MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 2593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	TAGCAG	2	12	429	440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170756151
2	NC_010516	AAAAAT	2	12	1368	1379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170756151
3	NC_010516	TCTATT	2	12	1589	1600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010516	GATAAT	2	12	2187	2198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757193
5	NC_010516	AAGTTA	2	12	2869	2880	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757697
6	NC_010516	CAAATA	2	12	3102	3113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170755060
7	NC_010516	ATAAAG	2	12	3198	3209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170755060
8	NC_010516	ATAAAA	2	12	3332	3343	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170755060
9	NC_010516	GAAGTA	2	12	4830	4841	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170756292
10	NC_010516	TTGATA	2	12	5881	5892	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170756292
11	NC_010516	GATTAG	2	12	6527	6538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756835
12	NC_010516	TTTAAA	2	12	7392	7403	50 %	50 %	0 %	0 %	170756835
13	NC_010516	CAAGCT	2	12	7618	7629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170756835
14	NC_010516	ATAGAT	2	12	17767	17778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170756130
15	NC_010516	ACAAAT	2	12	18676	18687	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170756130
16	NC_010516	AATAAA	2	12	19649	19660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170757148
17	NC_010516	GCAAAA	2	12	23505	23516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	170754615
18	NC_010516	TATAAT	2	12	29421	29432	50 %	50 %	0 %	0 %	170756206
19	NC_010516	ATATAA	2	12	30521	30532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010516	ATATAG	2	12	32520	32531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170754592
21	NC_010516	AGAAGC	2	12	32938	32949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170754592
22	NC_010516	TAAAAG	2	12	33839	33850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010516	AGATGA	2	12	40082	40093	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170757507
24	NC_010516	CTATAG	2	12	40263	40274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170756536
25	NC_010516	AATATA	2	12	41277	41288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010516	AGAAAA	2	12	42086	42097	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170755512
27	NC_010516	ATGTTT	2	12	47140	47151	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170757165
28	NC_010516	AATATG	2	12	69050	69061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757293
29	NC_010516	TAAAAA	2	12	84341	84352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010516	ATTATA	2	12	87880	87891	50 %	50 %	0 %	0 %	170757865
31	NC_010516	AATTAT	2	12	89922	89933	50 %	50 %	0 %	0 %	170756340
32	NC_010516	GAAAAA	2	12	90463	90474	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170757341
33	NC_010516	TGTAGA	2	12	91298	91309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170754779
34	NC_010516	AAAATA	2	12	92915	92926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170754439
35	NC_010516	GTTTTA	2	12	93148	93159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170754439
36	NC_010516	GAAAAG	2	12	93184	93195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170754439
37	NC_010516	AATATA	2	12	93211	93222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170754439
38	NC_010516	ATCACA	2	12	94127	94138	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170755254
39	NC_010516	GTAAGA	2	12	94587	94598	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170755254
40	NC_010516	AATAAA	2	12	95195	95206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010516	TTTCAA	2	12	100297	100308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010516	ATTTAA	2	12	104289	104300	50 %	50 %	0 %	0 %	170755864
43	NC_010516	ATAAAT	2	12	108368	108379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757504
44	NC_010516	AGTTAA	2	12	110232	110243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757578
45	NC_010516	AAGAGT	2	12	112228	112239	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170755195
46	NC_010516	AGAACA	2	12	113104	113115	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	170757375
47	NC_010516	AATATA	2	12	115474	115485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756750
48	NC_010516	AGGACA	2	12	116222	116233	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170757557
49	NC_010516	GTAGAT	2	12	116490	116501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757557
50	NC_010516	TACTGA	2	12	119147	119158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170754839
51	NC_010516	TATTAA	2	12	120266	120277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010516	AATAAA	2	12	122327	122338	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170755520
53	NC_010516	GATATA	2	12	122415	122426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170755520
54	NC_010516	TAAAGA	2	12	123663	123674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170756294
55	NC_010516	TTAAAT	2	12	127432	127443	50 %	50 %	0 %	0 %	170756479
56	NC_010516	TCAAAA	2	12	129948	129959	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170756964
57	NC_010516	TTTGCT	2	12	130974	130985	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	170756964
58	NC_010516	GAAAAA	2	12	133109	133120	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170757125
59	NC_010516	AGGAAA	2	12	133371	133382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757125
60	NC_010516	AATGTA	2	12	134181	134192	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757125
61	NC_010516	TGGATA	2	12	137232	137243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756927
62	NC_010516	ACATGA	2	12	138446	138457	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170755476
63	NC_010516	ACATGG	2	12	138488	138499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170755476
64	NC_010516	ATAAAT	2	12	138531	138542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755476
65	NC_010516	ATAAGA	2	12	144129	144140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170755057
66	NC_010516	ATATAA	2	12	146813	146824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755700
67	NC_010516	ATTTTT	2	12	149733	149744	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	170756227
68	NC_010516	GTAAGT	2	12	149967	149978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756227
69	NC_010516	TTGAAA	2	12	150165	150176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170755418
70	NC_010516	AGCAAG	2	12	151350	151361	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170754325
71	NC_010516	AAAGAA	2	12	154757	154768	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170755043
72	NC_010516	AATATA	2	12	155836	155847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755898
73	NC_010516	ATTAGT	2	12	158701	158712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170754962
74	NC_010516	AAATTT	2	12	162640	162651	50 %	50 %	0 %	0 %	170755389
75	NC_010516	TTAAAG	2	12	163731	163742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170756375
