MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa M12 chromosome

Total Repeats: 1542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010513	CGTTG	2	10	8227	8236	0 %	40 %	40 %	20 %	170729257
2	NC_010513	GATCA	2	10	9949	9958	40 %	20 %	20 %	20 %	170729258
3	NC_010513	GATGT	2	10	12660	12669	20 %	40 %	40 %	0 %	170729262
4	NC_010513	CAATT	2	10	12784	12793	40 %	40 %	0 %	20 %	170729262
5	NC_010513	CAAAG	2	10	15316	15325	60 %	0 %	20 %	20 %	170729264
6	NC_010513	TGCGT	2	10	22378	22387	0 %	40 %	40 %	20 %	170729267
7	NC_010513	AGCGA	2	10	24445	24454	40 %	0 %	40 %	20 %	170729269
8	NC_010513	ACCGC	2	10	24490	24499	20 %	0 %	20 %	60 %	170729269
9	NC_010513	ATTGA	2	10	24771	24780	40 %	40 %	20 %	0 %	170729270
10	NC_010513	ACAAT	2	10	25135	25144	60 %	20 %	0 %	20 %	170729270
11	NC_010513	GTGCA	2	10	25369	25378	20 %	20 %	40 %	20 %	170729270
12	NC_010513	GCGGT	2	10	26354	26363	0 %	20 %	60 %	20 %	170729272
13	NC_010513	GGGAC	2	10	28159	28168	20 %	0 %	60 %	20 %	170729272
14	NC_010513	ACGGT	2	10	29840	29849	20 %	20 %	40 %	20 %	170729272
15	NC_010513	GGTGA	2	10	30346	30355	20 %	20 %	60 %	0 %	170729273
16	NC_010513	CGGCG	2	10	31004	31013	0 %	0 %	60 %	40 %	170729274
17	NC_010513	AGGTG	2	10	36821	36830	20 %	20 %	60 %	0 %	170729281
18	NC_010513	TGCGC	2	10	38117	38126	0 %	20 %	40 %	40 %	170729282
19	NC_010513	TGCGT	2	10	40643	40652	0 %	40 %	40 %	20 %	170729284
20	NC_010513	GGCTT	2	10	41511	41520	0 %	40 %	40 %	20 %	170729284
21	NC_010513	TTTGG	2	10	42444	42453	0 %	60 %	40 %	0 %	170729284
22	NC_010513	ATTTG	2	10	46494	46503	20 %	60 %	20 %	0 %	170729288
23	NC_010513	TAGGA	2	10	46994	47003	40 %	20 %	40 %	0 %	170729288
24	NC_010513	CGATG	2	10	48492	48501	20 %	20 %	40 %	20 %	170729288
25	NC_010513	GGTAT	2	10	50707	50716	20 %	40 %	40 %	0 %	170729289
26	NC_010513	TGATC	2	10	50944	50953	20 %	40 %	20 %	20 %	170729289
27	NC_010513	TCGAT	2	10	52767	52776	20 %	40 %	20 %	20 %	170729290
28	NC_010513	TTGAG	2	10	56669	56678	20 %	40 %	40 %	0 %	170729293
29	NC_010513	GCAGC	2	10	57032	57041	20 %	0 %	40 %	40 %	170729293
30	NC_010513	GACTG	2	10	57284	57293	20 %	20 %	40 %	20 %	170729294
31	NC_010513	TTGCT	2	10	58088	58097	0 %	60 %	20 %	20 %	170729294
32	NC_010513	GCATC	2	10	71138	71147	20 %	20 %	20 %	40 %	170729297
33	NC_010513	TTGCT	2	10	72991	73000	0 %	60 %	20 %	20 %	170729299
34	NC_010513	TGTGC	2	10	73352	73361	0 %	40 %	40 %	20 %	170729299
35	NC_010513	AGCCC	2	10	74860	74869	20 %	0 %	20 %	60 %	170729300
36	NC_010513	TTCGG	2	10	81689	81698	0 %	40 %	40 %	20 %	170729304
37	NC_010513	CGTGA	2	10	81704	81713	20 %	20 %	40 %	20 %	170729304
38	NC_010513	AACGC	2	10	81997	82006	40 %	0 %	20 %	40 %	170729304
39	NC_010513	TCGAC	2	10	82023	82032	20 %	20 %	20 %	40 %	170729304
