MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia MC0-3 chromosome 2

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010515	TCGGAT	2	12	2234	2245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010515	CGGCCG	2	12	41835	41846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010515	TCGCGA	2	12	44443	44454	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010515	ACAAAT	2	12	63444	63455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010515	GCGCCC	2	12	116200	116211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_010515	CGGCCC	2	12	127912	127923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_010515	TCGAAC	2	12	143642	143653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010515	CCGGCG	2	12	144656	144667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010515	TGCGGC	2	12	159907	159918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010515	GCGACC	2	12	161516	161527	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010515	AATTTC	2	12	177346	177357	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_010515	GGAGAC	2	12	177399	177410	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010515	GAAGCC	2	12	210369	210380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010515	TCGGCG	2	12	225551	225562	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010515	CGCGCC	2	12	233509	233520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010515	CCCCGC	2	12	296020	296031	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
17	NC_010515	CGTCAT	2	12	371671	371682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010515	CGGTTC	2	12	378169	378180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010515	CGCTGC	2	12	382116	382127	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010515	TCATGC	2	12	389689	389700	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010515	GCCCCG	2	12	417222	417233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010515	CAAAAA	2	12	430146	430157	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010515	GCGCGG	2	12	458353	458364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010515	CGGGCG	2	12	458519	458530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010515	ATCACC	2	12	472962	472973	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010515	GAACAA	2	12	479574	479585	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010515	GCCCGC	2	12	489426	489437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010515	CAACGA	2	12	507349	507360	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010515	CATCGG	2	12	513668	513679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010515	GCCGGC	2	12	542825	542836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010515	CTCGGG	2	12	547237	547248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010515	ATTACG	2	12	569897	569908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010515	CGATGC	2	12	587944	587955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010515	CCGGTT	2	12	590776	590787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010515	TGCATA	2	12	676914	676925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010515	GTGTCG	2	12	693132	693143	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010515	GATACA	2	12	702971	702982	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010515	CCCTCG	2	12	711884	711895	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010515	CCGATG	2	12	714501	714512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010515	TCGCCG	2	12	721638	721649	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010515	GTCGAG	2	12	731911	731922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010515	CGGGCG	2	12	732472	732483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010515	CGATCA	2	12	755460	755471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010515	GCCGCG	2	12	766313	766324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010515	TCGGAT	2	12	768775	768786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010515	AACGGG	2	12	769030	769041	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010515	GGCGAC	3	18	769081	769098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010515	GACCCA	2	12	773546	773557	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010515	AGAGAA	2	12	793087	793098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010515	TCACCT	2	12	829782	829793	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010515	TCACCT	2	12	829839	829850	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010515	CGCCGG	2	12	839290	839301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010515	TGCGGA	2	12	840427	840438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010515	ATATCG	2	12	865299	865310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010515	GGCGCC	2	12	914708	914719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010515	ATGGAA	2	12	940687	940698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010515	ATCACG	2	12	942283	942294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010515	GCAGCG	2	12	945502	945513	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010515	AAAAAC	2	12	967439	967450	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010515	TCGCGT	2	12	988110	988121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010515	CGCACA	2	12	995987	995998	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010515	CTGCCG	2	12	1010436	1010447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010515	GCAAAA	2	12	1026353	1026364	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010515	GCCGTC	2	12	1030844	1030855	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010515	CCCGCC	2	12	1063957	1063968	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
66	NC_010515	CTGCGT	2	12	1065225	1065236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010515	CGTCAA	2	12	1078313	1078324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010515	CGACAA	2	12	1099085	1099096	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010515	CGGCGC	2	12	1106858	1106869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010515	GGAGCG	2	12	1180477	1180488	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010515	GTATCG	2	12	1186594	1186605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010515	CGGCGA	2	12	1186653	1186664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010515	AACACT	2	12	1189345	1189356	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010515	GCGGAA	2	12	1204685	1204696	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010515	ACGCGC	2	12	1204987	1204998	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010515	GCTTGC	2	12	1222184	1222195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010515	CGGTTC	2	12	1267380	1267391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010515	GTGCCG	2	12	1274234	1274245	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010515	CCCCGC	2	12	1274860	1274871	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_010515	CCCGGG	2	12	1274934	1274945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010515	CTGTTC	2	12	1312737	1312748	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010515	AAAAGA	2	12	1334784	1334795	