MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD04

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010517	GCGAA	2	10	2518	2527	40 %	0 %	40 %	20 %	170752140
2	NC_010517	CTTGC	2	10	5118	5127	0 %	40 %	20 %	40 %	170752141
3	NC_010517	ACCCA	2	10	6269	6278	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_010517	CTTCG	2	10	6457	6466	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010517	AGCCA	2	10	7213	7222	40 %	0 %	20 %	40 %	170752143
6	NC_010517	ACCCA	2	10	8356	8365	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_010517	TCAAG	2	10	8454	8463	40 %	20 %	20 %	20 %	170752144
8	NC_010517	CCCGG	2	10	10347	10356	0 %	0 %	40 %	60 %	170752146
9	NC_010517	GGCTT	2	10	10560	10569	0 %	40 %	40 %	20 %	170752147
10	NC_010517	CGATC	2	10	10634	10643	20 %	20 %	20 %	40 %	170752147
11	NC_010517	TCGGA	2	10	10750	10759	20 %	20 %	40 %	20 %	170752147
12	NC_010517	GAGAG	2	10	11026	11035	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010517	TCCCA	2	10	11594	11603	20 %	20 %	0 %	60 %	170752149
14	NC_010517	GGTCT	2	10	12961	12970	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010517	GCCAA	2	10	15550	15559	40 %	0 %	20 %	40 %	170752155
16	NC_010517	CCCCT	2	10	19427	19436	0 %	20 %	0 %	80 %	170752159
17	NC_010517	AACCC	2	10	23148	23157	40 %	0 %	0 %	60 %	170752164
18	NC_010517	CCGCA	2	10	23440	23449	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_010517	TCGGC	2	10	23602	23611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010517	CGGGC	2	10	23941	23950	0 %	0 %	60 %	40 %	170752165
21	NC_010517	GCCCG	2	10	24308	24317	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_010517	GCGTC	2	10	24350	24359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010517	GCGCC	2	10	26070	26079	0 %	0 %	40 %	60 %	170752167
24	NC_010517	GTGTG	2	10	27379	27388	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010517	CACAC	2	10	27658	27667	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_010517	GTTTG	2	10	27749	27758	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010517	TGGGC	2	10	30440	30449	0 %	20 %	60 %	20 %	170752171
28	NC_010517	CGGGG	2	10	31241	31250	0 %	0 %	80 %	20 %	170752171
29	NC_010517	TGGGT	2	10	31320	31329	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010517	CGAAG	2	10	33307	33316	40 %	0 %	40 %	20 %	170752174
31	NC_010517	CCGCG	2	10	33752	33761	0 %	0 %	40 %	60 %	170752175
32	NC_010517	GCCCC	2	10	34261	34270	0 %	0 %	20 %	80 %	170752176
33	NC_010517	TGGTC	2	10	34404	34413	0 %	40 %	40 %	20 %	170752176
34	NC_010517	GAGCG	2	10	34891	34900	20 %	0 %	60 %	20 %	170752176
35	NC_010517	TAAAT	2	10	35573	35582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010517	CCGGC	2	10	36229	36238	0 %	0 %	40 %	60 %	170752177
37	NC_010517	TCAAG	2	10	36253	36262	40 %	20 %	20 %	20 %	170752177
38	NC_010517	CCTGT	2	10	37140	37149	0 %	40 %	20 %	40 %	170752178

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.