40	NC_010513	GATGC	2	10	82883	82892	20 %	20 %	40 %	20 %	170729305
41	NC_010513	GTACA	2	10	85444	85453	40 %	20 %	20 %	20 %	170729307
42	NC_010513	GGTGT	2	10	85688	85697	0 %	40 %	60 %	0 %	170729307
43	NC_010513	CGCTG	2	10	88348	88357	0 %	20 %	40 %	40 %	170729310
44	NC_010513	TCCCC	2	10	89070	89079	0 %	20 %	0 %	80 %	170729310
45	NC_010513	ATGTT	2	10	89462	89471	20 %	60 %	20 %	0 %	170729311
46	NC_010513	CAGCT	2	10	92572	92581	20 %	20 %	20 %	40 %	170729314
47	NC_010513	TCTTT	2	10	97687	97696	0 %	80 %	0 %	20 %	170729319
48	NC_010513	TGCAA	2	10	99095	99104	40 %	20 %	20 %	20 %	170729320
49	NC_010513	TGGCG	2	10	99604	99613	0 %	20 %	60 %	20 %	170729320
50	NC_010513	GCGTA	2	10	100386	100395	20 %	20 %	40 %	20 %	170729321
51	NC_010513	GGGAT	2	10	103105	103114	20 %	20 %	60 %	0 %	170729323
52	NC_010513	TGACC	2	10	109828	109837	20 %	20 %	20 %	40 %	170729332
53	NC_010513	TGATC	2	10	109840	109849	20 %	40 %	20 %	20 %	170729332
54	NC_010513	TCGCA	2	10	110716	110725	20 %	20 %	20 %	40 %	170729332
55	NC_010513	CATCG	2	10	112113	112122	20 %	20 %	20 %	40 %	170729333
56	NC_010513	TGAGG	2	10	116965	116974	20 %	20 %	60 %	0 %	170729336
57	NC_010513	CGGCG	2	10	123749	123758	0 %	0 %	60 %	40 %	170729340
58	NC_010513	TGACG	2	10	125436	125445	20 %	20 %	40 %	20 %	170729341
59	NC_010513	GCCAT	2	10	126758	126767	20 %	20 %	20 %	40 %	170729343
60	NC_010513	CCTTC	2	10	127067	127076	0 %	40 %	0 %	60 %	170729344
61	NC_010513	GACTG	2	10	127849	127858	20 %	20 %	40 %	20 %	170729344
62	NC_010513	GAACA	2	10	128371	128380	60 %	0 %	20 %	20 %	170729344
63	NC_010513	TGCAA	2	10	130310	130319	40 %	20 %	20 %	20 %	170729346
64	NC_010513	AGCCA	2	10	134069	134078	40 %	0 %	20 %	40 %	170729349
65	NC_010513	ACTCC	2	10	135107	135116	20 %	20 %	0 %	60 %	170729350
66	NC_010513	TGTGG	2	10	135616	135625	0 %	40 %	60 %	0 %	170729350
67	NC_010513	TGTGT	2	10	138579	138588	0 %	60 %	40 %	0 %	170729353
68	NC_010513	GTGTT	2	10	139166	139175	0 %	60 %	40 %	0 %	170729354
69	NC_010513	GCGTC	2	10	140278	140287	0 %	20 %	40 %	40 %	170729354
70	NC_010513	GTTTG	2	10	142533	142542	0 %	60 %	40 %	0 %	170729356
71	NC_010513	AGCAC	2	10	144699	144708	40 %	0 %	20 %	40 %	170729357
72	NC_010513	CCGAC	2	10	144979	144988	20 %	0 %	20 %	60 %	170729357
73	NC_010513	GATGT	2	10	145246	145255	20 %	40 %	40 %	0 %	170729357
74	NC_010513	GGTGC	2	10	145924	145933	0 %	20 %	60 %	20 %	170729358
75	NC_010513	GCCAG	2	10	145939	145948	20 %	0 %	40 %	40 %	170729358
76	NC_010513	TGCGT	2	10	147202	147211	0 %	40 %	40 %	20 %	170729360
77	NC_010513	CGTTG	2	10	152335	152344	0 %	40 %	40 %	20 %	170729364
78	NC_010513	GTTGC	2	10	152661	152670	0 %	40 %	40 %	20 %	170729364