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010515	CCGCTT	2	12	1335591	1335602	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010515	CGATCC	2	12	1338572	1338583	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010515	AGGAAA	2	12	1383236	1383247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010515	TTCGCT	2	12	1383813	1383824	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010515	TCCACA	2	12	1384358	1384369	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010515	CGGCTT	2	12	1389240	1389251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010515	CTTCCC	2	12	1391071	1391082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010515	GTTGCA	2	12	1404924	1404935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010515	CCTGAG	2	12	1426555	1426566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010515	GGTCGC	2	12	1442255	1442266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010515	TGCGAT	2	12	1458424	1458435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010515	CGAACA	2	12	1476802	1476813	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010515	TTGATC	2	12	1617347	1617358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_010515	GAACGT	2	12	1650796	1650807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010515	CATGCG	2	12	1659135	1659146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010515	CGTGAC	2	12	1684990	1685001	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010515	ACTAAC	2	12	1687430	1687441	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010515	CGCGTT	2	12	1741791	1741802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010515	TCATCG	2	12	1757114	1757125	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010515	TGCCGC	2	12	1823460	1823471	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010515	GGCGCG	2	12	1834145	1834156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010515	GAGCGG	2	12	1871751	1871762	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010515	CGGGGC	2	12	1894715	1894726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010515	TCCTGA	2	12	1967162	1967173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010515	CGGCCC	2	12	1976182	1976193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010515	GGCGCG	2	12	1989792	1989803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010515	GCGGAA	2	12	1994775	1994786	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_010515	CGTGGC	2	12	2096817	2096828	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010515	CGCGTC	2	12	2097042	2097053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010515	GCCGAA	2	12	2146223	2146234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010515	TGAACG	2	12	2179850	2179861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010515	TGCTCG	2	12	2244370	2244381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010515	GCTTCG	2	12	2250609	2250620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010515	ACGCCG	2	12	2253952	2253963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010515	GTGCCG	2	12	2264989	2265000	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010515	GCCGGC	2	12	2350389	2350400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010515	TGCCGA	2	12	2357221	2357232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010515	CGGCGA	2	12	2381444	2381455	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010515	GCCGGC	2	12	2452405	2452416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010515	CGAACC	2	12	2454210	2454221	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010515	CCAGCG	2	12	2462893	2462904	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010515	GCTGAA	2	12	2463178	2463189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010515	CAATAC	2	12	2472778	2472789	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010515	GTTCCC	2	12	2490209	2490220	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010515	GACAGT	2	12	2548871	2548882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_010515	GCCGGC	2	12	2591804	2591815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010515	TATGCA	2	12	2601613	2601624	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_010515	ATTGCA	2	12	2687268	2687279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_010515	CATCGC	2	12	2691642	2691653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010515	TGGGAT	2	12	2698576	2698587	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010515	AGCTCA	2	12	2700578	2700589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010515	CGATGG	2	12	2705890	2705901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_010515	ATCGCA	2	12	2706824	2706835	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010515	GCCGGA	2	12	2706911	2706922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010515	GGTCGA	2	12	2710476	2710487	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_010515	TTTTGG	2	12	2714793	2714804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010515	GTGCCG	4	24	2756411	2756434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010515	CGCTAT	2	12	2766632	2766643	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010515	GATATG	2	12	2775109	2775120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010515	GCGGGC	2	12	2778653	2778664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010515	GGCGTG	2	12	2783760	2783771	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_010515	TGCGCG	2	12	2785961	2785972	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010515	CAATAT	2	12	2794117	2794128	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_010515	ACGTGT	2	12	2827993	2828004	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_010515	CTGCCG	2	12	2852220	2852231	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010515	GCCGGG	2	12	2853611	2853622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010515	CGAACC	2	12	2899309	2899320	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010515	GGAGTG	2	12	2931942	2931953	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010515	GGCAAG	2	12	2931959	2931970	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_010515	GCCGCG	2	12	2954021	2954032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010515	GACGGG	2	12	2965890	2965901	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_010515	TCGTTG	2	12	2999200	2999211	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_010515	GCATCG	2	12	3018032	3018043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_010515	CATCCC	2	12	3038634	3038645	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_010515	AATCGC	2	12	3054361	3054372	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_010515	CCGCGC	2	12	3085431	3085442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_010515	CGTGCG	2	12	3092473	3092484	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_010515	ACAGAA	2	12	3143640	3143651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_010515	GGAAAC	2	12	3148197	3148208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_010515	CCGGCG	2	12	3162749	3162760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_010515	TCCGCC	2	12	3203250	3203261	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.