MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD05

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010518	TTG	2	6	114	119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170752180
2	NC_010518	ACC	2	6	282	287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752180
3	NC_010518	CTG	2	6	310	315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752180
4	NC_010518	CGC	2	6	316	321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752180
5	NC_010518	CGA	2	6	379	384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752180
6	NC_010518	CTG	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752180
7	NC_010518	TCC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752180
8	NC_010518	GAT	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752180
9	NC_010518	GCC	2	6	570	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752180
10	NC_010518	CGT	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752180
11	NC_010518	CGG	2	6	723	728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752180
12	NC_010518	CGA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752180
13	NC_010518	GCG	3	9	885	893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752180
14	NC_010518	CCA	2	6	931	936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752180
15	NC_010518	ACG	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752180
16	NC_010518	ACG	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752180
17	NC_010518	GCC	2	6	1089	1094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752180
18	NC_010518	ATC	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752180
19	NC_010518	GTG	2	6	1284	1289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170752180
20	NC_010518	CAG	2	6	1334	1339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752180
21	NC_010518	CGC	2	6	1343	1348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752180
22	NC_010518	GAT	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752180
23	NC_010518	CAG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752180
24	NC_010518	GGC	2	6	1558	1563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752180
25	NC_010518	CCA	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752180
26	NC_010518	GCA	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752180
27	NC_010518	GAA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752180
28	NC_010518	GGT	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170752180
29	NC_010518	ATG	2	6	1692	1697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752180
30	NC_010518	GCC	2	6	1746	1751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752180
31	NC_010518	CTG	2	6	1943	1948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752180
32	NC_010518	CCG	2	6	1989	1994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752180
33	NC_010518	GAA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752180
34	NC_010518	CGG	2	6	2166	2171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752180
35	NC_010518	TCC	2	6	2187	2192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752180
36	NC_010518	CCG	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752180
37	NC_010518	GGC	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752180
38	NC_010518	CGA	2	6	2369	2374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752180
39	NC_010518	GCC	2	6	2387	2392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752180
40	NC_010518	CGA	2	6	3016	3021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752181
41	NC_010518	GCG	2	6	3054	3059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752181
42	NC_010518	CAG	3	9	3089	3097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752181
43	NC_010518	CAG	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752181
44	NC_010518	GAT	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752181
45	NC_010518	GCA	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752181
46	NC_010518	ATC	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752181
47	NC_010518	GAT	2	6	3467	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752181
48	NC_010518	GGC	2	6	4290	4295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752182
49	NC_010518	TGC	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752182
50	NC_010518	ATC	2	6	4623	4628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752182
51	NC_010518	CTG	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752183
52	NC_010518	CAG	2	6	5090	5095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752183
53	NC_010518	CAC	2	6	5165	5170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752183
54	NC_010518	GCC	2	6	5225	5230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752183
55	NC_010518	TCT	2	6	5281	5286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752183
56	NC_010518	GGC	2	6	5301	5306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752183
57	NC_010518	CGT	2	6	5432	5437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752183
58	NC_010518	GTA	2	6	6152	6157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752184
59	NC_010518	GTT	2	6	6161	6166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170752184
60	NC_010518	CAA	2	6	6187	6192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170752184
61	NC_010518	CGC	2	6	6196	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752184
62	NC_010518	GAG	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752184
63	NC_010518	TGG	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170752184
64	NC_010518	ATG	2	6	6329	6334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752184
65	NC_010518	GCC	2	6	7889	7894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752185
66	NC_010518	GAA	2	6	7943	7948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752185
67	NC_010518	AGC	2	6	8061	8066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752185
68	NC_010518	AGG	2	6	8128	8133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752185
69	NC_010518	GTC	2	6	8288	8293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752185
70	NC_010518	CTC	2	6	8501	8506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752185
71	NC_010518	CGG	2	6	8545	8550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752185
72	NC_010518	CAA	2	6	8761	8766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170752185
73	NC_010518	GAC	2	6	8861	8866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752185
74	NC_010518	CGC	2	6	11804	11809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752186
75	NC_010518	GCT	2	6	11826	11831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752186
76	NC_010518	TAC	2	6	11853	11858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752186
77	NC_010518	GCT	2	6	11865	11870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752186
78	NC_010518	GCC	2	6	11976	11981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752186
79	NC_010518	GCG	2	6	12081	12086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752186
80	NC_010518	CAG	2	6	12088	12093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752186
81	NC_010518	TCA	2	6	12099	12104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752186
82	NC_010518	GAC	2	6	13244	13249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752187
83	NC_010518	GAA	2	6	13330	13335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752187
84	NC_010518	GGC	2	6	13363	13368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752187
85	NC_010518	GCC	2	6	13417	13422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752187
86	NC_010518	CCG	2	6	13446	13451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752187
87	NC_010518	AGG	2	6	13474	13479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752187
88	NC_010518	CTG	2	6	13579	13584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752187
89	NC_010518	CGG	2	6	13587	13592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752187
90	NC_010518	TGC	2	6	13622	13627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752187
91	NC_010518	CCT	2	6	13640	13645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170752187
92	NC_010518	GGC	2	6	13704	13709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752187
93	NC_010518	CCG	2	6	13743	13748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752187
94	NC_010518	GCC	2	6	13811	13816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752187
95	NC_010518	CCG	2	6	13827	13832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752187
96	NC_010518	CGC	2	6	13872	13877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752187
97	NC_010518	CGC	2	6	13887	13892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752187
98	NC_010518	TCG	2	6	14375	14380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752188
99	NC_010518	GAG	2	6	14464	14469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752188
100	NC_010518	AAG	2	6	14470	14475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752188
101	NC_010518	GAT	2	6	14589	14594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752188
102	NC_010518	AAG	2	6	14794	14799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752188
103	NC_010518	AGG	2	6	14804	14809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170752188
104	NC_010518	GGC	2	6	14820	14825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752188
105	NC_010518	GGC	2	6	14838	14843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752188
106	NC_010518	CTT	2	6	14980	14985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752189
107	NC_010518	GCT	2	6	15042	15047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752189
108	NC_010518	TGG	2	6	15104	15109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170752189
109	NC_010518	TCG	2	6	15190	15195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752189
110	NC_010518	CGT	2	6	15202	15207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752189
111	NC_010518	AAC	2	6	15242	15247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170752189
112	NC_010518	GGC	2	6	15315	15320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170752189
113	NC_010518	GGT	2	6	15365	15370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170752189
114	NC_010518	CCA	2	6	15505	15510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170752190
115	NC_010518	GTC	2	6	15570	15575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752190
116	NC_010518	CCG	2	6	15673	15678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752190
117	NC_010518	GTT	2	6	15770	15775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170752190
118	NC_010518	CAT	2	6	16370	16375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170752191
119	NC_010518	TGA	2	6	16415	16420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752191
120	NC_010518	CAG	2	6	16518	16523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752191
121	NC_010518	GAA	2	6	16584	16589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170752191
122	NC_010518	CTG	2	6	16627	16632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170752191
123	NC_010518	GAC	2	6	16658	16663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752191
124	NC_010518	TTC	3	9	16683	16691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170752191
125	NC_010518	CGC	2	6	16708	16713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752191
126	NC_010518	GAT	2	6	16773	16778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170752191
127	NC_010518	GCC	2	6	16841	16846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752191
128	NC_010518	GCC	2	6	16863	16868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752191
129	NC_010518	CGC	2	6	16973	16978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170752191
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250	NC_010518	CGA	2	6	29331	29336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170752205
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.