MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 3262

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	TAAAT	2	10	3631	3640	60 %	40 %	0 %	0 %	170755060
2	NC_010516	TAAAA	2	10	4111	4120	80 %	20 %	0 %	0 %	170755060
3	NC_010516	ACTTT	2	10	5955	5964	20 %	60 %	0 %	20 %	170756292
4	NC_010516	AAGAT	2	10	6343	6352	60 %	20 %	20 %	0 %	170756292
5	NC_010516	TAAAA	2	10	6996	7005	80 %	20 %	0 %	0 %	170756835
6	NC_010516	AAATT	2	10	14666	14675	60 %	40 %	0 %	0 %	170757636
7	NC_010516	AATAA	2	10	15404	15413	80 %	20 %	0 %	0 %	170754952
8	NC_010516	ATATA	2	10	15782	15791	60 %	40 %	0 %	0 %	170756030
9	NC_010516	TTTTA	2	10	16344	16353	20 %	80 %	0 %	0 %	170756030
10	NC_010516	AATAA	2	10	16693	16702	80 %	20 %	0 %	0 %	170756130
11	NC_010516	TTATT	2	10	17136	17145	20 %	80 %	0 %	0 %	170756130
12	NC_010516	TATAA	2	10	17782	17791	60 %	40 %	0 %	0 %	170756130
13	NC_010516	CAAAG	2	10	18571	18580	60 %	0 %	20 %	20 %	170756130
14	NC_010516	TAATG	2	10	18756	18765	40 %	40 %	20 %	0 %	170756130
15	NC_010516	TAAAA	2	10	19304	19313	80 %	20 %	0 %	0 %	170756130
16	NC_010516	GAAAT	2	10	19593	19602	60 %	20 %	20 %	0 %	170757148
17	NC_010516	ATATT	2	10	20032	20041	40 %	60 %	0 %	0 %	170757148
18	NC_010516	TAATA	2	10	20092	20101	60 %	40 %	0 %	0 %	170757148
19	NC_010516	AATTT	2	10	21640	21649	40 %	60 %	0 %	0 %	170754524
20	NC_010516	AATAA	2	10	27936	27945	80 %	20 %	0 %	0 %	170756254
21	NC_010516	TATGT	2	10	28765	28774	20 %	60 %	20 %	0 %	170757006
22	NC_010516	TTATT	2	10	28883	28892	20 %	80 %	0 %	0 %	170756206
23	NC_010516	GGATT	2	10	29086	29095	20 %	40 %	40 %	0 %	170756206
24	NC_010516	ATTAT	2	10	29876	29885	40 %	60 %	0 %	0 %	170755918
25	NC_010516	ATTTT	2	10	30386	30395	20 %	80 %	0 %	0 %	170755918
26	NC_010516	TAATT	2	10	32561	32570	40 %	60 %	0 %	0 %	170754592
27	NC_010516	ATTTT	2	10	33390	33399	20 %	80 %	0 %	0 %	170756726
28	NC_010516	AATAA	2	10	35584	35593	80 %	20 %	0 %	0 %	170754513
29	NC_010516	AAAAT	2	10	37192	37201	80 %	20 %	0 %	0 %	170755371
30	NC_010516	AATAC	2	10	37284	37293	60 %	20 %	0 %	20 %	170755371
31	NC_010516	GATTT	2	10	38700	38709	20 %	60 %	20 %	0 %	170754521
32	NC_010516	GAATA	2	10	41320	41329	60 %	20 %	20 %	0 %	170756047
33	NC_010516	TTATT	2	10	41336	41345	20 %	80 %	0 %	0 %	170756047
34	NC_010516	GATTT	2	10	42070	42079	20 %	60 %	20 %	0 %	170755512
35	NC_010516	AAAAG	2	10	42329	42338	80 %	0 %	20 %	0 %	170755512
36	NC_010516	TTGTA	2	10	42594	42603	20 %	60 %	20 %	0 %	170754535
37	NC_010516	ATAGA	2	10	43992	44001	60 %	20 %	20 %	0 %	170757635
38	NC_010516	GCAAT	2	10	44649	44658	40 %	20 %	20 %	20 %	170757635
39	NC_010516	AAAGA	2	10	44666	44675	80 %	0 %	20 %	0 %	170757635
40	NC_010516	AGTAT	2	10	45675	45684	40 %	40 %	20 %	0 %	170755970
41	NC_010516	TTAAT	2	10	46712	46721	40 %	60 %	0 %	0 %	170757165
42	NC_010516	ATTGT	2	10	47895	47904	20 %	60 %	20 %	0 %	170754943
43	NC_010516	ATAGA	2	10	48000	48009	60 %	20 %	20 %	0 %	170754943
44	NC_010516	AATAA	2	10	53827	53836	80 %	20 %	0 %	0 %	170757429
45	NC_010516	GAATA	2	10	54178	54187	60 %	20 %	20 %	0 %	170757429
