MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum B1 str. Okra chromosome

Total Repeats: 62521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010516	GGA	2	6	25	30	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010516	AAT	2	6	152	157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
3	NC_010516	ACT	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756151
4	NC_010516	GAA	2	6	287	292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
5	NC_010516	ATA	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
6	NC_010516	ATG	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
7	NC_010516	CTA	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756151
8	NC_010516	GCA	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170756151
9	NC_010516	TGG	2	6	478	483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170756151
10	NC_010516	AGT	2	6	556	561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
11	NC_010516	TCT	2	6	569	574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170756151
12	NC_010516	GAT	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
13	NC_010516	TGA	2	6	667	672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
14	NC_010516	AAT	2	6	754	759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
15	NC_010516	AGA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
16	NC_010516	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
17	NC_010516	TAG	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756151
18	NC_010516	TCA	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756151
19	NC_010516	TAA	2	6	1015	1020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
20	NC_010516	AAG	2	6	1107	1112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
21	NC_010516	TAT	2	6	1124	1129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170756151
22	NC_010516	AGA	2	6	1141	1146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
23	NC_010516	AGA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
24	NC_010516	GAA	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756151
25	NC_010516	TAC	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756151
26	NC_010516	TAA	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756151
27	NC_010516	TAA	2	6	1396	1401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010516	TTG	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010516	ATT	2	6	1492	1497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010516	TTA	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010516	CAA	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010516	CTA	6	18	1558	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010516	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010516	TAA	2	6	1618	1623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010516	AGG	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010516	TAT	2	6	1723	1728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
37	NC_010516	TTA	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
38	NC_010516	TAA	2	6	1748	1753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
39	NC_010516	AGA	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
40	NC_010516	ATA	2	6	1866	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
41	NC_010516	AGA	2	6	1910	1915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
42	NC_010516	ATA	2	6	1929	1934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
43	NC_010516	TAT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
44	NC_010516	TAG	2	6	2140	2145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757193
45	NC_010516	AAG	2	6	2171	2176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
46	NC_010516	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170757193
47	NC_010516	AGA	3	9	2252	2260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
48	NC_010516	AAT	2	6	2324	2329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
49	NC_010516	ATT	2	6	2336	2341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
50	NC_010516	TTA	2	6	2353	2358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
51	NC_010516	GAA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
52	NC_010516	ATA	2	6	2397	2402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
53	NC_010516	AAG	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
54	NC_010516	GAT	2	6	2493	2498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757193
55	NC_010516	TAA	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
56	NC_010516	GAA	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170757193
57	NC_010516	AGT	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170757193
58	NC_010516	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757193
59	NC_010516	AAT	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757193
60	NC_010516	ATA	2	6	2787	2792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757697
61	NC_010516	CAA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170757697
62	NC_010516	GAC	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170757697
63	NC_010516	TAA	2	6	2939	2944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170757697
64	NC_010516	ATT	2	6	2958	2963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170757697
65	NC_010516	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010516	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010516	TAA	2	6	3057	3062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
68	NC_010516	ATG	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755060
69	NC_010516	TAA	2	6	3124	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
70	NC_010516	ATA	2	6	3231	3236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
71	NC_010516	TGT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170755060
72	NC_010516	AGA	2	6	3391	3396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755060
73	NC_010516	AAT	2	6	3403	3408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
74	NC_010516	TAT	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170755060
75	NC_010516	ATA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
76	NC_010516	ATG	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755060
77	NC_010516	ATT	2	6	3641	3646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170755060
78	NC_010516	AAG	2	6	3662	3667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755060
79	NC_010516	AGA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755060
80	NC_010516	ATA	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
81	NC_010516	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170755060
82	NC_010516	GAT	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755060
83	NC_010516	ACA	2	6	3871	3876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170755060
84	NC_010516	CAT	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170755060
85	NC_010516	ATA	2	6	3917	3922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
86	NC_010516	ATA	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
87	NC_010516	GAT	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755060
88	NC_010516	TAA	2	6	4032	4037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
89	NC_010516	AGA	2	6	4051	4056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170755060
90	NC_010516	TAA	2	6	4102	4107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170755060
91	NC_010516	TTC	2	6	4154	4159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170755684
92	NC_010516	GTA	3	9	4174	4182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170755684
93	NC_010516	TTG	2	6	4277	4282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170755684
94	NC_010516	AGG	2	6	4419	4424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010516	ATG	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756292
96	NC_010516	TCA	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756292
97	NC_010516	ATA	2	6	4573	4578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756292
98	NC_010516	CTG	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170756292
99	NC_010516	TAA	2	6	4717	4722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756292
100	NC_010516	TGG	3	9	4751	4759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170756292
101	NC_010516	TGG	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170756292
102	NC_010516	TGT	2	6	4802	4807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170756292
103	NC_010516	AGA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756292
104	NC_010516	TGA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756292
105	NC_010516	CAA	2	6	5148	5153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170756292
106	NC_010516	TGA	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756292
107	NC_010516	CAG	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170756292
108	NC_010516	TAG	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756292
109	NC_010516	ATA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756292
110	NC_010516	AGA	2	6	5613	5618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756292
111	NC_010516	TTC	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170756292
112	NC_010516	CAT	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756292
113	NC_010516	GAA	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756292
114	NC_010516	ATA	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756292
115	NC_010516	AAT	2	6	5909	5914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756292
116	NC_010516	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756292
117	NC_010516	ACC	2	6	6026	6031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170756292
118	NC_010516	TGC	2	6	6092	6097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170756292
119	NC_010516	ATT	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170756292
120	NC_010516	AAC	2	6	6172	6177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170756292
121	NC_010516	ACT	2	6	6186	6191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756292
122	NC_010516	TTA	2	6	6213	6218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170756292
123	NC_010516	AAG	2	6	6290	6295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756292
124	NC_010516	AGT	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756292
125	NC_010516	GAA	2	6	6417	6422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756835
126	NC_010516	AGA	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756835
127	NC_010516	ATA	2	6	6508	6513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170756835
128	NC_010516	ATC	2	6	6596	6601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170756835
129	NC_010516	CAG	2	6	6614	6619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170756835
130	NC_010516	TAG	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170756835
131	NC_010516	AGC	3	9	6714	6722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170756835
132	NC_010516	GAA	4	12	6820	6831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170756835
133	NC_010516	TTC	2	6	6876	6881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170756835
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388	NC_010516	TAA	2	6	23656	23661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170754615
389	NC_010516	ATT	2	6	23673	23678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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