 %	170752204
80	NC_010518	GCGG	2	8	28507	28514	0 %	0 %	75 %	25 %	170752204
81	NC_010518	GGCC	2	8	28613	28620	0 %	0 %	50 %	50 %	170752204
82	NC_010518	GGCG	2	8	28771	28778	0 %	0 %	75 %	25 %	170752204
83	NC_010518	GCCG	2	8	29107	29114	0 %	0 %	50 %	50 %	170752204
84	NC_010518	CTGG	2	8	29707	29714	0 %	25 %	50 %	25 %	170752206
85	NC_010518	GGCT	2	8	29948	29955	0 %	25 %	50 %	25 %	170752206
86	NC_010518	GGGC	2	8	30092	30099	0 %	0 %	75 %	25 %	170752206
87	NC_010518	CAAC	2	8	30177	30184	50 %	0 %	0 %	50 %	170752206
88	NC_010518	GCTC	2	8	30813	30820	0 %	25 %	25 %	50 %	170752206
89	NC_010518	TCTG	2	8	31077	31084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010518	ATCG	2	8	31604	31611	25 %	25 %	25 %	25 %	170752207
91	NC_010518	GACC	2	8	31769	31776	25 %	0 %	25 %	50 %	170752207
92	NC_010518	CGGC	2	8	31909	31916	0 %	0 %	50 %	50 %	170752207
93	NC_010518	GCCG	2	8	32968	32975	0 %	0 %	50 %	50 %	170752207
94	NC_010518	TCGG	2	8	33504	33511	0 %	25 %	50 %	25 %	170752208
95	NC_010518	TGCG	2	8	33522	33529	0 %	25 %	50 %	25 %	170752208
96	NC_010518	GTCG	2	8	33611	33618	0 %	25 %	50 %	25 %	170752208
97	NC_010518	GGCG	2	8	34055	34062	0 %	0 %	75 %	25 %	170752209
98	NC_010518	CGAA	2	8	34077	34084	50 %	0 %	25 %	25 %	170752209
99	NC_010518	GAGC	2	8	34678	34685	25 %	0 %	50 %	25 %	170752209
100	NC_010518	TCGA	2	8	34914	34921	25 %	25 %	25 %	25 %	170752209
101	NC_010518	GCAG	2	8	35362	35369	25 %	0 %	50 %	25 %	170752209
102	NC_010518	GGCC	2	8	35691	35698	0 %	0 %	50 %	50 %	170752210
103	NC_010518	GCCG	2	8	35784	35791	0 %	0 %	50 %	50 %	170752210
104	NC_010518	GTGA	2	8	36301	36308	25 %	25 %	50 %	0 %	170752210

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.