46	NC_010516	TAAAT	2	10	68212	68221	60 %	40 %	0 %	0 %	170754737
47	NC_010516	AAGAA	2	10	68711	68720	80 %	0 %	20 %	0 %	170756457
48	NC_010516	GTATA	2	10	69290	69299	40 %	40 %	20 %	0 %	170754427
49	NC_010516	GAAGA	2	10	75146	75155	60 %	0 %	40 %	0 %	170757604
50	NC_010516	AAATA	2	10	75764	75773	80 %	20 %	0 %	0 %	170757604
51	NC_010516	CAATC	2	10	82356	82365	40 %	20 %	0 %	40 %	170754739
52	NC_010516	TTATT	2	10	84633	84642	20 %	80 %	0 %	0 %	170756307
53	NC_010516	ATTTT	2	10	84650	84659	20 %	80 %	0 %	0 %	170756307
54	NC_010516	ATTTT	2	10	85003	85012	20 %	80 %	0 %	0 %	170756307
55	NC_010516	AAAAT	2	10	85037	85046	80 %	20 %	0 %	0 %	170756307
56	NC_010516	ATTTT	2	10	85733	85742	20 %	80 %	0 %	0 %	170757359
57	NC_010516	TATAA	2	10	87870	87879	60 %	40 %	0 %	0 %	170757865
58	NC_010516	AAAAG	2	10	88657	88666	80 %	0 %	20 %	0 %	170755522
59	NC_010516	TAAAT	2	10	89720	89729	60 %	40 %	0 %	0 %	170756340
60	NC_010516	TAAAT	2	10	90513	90522	60 %	40 %	0 %	0 %	170757341
61	NC_010516	TAGAA	2	10	90642	90651	60 %	20 %	20 %	0 %	170757341
62	NC_010516	ATGGA	2	10	92455	92464	40 %	20 %	40 %	0 %	170756863
63	NC_010516	AGGAT	2	10	92951	92960	40 %	20 %	40 %	0 %	170754439
64	NC_010516	AAAGA	2	10	93939	93948	80 %	0 %	20 %	0 %	170755254
65	NC_010516	AAGAA	2	10	94064	94073	80 %	0 %	20 %	0 %	170755254
66	NC_010516	ATTTA	2	10	100422	100431	40 %	60 %	0 %	0 %	170757565
67	NC_010516	TAATA	2	10	101877	101886	60 %	40 %	0 %	0 %	170754593
68	NC_010516	ATATT	2	10	104061	104070	40 %	60 %	0 %	0 %	170756172
69	NC_010516	AGAAA	2	10	106561	106570	80 %	0 %	20 %	0 %	170755122
70	NC_010516	AAAAC	2	10	106606	106615	80 %	0 %	0 %	20 %	170755122
71	NC_010516	AAATT	2	10	107706	107715	60 %	40 %	0 %	0 %	170757504
72	NC_010516	AAATG	2	10	107974	107983	60 %	20 %	20 %	0 %	170757504
73	NC_010516	GAAGT	2	10	108987	108996	40 %	20 %	40 %	0 %	170756516
74	NC_010516	GAAAA	2	10	110552	110561	80 %	0 %	20 %	0 %	170757578
75	NC_010516	AAAAT	2	10	116047	116056	80 %	20 %	0 %	0 %	170757557
76	NC_010516	ATAAA	2	10	116137	116146	80 %	20 %	0 %	0 %	170757557
77	NC_010516	ATTTA	2	10	117024	117033	40 %	60 %	0 %	0 %	170757668
78	NC_010516	ATTTT	2	10	121376	121385	20 %	80 %	0 %	0 %	170754242
79	NC_010516	ATACA	2	10	121893	121902	60 %	20 %	0 %	20 %	170755520
80	NC_010516	AATAT	2	10	122197	122206	60 %	40 %	0 %	0 %	170755520
81	NC_010516	AAGAA	2	10	123462	123471	80 %	0 %	20 %	0 %	170756294
82	NC_010516	TAATA	2	10	123750	123759	60 %	40 %	0 %	0 %	170756294
83	NC_010516	AGAGA	2	10	123784	123793	60 %	0 %	40 %	0 %	170756294
84	NC_010516	TAAAT	2	10	124374	124383	60 %	40 %	0 %	0 %	170756294
85	NC_010516	AATTC	2	10	126713	126722	40 %	40 %	0 %	20 %	170757315
86	NC_010516	ATTAT	2	10	127444	127453	40 %	60 %	0 %	0 %	170756479
87	NC_010516	AAAAG	2	10	129599	129608	80 %	0 %	20 %	0 %	170756964
88	NC_010516	TTAAA	2	10	129661	129670	60 %	40 %	0 %	0 %	170756964
89	NC_010516	GCTTA	2	10	130576	130585	20 %	40 %	20 %	20 %	170756964
90	NC_010516	AGAAA	2	10	130827	130836	80 %	0 %	20 %	0 %	170756964
91	NC_010516	TATAA	2	10	131712	131721	60 %	40 %	0 %	0 %	170755679
