MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 13002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	AATA	2	8	73	80	75 %	25 %	0 %	0 %	170756151
2	NC_010516	AAGT	2	8	102	109	50 %	25 %	25 %	0 %	170756151
3	NC_010516	TTAC	2	8	242	249	25 %	50 %	0 %	25 %	170756151
4	NC_010516	TTTA	2	8	466	473	25 %	75 %	0 %	0 %	170756151
5	NC_010516	ATGC	2	8	509	516	25 %	25 %	25 %	25 %	170756151
6	NC_010516	AATT	3	12	591	602	50 %	50 %	0 %	0 %	170756151
7	NC_010516	AAAT	2	8	634	641	75 %	25 %	0 %	0 %	170756151
8	NC_010516	AGAA	2	8	694	701	75 %	0 %	25 %	0 %	170756151
9	NC_010516	AACA	2	8	746	753	75 %	0 %	0 %	25 %	170756151
10	NC_010516	TACC	2	8	789	796	25 %	25 %	0 %	50 %	170756151
11	NC_010516	TAAA	2	8	1350	1357	75 %	25 %	0 %	0 %	170756151
12	NC_010516	TTAT	2	8	1406	1413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010516	AAAT	2	8	1897	1904	75 %	25 %	0 %	0 %	170757193
14	NC_010516	TTTA	2	8	2300	2307	25 %	75 %	0 %	0 %	170757193
15	NC_010516	AATT	2	8	2774	2781	50 %	50 %	0 %	0 %	170757697
16	NC_010516	TTCT	2	8	2801	2808	0 %	75 %	0 %	25 %	170757697
17	NC_010516	TAAT	2	8	3014	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010516	TAAA	2	8	3324	3331	75 %	25 %	0 %	0 %	170755060
19	NC_010516	GAAA	2	8	3512	3519	75 %	0 %	25 %	0 %	170755060
20	NC_010516	AAGT	2	8	3825	3832	50 %	25 %	25 %	0 %	170755060
21	NC_010516	GGAT	2	8	4269	4276	25 %	25 %	50 %	0 %	170755684
22	NC_010516	TTTA	2	8	5116	5123	25 %	75 %	0 %	0 %	170756292
23	NC_010516	GATG	2	8	5178	5185	25 %	25 %	50 %	0 %	170756292
24	NC_010516	GACA	2	8	5437	5444	50 %	0 %	25 %	25 %	170756292
25	NC_010516	ATTT	2	8	5694	5701	25 %	75 %	0 %	0 %	170756292
26	NC_010516	AATG	2	8	5786	5793	50 %	25 %	25 %	0 %	170756292
27	NC_010516	GTAA	2	8	6403	6410	50 %	25 %	25 %	0 %	170756835
28	NC_010516	ATAA	2	8	6778	6785	75 %	25 %	0 %	0 %	170756835
29	NC_010516	ATAC	2	8	7922	7929	50 %	25 %	0 %	25 %	170756835
30	NC_010516	TTAA	2	8	9089	9096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010516	CTTC	2	8	9438	9445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010516	GGTA	2	8	10574	10581	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010516	TTCT	2	8	10900	10907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010516	AGAA	2	8	11250	11257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010516	AGGT	2	8	12680	12687	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010516	TGCT	2	8	13067	13074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010516	TAAA	2	8	14877	14884	75 %	25 %	0 %	0 %	170757636
38	NC_010516	AGAA	2	8	14950	14957	75 %	0 %	25 %	0 %	170754952
39	NC_010516	TATG	2	8	15286	15293	25 %	50 %	25 %	0 %	170754952
40	NC_010516	TACT	2	8	15348	15355	25 %	50 %	0 %	25 %	170754952
41	NC_010516	GGAA	2	8	16094	16101	50 %	0 %	50 %	0 %	170756030
42	NC_010516	TTTA	2	8	16674	16681	25 %	75 %	0 %	0 %	170756130
43	NC_010516	TAAA	2	8	16883	16890	75 %	25 %	0 %	0 %	170756130
44	NC_010516	TAAA	2	8	18158	18165	75 %	25 %	0 %	0 %	170756130
45	NC_010516	ATTT	2	8	18557	18564	25 %	75 %	0 %	0 %	170756130
46	NC_010516	ATGG	2	8	18802	18809	25 %	25 %	50 %	0 %	170756130
47	NC_010516	ATTT	2	8	18872	18879	25 %	75 %	0 %	0 %	170756130
48	NC_010516	AATT	2	8	19426	19433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010516	TACA	2	8	19515	19522	50 %	25 %	0 %	25 %	170757148
