MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 1198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	CATAA	2	10	9536	9545	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010516	GGTAA	2	10	9614	9623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010516	TCGTG	2	10	10405	10414	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010516	TAAGT	2	10	12081	12090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010516	AAAAT	2	10	13932	13941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010516	ATTAT	2	10	22317	22326	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010516	TTTAA	2	10	23701	23710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010516	ATTAA	2	10	23721	23730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010516	TATTT	2	10	23793	23802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010516	TTTTA	2	10	26455	26464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010516	AATTA	2	10	26552	26561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010516	ATATT	2	10	26633	26642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010516	TTAAT	2	10	27046	27055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010516	ATAAG	2	10	31602	31611	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010516	TAAAT	2	10	33728	33737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010516	ATATA	2	10	34015	34024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010516	ATATT	2	10	37623	37632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010516	AATAA	2	10	37681	37690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010516	TAATA	2	10	41233	41242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010516	ATAAA	2	10	41715	41724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010516	GGTAA	2	10	48787	48796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010516	TCGTG	2	10	49578	49587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010516	TAAGT	2	10	51318	51327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010516	AAAAT	2	10	53169	53178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010516	GGTAA	2	10	55394	55403	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010516	TCGTG	2	10	56185	56194	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010516	TAAGT	2	10	57925	57934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010516	AAAAT	2	10	59776	59785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010516	TTATA	2	10	60328	60337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010516	GGTAA	2	10	63315	63324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010516	TCGTG	2	10	64106	64115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_010516	TAAGT	2	10	65782	65791	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010516	AAAAT	2	10	67633	67642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010516	TGATT	2	10	67968	67977	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010516	TTATA	2	10	69362	69371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010516	CATAA	2	10	70179	70188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010516	GGTAA	2	10	70257	70266	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010516	TCGTG	2	10	71048	71057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010516	TAAGT	2	10	72788	72797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010516	AAAAT	2	10	74639	74648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010516	ATTAT	2	10	75887	75896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010516	GGTAA	2	10	76539	76548	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010516	TCGTG	2	10	77330	77339	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010516	TAAGT	2	10	79006	79015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010516	AAAAT	2	10	80857	80866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010516	TTGAA	2	10	82205	82214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010516	GAATA	2	10	86292	86301	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010516	ATTTA	2	10	95034	95043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010516	TACAA	2	10	95292	95301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_010516	TTTAA	2	10	95700	95709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010516	AAGTT	2	10	96594	96603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010516	TATAA	2	10	99150	99159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010516	ATTTT	2	10	100220	100229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010516	TAATA	2	10	100692	100701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010516	GTTAT	2	10	119635	119644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010516	GAAAT	2	10	120335	120344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010516	TAAAA	2	10	122489	122498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010516	TTCTA	2	10	125662	125671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010516	TTTAA	2	10	142754	142763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010516	ATAAA	2	10	165660	165669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010516	TAATA	2	10	173844	173853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010516	ATATA	2	10	176362	176371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010516	ATTTA	2	10	182431	182440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010516	AAATA	2	10	185402	185411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010516	ATAAA	2	10	185415	185424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010516	ATTAT	2	10	185438	185447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010516	TAATT	2	10	187236	187245	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010516	GTCTA	2	10	196363	196372	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010516	TATTT	2	10	196483	196492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010516	AAATA	2	10	200416	200425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010516	TAAAG	2	10	201010	201019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010516	TATTT	2	10	211709	211718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010516	TAATT	2	10	213270	213279	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010516	AATTT	2	10	216577	216586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010516	TTTAT	2	10	216650	216659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010516	GATTT	2	10	224140	224149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010516	TAAAA	2	10	227701	227710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010516	TAAAA	2	10	227792	227801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010516	AAATT	2	10	230626	230635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010516	ATTAT	2	10	233145	233154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010516	ATTTA	2	10	233587	233596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010516	ATTAA	2	10	236927	236936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010516	TAATT	2	10	240472	240481	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010516	TTTTG	2	10	244744	244753	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010516	ATTAT	2	10	244820	244829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010516	ATTAT	2	10	247134	247143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010516	ACTTA	2	10	250018	250027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010516	TAAAT	2	10	251843	251852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010516	TAATT	2	10	271019	271028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010516	GGTTT	2	10	272301	272310	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010516	TAATT	2	10	280432	280441	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010516	TATAT	2	10	284072	284081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010516	ATATT	2	10	285797	285806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010516	TTTTA	2	10	286434	286443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010516	ATGGA	2	10	286501	286510	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010516	ATAGT	2	10	286530	286539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010516	GAAAA	2	10	288398	288407	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010516	TATAA	2	10	288505	288514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010516	AATTA	2	10	293855	293864	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010516	TAAAA	2	10	295852	295861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010516	TTTCT	2	10	304563	304572	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010516	ATTCT	2	10	305192	305201	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010516	TAATT	2	10	306252	306261	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010516	ATTAA	2	10	307569	307578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010516	AAATA	2	10	312759	312768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010516	AACTA	2	10	315003	315012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010516	AAAAT	2	10	315116	315125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010516	TATAA	2	10	316054	316063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010516	CTTAT	2	10	325632	325641	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010516	ACTTT	2	10	325905	325914	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_010516	ATTTC	2	10	335874	335883	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010516	TTTTA	2	10	341147	341156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010516	TAATA	2	10	341260	341269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010516	TTATA	2	10	342762	342771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010516	AATAA	2	10	347874	347883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010516	ATTAT	2	10	353357	353366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010516	TAACT	2	10	356770	356779	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010516	AAAAT	2	10	357027	357036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010516	ATATA	2	10	359236	359245	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010516	ATGTA	2	10	372612	372621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010516	ATATA	2	10	372676	372685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010516	ATTAG	2	10	374728	374737	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010516	TTTAG	2	10	381417	381426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010516	ATAAA	2	10	381473	381482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010516	ATATA	2	10	381492	381501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010516	TTATT	2	10	382715	382724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010516	CTTAT	2	10	388625	388634	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010516	TGAAA	2	10	388659	388668	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010516	TATTT	2	10	398110	398119	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010516	ATTAT	2	10	398159	398168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010516	ACTAT	3	15	400121	400135	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_010516	TTATT	2	10	404779	404788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010516	TTTTA	2	10	404898	404907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010516	TTTTA	2	10	406061	406070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010516	TCAAT	2	10	406200	406209	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_010516	ATATA	2	10	406289	406298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010516	AATAA	2	10	408356	408365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010516	ATTTA	2	10	410043	410052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010516	AAACA	2	10	414825	414834	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010516	AATTT	2	10	420824	420833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010516	TTTAA	2	10	422842	422851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010516	AAATA	2	10	425819	425828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010516	AATAT	2	10	428900	428909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010516	TTAAT	2	10	436073	436082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010516	TAAAA	2	10	442081	442090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010516	AAAAT	2	10	448950	448959	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010516	AAAGG	2	10	449123	449132	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010516	TATAA	2	10	453200	453209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010516	ATTTT	2	10	455520	455529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010516	TAAAA	2	10	455623	455632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_010516	AAAAT	2	10	859584	859593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_010516	CATAG	2	10	859804	859813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
293	NC_010516	AAATA	2	10	859827	859836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_010516	ATGAA	2	10	1398885	1398894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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