92	NC_010516	GAAAG	2	10	133784	133793	60 %	0 %	40 %	0 %	170757125
93	NC_010516	ATAAA	2	10	134151	134160	80 %	20 %	0 %	0 %	170757125
94	NC_010516	ATTAT	2	10	134281	134290	40 %	60 %	0 %	0 %	170757125
95	NC_010516	TAATT	2	10	134683	134692	40 %	60 %	0 %	0 %	170757125
96	NC_010516	ATTTA	2	10	135841	135850	40 %	60 %	0 %	0 %	170757125
97	NC_010516	TTATG	2	10	136345	136354	20 %	60 %	20 %	0 %	170757125
98	NC_010516	ACAAA	2	10	138929	138938	80 %	0 %	0 %	20 %	170755476
99	NC_010516	TAGAA	2	10	140139	140148	60 %	20 %	20 %	0 %	170754234
100	NC_010516	TAATA	2	10	141909	141918	60 %	40 %	0 %	0 %	170755470
101	NC_010516	ATGGA	2	10	141995	142004	40 %	20 %	40 %	0 %	170755470
102	NC_010516	TCCTA	2	10	143119	143128	20 %	40 %	0 %	40 %	170755057
103	NC_010516	ATTAT	2	10	143307	143316	40 %	60 %	0 %	0 %	170755057
104	NC_010516	TATAA	2	10	143338	143347	60 %	40 %	0 %	0 %	170755057
105	NC_010516	AGAAT	2	10	143563	143572	60 %	20 %	20 %	0 %	170755057
106	NC_010516	AATGT	2	10	146100	146109	40 %	40 %	20 %	0 %	170756643
107	NC_010516	AAAGA	2	10	146653	146662	80 %	0 %	20 %	0 %	170755858
108	NC_010516	TTATC	2	10	147400	147409	20 %	60 %	0 %	20 %	170755700
109	NC_010516	ATAAA	2	10	149438	149447	80 %	20 %	0 %	0 %	170756227
110	NC_010516	ATGCA	2	10	153946	153955	40 %	20 %	20 %	20 %	170756686
111	NC_010516	TTTGA	2	10	155429	155438	20 %	60 %	20 %	0 %	170755043
112	NC_010516	ATATA	2	10	155915	155924	60 %	40 %	0 %	0 %	170755898
113	NC_010516	CAAGG	2	10	156279	156288	40 %	0 %	40 %	20 %	170755898
114	NC_010516	ATTAT	2	10	157371	157380	40 %	60 %	0 %	0 %	170755898
115	NC_010516	AAAAG	2	10	158267	158276	80 %	0 %	20 %	0 %	170754962
116	NC_010516	ATGGC	2	10	159820	159829	20 %	20 %	40 %	20 %	170757021
117	NC_010516	TTATT	2	10	160631	160640	20 %	80 %	0 %	0 %	170757021
118	NC_010516	AGCTT	2	10	160696	160705	20 %	40 %	20 %	20 %	170757021
119	NC_010516	AGATA	2	10	161117	161126	60 %	20 %	20 %	0 %	170757021
120	NC_010516	ATTTT	2	10	162208	162217	20 %	80 %	0 %	0 %	170754373
121	NC_010516	GAAAA	2	10	162438	162447	80 %	0 %	20 %	0 %	170755389
122	NC_010516	ATAAA	2	10	162498	162507	80 %	20 %	0 %	0 %	170755389
123	NC_010516	AATAA	2	10	163474	163483	80 %	20 %	0 %	0 %	170755389
124	NC_010516	AAATA	2	10	163666	163675	80 %	20 %	0 %	0 %	170756375
125	NC_010516	ATTTT	2	10	164949	164958	20 %	80 %	0 %	0 %	170754536
126	NC_010516	ATTTA	2	10	165083	165092	40 %	60 %	0 %	0 %	170754536
127	NC_010516	TTATG	2	10	167084	167093	20 %	60 %	20 %	0 %	170755535
128	NC_010516	AATAT	2	10	167203	167212	60 %	40 %	0 %	0 %	170755535
129	NC_010516	TATAA	2	10	168282	168291	60 %	40 %	0 %	0 %	170757780
130	NC_010516	AGAAA	2	10	169097	169106	80 %	0 %	20 %	0 %	170755608
131	NC_010516	TAAAA	2	10	169168	169177	80 %	20 %	0 %	0 %	170755608
132	NC_010516	CAAAT	2	10	169889	169898	60 %	20 %	0 %	20 %	170756802
133	NC_010516	CAGAA	2	10	170667	170676	60 %	0 %	20 %	20 %	170756802
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135	NC_010516	GCAAA	2	10	174058	174067	60 %	0 %	20 %	20 %	170755962
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