79	NC_010513	AGCGC	2	10	153424	153433	20 %	0 %	40 %	40 %	170729364
80	NC_010513	AGCGT	2	10	153552	153561	20 %	20 %	40 %	20 %	170729364
81	NC_010513	TGGAT	2	10	156633	156642	20 %	40 %	40 %	0 %	170729367
82	NC_010513	CGGAG	2	10	161941	161950	20 %	0 %	60 %	20 %	170729371
83	NC_010513	TGTGT	2	10	163288	163297	0 %	60 %	40 %	0 %	170729372
84	NC_010513	CGCGG	2	10	163508	163517	0 %	0 %	60 %	40 %	170729372
85	NC_010513	TCGAT	2	10	163881	163890	20 %	40 %	20 %	20 %	170729373
86	NC_010513	TGGAT	2	10	164382	164391	20 %	40 %	40 %	0 %	170729373
87	NC_010513	GAGGT	2	10	168519	168528	20 %	20 %	60 %	0 %	170729376
88	NC_010513	GCATC	2	10	175397	175406	20 %	20 %	20 %	40 %	170729377
89	NC_010513	GCTTG	2	10	178467	178476	0 %	40 %	40 %	20 %	170729379
90	NC_010513	GAGTG	2	10	183151	183160	20 %	20 %	60 %	0 %	170729382
91	NC_010513	GCAAC	2	10	187718	187727	40 %	0 %	20 %	40 %	170729387
92	NC_010513	ACGTA	2	10	190820	190829	40 %	20 %	20 %	20 %	170729389
93	NC_010513	TGCGA	2	10	190974	190983	20 %	20 %	40 %	20 %	170729389
94	NC_010513	CCCAT	2	10	192077	192086	20 %	20 %	0 %	60 %	170729390
95	NC_010513	TGCAT	2	10	194663	194672	20 %	40 %	20 %	20 %	170729393
96	NC_010513	CGCGC	2	10	196006	196015	0 %	0 %	40 %	60 %	170729395
97	NC_010513	GGCTT	2	10	196941	196950	0 %	40 %	40 %	20 %	170729395
98	NC_010513	TGTCA	2	10	197113	197122	20 %	40 %	20 %	20 %	170729396
99	NC_010513	GCATC	2	10	200416	200425	20 %	20 %	20 %	40 %	170729397
100	NC_010513	AACAA	2	10	200689	200698	80 %	0 %	0 %	20 %	170729397
101	NC_010513	GTGGC	2	10	202743	202752	0 %	20 %	60 %	20 %	170729400
102	NC_010513	ACCGA	2	10	203361	203370	40 %	0 %	20 %	40 %	170729401
103	NC_010513	GTTGG	2	10	203659	203668	0 %	40 %	60 %	0 %	170729401
104	NC_010513	TGTCG	2	10	205720	205729	0 %	40 %	40 %	20 %	170729404
105	NC_010513	GTTGC	2	10	205918	205927	0 %	40 %	40 %	20 %	170729404
106	NC_010513	GGTTG	2	10	206536	206545	0 %	40 %	60 %	0 %	170729405
107	NC_010513	TGCGC	2	10	206629	206638	0 %	20 %	40 %	40 %	170729405
108	NC_010513	GGCGT	2	10	209715	209724	0 %	20 %	60 %	20 %	170729407
109	NC_010513	CCAGT	2	10	211902	211911	20 %	20 %	20 %	40 %	170729408
110	NC_010513	GATCG	2	10	212541	212550	20 %	20 %	40 %	20 %	170729408
111	NC_010513	GTGAT	2	10	214260	214269	20 %	40 %	40 %	0 %	170729410
112	NC_010513	GATGT	2	10	214988	214997	20 %	40 %	40 %	0 %	170729411
113	NC_010513	GTCAT	2	10	216311	216320	20 %	40 %	20 %	20 %	170729412
114	NC_010513	TATGG	2	10	218259	218268	20 %	40 %	40 %	0 %	170729414
115	NC_010513	TGACA	2	10	223888	223897	40 %	20 %	20 %	20 %	170729419
116	NC_010513	GGCGA	2	10	224030	224039	20 %	0 %	60 %	20 %	170729419
117	NC_010513	TCACG	2	10	224482	224491	20 %	20 %	20 %	40 %	170729419