76	NC_010516	TACCTA	2	12	164818	164829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170754536
77	NC_010516	ACATTA	2	12	165539	165550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010516	TAAAAA	2	12	165722	165733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010516	GTAGAA	2	12	167804	167815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170757780
80	NC_010516	AAGGAA	2	12	168296	168307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010516	AAAAGA	2	12	168363	168374	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170757023
82	NC_010516	ATAAAT	2	12	168604	168615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757023
83	NC_010516	ATAGAA	2	12	169023	169034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170755608
84	NC_010516	AAACTT	2	12	169354	169365	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_010516	AGATTT	2	12	169615	169626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170756802
86	NC_010516	AAAGAA	2	12	169802	169813	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170756802
87	NC_010516	AGGCAT	2	12	170783	170794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170756802
88	NC_010516	ATGAAT	2	12	171604	171615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757224
89	NC_010516	TTTATT	2	12	171876	171887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010516	GTGGTA	2	12	175834	175845	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170756524
91	NC_010516	ATATAA	2	12	177040	177051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755459
92	NC_010516	AGGTAT	2	12	180693	180704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757081
93	NC_010516	TTGAAA	2	12	181117	181128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170754811
94	NC_010516	AGTTAT	2	12	183442	183453	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170754907
95	NC_010516	TACAAC	2	12	184535	184546	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	170754429
96	NC_010516	ATATTT	2	12	185546	185557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010516	AAAAAT	2	12	186077	186088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170757044
98	NC_010516	ATGGTA	2	12	190085	190096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755934
99	NC_010516	AACATA	2	12	190153	190164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170755934
100	NC_010516	AATTAA	2	12	192535	192546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757042
101	NC_010516	TAATTT	2	12	193252	193263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757717
102	NC_010516	AATAAA	2	12	194230	194241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170754827
103	NC_010516	ATAAAA	2	12	194303	194314	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	170754827
104	NC_010516	TTTTTA	2	12	196172	196183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010516	TTTAAT	2	12	196381	196392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010516	TAAAGT	2	12	197257	197268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170755377
107	NC_010516	AATGGT	2	12	201459	201470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170754418
108	NC_010516	TTAAAA	2	12	202820	202831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755250
109	NC_010516	TAAATA	2	12	203580	203591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755250
110	NC_010516	AAAGAT	2	12	204197	204208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170755250
111	NC_010516	TGTAAT	2	12	208957	208968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	170755666
112	NC_010516	GAAATA	2	12	211223	211234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170755895
113	NC_010516	AATTAA	2	12	212194	212205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756096
114	NC_010516	GAAAAA	2	12	214030	214041	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170756784
115	NC_010516	AATATT	2	12	215523	215534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010516	ATTAAT	2	12	215575	215586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010516	ATTAAT	2	12	216692	216703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010516	GGGTAA	2	12	218145	218156	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170757707
119	NC_010516	ATATAG	2	12	218635	218646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757316
120	NC_010516	TAAGAT	2	12	219167	219178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170755625
121	NC_010516	CAGATA	2	12	220243	220254	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170757317
122	NC_010516	GATAAA	2	12	221223	221234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170757317
123	NC_010516	TAAAAG	2	12	221641	221652	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170757317
124	NC_010516	CTATAT	2	12	222794	222805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	170754361
125	NC_010516	ATTATA	2	12	223204	223215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010516	AATTAT	2	12	223226	223237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010516	TATAAA	2	12	223803	223814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755214
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236	NC_010516	ATGAAT	2	12	404016	404027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170755040
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241	NC_010516	GAGATC	2	12	412122	412133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
242	NC_010516	TTATTT	2	12	412528	412539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	170756330
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249	NC_010516	TGTGAG	2	12	418903	418914	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_010516	TGTAAA	2	12	560134	560145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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358	NC_010516	TAGTAA	2	12	566758	566769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170757521
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472	NC_010516	TATTAA	2	12	727329	727340	50 %	50 %	0 %	0 %	170757133
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477	NC_010516	TTTTTA	2	12	731973	731984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_010516	GATAAA	2	12	732403	732414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170756542
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481	NC_010516	TTATAA	2	12	736223	736234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_010516	ACAATA	2	12	736906	736917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170756083
483	NC_010516	CCTTTT	2	12	737115	737126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170755300
484	NC_010516	ATTTTT	2	12	738017	738028	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	170755300
485	NC_010516	TTTAAT	2	12	738514	738525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_010516	AATTTT	2	12	739420	739431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170754319
487	NC_010516	TAAATA	2	12	740199	740210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_010516	AATTGC	2	12	744578	744589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170756197
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492	NC_010516	TTAAAA	2	12	750365	750376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755433
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