50	NC_010516	AAAT	2	8	19569	19576	75 %	25 %	0 %	0 %	170757148
51	NC_010516	GGAT	2	8	19790	19797	25 %	25 %	50 %	0 %	170757148
52	NC_010516	ATTC	2	8	20063	20070	25 %	50 %	0 %	25 %	170757148
53	NC_010516	AAAT	2	8	21099	21106	75 %	25 %	0 %	0 %	170754524
54	NC_010516	ATAA	2	8	21116	21123	75 %	25 %	0 %	0 %	170754524
55	NC_010516	TAGT	2	8	21264	21271	25 %	50 %	25 %	0 %	170754524
56	NC_010516	AAAG	2	8	21289	21296	75 %	0 %	25 %	0 %	170754524
57	NC_010516	TAAA	2	8	21528	21535	75 %	25 %	0 %	0 %	170754524
58	NC_010516	AAAT	2	8	21562	21569	75 %	25 %	0 %	0 %	170754524
59	NC_010516	ATTT	2	8	21674	21681	25 %	75 %	0 %	0 %	170755420
60	NC_010516	GTTA	2	8	21815	21822	25 %	50 %	25 %	0 %	170755420
61	NC_010516	TATT	2	8	22354	22361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010516	AATA	2	8	22371	22378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010516	CAAG	2	8	23469	23476	50 %	0 %	25 %	25 %	170754615
64	NC_010516	TAAA	2	8	23770	23777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010516	ATTT	2	8	24326	24333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010516	ATAA	2	8	24812	24819	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010516	TTTA	2	8	25999	26006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010516	GACT	2	8	26358	26365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010516	AAAT	2	8	26532	26539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010516	TGGC	2	8	26900	26907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010516	GTAA	2	8	27651	27658	50 %	25 %	25 %	0 %	170756254
72	NC_010516	TAAA	2	8	27928	27935	75 %	25 %	0 %	0 %	170756254
73	NC_010516	TTGT	2	8	28160	28167	0 %	75 %	25 %	0 %	170757006
74	NC_010516	CTAT	2	8	29209	29216	25 %	50 %	0 %	25 %	170756206
75	NC_010516	CATT	2	8	29694	29701	25 %	50 %	0 %	25 %	170755918
76	NC_010516	TATT	2	8	30040	30047	25 %	75 %	0 %	0 %	170755918
77	NC_010516	TTGA	2	8	31338	31345	25 %	50 %	25 %	0 %	170755106
78	NC_010516	ATTT	3	12	31386	31397	25 %	75 %	0 %	0 %	170755106
79	NC_010516	AAAT	2	8	32260	32267	75 %	25 %	0 %	0 %	170754592
80	NC_010516	AAAT	2	8	32281	32288	75 %	25 %	0 %	0 %	170754592
81	NC_010516	AGGT	2	8	33135	33142	25 %	25 %	50 %	0 %	170754592
82	NC_010516	TAAA	2	8	33318	33325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010516	ATAA	2	8	34192	34199	75 %	25 %	0 %	0 %	170754513
84	NC_010516	GATA	2	8	34272	34279	50 %	25 %	25 %	0 %	170754513
85	NC_010516	ATGT	2	8	34543	34550	25 %	50 %	25 %	0 %	170754513
86	NC_010516	AGAA	2	8	35202	35209	75 %	0 %	25 %	0 %	170754513
87	NC_010516	TAAA	2	8	35252	35259	75 %	25 %	0 %	0 %	170754513
88	NC_010516	TAAA	2	8	35264	35271	75 %	25 %	0 %	0 %	170754513
89	NC_010516	TAAA	2	8	35300	35307	75 %	25 %	0 %	0 %	170754513
90	NC_010516	AATG	2	8	35517	35524	50 %	25 %	25 %	0 %	170754513
91	NC_010516	TGTA	2	8	35606	35613	25 %	50 %	25 %	0 %	170754513
92	NC_010516	AATA	2	8	35614	35621	75 %	25 %	0 %	0 %	170754513
93	NC_010516	CATA	2	8	36355	36362	50 %	25 %	0 %	25 %	170756985
94	NC_010516	AAGA	2	8	36865	36872	75 %	0 %	25 %	0 %	170756985
95	NC_010516	TAAA	2	8	37040	37047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010516	AATA	2	8	37072	37079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010516	ATGA	2	8	37104	37111	50 %	25 %	25 %	0 %	170755371
