MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD05

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010518	GTG	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010518	GCG	2	6	2672	2677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010518	GCT	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010518	GTC	2	6	2835	2840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010518	CGG	2	6	2896	2901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010518	CGA	2	6	2954	2959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010518	GTT	2	6	2991	2996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010518	GGC	3	9	3940	3948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010518	CGC	2	6	3982	3987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010518	TAT	2	6	4629	4634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010518	TGA	2	6	4823	4828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010518	GAT	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010518	TGC	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010518	GGC	2	6	4886	4891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010518	CGC	2	6	4917	4922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010518	TGG	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010518	AAG	2	6	5719	5724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010518	GCT	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010518	GAT	2	6	5878	5883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010518	ACC	2	6	5952	5957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010518	TTA	2	6	5969	5974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010518	TAA	2	6	6027	6032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010518	GGC	2	6	6409	6414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010518	CGG	2	6	6439	6444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010518	GCC	2	6	6597	6602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010518	GCT	2	6	6617	6622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010518	CGC	2	6	6640	6645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010518	ACA	2	6	6762	6767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010518	CCG	2	6	6871	6876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010518	GCA	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010518	TTA	2	6	7111	7116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010518	ACG	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010518	AGG	2	6	7237	7242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010518	GCC	3	9	7342	7350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010518	GCC	2	6	7438	7443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010518	TCC	2	6	7451	7456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010518	GCA	3	9	7472	7480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010518	GGC	2	6	7527	7532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010518	GGC	3	9	7607	7615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010518	CAC	2	6	8895	8900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010518	ACA	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010518	GCG	2	6	8974	8979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010518	GAA	2	6	8987	8992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010518	TCA	2	6	9039	9044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010518	CGC	2	6	9213	9218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010518	TAT	3	9	9509	9517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010518	ATT	3	9	9658	9666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010518	ATT	2	6	9679	9684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010518	TTG	2	6	9699	9704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010518	CCA	2	6	10148	10153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010518	TCG	2	6	10166	10171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010518	GGT	2	6	10200	10205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010518	CGC	2	6	10284	10289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010518	CAC	2	6	10317	10322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010518	GCC	2	6	10333	10338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010518	CTT	2	6	10578	10583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010518	CGT	2	6	10597	10602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010518	CGT	2	6	10629	10634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010518	CGC	2	6	10710	10715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010518	CAT	2	6	10719	10724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010518	CGC	2	6	10725	10730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010518	TCT	2	6	11087	11092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010518	GCT	2	6	11274	11279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010518	GCT	2	6	11389	11394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010518	AAT	2	6	11433	11438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010518	AAG	2	6	11480	11485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010518	GAC	2	6	11492	11497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010518	TCA	2	6	11505	11510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010518	CTT	2	6	11595	11600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010518	ATT	2	6	11651	11656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010518	CAT	2	6	11739	11744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010518	TGG	2	6	12704	12709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010518	TAA	2	6	12720	12725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010518	CGG	2	6	12803	12808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010518	GCC	2	6	12835	12840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010518	TCC	3	9	12920	12928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010518	TGA	2	6	12939	12944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010518	GCC	2	6	12953	12958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010518	AAG	2	6	13046	13051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010518	CGC	3	9	13074	13082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010518	TCA	2	6	13951	13956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010518	TCG	2	6	13957	13962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010518	CAC	2	6	13997	14002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010518	TGG	2	6	14114	14119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010518	GAC	2	6	14170	14175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010518	CGC	2	6	15386	15391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010518	GTA	2	6	15873	15878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010518	CGG	2	6	15882	15887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010518	GTT	2	6	15905	15910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010518	TCG	2	6	15918	15923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010518	CGC	2	6	15963	15968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010518	CTA	2	6	15996	16001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010518	GGA	2	6	16044	16049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010518	GCC	2	6	16057	16062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010518	CCG	2	6	16116	16121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010518	CGG	2	6	16132	16137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010518	CCT	2	6	16162	16167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010518	GGC	2	6	16193	16198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010518	CAA	2	6	16202	16207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010518	ATC	2	6	16216	16221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010518	CGC	2	6	16231	16236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010518	CAC	2	6	16253	16258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_010518	CGA	2	6	16264	16269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010518	GAG	2	6	16280	16285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010518	CGG	2	6	16300	16305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010518	TGG	2	6	16348	16353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010518	GCG	2	6	17109	17114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010518	TTG	2	6	17892	17897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010518	TGC	2	6	17923	17928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010518	CGT	2	6	17969	17974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010518	CTT	2	6	17988	17993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010518	TCC	2	6	18001	18006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010518	CTT	2	6	18046	18051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010518	GCT	2	6	18064	18069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010518	ATG	2	6	18102	18107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010518	GCT	2	6	18869	18874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010518	TCA	2	6	18979	18984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010518	GCC	2	6	19049	19054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010518	CAG	2	6	19120	19125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010518	CTC	2	6	19238	19243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_010518	GCG	2	6	19290	19295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010518	AGG	2	6	19345	19350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010518	GCC	2	6	19403	19408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010518	CCT	2	6	19425	19430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010518	GCC	2	6	19467	19472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010518	TGG	2	6	19552	19557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010518	CGT	2	6	19597	19602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010518	CGA	2	6	19656	19661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010518	CGG	2	6	22191	22196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010518	TTA	2	6	22220	22225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010518	ACC	2	6	22265	22270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010518	ACC	2	6	22299	22304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_010518	GCC	2	6	22408	22413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010518	CGG	2	6	22416	22421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010518	CCT	2	6	22571	22576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_010518	ATG	3	9	22610	22618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010518	CGG	2	6	22685	22690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010518	GCG	2	6	23268	23273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010518	CCA	2	6	23280	23285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_010518	GCC	2	6	23295	23300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_010518	ATC	2	6	23332	23337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010518	GCG	2	6	23377	23382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010518	GGT	3	9	23387	23395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010518	ACG	2	6	23407	23412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010518	TCC	2	6	25001	25006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_010518	AAG	2	6	25081	25086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010518	GGC	2	6	25203	25208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_010518	CCT	2	6	25430	25435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_010518	CGC	2	6	25437	25442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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153	NC_010518	CCG	2	6	25798	25803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_010518	ACG	3	9	26207	26215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_010518	GAG	2	6	27229	27234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_010518	GCA	2	6	27333	27338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_010518	CAC	2	6	27383	27388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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166	NC_010518	GCC	2	6	27559	27564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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169	NC_010518	TCG	2	6	27856	27861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_010518	GTG	2	6	31104	31109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010518	TTA	2	6	31137	31142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010518	TCG	2	6	33039	33044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_010518	GCC	2	6	33203	33208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.