MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD03

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010514	CTG	2	6	3338	3343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010514	GGC	2	6	3356	3361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010514	GGC	2	6	3379	3384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010514	CTC	2	6	3508	3513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010514	GAT	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010514	GCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010514	GCA	2	6	6022	6027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010514	GCC	2	6	6051	6056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010514	TCA	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010514	CAC	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010514	CAG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010514	TCC	2	6	8923	8928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010514	TCG	2	6	8966	8971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010514	CAG	2	6	9082	9087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010514	GCT	2	6	9094	9099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010514	ACC	2	6	9185	9190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_010514	CAC	2	6	9215	9220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_010514	CCG	2	6	9275	9280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010514	GCC	2	6	11191	11196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010514	TCG	2	6	12325	12330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010514	GCC	2	6	12352	12357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010514	GAG	2	6	12445	12450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010514	GCG	3	9	12535	12543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010514	AGC	2	6	12580	12585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010514	TCC	2	6	12800	12805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010514	CGT	2	6	12970	12975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010514	GCC	2	6	12983	12988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010514	GAG	2	6	13174	13179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010514	AGG	3	9	13181	13189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010514	CTC	2	6	13225	13230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010514	ACG	2	6	13990	13995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010514	AGC	2	6	14010	14015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010514	ACG	2	6	14178	14183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010514	TCG	2	6	14202	14207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010514	GGA	2	6	14290	14295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010514	TCG	2	6	14308	14313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010514	TTA	2	6	14490	14495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010514	ATG	2	6	14541	14546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010514	ATA	2	6	14674	14679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010514	CGT	2	6	14734	14739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010514	GCC	2	6	14790	14795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010514	GCA	2	6	14833	14838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010514	GTT	2	6	15070	15075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010514	GTC	2	6	15736	15741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010514	CGC	2	6	15754	15759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_010514	TGC	2	6	15763	15768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010514	GGC	2	6	15827	15832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010514	AGA	2	6	15884	15889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010514	CCG	2	6	15944	15949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010514	GCG	2	6	15969	15974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010514	CGT	2	6	16372	16377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010514	GCC	2	6	16438	16443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010514	GTA	2	6	16454	16459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010514	ATT	2	6	16502	16507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010514	AAT	2	6	16530	16535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010514	CGA	2	6	16682	16687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010514	GCA	2	6	16788	16793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010514	GGC	2	6	16800	16805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010514	GGA	2	6	16845	16850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010514	TAT	2	6	16913	16918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010514	TGC	2	6	17019	17024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010514	ATC	2	6	17077	17082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010514	GTA	2	6	17083	17088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010514	GCT	2	6	19377	19382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010514	TCG	2	6	19480	19485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010514	CGA	2	6	19499	19504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010514	GGC	2	6	19583	19588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010514	GAT	2	6	19631	19636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010514	CAT	2	6	19659	19664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010514	GCC	2	6	19675	19680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010514	GCG	2	6	19718	19723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010514	TAT	2	6	19801	19806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010514	TTC	2	6	19844	19849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010514	GAA	2	6	19874	19879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010514	TTA	2	6	19973	19978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010514	ATT	2	6	20018	20023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010514	TAA	2	6	20133	20138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010514	TCC	2	6	20186	20191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010514	TGT	2	6	20192	20197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010514	CGA	2	6	20202	20207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010514	ATG	2	6	20250	20255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010514	TCG	2	6	20433	20438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010514	GAT	2	6	20458	20463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010514	CCG	2	6	20526	20531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010514	CTG	2	6	20537	20542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010514	TGA	2	6	20637	20642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010514	TGC	2	6	20649	20654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010514	GCC	2	6	20688	20693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010514	CGA	2	6	20698	20703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010514	CTG	2	6	20816	20821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010514	GCG	2	6	20874	20879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010514	CGA	2	6	21004	21009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010514	CGC	2	6	21010	21015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010514	CCG	2	6	21057	21062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010514	ACC	2	6	21170	21175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010514	GCC	2	6	21200	21205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010514	AGC	2	6	21432	21437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010514	TCG	2	6	21477	21482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010514	TGC	2	6	21495	21500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010514	TGC	2	6	21551	21556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010514	CGG	2	6	21653	21658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010514	AAG	2	6	21665	21670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010514	GCC	3	9	21767	21775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_010514	TGA	2	6	21975	21980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010514	TCG	2	6	21996	22001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010514	GAG	2	6	22039	22044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010514	CTC	2	6	22048	22053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010514	CCA	2	6	23492	23497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010514	CGC	2	6	23541	23546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010514	CAG	2	6	24452	24457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010514	ATC	2	6	24561	24566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010514	CGT	2	6	24578	24583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010514	CGT	2	6	24632	24637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010514	GAA	2	6	24744	24749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010514	TCA	2	6	24820	24825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010514	CAT	2	6	24842	24847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010514	GCC	2	6	24897	24902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010514	CTA	2	6	24903	24908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010514	ACC	2	6	25069	25074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010514	AGC	2	6	25103	25108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010514	CGG	2	6	25198	25203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010514	CCA	2	6	25890	25895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_010514	TGC	2	6	25899	25904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010514	CCG	2	6	25995	26000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010514	CGC	2	6	26008	26013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010514	TCG	2	6	26049	26054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010514	TCC	2	6	26111	26116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_010514	GGC	2	6	26123	26128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010514	GCC	2	6	26791	26796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010514	GGC	2	6	27763	27768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010514	GCG	2	6	28649	28654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010514	CTG	2	6	28699	28704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010514	CAG	2	6	28705	28710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010514	GCC	2	6	28738	28743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010514	AAC	2	6	28748	28753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010514	CGG	2	6	28766	28771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010514	CGG	2	6	28782	28787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010514	GCC	2	6	28873	28878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010514	GCC	2	6	28965	28970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_010514	CCG	2	6	29011	29016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_010514	AGT	2	6	31323	31328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010514	GGT	2	6	31339	31344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010514	TTG	2	6	31393	31398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010514	TGG	2	6	31795	31800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010514	CGA	2	6	31928	31933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010514	ATG	2	6	32741	32746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010514	GCT	2	6	33491	33496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010514	CGA	2	6	33558	33563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010514	CTG	2	6	34784	34789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010514	CTG	2	6	34852	34857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_010514	TGG	2	6	34907	34912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010514	CGT	2	6	34966	34971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010514	CGA	2	6	36105	36110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010514	GCT	2	6	36196	36201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_010514	ACC	2	6	36665	36670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_010514	ATT	2	6	39773	39778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010514	GCA	2	6	39801	39806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_010514	CAG	2	6	39876	39881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_010514	GGC	2	6	41878	41883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_010514	TGC	2	6	41992	41997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_010514	TCA	2	6	42396	42401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_010514	GGC	2	6	42410	42415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_010514	TCG	2	6	42426	42431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.