98	NC_010516	ATGT	2	8	37320	37327	25 %	50 %	25 %	0 %	170755371
99	NC_010516	TATT	2	8	37587	37594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010516	GGAA	2	8	37965	37972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010516	AATA	2	8	38428	38435	75 %	25 %	0 %	0 %	170754521
102	NC_010516	AAAG	2	8	39407	39414	75 %	0 %	25 %	0 %	170754521
103	NC_010516	AGAA	2	8	39985	39992	75 %	0 %	25 %	0 %	170757507
104	NC_010516	TGCA	2	8	40124	40131	25 %	25 %	25 %	25 %	170757507
105	NC_010516	AAAG	2	8	40142	40149	75 %	0 %	25 %	0 %	170757507
106	NC_010516	GAAG	2	8	40826	40833	50 %	0 %	50 %	0 %	170756536
107	NC_010516	AATT	2	8	41036	41043	50 %	50 %	0 %	0 %	170757109
108	NC_010516	TTAT	2	8	41445	41452	25 %	75 %	0 %	0 %	170756047
109	NC_010516	AAAT	2	8	41797	41804	75 %	25 %	0 %	0 %	170755512
110	NC_010516	AATT	2	8	42509	42516	50 %	50 %	0 %	0 %	170754535
111	NC_010516	GATT	2	8	42870	42877	25 %	50 %	25 %	0 %	170754535
112	NC_010516	ATAA	2	8	43432	43439	75 %	25 %	0 %	0 %	170756580
113	NC_010516	AATT	2	8	43536	43543	50 %	50 %	0 %	0 %	170756580
114	NC_010516	ATTA	2	8	44068	44075	50 %	50 %	0 %	0 %	170757635
115	NC_010516	ATAA	2	8	44300	44307	75 %	25 %	0 %	0 %	170757635
116	NC_010516	ATAA	2	8	44432	44439	75 %	25 %	0 %	0 %	170757635
117	NC_010516	ATAA	2	8	44750	44757	75 %	25 %	0 %	0 %	170754960
118	NC_010516	TTAG	2	8	45408	45415	25 %	50 %	25 %	0 %	170755970
119	NC_010516	CTAT	2	8	45543	45550	25 %	50 %	0 %	25 %	170755970
120	NC_010516	TAAA	2	8	45589	45596	75 %	25 %	0 %	0 %	170755970
121	NC_010516	AAAT	2	8	45731	45738	75 %	25 %	0 %	0 %	170755970
122	NC_010516	TAAA	2	8	45986	45993	75 %	25 %	0 %	0 %	170755970
123	NC_010516	ATAA	2	8	46144	46151	75 %	25 %	0 %	0 %	170757165
124	NC_010516	TCTT	2	8	46282	46289	0 %	75 %	0 %	25 %	170757165
125	NC_010516	TTTA	2	8	46523	46530	25 %	75 %	0 %	0 %	170757165
126	NC_010516	GAAA	2	8	46620	46627	75 %	0 %	25 %	0 %	170757165
127	NC_010516	TTTA	2	8	47124	47131	25 %	75 %	0 %	0 %	170757165
128	NC_010516	ATTT	2	8	47387	47394	25 %	75 %	0 %	0 %	170754943
129	NC_010516	ATTT	2	8	47424	47431	25 %	75 %	0 %	0 %	170754943
130	NC_010516	AAAT	2	8	47451	47458	75 %	25 %	0 %	0 %	170754943
131	NC_010516	TTTA	2	8	47508	47515	25 %	75 %	0 %	0 %	170754943
132	NC_010516	GAAG	2	8	47947	47954	50 %	0 %	50 %	0 %	170754943
133	NC_010516	TTAA	2	8	48197	48204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010516	CTTC	2	8	48611	48618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_010516	GGTA	2	8	49747	49754	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010516	AGAA	2	8	50060	50067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010516	TTCT	2	8	50073	50080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010516	AGAA	2	8	50487	50494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010516	AGGT	2	8	51917	51924	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010516	TGCT	2	8	52304	52311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010516	AATG	2	8	53570	53577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010516	GATG	2	8	53786	53793	25 %	25 %	50 %	0 %	170757429
143	NC_010516	TCCT	2	8	54305	54312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_010516	CTTC	2	8	55218	55225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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