118	NC_010513	TTCGC	2	10	225393	225402	0 %	40 %	20 %	40 %	170729420
119	NC_010513	GCAGC	2	10	225435	225444	20 %	0 %	40 %	40 %	170729420
120	NC_010513	GCGTG	2	10	231700	231709	0 %	20 %	60 %	20 %	170729423
121	NC_010513	GCGGT	2	10	233832	233841	0 %	20 %	60 %	20 %	170729425
122	NC_010513	GTGCG	2	10	234255	234264	0 %	20 %	60 %	20 %	170729425
123	NC_010513	GCCGC	2	10	234706	234715	0 %	0 %	40 %	60 %	170729425
124	NC_010513	GTTGG	2	10	235030	235039	0 %	40 %	60 %	0 %	170729426
125	NC_010513	GACTC	2	10	235713	235722	20 %	20 %	20 %	40 %	170729427
126	NC_010513	TGTCA	2	10	236992	237001	20 %	40 %	20 %	20 %	170729428
127	NC_010513	CGTGC	2	10	237915	237924	0 %	20 %	40 %	40 %	170729430
128	NC_010513	CTGCG	2	10	237931	237940	0 %	20 %	40 %	40 %	170729430
129	NC_010513	TGCGT	2	10	238106	238115	0 %	40 %	40 %	20 %	170729430
130	NC_010513	ATTGT	2	10	242346	242355	20 %	60 %	20 %	0 %	170729432
131	NC_010513	CGCGA	2	10	248679	248688	20 %	0 %	40 %	40 %	170729437
132	NC_010513	CAGAT	2	10	250871	250880	40 %	20 %	20 %	20 %	170729439
133	NC_010513	TGCAT	2	10	251918	251927	20 %	40 %	20 %	20 %	170729440
134	NC_010513	GGCAT	2	10	251965	251974	20 %	20 %	40 %	20 %	170729440
135	NC_010513	ACTTG	2	10	251993	252002	20 %	40 %	20 %	20 %	170729440
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138	NC_010513	TTGCA	2	10	258126	258135	20 %	40 %	20 %	20 %	170729444
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142	NC_010513	TGGTT	2	10	259106	259115	0 %	60 %	40 %	0 %	170729445
143	NC_010513	TGCGT	2	10	259460	259469	0 %	40 %	40 %	20 %	170729445
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145	NC_010513	GTTGA	2	10	262134	262143	20 %	40 %	40 %	0 %	170729446
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151	NC_010513	CGCTG	2	10	281179	281188	0 %	20 %	40 %	40 %	170729464
152	NC_010513	CGCTG	2	10	281814	281823	0 %	20 %	40 %	40 %	170729465
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163	NC_010513	CTTGA	2	10	297250	297259	20 %	40 %	20 %	20 %	170729477
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249	NC_010513	CGATG	2	10	416168	416177	20 %	20 %	40 %	20 %	170729571
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253	NC_010513	CAAAA	2	10	427217	427226	80 %	0 %	0 %	20 %	170729580
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258	NC_010513	TGATC	2	10	438160	438169	20 %	40 %	20 %	20 %	170729591
259	NC_010513	TTGCG	2	10	440668	440677	0 %	40 %	40 %	20 %	170729594
260	NC_010513	GGCGT	2	10	442232	442241	0 %	20 %	60 %	20 %	170729595
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389	NC_010513	TTCCG	2	10	646639	646648	0 %	40 %	20 %	40 %	170729789
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